MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME02

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015592	GCGGA	2	10	9946	9955	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015592	CCGCA	2	10	12766	12775	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_015592	CTGAC	2	10	12948	12957	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015592	ATCGC	2	10	31455	31464	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015592	CGACC	2	10	31997	32006	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_015592	CCGGC	2	10	32688	32697	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_015592	CTTCT	2	10	39661	39670	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015592	CGCGC	2	10	41764	41773	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_015592	GGCAC	2	10	45841	45850	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_015592	GGGCA	2	10	46680	46689	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015592	GAGGG	2	10	48035	48044	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015592	ACGGA	2	10	48932	48941	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015592	TCATT	2	10	60312	60321	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015592	CAACA	2	10	60677	60686	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015592	GCGTG	2	10	62780	62789	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015592	TCCTT	2	10	64095	64104	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_015592	CGCAG	2	10	64203	64212	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015592	ATTCT	2	10	65276	65285	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015592	CGTCA	2	10	66981	66990	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.