MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 chromosome 1

Total Repeats: 1617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015590	TCCG	2	8	7312	7319	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015590	CCGC	2	8	7413	7420	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_015590	CCGC	2	8	10365	10372	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_015590	GGCT	2	8	11291	11298	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015590	GGCA	2	8	13876	13883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015590	ATAC	2	8	16019	16026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015590	CTGC	2	8	25059	25066	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015590	CGAA	2	8	25105	25112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015590	GCTT	2	8	25194	25201	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015590	CGGC	2	8	30433	30440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015590	CCGC	2	8	39252	39259	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_015590	GATT	2	8	44508	44515	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015590	TGCC	2	8	46241	46248	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015590	CCCG	2	8	46928	46935	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_015590	GGCG	2	8	48453	48460	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015590	CCTG	2	8	50218	50225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015590	CGGA	2	8	54051	54058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015590	GCTC	2	8	58796	58803	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015590	ATGC	2	8	64106	64113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015590	AGCG	2	8	67397	67404	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015590	GATC	2	8	74991	74998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015590	TCGC	2	8	84911	84918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015590	TCCG	2	8	87394	87401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015590	GCAC	2	8	89069	89076	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015590	CTCG	2	8	91079	91086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015590	GCCG	2	8	92590	92597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015590	GGAA	2	8	92640	92647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015590	TCGG	2	8	97935	97942	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015590	CGGG	2	8	97943	97950	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015590	CGTC	2	8	104462	104469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015590	CCGC	2	8	112284	112291	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_015590	CTGC	2	8	115005	115012	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015590	CATC	2	8	118861	118868	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015590	TGCC	2	8	119315	119322	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015590	CGGG	2	8	120213	120220	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015590	CGCT	2	8	121629	121636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015590	CCGC	2	8	123659	123666	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_015590	CCGA	2	8	124472	124479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015590	CGGG	2	8	124548	124555	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015590	CGCT	2	8	126893	126900	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015590	ATTT	2	8	127012	127019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015590	TTGA	2	8	127044	127051	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015590	GCCG	2	8	131075	131082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015590	GGCG	2	8	135737	135744	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015590	TCCC	2	8	137691	137698	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_015590	GCCG	2	8	139292	139299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015590	AGAC	2	8	140620	140627	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015590	GCGG	2	8	143162	143169	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015590	GTTG	2	8	146527	146534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015590	CCCT	2	8	148984	148991	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_015590	TCAA	2	8	149133	149140	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015590	TGGG	2	8	150550	150557	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015590	GCAT	2	8	150910	150917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015590	CGGG	2	8	150984	150991	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015590	TCCG	2	8	150994	151001	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015590	CCGG	2	8	151008	151015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015590	AAGT	2	8	160314	160321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015590	GCCT	2	8	165743	165750	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015590	GATC	2	8	165814	165821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015590	TTCG	2	8	165834	165841	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015590	CAGC	2	8	166783	166790	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015590	GTGC	2	8	168442	168449	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015590	CGCT	2	8	170749	170756	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015590	GCTG	2	8	170906	170913	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015590	TCCC	2	8	177192	177199	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_015590	AGGA	2	8	178059	178066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015590	CGGG	2	8	181020	181027	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015590	GGCG	2	8	181985	181992	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015590	AGCG	2	8	182236	182243	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015590	CCGC	2	8	182248	182255	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_015590	CAGC	2	8	191011	191018	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015590	TCCT	2	8	191084	191091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015590	TAAA	2	8	191159	191166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015590	GCGG	2	8	192358	192365	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015590	CCGT	2	8	203224	203231	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015590	CCGC	2	8	203357	203364	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_015590	CCGC	2	8	205494	205501	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_015590	CGGA	2	8	205538	205545	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015590	GGGA	2	8	216355	216362	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015590	TTGG	2	8	220721	220728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015590	CGGC	2	8	220733	220740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015590	GCGG	2	8	238371	238378	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015590	GCCA	2	8	238706	238713	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015590	TGGC	2	8	243988	243995	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015590	CGGC	2	8	255443	255450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015590	AATC	2	8	255468	255475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015590	CCGC	2	8	255598	255605	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_015590	GCCG	2	8	258359	258366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015590	CAAC	2	8	262148	262155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015590	TGGC	2	8	264314	264321	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015590	GCCG	2	8	272702	272709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015590	TCCT	2	8	279200	279207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015590	CCGC	2	8	279213	279220	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_015590	TCCC	2	8	289772	289779	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_015590	CCAA	2	8	293056	293063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015590	GCGG	2	8	300326	300333	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015590	GCCG	2	8	300846	300853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015590	CATG	2	8	301065	301072	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015590	GGGC	2	8	303337	303344	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015590	CGGT	2	8	303649	303656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015590	TCAC	2	8	303706	303713	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015590	GTTG	2	8	305377	305384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015590	GAAG	2	8	306655	306662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015590	CTGT	2	8	307834	307841	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015590	GGAA	2	8	312916	312923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015590	GGGC	2	8	313491	313498	