MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 plasmid pSPHCH01

Total Repeats: 1841

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015595	TCT	2	6	340	345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334346523
2	NC_015595	GGC	2	6	347	352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346523
3	NC_015595	GCA	2	6	380	385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346523
4	NC_015595	CGA	2	6	428	433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346523
5	NC_015595	CCA	2	6	435	440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334346523
6	NC_015595	CTG	2	6	467	472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346523
7	NC_015595	CAT	2	6	509	514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346523
8	NC_015595	CTG	2	6	527	532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346523
9	NC_015595	CTG	2	6	551	556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346523
10	NC_015595	GCG	2	6	606	611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346523
11	NC_015595	CGC	2	6	1073	1078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346524
12	NC_015595	GCA	2	6	1207	1212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346524
13	NC_015595	ACG	2	6	1267	1272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346524
14	NC_015595	GGC	2	6	1307	1312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346524
15	NC_015595	TCG	2	6	1347	1352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346524
16	NC_015595	TGC	3	9	1392	1400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346524
17	NC_015595	CGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346524
18	NC_015595	CGG	3	9	1426	1434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346524
19	NC_015595	ATC	2	6	1473	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346524
20	NC_015595	CGG	2	6	1521	1526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346525
21	NC_015595	CGC	2	6	1555	1560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346525
22	NC_015595	TCC	2	6	1589	1594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346525
23	NC_015595	TCG	2	6	1679	1684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346525
24	NC_015595	TGC	2	6	1752	1757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346525
25	NC_015595	GAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334346525
26	NC_015595	TTG	2	6	1959	1964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334346526
27	NC_015595	GCG	2	6	2065	2070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346526
28	NC_015595	GCC	2	6	2275	2280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346526
29	NC_015595	GAT	2	6	2318	2323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346526
30	NC_015595	AGG	2	6	2353	2358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334346526
31	NC_015595	CCA	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334346526
32	NC_015595	CAG	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346526
33	NC_015595	CGC	2	6	2671	2676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346527
34	NC_015595	AGC	2	6	2693	2698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346527
35	NC_015595	CAG	2	6	2716	2721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346527
36	NC_015595	GCG	2	6	2804	2809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346527
37	NC_015595	CGA	2	6	2856	2861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346527
38	NC_015595	GCG	2	6	2886	2891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346527
39	NC_015595	GCC	2	6	2918	2923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346527
40	NC_015595	CTC	2	6	2926	2931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346527
41	NC_015595	GGC	2	6	2938	2943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346527
42	NC_015595	TGA	2	6	3024	3029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346527
43	NC_015595	TCA	2	6	3033	3038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346527
44	NC_015595	AGG	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334346527
45	NC_015595	GCG	2	6	3086	3091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346527
46	NC_015595	GAC	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346527
47	NC_015595	CAG	2	6	3223	3228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346527
48	NC_015595	GAT	2	6	3253	3258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346527
49	NC_015595	CCG	2	6	3260	3265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346527
50	NC_015595	CAG	3	9	3319	3327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346527
51	NC_015595	CAG	2	6	3337	3342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346527
52	NC_015595	GCG	2	6	3389	3394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346528
53	NC_015595	CGG	2	6	3443	3448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346528
54	NC_015595	GCA	2	6	3488	3493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346528
55	NC_015595	GCC	2	6	3562	3567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346528
56	NC_015595	GCC	2	6	3595	3600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346528
57	NC_015595	CGC	2	6	3779	3784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346528
58	NC_015595	CAT	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346528
59	NC_015595	CGG	2	6	3804	3809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346528
60	NC_015595	ATC	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346528
61	NC_015595	CGA	2	6	3926	3931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346528
62	NC_015595	TCG	2	6	3970	3975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346528
63	NC_015595	AGA	4	12	4010	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334346528
64	NC_015595	GCA	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346528
65	NC_015595	CAT	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346528
66	NC_015595	CAG	2	6	4161	4166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346528
67	NC_015595	TCG	2	6	4168	4173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346528
68	NC_015595	CGA	2	6	4175	4180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346528
69	NC_015595	CTC	2	6	4215	4220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346528
70	NC_015595	CGG	2	6	4361	4366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346528
71	NC_015595	CCG	2	6	4600	4605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346528
72	NC_015595	CCG	2	6	4620	4625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346528
73	NC_015595	AGG	2	6	4687	4692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334346528
