MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 plasmid pSPHCH01

Total Repeats: 1980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015595	TCG	2	6	13	18	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015595	CTC	2	6	160	165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015595	GAA	2	6	225	230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015595	CGC	2	6	237	242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015595	GCG	2	6	250	255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015595	TCT	2	6	340	345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334346523
7	NC_015595	GGC	2	6	347	352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346523
8	NC_015595	GCA	2	6	380	385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346523
9	NC_015595	CGA	2	6	428	433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346523
10	NC_015595	CCA	2	6	435	440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334346523
11	NC_015595	CTG	2	6	467	472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346523
12	NC_015595	CAT	2	6	509	514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346523
13	NC_015595	CTG	2	6	527	532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346523
14	NC_015595	CTG	2	6	551	556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346523
15	NC_015595	GCG	2	6	606	611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346523
16	NC_015595	ATG	2	6	711	716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015595	CCG	2	6	931	936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015595	CGG	2	6	943	948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015595	CGC	2	6	1073	1078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346524
20	NC_015595	GCA	2	6	1207	1212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346524
21	NC_015595	ACG	2	6	1267	1272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346524
22	NC_015595	GGC	2	6	1307	1312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346524
23	NC_015595	TCG	2	6	1347	1352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346524
24	NC_015595	TGC	3	9	1392	1400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346524
25	NC_015595	CGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346524
26	NC_015595	CGG	3	9	1426	1434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346524
27	NC_015595	ATC	2	6	1473	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346524
28	NC_015595	CGG	2	6	1521	1526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346525
29	NC_015595	CGC	2	6	1555	1560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346525
30	NC_015595	TCC	2	6	1589	1594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346525
31	NC_015595	TCG	2	6	1679	1684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346525
32	NC_015595	TGC	2	6	1752	1757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346525
33	NC_015595	GAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334346525
34	NC_015595	TTG	2	6	1959	1964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334346526
35	NC_015595	GCG	2	6	2065	2070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346526
36	NC_015595	GCC	2	6	2275	2280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346526
37	NC_015595	GAT	2	6	2318	2323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346526
38	NC_015595	AGG	2	6	2353	2358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334346526
39	NC_015595	CCA	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334346526
40	NC_015595	CAG	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346526
41	NC_015595	CGC	2	6	2671	2676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346527
42	NC_015595	AGC	2	6	2693	2698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346527
43	NC_015595	CAG	2	6	2716	2721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346527
44	NC_015595	GCG	2	6	2804	2809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346527
45	NC_015595	CGA	2	6	2856	2861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346527
46	NC_015595	GCG	2	6	2886	2891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346527
47	NC_015595	GCC	2	6	2918	2923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346527
48	NC_015595	CTC	2	6	2926	2931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346527
49	NC_015595	GGC	2	6	2938	2943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346527
50	NC_015595	TGA	2	6	3024	3029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346527
51	NC_015595	TCA	2	6	3033	3038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346527
52	NC_015595	AGG	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334346527
53	NC_015595	GCG	2	6	3086	3091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346527
54	NC_015595	GAC	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346527
55	NC_015595	CAG	2	6	3223	3228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346527
56	NC_015595	GAT	2	6	3253	3258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346527
57	NC_015595	CCG	2	6	3260	3265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346527
58	NC_015595	CAG	3	9	3319	3327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346527
59	NC_015595	CAG	2	6	3337	3342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346527
60	NC_015595	GCG	2	6	3389	3394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346528
61	NC_015595	CGG	2	6	3443	3448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346528
62	NC_015595	GCA	2	6	3488	3493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346528
63	NC_015595	GCC	2	6	3562	3567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346528
64	NC_015595	GCC	2	6	3595	3600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346528
65	NC_015595	CGC	2	6	3779	3784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346528
66	NC_015595	CAT	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346528
67	NC_015595	CGG	2	6	3804	3809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346528
68	NC_015595	ATC	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346528
69	NC_015595	CGA	2	6	3926	3931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346528
70	NC_015595	TCG	2	6	3970	3975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346528
71	NC_015595	AGA	4	12	4010	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334346528
72	NC_015595	GCA	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346528
73	NC_015595	CAT	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346528
74	NC_015595	CAG	2	6	4161	4166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346528
75	NC_015595	TCG	2	6	4168	4173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346528
76	NC_015595	CGA	2	6	4175	4180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346528
77	NC_015595	CTC	2	6	4215	4220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346528
78	NC_015595	CGG	2	6	4361	4366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346528
79	NC_015595	CCG	2	6	4600	4605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346528
80	NC_015595	CCG	2	6	4620	4625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346528
81	NC_015595	AGG	2	6	4687	4692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334346528
82	NC_015595	GGC	2	6	4789	4794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346528
83	NC_015595	GCG	2	6	4819	4824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346528
84	NC_015595	GGC	2	6	4917	4922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346528
85	NC_015595	ATC	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346528
86	NC_015595	AGC	2	6	5011	5016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346528
87	NC_015595	CAT	2	6	5088	5093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346528
88	NC_015595	TCA	2	6	5099	5104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346528
89	NC_015595	CGA	2	6	5118	5123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346528
90	NC_015595	ATG	2	6	5175	5180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346528
91	NC_015595	CGC	2	6	5327	5332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346529
92	NC_015595	GGC	2	6	5501	5506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346529
93	NC_015595	CGC	2	6	5516	5521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346529
94	NC_015595	GGC	2	6	5523	5528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346529
95	NC_015595	CCG	2	6	5586	5591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346529