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015590	ACGG	2	8	315478	315485	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015590	ATGC	2	8	318658	318665	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015590	CATG	2	8	318699	318706	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015590	CGTT	2	8	319601	319608	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015590	CGCT	2	8	319753	319760	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015590	ATTA	2	8	324168	324175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015590	AAGC	2	8	324627	324634	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015590	TCAA	2	8	330153	330160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015590	TGAT	2	8	330205	330212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015590	ATGG	2	8	330233	330240	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015590	GCCG	2	8	332215	332222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015590	CAAG	2	8	338029	338036	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015590	GACG	2	8	338159	338166	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015590	GGCG	2	8	338169	338176	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015590	CGCC	2	8	346643	346650	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_015590	AGCC	2	8	346893	346900	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015590	GCAG	2	8	346957	346964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015590	TCGG	2	8	347105	347112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015590	CGCT	2	8	347179	347186	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015590	CGGG	2	8	347191	347198	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015590	ACCG	2	8	348302	348309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015590	ACCG	2	8	348820	348827	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015590	TAAT	2	8	350768	350775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015590	AAGT	2	8	350973	350980	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015590	GGGT	2	8	354532	354539	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015590	CCCG	2	8	355654	355661	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_015590	GCGG	2	8	355694	355701	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015590	CCGG	2	8	367026	367033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015590	AATG	2	8	368394	368401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015590	CTTC	2	8	369782	369789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015590	AACC	2	8	369937	369944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015590	AGCA	2	8	370001	370008	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015590	CGTT	2	8	371471	371478	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015590	GGGA	2	8	374068	374075	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015590	TGAA	2	8	374130	374137	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015590	CCTT	2	8	374232	374239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015590	GGCG	2	8	379957	379964	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015590	CGAC	2	8	389905	389912	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015590	CTCG	2	8	389924	389931	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015590	TCCT	2	8	389994	390001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015590	CCGC	2	8	390120	390127	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
148	NC_015590	GGAA	2	8	394711	394718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015590	CGGT	2	8	396243	396250	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015590	GGGC	2	8	396286	396293	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015590	CGCT	2	8	402018	402025	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_015590	GCGG	2	8	402033	402040	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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155	NC_015590	CGGC	2	8	410130	410137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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157	NC_015590	GGCT	2	8	410678	410685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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225	NC_015590	CCGC	2	8	556623	556630	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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229	NC_015590	CGCC	2	8	566040	566047	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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262	NC_015590	GAAG	2	8	672679	672686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
263	NC_015590	CGGC	2	8	673256	673263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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272	NC_015590	GAAA	2	8	681792	681799	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
273	NC_015590	CTTG	2	8	692291	692298	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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282	NC_015590	CAAG	2	8	706117	706124	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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442	NC_015590	CATG	2	8	1052850	1052857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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447	NC_015590	GATA	2	8	1058143	1058150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
448	NC_015590	GGAA	2	8	1061926	1061933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_015590	TGCA	2	8	1086754	1086761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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462	NC_015590	AGGC	2	8	1095760	1095767	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
463	NC_015590	AGCA	2	8	1096152	1096159	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
464	NC_015590	CCTG	2	8	1096810	1096817	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
465	NC_015590	CTCG	2	8	1100609	1100616	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
466	NC_015590	GCTG	2	8	1104640	1104647	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
467	NC_015590	GCCG	2	8	1107585	1107592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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473	NC_015590	CCGG	2	8	1131710	1131717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
474	NC_015590	GCCG	3	12	1135862	1135873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
475	NC_015590	GTCG	2	8	1136668	1136675	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
476	NC_015590	GCGG	2	8	1138099	1138106	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
477	NC_015590	CGGA	2	8	1138419	1138426	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
478	NC_015590	TCCG	2	8	1138774	1138781	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
479	NC_015590	TGGA	2	8	1142358	1142365	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
480	NC_015590	CTTC	2	8	1143928	1143935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
481	NC_015590	CCGC	2	8	1147826	1147833	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
482	NC_015590	GAGC	2	8	1147840	1147847	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
483	NC_015590	CCGA	2	8	1147914	1147921	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
484	NC_015590	GGCG	2	8	1149613	1149620	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
485	NC_015590	CGGG	2	8	1150509	1150516	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
486	NC_015590	CGGC	2	8	1152310	1152317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
487	NC_015590	GCCG	2	8	1152346	1152353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
488	NC_015590	GGAC	2	8	1153804	1153811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
489	NC_015590	CTCC	2	8	1153852	1153859	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
490	NC_015590	ATCC	2	8	1154191	1154198	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
491	NC_015590	GCAC	2	8	1156433	1156440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
492	NC_015590	GATC	2	8	1156441	1156448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
493	NC_015590	CTGG	2	8	1157606	1157613	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
494	NC_015590	GATC	3	12	1159012	1159023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
495	NC_015590	ATTG	2	8	1161712	1161719	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
496	NC_015590	CCGT	2	8	1161744	1161751	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
497	NC_015590	GTGC	2	8	1165940	1165947	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
498	NC_015590	CCCT	2	8	1170342	1170349	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
499	NC_015590	CCGC	2	8	1170557	1170564	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
500	NC_015590	CGAT	2	8	1171032	1171039	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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