MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME02

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015592	CT	3	6	108	113	0 %	50 %	0 %	50 %	334321157
2	NC_015592	CG	3	6	322	327	0 %	0 %	50 %	50 %	334321157
3	NC_015592	AG	3	6	1061	1066	50 %	0 %	50 %	0 %	334321158
4	NC_015592	AT	3	6	1754	1759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015592	CT	3	6	1941	1946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015592	CT	4	8	2113	2120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015592	GT	3	6	2143	2148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015592	CG	3	6	3583	3588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015592	GC	3	6	4145	4150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015592	CG	3	6	4341	4346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015592	AC	3	6	4555	4560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015592	GA	3	6	4814	4819	50 %	0 %	50 %	0 %	334321160
13	NC_015592	GC	3	6	5160	5165	0 %	0 %	50 %	50 %	334321160
14	NC_015592	GC	3	6	6702	6707	0 %	0 %	50 %	50 %	334321161
15	NC_015592	CG	3	6	6954	6959	0 %	0 %	50 %	50 %	334321161
16	NC_015592	TC	3	6	7551	7556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015592	CT	3	6	7575	7580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015592	CT	3	6	7928	7933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015592	GA	3	6	7997	8002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015592	CG	3	6	8582	8587	0 %	0 %	50 %	50 %	334321162
21	NC_015592	CG	3	6	9053	9058	0 %	0 %	50 %	50 %	334321162
22	NC_015592	CG	3	6	9151	9156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015592	GT	3	6	9765	9770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015592	GA	3	6	9970	9975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015592	TC	3	6	10341	10346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015592	GC	3	6	10951	10956	0 %	0 %	50 %	50 %	334321163
27	NC_015592	CG	3	6	11961	11966	0 %	0 %	50 %	50 %	334321163
28	NC_015592	GC	3	6	12021	12026	0 %	0 %	50 %	50 %	334321163
29	NC_015592	GC	4	8	12144	12151	0 %	0 %	50 %	50 %	334321163
30	NC_015592	CG	3	6	12619	12624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015592	GA	3	6	14181	14186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015592	GT	3	6	14783	14788	0 %	50 %	50 %	0 %	334321166
33	NC_015592	CT	3	6	15769	15774	0 %	50 %	0 %	50 %	334321167
34	NC_015592	AT	3	6	16537	16542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015592	AG	3	6	16890	16895	50 %	0 %	50 %	0 %	334321168
36	NC_015592	TC	3	6	18412	18417	0 %	50 %	0 %	50 %	334321169
37	NC_015592	GA	3	6	18529	18534	50 %	0 %	50 %	0 %	334321169
38	NC_015592	TC	3	6	20391	20396	0 %	50 %	0 %	50 %	334321171
39	NC_015592	GC	3	6	20722	20727	0 %	0 %	50 %	50 %	334321171
40	NC_015592	GC	3	6	21270	21275	0 %	0 %	50 %	50 %	334321172
41	NC_015592	CG	3	6	21614	21619	0 %	0 %	50 %	50 %	334321172
42	NC_015592	AG	3	6	22025	22030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015592	GC	3	6	22312	22317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015592	GC	3	6	22686	22691	0 %	0 %	50 %	50 %	334321173
45	NC_015592	AT	3	6	22768	22773	50 %	50 %	0 %	0 %	334321173
46	NC_015592	GA	3	6	22848	22853	50 %	0 %	50 %	0 %	334321173
47	NC_015592	GT	3	6	23024	23029	0 %	50 %	50 %	0 %	334321173
48	NC_015592	CG	3	6	23355	23360	0 %	0 %	50 %	50 %	334321173
49	NC_015592	TC	3	6	23873	23878	0 %	50 %	0 %	50 %	334321173
50	NC_015592	CG	3	6	24127	24132	0 %	0 %	50 %	50 %	334321173
51	NC_015592	AT	3	6	24164	24169	50 %	50 %	0 %	0 %	334321173
52	NC_015592	TG	3	6	24259	24264	0 %	50 %	50 %	0 %	334321173
53	NC_015592	GT	3	6	25483	25488	0 %	50 %	50 %	0 %	334321174
54	NC_015592	AC	3	6	25678	25683	50 %	0 %	0 %	50 %	334321174
55	NC_015592	AG	3	6	25820	25825	50 %	0 %	50 %	0 %	334321174
56	NC_015592	AG	3	6	25851	25856	50 %	0 %	50 %	0 %	334321174
57	NC_015592	CA	3	6	26402	26407	50 %	0 %	0 %	50 %	334321174
58	NC_015592	CG	4	8	27212	27219	0 %	0 %	50 %	50 %	334321175
59	NC_015592	CG	3	6	28081	28086	0 %	0 %	50 %	50 %	334321176
60	NC_015592	GC	4	8	29577	29584	0 %	0 %	50 %	50 %	334321178
61	NC_015592	CG	3	6	29641	29646	0 %	0 %	50 %	50 %	334321178
62	NC_015592	CG	3	6	30078	30083	0 %	0 %	50 %	50 %	334321178
63	NC_015592	GC	3	6	30553	30558	0 %	0 %	50 %	50 %	334321179
64	NC_015592	CG	3	6	30604	30609	0 %	0 %	50 %	50 %	334321179
65	NC_015592	GA	3	6	31286	31291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015592	AT	3	6	31322	31327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015592	TA	3	6	31342	31347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015592	AT	3	6	31355	31360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015592	TA	3	6	31362	31367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015592	CG	3	6	31744	31749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015592	CG	4	8	31757	31764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015592	TC	3	6	32033	32038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015592	GC	4	8	32487	32494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015592	CG	3	6	32707	32712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015592	GC	4	8	34612	34619	0 %	0 %	50 %	50 %	334321181
