MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 plasmid pSPHCH01

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015595	TTGG	2	8	7082	7089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015595	ATCG	2	8	7510	7517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015595	TGCG	2	8	7519	7526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015595	GCCG	2	8	14236	14243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015595	CCAG	2	8	14415	14422	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015595	TCAA	2	8	17011	17018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015595	ACGC	2	8	31808	31815	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015595	CCTT	2	8	34796	34803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015595	AAGC	2	8	34824	34831	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015595	TGGG	2	8	39030	39037	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015595	TGTT	2	8	41759	41766	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015595	ACCA	2	8	41768	41775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015595	CATA	2	8	43051	43058	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015595	AGAA	2	8	43064	43071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015595	GCGA	2	8	48477	48484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015595	GGCA	2	8	48579	48586	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015595	GGGA	2	8	50096	50103	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015595	GCCG	2	8	54428	54435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015595	CGCC	2	8	56517	56524	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_015595	GCCG	2	8	62404	62411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015595	TGGG	2	8	63336	63343	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015595	GCCG	2	8	63396	63403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015595	TGGA	2	8	64549	64556	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015595	GGCA	2	8	64559	64566	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015595	CCGG	2	8	64744	64751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015595	CCCG	2	8	66164	66171	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_015595	GCCC	2	8	66777	66784	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_015595	CGAT	2	8	68936	68943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015595	GCCG	2	8	70729	70736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015595	CGAG	2	8	72791	72798	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015595	CGGC	2	8	76667	76674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015595	GTGG	2	8	85921	85928	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015595	CAGG	2	8	85987	85994	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015595	CGAT	2	8	97312	97319	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015595	AGGC	2	8	97441	97448	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015595	CGCC	2	8	101602	101609	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_015595	GCAT	2	8	101694	101701	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015595	GATC	2	8	101891	101898	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015595	GATG	2	8	107153	107160	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015595	CGAA	2	8	111664	111671	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015595	CCGG	2	8	112191	112198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015595	GCCG	2	8	112207	112214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015595	GAGC	2	8	115362	115369	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015595	GTAG	2	8	116438	116445	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015595	TAAG	2	8	123645	123652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.