MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME02

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015592	CT	3	6	108	113	0 %	50 %	0 %	50 %	334321157
2	NC_015592	CG	3	6	322	327	0 %	0 %	50 %	50 %	334321157
3	NC_015592	AG	3	6	1061	1066	50 %	0 %	50 %	0 %	334321158
4	NC_015592	GA	3	6	4814	4819	50 %	0 %	50 %	0 %	334321160
5	NC_015592	GC	3	6	5160	5165	0 %	0 %	50 %	50 %	334321160
6	NC_015592	GC	3	6	6702	6707	0 %	0 %	50 %	50 %	334321161
7	NC_015592	CG	3	6	6954	6959	0 %	0 %	50 %	50 %	334321161
8	NC_015592	CG	3	6	8582	8587	0 %	0 %	50 %	50 %	334321162
9	NC_015592	CG	3	6	9053	9058	0 %	0 %	50 %	50 %	334321162
10	NC_015592	GC	3	6	10951	10956	0 %	0 %	50 %	50 %	334321163
11	NC_015592	CG	3	6	11961	11966	0 %	0 %	50 %	50 %	334321163
12	NC_015592	GC	3	6	12021	12026	0 %	0 %	50 %	50 %	334321163
13	NC_015592	GC	4	8	12144	12151	0 %	0 %	50 %	50 %	334321163
14	NC_015592	GT	3	6	14783	14788	0 %	50 %	50 %	0 %	334321166
15	NC_015592	CT	3	6	15769	15774	0 %	50 %	0 %	50 %	334321167
16	NC_015592	AG	3	6	16890	16895	50 %	0 %	50 %	0 %	334321168
17	NC_015592	TC	3	6	18412	18417	0 %	50 %	0 %	50 %	334321169
18	NC_015592	GA	3	6	18529	18534	50 %	0 %	50 %	0 %	334321169
19	NC_015592	TC	3	6	20391	20396	0 %	50 %	0 %	50 %	334321171
20	NC_015592	GC	3	6	20722	20727	0 %	0 %	50 %	50 %	334321171
21	NC_015592	GC	3	6	21270	21275	0 %	0 %	50 %	50 %	334321172
22	NC_015592	CG	3	6	21614	21619	0 %	0 %	50 %	50 %	334321172
23	NC_015592	GC	3	6	22686	22691	0 %	0 %	50 %	50 %	334321173
24	NC_015592	AT	3	6	22768	22773	50 %	50 %	0 %	0 %	334321173
25	NC_015592	GA	3	6	22848	22853	50 %	0 %	50 %	0 %	334321173
26	NC_015592	GT	3	6	23024	23029	0 %	50 %	50 %	0 %	334321173
27	NC_015592	CG	3	6	23355	23360	0 %	0 %	50 %	50 %	334321173
28	NC_015592	TC	3	6	23873	23878	0 %	50 %	0 %	50 %	334321173
29	NC_015592	CG	3	6	24127	24132	0 %	0 %	50 %	50 %	334321173
30	NC_015592	AT	3	6	24164	24169	50 %	50 %	0 %	0 %	334321173
31	NC_015592	TG	3	6	24259	24264	0 %	50 %	50 %	0 %	334321173
32	NC_015592	GT	3	6	25483	25488	0 %	50 %	50 %	0 %	334321174
33	NC_015592	AC	3	6	25678	25683	50 %	0 %	0 %	50 %	334321174
34	NC_015592	AG	3	6	25820	25825	50 %	0 %	50 %	0 %	334321174
35	NC_015592	AG	3	6	25851	25856	50 %	0 %	50 %	0 %	334321174
36	NC_015592	CA	3	6	26402	26407	50 %	0 %	0 %	50 %	334321174
37	NC_015592	CG	4	8	27212	27219	0 %	0 %	50 %	50 %	334321175
38	NC_015592	CG	3	6	28081	28086	0 %	0 %	50 %	50 %	334321176
