MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME02

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015592	GGCG	2	8	1457	1464	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015592	GATG	2	8	1485	1492	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015592	GAAG	2	8	3518	3525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015592	GAGG	2	8	3729	3736	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015592	GAGC	2	8	4328	4335	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015592	TTCG	2	8	7138	7145	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015592	CCCG	2	8	7758	7765	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_015592	GCCG	2	8	9145	9152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015592	GAAC	2	8	10028	10035	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015592	GCCT	2	8	10486	10493	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015592	GGAT	2	8	12651	12658	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015592	GGCT	2	8	12690	12697	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015592	GGAG	2	8	22148	22155	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015592	CGGA	2	8	22529	22536	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015592	CTGG	2	8	22609	22616	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015592	TTAC	2	8	32057	32064	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015592	ACAG	2	8	32210	32217	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015592	CCTG	2	8	33281	33288	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015592	GCCG	2	8	40099	40106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015592	GGCC	2	8	40203	40210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015592	CCTC	2	8	40653	40660	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_015592	CAGC	2	8	40927	40934	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015592	CCGG	2	8	40941	40948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015592	TGCC	2	8	41540	41547	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015592	TGAA	2	8	41605	41612	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015592	GTCG	2	8	42175	42182	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015592	CCTT	2	8	42305	42312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015592	CCAG	2	8	42368	42375	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015592	CCGA	2	8	42401	42408	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015592	CGAC	2	8	42461	42468	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015592	CCGC	2	8	44328	44335	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_015592	TTTC	2	8	45395	45402	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015592	CGGG	2	8	45713	45720	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015592	CCGA	2	8	45727	45734	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015592	GAAC	2	8	46765	46772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015592	TCGG	2	8	47014	47021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015592	GATG	2	8	47036	47043	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015592	CCAC	2	8	47090	47097	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_015592	CCTT	2	8	48828	48835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015592	AGCG	2	8	49483	49490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015592	CGCC	2	8	49825	49832	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_015592	CATG	2	8	50145	50152	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015592	AGCT	2	8	55591	55598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015592	CGGA	2	8	55643	55650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015592	GCGA	2	8	55970	55977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015592	GAAG	2	8	56015	56022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015592	AGGC	2	8	56682	56689	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015592	GCGT	2	8	57414	57421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015592	AACG	2	8	57888	57895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015592	GCCA	2	8	60791	60798	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015592	CAAT	2	8	60884	60891	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015592	CCAG	2	8	62421	62428	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015592	CCGC	2	8	62990	62997	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_015592	CCTT	2	8	63058	63065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015592	GGCA	2	8	63236	63243	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015592	GGCC	2	8	65201	65208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015592	ACGA	2	8	65994	66001	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015592	CCAG	2	8	66958	66965	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015592	TGCC	2	8	67112	67119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015592	CGCT	2	8	67171	67178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015592	ACAA	2	8	68162	68169	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015592	CTCC	2	8	68932	68939	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.