MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME02

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015592	GCGCG	2	10	3049	3058	0 %	0 %	60 %	40 %	334321159
2	NC_015592	TGATC	2	10	11481	11490	20 %	40 %	20 %	20 %	334321163
3	NC_015592	CAGAA	2	10	15658	15667	60 %	0 %	20 %	20 %	334321167
4	NC_015592	GGAAT	2	10	18911	18920	40 %	20 %	40 %	0 %	334321169
5	NC_015592	ACCCA	2	10	19135	19144	40 %	0 %	0 %	60 %	334321169
6	NC_015592	CTTCG	2	10	19163	19172	0 %	40 %	20 %	40 %	334321169
7	NC_015592	CATGA	2	10	19274	19283	40 %	20 %	20 %	20 %	334321170
8	NC_015592	AGCGC	2	10	19762	19771	20 %	0 %	40 %	40 %	334321170
9	NC_015592	TGGGA	2	10	20925	20934	20 %	20 %	60 %	0 %	334321171
10	NC_015592	GCAAG	2	10	27395	27404	40 %	0 %	40 %	20 %	334321176
11	NC_015592	TCGCC	2	10	28126	28135	0 %	20 %	20 %	60 %	334321177
12	NC_015592	CGCAT	2	10	30352	30361	20 %	20 %	20 %	40 %	334321179
13	NC_015592	ACGCA	2	10	31038	31047	40 %	0 %	20 %	40 %	334321179
14	NC_015592	CATTT	2	10	33430	33439	20 %	60 %	0 %	20 %	334321180
15	NC_015592	TCCTG	2	10	35026	35035	0 %	40 %	20 %	40 %	334321181
16	NC_015592	CCGCG	2	10	35888	35897	0 %	0 %	40 %	60 %	334321181
17	NC_015592	GCGCC	2	10	36467	36476	0 %	0 %	40 %	60 %	334321181
18	NC_015592	CATTC	2	10	38613	38622	20 %	40 %	0 %	40 %	334321183
19	NC_015592	TCCCC	2	10	43530	43539	0 %	20 %	0 %	80 %	334321188
20	NC_015592	CCGAT	2	10	43911	43920	20 %	20 %	20 %	40 %	334321188
21	NC_015592	GGGGA	2	10	44684	44693	20 %	0 %	80 %	0 %	334321189
22	NC_015592	AAGCA	2	10	51285	51294	60 %	0 %	20 %	20 %	334321193
23	NC_015592	TGAAC	2	10	51970	51979	40 %	20 %	20 %	20 %	334321194
24	NC_015592	GCCGC	2	10	52050	52059	0 %	0 %	40 %	60 %	334321194
25	NC_015592	TCCGA	2	10	52319	52328	20 %	20 %	20 %	40 %	334321194
26	NC_015592	GCGCA	2	10	52412	52421	20 %	0 %	40 %	40 %	334321194
27	NC_015592	GGCGT	2	10	52880	52889	0 %	20 %	60 %	20 %	334321194
28	NC_015592	ATGCC	2	10	54022	54031	20 %	20 %	20 %	40 %	334321194
29	NC_015592	TTGTC	2	10	54681	54690	0 %	60 %	20 %	20 %	334321195
30	NC_015592	TGGCC	2	10	56977	56986	0 %	20 %	40 %	40 %	334321198
31	NC_015592	CGATG	2	10	61125	61134	20 %	20 %	40 %	20 %	334321205

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.