39	NC_015592	GC	4	8	29577	29584	0 %	0 %	50 %	50 %	334321178
40	NC_015592	CG	3	6	29641	29646	0 %	0 %	50 %	50 %	334321178
41	NC_015592	CG	3	6	30078	30083	0 %	0 %	50 %	50 %	334321178
42	NC_015592	GC	3	6	30553	30558	0 %	0 %	50 %	50 %	334321179
43	NC_015592	CG	3	6	30604	30609	0 %	0 %	50 %	50 %	334321179
44	NC_015592	GC	4	8	34612	34619	0 %	0 %	50 %	50 %	334321181
45	NC_015592	CT	3	6	34702	34707	0 %	50 %	0 %	50 %	334321181
46	NC_015592	CT	3	6	34814	34819	0 %	50 %	0 %	50 %	334321181
47	NC_015592	GC	3	6	35344	35349	0 %	0 %	50 %	50 %	334321181
48	NC_015592	GC	3	6	36039	36044	0 %	0 %	50 %	50 %	334321181
49	NC_015592	CG	3	6	36509	36514	0 %	0 %	50 %	50 %	334321181
50	NC_015592	CG	3	6	36770	36775	0 %	0 %	50 %	50 %	334321181
51	NC_015592	CG	3	6	37037	37042	0 %	0 %	50 %	50 %	334321181
52	NC_015592	CG	3	6	37495	37500	0 %	0 %	50 %	50 %	334321181
53	NC_015592	AC	3	6	38455	38460	50 %	0 %	0 %	50 %	334321183
54	NC_015592	CG	4	8	39050	39057	0 %	0 %	50 %	50 %	334321183
55	NC_015592	GC	3	6	39061	39066	0 %	0 %	50 %	50 %	334321183
56	NC_015592	GC	3	6	39354	39359	0 %	0 %	50 %	50 %	334321184
57	NC_015592	CG	3	6	39450	39455	0 %	0 %	50 %	50 %	334321184
58	NC_015592	GC	3	6	43501	43506	0 %	0 %	50 %	50 %	334321187
59	NC_015592	CG	3	6	43896	43901	0 %	0 %	50 %	50 %	334321188
60	NC_015592	CG	5	10	45103	45112	0 %	0 %	50 %	50 %	334321189
61	NC_015592	TC	4	8	51622	51629	0 %	50 %	0 %	50 %	334321193
62	NC_015592	TC	3	6	52973	52978	0 %	50 %	0 %	50 %	334321194
63	NC_015592	CG	3	6	53090	53095	0 %	0 %	50 %	50 %	334321194
64	NC_015592	CT	3	6	53204	53209	0 %	50 %	0 %	50 %	334321194
65	NC_015592	GC	3	6	54114	54119	0 %	0 %	50 %	50 %	334321195
66	NC_015592	GC	3	6	54397	54402	0 %	0 %	50 %	50 %	334321195
67	NC_015592	GT	3	6	57312	57317	0 %	50 %	50 %	0 %	334321199
68	NC_015592	GA	3	6	57328	57333	50 %	0 %	50 %	0 %	334321199
69	NC_015592	GC	4	8	60053	60060	0 %	0 %	50 %	50 %	334321204
70	NC_015592	CG	4	8	61170	61177	0 %	0 %	50 %	50 %	334321205
71	NC_015592	CG	3	6	61804	61809	0 %	0 %	50 %	50 %	334321205
72	NC_015592	CG	3	6	61938	61943	0 %	0 %	50 %	50 %	334321205
73	NC_015592	GC	3	6	63664	63669	0 %	0 %	50 %	50 %	334321206
74	NC_015592	CA	3	6	64081	64086	50 %	0 %	0 %	50 %	334321207
75	NC_015592	CA	3	6	64579	64584	50 %	0 %	0 %	50 %	334321208
76	NC_015592	CG	3	6	67366	67371	0 %	0 %	50 %	50 %	334321212
77	NC_015592	CG	3	6	68860	68865	0 %	0 %	50 %	50 %	334321213

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.