MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 chromosome 3

Total Repeats: 964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015591	AGCC	2	8	8912	8919	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015591	CATC	2	8	9031	9038	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015591	TTGC	2	8	9107	9114	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015591	GATA	2	8	9124	9131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015591	CTGC	2	8	10852	10859	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015591	GCCT	2	8	11518	11525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015591	GGCC	2	8	11602	11609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015591	AACC	2	8	12241	12248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015591	GCGT	2	8	15076	15083	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015591	CATG	2	8	15637	15644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015591	GCCC	2	8	16091	16098	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_015591	CGTT	2	8	16101	16108	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015591	TCCC	2	8	16120	16127	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_015591	GACG	2	8	16627	16634	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015591	CGAT	2	8	17375	17382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015591	ATGT	2	8	18108	18115	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015591	CGAA	2	8	18821	18828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015591	CAGG	2	8	18997	19004	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015591	TGGC	2	8	19093	19100	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015591	GTAT	2	8	20180	20187	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015591	GGCC	2	8	21138	21145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015591	ATGA	2	8	22127	22134	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015591	GCTT	2	8	23863	23870	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015591	GATG	2	8	24881	24888	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015591	CCAA	2	8	26179	26186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015591	GACA	2	8	26392	26399	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015591	TTGA	2	8	28217	28224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015591	AACG	2	8	29692	29699	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015591	GGCT	2	8	33152	33159	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015591	GAAG	2	8	37384	37391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015591	TGCC	2	8	40173	40180	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015591	CGGG	2	8	40980	40987	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015591	CGAC	2	8	41691	41698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015591	CGTC	2	8	41961	41968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015591	ACAG	2	8	42748	42755	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015591	CAAG	2	8	48144	48151	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015591	GTTT	2	8	50981	50988	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015591	ATCG	2	8	52079	52086	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015591	GCCC	2	8	52087	52094	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_015591	CGTT	2	8	52237	52244	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015591	AGTG	2	8	52366	52373	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015591	GAAA	2	8	52616	52623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015591	GAAG	2	8	52900	52907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015591	CGGC	2	8	53477	53484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015591	TCGG	2	8	53594	53601	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015591	GGCC	2	8	53915	53922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015591	ACCA	2	8	54341	54348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015591	TCGG	2	8	60214	60221	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015591	CGAC	2	8	60493	60500	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015591	GCTG	2	8	60571	60578	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015591	TCCT	2	8	61047	61054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015591	CGCA	2	8	61805	61812	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015591	TTGC	2	8	61897	61904	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015591	GTCG	2	8	62084	62091	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015591	CCTG	2	8	62233	62240	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015591	GAGG	2	8	62475	62482	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015591	CCGG	2	8	64050	64057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015591	GCCC	2	8	67910	67917	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_015591	ATCA	2	8	68176	68183	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015591	GGCG	2	8	78380	78387	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015591	TCCC	2	8	85676	85683	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_015591	GTAA	2	8	86966	86973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015591	CTCA	2	8	89383	89390	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015591	TGAA	2	8	93449	93456	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015591	GCTG	2	8	94863	94870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015591	TGCA	2	8	96114	96121	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015591	GCAC	2	8	96356	96363	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015591	CAAC	2	8	97828	97835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015591	AAGT	2	8	100667	100674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015591	TGGG	2	8	101311	101318	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015591	AGGG	2	8	102160	102167	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015591	GGCC	2	8	102182	102189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015591	CCGG	2	8	104816	104823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015591	CCAA	2	8	107501	107508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015591	TGCC	2	8	108511	108518	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015591	TCGC	2	8	109292	109299	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015591	GATC	2	8	109474	109481	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015591	CGAT	2	8	117301	117308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015591	CGGC	2	8	117373	117380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015591	GGGC	2	8	118501	118508	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015591	CGCC	2	8	118886	118893	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_015591	TCCG	2	8	119671	119678	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015591	TCCC	2	8	120355	120362	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_015591	CATG	2	8	120374	120381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015591	GCGT	2	8	123674	123681	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015591	TTGG	2	8	129152	129159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015591	CGAG	2	8	130384	130391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015591	CGAG	3	12	131773	131784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015591	TAAA	2	8	136868	136875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015591	AATG	2	8	147145	147152	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015591	GCCT	2	8	148655	148662	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015591	GCGG	2	8	148741	148748	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015591	CGGG	2	8	148831	148838	