96	NC_015595	TTC	2	6	5607	5612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334346529
97	NC_015595	GCG	2	6	5775	5780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346530
98	NC_015595	AGC	2	6	5864	5869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346530
99	NC_015595	TTC	2	6	5900	5905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334346530
100	NC_015595	GTG	2	6	5927	5932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334346531
101	NC_015595	TGC	2	6	5968	5973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346531
102	NC_015595	CCG	2	6	5982	5987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346531
103	NC_015595	TCG	2	6	6043	6048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346531
104	NC_015595	GCA	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346531
105	NC_015595	CAG	2	6	6174	6179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346531
106	NC_015595	CGT	2	6	6254	6259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346531
107	NC_015595	GCA	2	6	6296	6301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346531
108	NC_015595	ATA	2	6	6315	6320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334346531
109	NC_015595	TCG	2	6	6458	6463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015595	CGG	2	6	6465	6470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015595	GCC	2	6	6504	6509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015595	CGA	2	6	6541	6546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346532
113	NC_015595	CGA	2	6	6628	6633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346532
114	NC_015595	ACG	2	6	6684	6689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346532
115	NC_015595	GAC	2	6	6743	6748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346532
116	NC_015595	TGC	2	6	6757	6762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346532
117	NC_015595	CGA	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346532
118	NC_015595	GCA	2	6	6828	6833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346532
119	NC_015595	CCT	2	6	6886	6891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_015595	TCT	2	6	6998	7003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015595	CCT	2	6	7141	7146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346533
122	NC_015595	GGC	2	6	7189	7194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346533
123	NC_015595	GGC	2	6	7213	7218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346533
124	NC_015595	GAT	2	6	7261	7266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346533
125	NC_015595	AGC	3	9	7272	7280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346533
126	NC_015595	CGC	2	6	7327	7332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346533
127	NC_015595	GGC	2	6	7373	7378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346533
128	NC_015595	ACG	2	6	7398	7403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346533
129	NC_015595	GAC	2	6	7417	7422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346533
130	NC_015595	TCC	2	6	7465	7470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346533
131	NC_015595	CTT	2	6	7538	7543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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141	NC_015595	GAT	2	6	7875	7880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_015595	GCG	2	6	14206	14211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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255	NC_015595	GCC	2	6	14364	14369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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258	NC_015595	GCA	2	6	14564	14569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346539
259	NC_015595	GGT	2	6	14570	14575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334346539
260	NC_015595	TGC	2	6	14778	14783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346539
261	NC_015595	CCG	2	6	14788	14793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346539
262	NC_015595	ATC	2	6	14799	14804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346539
263	NC_015595	GCA	2	6	14815	14820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346539
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265	NC_015595	GCC	2	6	14894	14899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346539
266	NC_015595	CGG	2	6	15050	15055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346539
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270	NC_015595	CGA	2	6	15122	15127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346539
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274	NC_015595	GCC	2	6	15519	15524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346539
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278	NC_015595	GGC	2	6	16165	16170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346540
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282	NC_015595	AGC	2	6	16451	16456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346541
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285	NC_015595	ATC	2	6	16823	16828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346541
286	NC_015595	TGC	2	6	16872	16877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346541
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288	NC_015595	GCT	2	6	17130	17135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346542
289	NC_015595	CGA	2	6	17319	17324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346542
290	NC_015595	CTC	2	6	17329	17334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346542
291	NC_015595	GGC	2	6	17457	17462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346542
292	NC_015595	CGC	2	6	17506	17511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346542
293	NC_015595	CTC	2	6	17532	17537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346542
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303	NC_015595	GGC	2	6	18294	18299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346542
304	NC_015595	TGC	2	6	18308	18313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346542
305	NC_015595	CCG	2	6	18334	18339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346542
306	NC_015595	GCG	2	6	18395	18400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346542
307	NC_015595	ACC	2	6	18401	18406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334346542
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311	NC_015595	ATC	2	6	18655	18660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346542
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325	NC_015595	TTC	2	6	19526	19531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334346542
326	NC_015595	CAA	2	6	19665	19670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334346542
327	NC_015595	CAC	2	6	19681	19686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334346542
328	NC_015595	CCG	2	6	19713	19718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346542
329	NC_015595	CGC	2	6	19782	19787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346542
330	NC_015595	CAT	3	9	19788	19796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346542
331	NC_015595	GTC	2	6	19825	19830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346542
332	NC_015595	GCC	2	6	19840	19845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346542
333	NC_015595	GCG	2	6	19993	19998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
334	NC_015595	CTT	2	6	20052	20057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
335	NC_015595	GAT	2	6	20165	20170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346543
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340	NC_015595	GCG	2	6	20479	20484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346543
341	NC_015595	TCG	2	6	20553	20558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346543
342	NC_015595	CGT	2	6	20617	20622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346543
343	NC_015595	TGA	2	6	20659	20664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346543
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376	NC_015595	CCT	2	6	22989	22994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346544
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378	NC_015595	GCG	2	6	23174	23179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346544
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