MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 plasmid pSPHCH01

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015595	TGCTT	2	10	1288	1297	0 %	60 %	20 %	20 %	334346524
2	NC_015595	TCGGT	2	10	1790	1799	0 %	40 %	40 %	20 %	334346525
3	NC_015595	CGGGC	2	10	2513	2522	0 %	0 %	60 %	40 %	334346526
4	NC_015595	GCGCC	2	10	4860	4869	0 %	0 %	40 %	60 %	334346528
5	NC_015595	CGCGC	2	10	8230	8239	0 %	0 %	40 %	60 %	334346535
6	NC_015595	CGATC	2	10	8589	8598	20 %	20 %	20 %	40 %	334346535
7	NC_015595	CCATG	2	10	8913	8922	20 %	20 %	20 %	40 %	334346535
8	NC_015595	CGCTG	2	10	9163	9172	0 %	20 %	40 %	40 %	334346536
9	NC_015595	GAGCG	2	10	9756	9765	20 %	0 %	60 %	20 %	334346536
10	NC_015595	AGCCA	2	10	11261	11270	40 %	0 %	20 %	40 %	334346537
11	NC_015595	ATCCC	2	10	13746	13755	20 %	20 %	0 %	60 %	334346537
12	NC_015595	GGCCA	2	10	16529	16538	20 %	0 %	40 %	40 %	334346541
13	NC_015595	CGCGT	2	10	17063	17072	0 %	20 %	40 %	40 %	334346542
14	NC_015595	CGGGG	2	10	17408	17417	0 %	0 %	80 %	20 %	334346542
15	NC_015595	TCCGG	2	10	18449	18458	0 %	20 %	40 %	40 %	334346542
16	NC_015595	GGCGA	2	10	19096	19105	20 %	0 %	60 %	20 %	334346542
17	NC_015595	ATCGC	2	10	19757	19766	20 %	20 %	20 %	40 %	334346542
18	NC_015595	TGGGA	2	10	19892	19901	20 %	20 %	60 %	0 %	334346542
19	NC_015595	CGGCA	2	10	21661	21670	20 %	0 %	40 %	40 %	334346544
20	NC_015595	CAGCG	2	10	22600	22609	20 %	0 %	40 %	40 %	334346544
21	NC_015595	AGCGC	2	10	22976	22985	20 %	0 %	40 %	40 %	334346544
22	NC_015595	CGGCA	2	10	24179	24188	20 %	0 %	40 %	40 %	334346546
23	NC_015595	CGCGT	2	10	24727	24736	0 %	20 %	40 %	40 %	334346547
24	NC_015595	GGCAG	2	10	25136	25145	20 %	0 %	60 %	20 %	334346547
25	NC_015595	ATCGA	2	10	25806	25815	40 %	20 %	20 %	20 %	334346549
26	NC_015595	GGGCG	2	10	26029	26038	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015595	CGCCC	2	10	26048	26057	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
28	NC_015595	TCGCG	2	10	27037	27046	0 %	20 %	40 %	40 %	334346550
29	NC_015595	CCGAG	2	10	27562	27571	20 %	0 %	40 %	40 %	334346550
30	NC_015595	GCGAT	2	10	29790	29799	20 %	20 %	40 %	20 %	334346551
31	NC_015595	TCAGG	2	10	30933	30942	20 %	20 %	40 %	20 %	334346552
32	NC_015595	TCCGA	2	10	31114	31123	20 %	20 %	20 %	40 %	334346552
33	NC_015595	GCGTC	2	10	33154	33163	0 %	20 %	40 %	40 %	334346554
34	NC_015595	GGGTC	2	10	33445	33454	0 %	20 %	60 %	20 %	334346554
35	NC_015595	CGCTG	2	10	33616	33625	0 %	20 %	40 %	40 %	334346554
36	NC_015595	GGCTT	2	10	35042	35051	0 %	40 %	40 %	20 %	334346556
37	NC_015595	GGCAT	2	10	36323	36332	20 %	20 %	40 %	20 %	334346558
38	NC_015595	CCTGT	2	10	38732	38741	0 %	40 %	20 %	40 %	334346558
39	NC_015595	GGGAT	2	10	39470	39479	20 %	20 %	60 %	0 %	334346559
40	NC_015595	GGCGG	2	10	40899	40908	0 %	0 %	80 %	20 %	334346560
41	NC_015595	CAGCG	2	10	42585	42594	20 %	0 %	40 %	40 %	334346562
42	NC_015595	GATCA	2	10	42732	42741	40 %	20 %	20 %	20 %	334346562
43	NC_015595	GCGCG	2	10	43253	43262	0 %	0 %	60 %	40 %	334346563