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015591	GCTG	2	8	149253	149260	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015591	GTAA	2	8	151695	151702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015591	GTAG	2	8	153814	153821	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015591	TCCG	2	8	153934	153941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015591	GGCT	2	8	154955	154962	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015591	GCCC	2	8	154994	155001	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_015591	TCGC	2	8	156436	156443	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015591	CAAA	2	8	157331	157338	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015591	CGTT	2	8	157436	157443	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015591	TCCG	2	8	157491	157498	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015591	GCGT	2	8	157547	157554	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015591	AACT	2	8	157607	157614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015591	AGAA	2	8	157816	157823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015591	CCGG	2	8	159846	159853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015591	GACG	2	8	159881	159888	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015591	GCCC	2	8	160562	160569	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_015591	CGCA	2	8	166620	166627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015591	GCCG	2	8	167512	167519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015591	CCCT	2	8	176845	176852	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_015591	GATC	2	8	183885	183892	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015591	TGCA	2	8	193204	193211	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015591	CATC	2	8	193501	193508	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015591	CGAA	2	8	193911	193918	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015591	GCCG	2	8	194084	194091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015591	ACGA	2	8	194195	194202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015591	GGGC	2	8	194227	194234	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015591	CCCG	2	8	196336	196343	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_015591	CGGG	2	8	196351	196358	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015591	TGCC	2	8	196363	196370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015591	TCTT	2	8	197700	197707	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015591	AGTT	2	8	198037	198044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015591	GGCC	2	8	199069	199076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015591	GCTT	2	8	199446	199453	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015591	ATTG	2	8	201727	201734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015591	TGGT	2	8	201870	201877	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015591	CCGA	2	8	203044	203051	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015591	CCGA	2	8	203070	203077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015591	GCCG	2	8	203371	203378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015591	CACG	2	8	203408	203415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015591	GACT	2	8	205722	205729	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015591	GTGA	2	8	205759	205766	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015591	GATC	2	8	208504	208511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015591	CCCT	2	8	208568	208575	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_015591	GTAT	2	8	208655	208662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015591	GGCC	2	8	209613	209620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015591	ACCC	2	8	209986	209993	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_015591	TGGA	2	8	210280	210287	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015591	GGGT	2	8	210347	210354	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015591	TGTT	2	8	210507	210514	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015591	TTGC	2	8	210742	210749	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015591	CAGT	2	8	211068	211075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015591	CCGG	2	8	212060	212067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015591	TCGG	2	8	212152	212159	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015591	CCTT	2	8	213693	213700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015591	AAAG	2	8	223803	223810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015591	AGCG	2	8	223818	223825	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015591	CGGC	2	8	224109	224116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015591	GTCC	2	8	224873	224880	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_015591	AGGC	2	8	225296	225303	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_015591	CGTC	2	8	225392	225399	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_015591	AACG	2	8	229570	229577	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_015591	GCCG	2	8	230880	230887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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161	NC_015591	CCTA	2	8	251208	251215	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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163	NC_015591	TCCG	2	8	251505	251512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
164	NC_015591	CTTC	2	8	251522	251529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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170	NC_015591	CGGC	2	8	273558	273565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
171	NC_015591	CTTG	2	8	279801	279808	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
172	NC_015591	GCCT	2	8	280092	280099	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
173	NC_015591	GCCG	2	8	280673	280680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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234	NC_015591	GTAT	2	8	335145	335152	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_015591	ATCG	2	8	335979	335986	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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278	NC_015591	GACC	2	8	370468	370475	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
279	NC_015591	TCAG	2	8	370673	370680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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281	NC_015591	GCCC	2	8	373328	373335	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
282	NC_015591	CCAG	2	8	376036	376043	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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287	NC_015591	TCCG	2	8	380627	380634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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291	NC_015591	CGGG	2	8	382244	382251	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
292	NC_015591	AGTG	2	8	385097	385104	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015591	CGGG	2	8	385120	385127	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
294	NC_015591	TCGC	2	8	385443	385450	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
295	NC_015591	CCGA	3	12	385524	385535	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
296	NC_015591	TTCG	2	8	387266	387273	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
297	NC_015591	ATGC	2	8	387620	387627	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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299	NC_015591	CATT	2	8	388097	388104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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