MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 chromosome 2

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015596	ACTCC	2	10	187	196	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_015596	CGATT	2	10	31424	31433	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015596	TTCCG	2	10	42725	42734	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015596	AAACG	2	10	47269	47278	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015596	CGCCA	2	10	50881	50890	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_015596	GAAAG	2	10	63053	63062	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015596	TCCCG	2	10	64539	64548	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_015596	GCCGG	2	10	65294	65303	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_015596	CTGCC	2	10	65585	65594	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_015596	GGCAG	2	10	65596	65605	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015596	TAGAG	2	10	70774	70783	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015596	GTCAA	2	10	70859	70868	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015596	GGGAG	2	10	114564	114573	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015596	TGTTA	2	10	119826	119835	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015596	CGGGG	2	10	120819	120828	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015596	GACAG	2	10	142591	142600	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015596	AAATA	2	10	156746	156755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015596	GGGCC	2	10	162672	162681	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_015596	GGTCG	2	10	163252	163261	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015596	GCCGG	2	10	165303	165312	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_015596	TTTGC	2	10	186344	186353	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015596	CCGAT	2	10	201593	201602	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015596	TGCCC	2	10	202122	202131	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_015596	GCGTC	2	10	202199	202208	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015596	GAAAA	2	10	205877	205886	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015596	AACAT	2	10	217799	217808	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015596	ATCAA	2	10	219362	219371	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015596	CTTTC	2	10	229866	229875	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_015596	TATTT	2	10	232696	232705	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015596	CCAAG	2	10	264311	264320	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015596	AAGCC	2	10	271444	271453	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_015596	AGGGC	2	10	294530	294539	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015596	AAATT	2	10	331178	331187	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015596	TGAGG	2	10	347657	347666	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015596	GCGGT	2	10	349186	349195	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015596	TCCGG	2	10	349236	349245	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_015596	AGATT	2	10	354888	354897	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015596	GAAAT	2	10	355045	355054	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015596	GCACT	2	10	355182	355191	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015596	GGAAT	2	10	355322	355331	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015596	CGGGC	2	10	371984	371993	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015596	TTTCC	2	10	376405	376414	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_015596	CGGCG	2	10	380997	381006	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_015596	GAGCG	2	10	381465	381474	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015596	GCGCC	2	10	383581	383590	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46	NC_015596	GGCGC	2	10	396946	396955	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015596	CGCCA	2	10	400158	400167	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_015596	TCAAT	2	10	408673	408682	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015596	GTGCC	2	10	418884	418893	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015596	CGACC	2	10	422930	422939	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_015596	ATGTT	2	10	429169	429178	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015596	GTAAT	2	10	455632	455641	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015596	GTTGC	2	10	458911	458920	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015596	GAGGG	2	10	468780	468789	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015596	GGTCG	2	10	469137	469146	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015596	TCCAC	2	10	473076	473085	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_015596	CGTGC	2	10	490421	490430	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_015596	GCAGG	2	10	497652	497661	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015596	TGCCG	2	10	501317	501326	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_015596	GCCGA	2	10	517558	517567	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_015596	CTGCC	2	10	527606	527615	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_015596	TGTCG	2	10	534109	534118	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015596	GGCCG	2	10	541631	541640	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_015596	CGGCG	2	10	546274	546283	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_015596	GGTCC	2	10	546317	546326	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_015596	TGCAG	2	10	559526	559535	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015596	TTGCG	2	10	559584	559593	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015596	TTCCT	2	10	573144	573153	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_015596	GGGGA	2	10	574773	574782	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015596	AGCCG	2	10	581362	581371	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_015596	CAAAG	2	10	594420	594429	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015596	GGGCA	2	10	642727	642736	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015596	CAGCC	2	10	643353	643362	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_015596	CTGCC	2	10	649993	650002	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_015596	GGCAG	2	10	650164	650173	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015596	TTGAA	2	10	664696	664705	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015596	CCGGC	2	10	680577	680586	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