44	NC_015595	GCCCT	2	10	43932	43941	0 %	20 %	20 %	60 %	334346564
45	NC_015595	GCCTT	2	10	44336	44345	0 %	40 %	20 %	40 %	334346565
46	NC_015595	GCGCC	2	10	45557	45566	0 %	0 %	40 %	60 %	334346566
47	NC_015595	AGGCA	2	10	45777	45786	40 %	0 %	40 %	20 %	334346567
48	NC_015595	CGCGC	2	10	47382	47391	0 %	0 %	40 %	60 %	334346568
49	NC_015595	CCATG	2	10	48243	48252	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015595	GGGGA	2	10	49171	49180	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015595	GCGCT	2	10	51057	51066	0 %	20 %	40 %	40 %	334346571
52	NC_015595	CGATG	2	10	51076	51085	20 %	20 %	40 %	20 %	334346571
53	NC_015595	CTGGA	2	10	54227	54236	20 %	20 %	40 %	20 %	334346571
54	NC_015595	AACGG	2	10	55073	55082	40 %	0 %	40 %	20 %	334346572
55	NC_015595	CTGCG	2	10	56266	56275	0 %	20 %	40 %	40 %	334346572
56	NC_015595	CATCG	2	10	59003	59012	20 %	20 %	20 %	40 %	334346577
57	NC_015595	GGCCT	2	10	59694	59703	0 %	20 %	40 %	40 %	334346577
58	NC_015595	ACGGC	2	10	60696	60705	20 %	0 %	40 %	40 %	334346579
59	NC_015595	CTGGG	2	10	61638	61647	0 %	20 %	60 %	20 %	334346580
60	NC_015595	GGCGC	2	10	61949	61958	0 %	0 %	60 %	40 %	334346580
61	NC_015595	CTTCG	2	10	62019	62028	0 %	40 %	20 %	40 %	334346580
62	NC_015595	GGAGG	2	10	62454	62463	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015595	GGGCG	2	10	62464	62473	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015595	CCGCG	2	10	62553	62562	0 %	0 %	40 %	60 %	334346581
65	NC_015595	GCACT	2	10	62821	62830	20 %	20 %	20 %	40 %	334346581
66	NC_015595	CGGCC	2	10	63003	63012	0 %	0 %	40 %	60 %	334346581
67	NC_015595	GCGCT	2	10	63489	63498	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_015595	CCGGT	2	10	64177	64186	0 %	20 %	40 %	40 %	334346583
69	NC_015595	TCGCT	2	10	64693	64702	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_015595	TCGCT	2	10	65013	65022	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_015595	CGCGC	2	10	65774	65783	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_015595	CGATC	2	10	66578	66587	20 %	20 %	20 %	40 %	334346587
73	NC_015595	GGGAG	2	10	66836	66845	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015595	TCGCG	2	10	68052	68061	0 %	20 %	40 %	40 %	334346590
75	NC_015595	CCGAT	2	10	68651	68660	20 %	20 %	20 %	40 %	334346590
76	NC_015595	TGAGT	2	10	69000	69009	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015595	GGCGC	2	10	69207	69216	0 %	0 %	60 %	40 %	334346591
78	NC_015595	GGCGC	2	10	69336	69345	0 %	0 %	60 %	40 %	334346591
79	NC_015595	ATCGG	2	10	69413	69422	20 %	20 %	40 %	20 %	334346591
80	NC_015595	TCGCC	2	10	71751	71760	0 %	20 %	20 %	60 %	334346594
81	NC_015595	GCCGC	2	10	72464	72473	0 %	0 %	40 %	60 %	334346594
82	NC_015595	ACCCG	2	10	73357	73366	20 %	0 %	20 %	60 %	334346596
83	NC_015595	GCGCA	2	10	74396	74405	20 %	0 %	40 %	40 %	334346597
84	NC_015595	GGGCG	2	10	74659	74668	0 %	0 %	80 %	20 %	334346597
85	NC_015595	AGCCG	2	10	74906	74915	20 %	0 %	40 %	40 %	334346597