76	NC_015592	CT	3	6	34702	34707	0 %	50 %	0 %	50 %	334321181
77	NC_015592	CT	3	6	34814	34819	0 %	50 %	0 %	50 %	334321181
78	NC_015592	GC	3	6	35344	35349	0 %	0 %	50 %	50 %	334321181
79	NC_015592	GC	3	6	36039	36044	0 %	0 %	50 %	50 %	334321181
80	NC_015592	CG	3	6	36509	36514	0 %	0 %	50 %	50 %	334321181
81	NC_015592	CG	3	6	36770	36775	0 %	0 %	50 %	50 %	334321181
82	NC_015592	CG	3	6	37037	37042	0 %	0 %	50 %	50 %	334321181
83	NC_015592	CG	3	6	37495	37500	0 %	0 %	50 %	50 %	334321181
84	NC_015592	AC	3	6	38455	38460	50 %	0 %	0 %	50 %	334321183
85	NC_015592	CG	4	8	39050	39057	0 %	0 %	50 %	50 %	334321183
86	NC_015592	GC	3	6	39061	39066	0 %	0 %	50 %	50 %	334321183
87	NC_015592	GC	3	6	39354	39359	0 %	0 %	50 %	50 %	334321184
88	NC_015592	CG	3	6	39450	39455	0 %	0 %	50 %	50 %	334321184
89	NC_015592	CG	3	6	39590	39595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015592	GC	3	6	40681	40686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015592	GC	3	6	40750	40755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015592	CG	3	6	40892	40897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015592	CG	4	8	41872	41879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015592	GC	3	6	42080	42085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015592	GA	3	6	42330	42335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015592	CG	3	6	42418	42423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015592	CT	3	6	42712	42717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015592	GC	3	6	43501	43506	0 %	0 %	50 %	50 %	334321187
99	NC_015592	CG	3	6	43896	43901	0 %	0 %	50 %	50 %	334321188
100	NC_015592	TC	3	6	44338	44343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015592	CG	5	10	45103	45112	0 %	0 %	50 %	50 %	334321189
102	NC_015592	GA	3	6	45368	45373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015592	GC	3	6	45437	45442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015592	TC	3	6	45698	45703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015592	GC	3	6	46956	46961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015592	TG	3	6	47589	47594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015592	CG	3	6	48879	48884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015592	GA	3	6	48986	48991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015592	GA	3	6	49202	49207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015592	AG	3	6	49769	49774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015592	TG	4	8	49856	49863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015592	AG	4	8	49866	49873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015592	AC	3	6	50200	50205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015592	TC	4	8	51622	51629	0 %	50 %	0 %	50 %	334321193
115	NC_015592	TC	3	6	52973	52978	0 %	50 %	0 %	50 %	334321194
116	NC_015592	CG	3	6	53090	53095	0 %	0 %	50 %	50 %	334321194
117	NC_015592	CT	3	6	53204	53209	0 %	50 %	0 %	50 %	334321194
118	NC_015592	GC	3	6	54114	54119	0 %	0 %	50 %	50 %	334321195
119	NC_015592	GC	3	6	54397	54402	0 %	0 %	50 %	50 %	334321195
120	NC_015592	CG	3	6	55620	55625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015592	GA	3	6	55809	55814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015592	CG	3	6	56718	56723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015592	GT	3	6	57312	57317	0 %	50 %	50 %	0 %	334321199
124	NC_015592	GA	3	6	57328	57333	50 %	0 %	50 %	0 %	334321199
125	NC_015592	GC	3	6	57439	57444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015592	GA	3	6	57844	57849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015592	GC	4	8	60053	60060	0 %	0 %	50 %	50 %	334321204
128	NC_015592	GA	3	6	60288	60293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015592	CG	3	6	60596	60601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015592	GC	3	6	60629	60634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015592	CG	4	8	61170	61177	0 %	0 %	50 %	50 %	334321205
132	NC_015592	CG	3	6	61804	61809	0 %	0 %	50 %	50 %	334321205
133	NC_015592	CG	3	6	61938	61943	0 %	0 %	50 %	50 %	334321205
134	NC_015592	TA	3	6	62600	62605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015592	GC	3	6	63664	63669	0 %	0 %	50 %	50 %	334321206
136	NC_015592	CA	3	6	64081	64086	50 %	0 %	0 %	50 %	334321207
137	NC_015592	CA	3	6	64579	64584	50 %	0 %	0 %	50 %	334321208
138	NC_015592	GC	3	6	66166	66171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015592	CG	3	6	66420	66425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015592	GC	3	6	66868	66873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015592	CG	3	6	66934	66939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015592	GC	3	6	67232	67237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015592	CG	3	6	67366	67371	0 %	0 %	50 %	50 %	334321212
144	NC_015592	CG	3	6	68860	68865	0 %	0 %	50 %	50 %	334321213

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.