78	NC_015596	AGCAC	2	10	690455	690464	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_015596	GTCGA	2	10	734879	734888	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015596	GCGCG	2	10	741152	741161	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
81	NC_015596	GAGCA	2	10	747898	747907	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015596	AGGAC	2	10	758328	758337	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015596	AGCGG	2	10	759066	759075	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015596	TCCCG	2	10	769212	769221	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_015596	CGACC	2	10	773021	773030	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_015596	AGTGA	2	10	773257	773266	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015596	CGCCT	2	10	774929	774938	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_015596	GGAGG	2	10	778808	778817	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015596	TTGCA	2	10	784705	784714	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_015596	GGCCG	2	10	788507	788516	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_015596	CGTTG	2	10	799082	799091	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015596	GCAGC	2	10	806427	806436	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_015596	GGCCA	2	10	818510	818519	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_015596	CCCAT	2	10	833587	833596	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_015596	CAGAT	2	10	833789	833798	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015596	GCTGC	2	10	834005	834014	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_015596	CGTGG	2	10	834226	834235	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015596	CGAGG	2	10	836405	836414	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015596	GGATC	2	10	839191	839200	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015596	TCGCC	2	10	839482	839491	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_015596	GCGCA	2	10	853868	853877	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_015596	CCCGA	2	10	854344	854353	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_015596	TGCAA	2	10	872526	872535	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_015596	CGACC	2	10	876138	876147	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
105	NC_015596	ACAAA	2	10	891637	891646	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015596	GGTCG	2	10	895873	895882	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015596	GTTTT	2	10	919888	919897	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015596	GCCGG	2	10	922543	922552	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
109	NC_015596	CTGCC	2	10	925774	925783	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_015596	GGCAG	2	10	927095	927104	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015596	CGGGA	2	10	931734	931743	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015596	CCGCA	2	10	934888	934897	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
113	NC_015596	TCGGT	2	10	949346	949355	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015596	CGCGG	2	10	996544	996553	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_015596	ATCAG	2	10	996725	996734	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015596	CCGGC	2	10	1003050	1003059	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
117	NC_015596	AAAAC	2	10	1015639	1015648	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015596	TCGGA	2	10	1021552	1021561	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015596	TGCAG	2	10	1022638	1022647	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015596	GTGCG	2	10	1038880	1038889	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015596	CCTTG	2	10	1053684	1053693	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_015596	TCCGG	2	10	1059024	1059033	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_015596	GAGCG	2	10	1063396	1063405	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015596	GGGCA	2	10	1065416	1065425	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015596	CGCCC	2	10	1077686	1077695	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
126	NC_015596	AAATC	2	10	1101701	1101710	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_015596	TCCGG	2	10	1123068	1123077	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_015596	GGTCG	2	10	1139879	1139888	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_015596	ATGGC	3	15	1141522	1141536	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015596	GACGT	2	10	1168711	1168720	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015596	GGGCG	2	10	1168809	1168818	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015596	TTTTA	2	10	1186785	1186794	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015596	GCCCT	2	10	1187632	1187641	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
134	NC_015596	AGAGC	2	10	1203229	1203238	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015596	ATTTG	2	10	1230418	1230427	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015596	CGACC	2	10	1247603	1247612	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_015596	AGTGA	2	10	1252095	1252104	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015596	TGCGG	2	10	1259342	1259351	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015596	CGCAT	2	10	1274956	1274965	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_015596	GCCGC	2	10	1280578	1280587	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