74	NC_015595	GGC	2	6	4789	4794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346528
75	NC_015595	GCG	2	6	4819	4824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346528
76	NC_015595	GGC	2	6	4917	4922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346528
77	NC_015595	ATC	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346528
78	NC_015595	AGC	2	6	5011	5016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346528
79	NC_015595	CAT	2	6	5088	5093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346528
80	NC_015595	TCA	2	6	5099	5104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334346528
81	NC_015595	CGA	2	6	5118	5123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346528
82	NC_015595	ATG	2	6	5175	5180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346528
83	NC_015595	CGC	2	6	5327	5332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346529
84	NC_015595	GGC	2	6	5501	5506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346529
85	NC_015595	CGC	2	6	5516	5521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346529
86	NC_015595	GGC	2	6	5523	5528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346529
87	NC_015595	CCG	2	6	5586	5591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346529
88	NC_015595	TTC	2	6	5607	5612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334346529
89	NC_015595	GCG	2	6	5775	5780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346530
90	NC_015595	AGC	2	6	5864	5869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346530
91	NC_015595	TTC	2	6	5900	5905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334346530
92	NC_015595	GTG	2	6	5927	5932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334346531
93	NC_015595	TGC	2	6	5968	5973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346531
94	NC_015595	CCG	2	6	5982	5987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346531
95	NC_015595	TCG	2	6	6043	6048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346531
96	NC_015595	GCA	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346531
97	NC_015595	CAG	2	6	6174	6179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346531
98	NC_015595	CGT	2	6	6254	6259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346531
99	NC_015595	GCA	2	6	6296	6301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346531
100	NC_015595	ATA	2	6	6315	6320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334346531
101	NC_015595	CGA	2	6	6541	6546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346532
102	NC_015595	CGA	2	6	6628	6633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346532
103	NC_015595	ACG	2	6	6684	6689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346532
104	NC_015595	GAC	2	6	6743	6748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346532
105	NC_015595	TGC	2	6	6757	6762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346532
106	NC_015595	CGA	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346532
107	NC_015595	GCA	2	6	6828	6833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346532
108	NC_015595	CCT	2	6	7141	7146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346533
109	NC_015595	GGC	2	6	7189	7194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346533
110	NC_015595	GGC	2	6	7213	7218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346533
111	NC_015595	GAT	2	6	7261	7266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346533
112	NC_015595	AGC	3	9	7272	7280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346533
113	NC_015595	CGC	2	6	7327	7332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346533
114	NC_015595	GGC	2	6	7373	7378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346533
115	NC_015595	ACG	2	6	7398	7403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346533
116	NC_015595	GAC	2	6	7417	7422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346533
117	NC_015595	TCC	2	6	7465	7470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334346533
118	NC_015595	TGA	2	6	7562	7567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346534
119	NC_015595	GCC	2	6	7582	7587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346534
120	NC_015595	GGC	2	6	7593	7598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346534
121	NC_015595	CGC	2	6	7608	7613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346534
122	NC_015595	CGC	2	6	7643	7648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346534
123	NC_015595	GAT	2	6	7761	7766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334346534
124	NC_015595	GCC	2	6	7777	7782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346534
125	NC_015595	GCG	2	6	7793	7798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346534
126	NC_015595	GCC	2	6	8011	8016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346535
127	NC_015595	GGC	2	6	8043	8048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346535
128	NC_015595	CGG	2	6	8069	8074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346535
129	NC_015595	CGA	2	6	8180	8185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346535
130	NC_015595	TAT	2	6	8332	8337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334346535
131	NC_015595	CGA	2	6	8382	8387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346535
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133	NC_015595	CGC	2	6	8466	8471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346535
134	NC_015595	CGC	2	6	8482	8487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346535
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249	NC_015595	CGG	2	6	15115	15120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346539
250	NC_015595	CGA	2	6	15122	15127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334346539
251	NC_015595	GCC	2	6	15183	15188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346539
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253	NC_015595	CGC	3	9	15425	15433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346539
254	NC_015595	GCC	2	6	15519	15524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346539
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258	NC_015595	GGC	2	6	16165	16170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334346540
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498	NC_015595	GCC	2	6	30683	30688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346552
499	NC_015595	CGC	2	6	30703	30708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334346552
500	NC_015595	CGT	2	6	30715	30720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334346552

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