86	NC_015595	GCCGC	2	10	75363	75372	0 %	0 %	40 %	60 %	334346597
87	NC_015595	GCCTG	2	10	76385	76394	0 %	20 %	40 %	40 %	334346598
88	NC_015595	GCACG	2	10	78043	78052	20 %	0 %	40 %	40 %	334346599
89	NC_015595	AGCCG	2	10	80676	80685	20 %	0 %	40 %	40 %	334346601
90	NC_015595	GATCG	2	10	81381	81390	20 %	20 %	40 %	20 %	334346601
91	NC_015595	GCCCA	2	10	81958	81967	20 %	0 %	20 %	60 %	334346601
92	NC_015595	GATCC	2	10	82334	82343	20 %	20 %	20 %	40 %	334346602
93	NC_015595	AGCGC	2	10	85725	85734	20 %	0 %	40 %	40 %	334346605
94	NC_015595	TCCTG	2	10	85743	85752	0 %	40 %	20 %	40 %	334346605
95	NC_015595	GACGC	2	10	86237	86246	20 %	0 %	40 %	40 %	334346606
96	NC_015595	ACTAT	2	10	86745	86754	40 %	40 %	0 %	20 %	334346606
97	NC_015595	AGCGC	2	10	88415	88424	20 %	0 %	40 %	40 %	334346608
98	NC_015595	CGATG	2	10	88580	88589	20 %	20 %	40 %	20 %	334346608
99	NC_015595	ACCCA	2	10	88702	88711	40 %	0 %	0 %	60 %	334346608
100	NC_015595	ACCAG	2	10	89380	89389	40 %	0 %	20 %	40 %	334346608
101	NC_015595	GCCGA	2	10	90049	90058	20 %	0 %	40 %	40 %	334346608
102	NC_015595	GGATC	2	10	90284	90293	20 %	20 %	40 %	20 %	334346608
103	NC_015595	GGTCG	2	10	92317	92326	0 %	20 %	60 %	20 %	334346613
104	NC_015595	GCCCT	2	10	94824	94833	0 %	20 %	20 %	60 %	334346616
105	NC_015595	CCGAG	2	10	94869	94878	20 %	0 %	40 %	40 %	334346616
106	NC_015595	CTGGG	2	10	97772	97781	0 %	20 %	60 %	20 %	334346620
107	NC_015595	CGGCG	2	10	98035	98044	0 %	0 %	60 %	40 %	334346620
108	NC_015595	ACCCC	2	10	98499	98508	20 %	0 %	0 %	80 %	334346620
109	NC_015595	CTCGC	2	10	99217	99226	0 %	20 %	20 %	60 %	334346621
110	NC_015595	TCACC	2	10	99554	99563	20 %	20 %	0 %	60 %	334346621
111	NC_015595	GCCGA	2	10	99925	99934	20 %	0 %	40 %	40 %	334346621
112	NC_015595	ATCCG	2	10	101013	101022	20 %	20 %	20 %	40 %	334346622
113	NC_015595	CGTCA	2	10	101028	101037	20 %	20 %	20 %	40 %	334346622
114	NC_015595	TGTCG	2	10	101464	101473	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015595	GACGC	2	10	102117	102126	20 %	0 %	40 %	40 %	334346623
116	NC_015595	CGCCT	2	10	106221	106230	0 %	20 %	20 %	60 %	334346626
117	NC_015595	GCTCG	2	10	107405	107414	0 %	20 %	40 %	40 %	334346628
118	NC_015595	CCCCG	2	10	108743	108752	0 %	0 %	20 %	80 %	334346631
119	NC_015595	GGCGA	2	10	109509	109518	20 %	0 %	60 %	20 %	334346631
120	NC_015595	CGCGC	2	10	109550	109559	0 %	0 %	40 %	60 %	334346631
121	NC_015595	CGGCG	2	10	109733	109742	0 %	0 %	60 %	40 %	334346631
122	NC_015595	TCACC	2	10	110093	110102	20 %	20 %	0 %	60 %	334346631
123	NC_015595	CAGCG	2	10	112721	112730	20 %	0 %	40 %	40 %	334346634
124	NC_015595	CCCCT	2	10	117052	117061	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
125	NC_015595	GCCGT	2	10	118372	118381	0 %	20 %	40 %	40 %	334346641
126	NC_015595	CTGCT	2	10	120396	120405	0 %	40 %	20 %	40 %	334346642
127	NC_015595	GGGTT	2	10	121864	121873	0 %	40 %	60 %	0 %	334346643

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.