141	NC_015596	CGGGG	2	10	1296533	1296542	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
142	NC_015596	GGCGG	2	10	1307037	1307046	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015596	GCAAG	2	10	1319301	1319310	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_015596	AAAAT	2	10	1336340	1336349	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015596	CTTCG	2	10	1341978	1341987	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_015596	TCCCG	2	10	1344826	1344835	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
147	NC_015596	CCCCT	2	10	1348394	1348403	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
148	NC_015596	TTTCA	2	10	1348600	1348609	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_015596	TACCG	2	10	1365208	1365217	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
150	NC_015596	ATCTA	2	10	1365292	1365301	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_015596	TTGCG	2	10	1366636	1366645	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_015596	GCGCA	2	10	1373026	1373035	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
153	NC_015596	CGCTG	2	10	1373051	1373060	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
154	NC_015596	CGGGT	2	10	1382349	1382358	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
155	NC_015596	CGGCC	2	10	1424069	1424078	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
156	NC_015596	GCGGA	2	10	1428256	1428265	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
157	NC_015596	CGCCC	2	10	1430979	1430988	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
158	NC_015596	GGCGC	2	10	1434019	1434028	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
159	NC_015596	GTCCC	2	10	1441960	1441969	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
160	NC_015596	AATTA	2	10	1450333	1450342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015596	TGCAG	2	10	1453221	1453230	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_015596	CAAAA	2	10	1454902	1454911	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_015596	TGCGC	2	10	1455083	1455092	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
164	NC_015596	CCGTT	2	10	1456801	1456810	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
165	NC_015596	GCCGG	2	10	1459086	1459095	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
166	NC_015596	GCCGC	2	10	1462353	1462362	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
167	NC_015596	CTAAC	2	10	1468655	1468664	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
168	NC_015596	ATCGC	2	10	1469346	1469355	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
169	NC_015596	GATCG	2	10	1469573	1469582	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
170	NC_015596	CCCGG	2	10	1471996	1472005	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
171	NC_015596	AGGCT	2	10	1491891	1491900	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
172	NC_015596	TGAGG	2	10	1494033	1494042	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015596	CAGGA	2	10	1495974	1495983	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
174	NC_015596	GATCG	2	10	1496133	1496142	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
175	NC_015596	CCATC	2	10	1501595	1501604	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
176	NC_015596	CCGTG	2	10	1502165	1502174	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
177	NC_015596	CTTCG	2	10	1502371	1502380	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
178	NC_015596	ACGGC	2	10	1502405	1502414	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
179	NC_015596	TTCAC	2	10	1504800	1504809	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
180	NC_015596	CGAAC	2	10	1505829	1505838	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
181	NC_015596	CCCGG	2	10	1507728	1507737	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
182	NC_015596	TGATC	2	10	1512364	1512373	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
183	NC_015596	CCGGA	2	10	1513317	1513326	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
184	NC_015596	AGGGA	2	10	1540452	1540461	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
185	NC_015596	CGCCA	2	10	1542484	1542493	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
186	NC_015596	TCACC	2	10	1542539	1542548	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
187	NC_015596	GACGC	2	10	1558426	1558435	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
188	NC_015596	GATCA	2	10	1562608	1562617	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
189	NC_015596	GCATC	2	10	1567434	1567443	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
190	NC_015596	TCGCT	2	10	1570142	1570151	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
191	NC_015596	GTCTG	2	10	1578452	1578461	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
192	NC_015596	CCTGC	2	10	1581023	1581032	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
193	NC_015596	GCTAT	2	10	1582334	1582343	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
194	NC_015596	GTCCC	2	10	1599716	1599725	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
195	NC_015596	AAATC	2	10	1605119	1605128	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_015596	TCTGG	2	10	1614546	1614555	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
197	NC_015596	CCCGG	2	10	1622004	1622013	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
198	NC_015596	GAAAG	2	10	1625200	1625209	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
199	NC_015596	AGCCT	2	10	1632114	1632123	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
200	NC_015596	CGAAG	2	10	1641169	1641178	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
201	NC_015596	GAGCT	2	10	1643820	1643829	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
202	NC_015596	CTAGC	2	10	1648851	1648860	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
203	NC_015596	CTTCC	2	10	1653187	1653196	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
204	NC_015596	GCGGT	2	10	1653683	1653692	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
205	NC_015596	CGACG	2	10	1677765	1677774	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.