MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Desulfotomaculum ruminis DSM 2154 chromosome

Total Repeats: 1472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015589	GGTAAA	2	12	2891	2902	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	334338616
2	NC_015589	GTAAAA	2	12	5035	5046	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	334338619
3	NC_015589	CCGATG	2	12	6052	6063	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334338619
4	NC_015589	TTGAAA	2	12	8414	8425	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	334338621
5	NC_015589	TCACCA	2	12	9197	9208	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	334338621
6	NC_015589	GATTAT	2	12	9957	9968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	334338621
7	NC_015589	AAGCGA	2	12	13203	13214	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015589	CGCAGG	2	12	15197	15208	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015589	TGTAAA	2	12	19768	19779	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	334338626
10	NC_015589	GGCTAC	2	12	21037	21048	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334338628
11	NC_015589	CGGGCA	2	12	21853	21864	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334338629
12	NC_015589	AAGTGG	2	12	26352	26363	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	334338634
13	NC_015589	GTCCCA	2	12	28166	28177	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334338635
14	NC_015589	TTTTGC	2	12	29489	29500	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	334338637
15	NC_015589	CCCTAA	2	12	30793	30804	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	334338638
16	NC_015589	TTAAGG	2	12	31078	31089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015589	TGAAAA	2	12	31452	31463	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	334338639
18	NC_015589	GGTTAA	2	12	34690	34701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334338642
19	NC_015589	TACTGG	2	12	37522	37533	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334338646
20	NC_015589	GCAAAG	2	12	41405	41416	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	334338649
21	NC_015589	AAGGTG	2	12	42403	42414	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	334338650
22	NC_015589	GAAAAG	2	12	43824	43835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015589	CACATA	2	12	51111	51122	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015589	TAGGAT	2	12	58264	58275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015589	TTATTT	2	12	58727	58738	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	334338666
26	NC_015589	GCGGGA	2	12	66536	66547	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	334338673
27	NC_015589	GTAAAG	2	12	69339	69350	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015589	ATTTAG	2	12	73660	73671	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	334338680
29	NC_015589	TTTTCA	2	12	82077	82088	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	334338687
30	NC_015589	CTTTTT	2	12	84456	84467	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015589	AATGCC	2	12	88313	88324	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	334338691
32	NC_015589	TTTTCC	2	12	88358	88369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334338691
33	NC_015589	GCTGGA	2	12	88837	88848	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334338691
34	NC_015589	GTAGCC	2	12	90237	90248	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334338693
35	NC_015589	AAGGGC	2	12	92224	92235	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	334338695
36	NC_015589	GGGAAA	2	12	96577	96588	50 %	0 %	50 %	0 %	334338698
37	NC_015589	CCGCAT	2	12	99309	99320	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334338699
38	NC_015589	TATGAA	2	12	109223	109234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	334338710
39	NC_015589	AAAATT	2	12	109402	109413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334338710
40	NC_015589	TTGCGG	2	12	110852	110863	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	334338712
41	NC_015589	CAAAAA	2	12	113631	113642	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	334338714
42	NC_015589	GCCTGG	2	12	117631	117642	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334338719
43	NC_015589	ATGGCG	2	12	120149	120160	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334338723
44	NC_015589	TGGCCC	2	12	123108	123119	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	334338726
45	NC_015589	CGGCAA	2	12	124849	124860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334338728
46	NC_015589	GTTGGG	2	12	126619	126630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334338730
47	NC_015589	AGCCGG	2	12	130776	130787	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334338735
48	NC_015589	AACATC	2	12	131856	131867	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	334338736
49	NC_015589	GTGGAT	2	12	132306	132317	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	334338736
50	NC_015589	GCCAGG	2	12	132686	132697	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334338737
51	NC_015589	GAAAAA	2	12	134242	134253	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	334338739
52	NC_015589	GGCCCG	2	12	135297	135308	0 %	0 %	50 %	50 %	334338739
53	NC_015589	CTTTGC	2	12	137159	137170	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	334338743
54	NC_015589	TGGGGA	2	12	150011	150022	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	334338756
55	NC_015589	ATGGTT	2	12	150403	150414	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	334338756
56	NC_015589	ATTGAA	2	12	151435	151446	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	334338757
57	NC_015589	TGAGGG	2	12	157472	157483	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015589	GTGGAT	2	12	161260	161271	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	334338770
59	NC_015589	ATGTGA	2	12	162316	162327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334338771
60	NC_015589	TAAAGG	2	12	163735	163746	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	334338773
61	NC_015589	TTGGCA	2	12	167664	167675	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334338776
62	NC_015589	TTTTTA	2	12	170507	170518	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015589	AATCAG	2	12	173631	173642	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015589	TGCAGT	2	12	175900	175911	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334338786
65	NC_015589	GCCAAA	2	12	176031	176042	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	334338786
66	NC_015589	GAGAAA	2	12	178143	178154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338787
67	NC_015589	ATCTTA	2	12	182255	182266	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	334338792
68	NC_015589	AATTAA	2	12	186594	186605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334338797
69	NC_015589	CGAGGA	2	12	186703	186714	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	334338797
70	NC_015589	CATTAC	2	12	190356	190367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334338801
71	NC_015589	TGTGGT	2	12	193151	193162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015589	TTGGGC	2	12	197606	197617	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	334338806
73	NC_015589	ATAAAA	2	12	200314	200325	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015589	AAAGAG	2	12	200539	200550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015589	GAAGGG	2	12	205045	205056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334338813
76	NC_015589	CTGCCG	2	12	206651	206662	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	334338815
77	NC_015589	GGCCAA	2	12	208581	208592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334338816
78	NC_015589	GAAGGG	2	12	213053	213064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334338820
79	NC_015589	CTGCCG	2	12	214659	214670	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	334338822
80	NC_015589	TCCGGT	2	12	223218	223229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334338830
81	NC_015589	CTGATG	2	12	224763	224774	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334338833
82	NC_015589	CATGGC	2	12	225398	225409	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334338834
83	NC_015589	AGCTCC	2	12	231083	231094	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334338839
84	NC_015589	GCCGGC	2	12	236974	236985	0 %	0 %	50 %	50 %	334338846
85	NC_015589	TAAGCA	2	12	240494	240505	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	334338849
86	NC_015589	TAAAAA	2	12	240826	240837	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015589	TAAGCC	2	12	242961	242972	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	334338852
88	NC_015589	GCCAGA	2	12	245723	245734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334338853
89	NC_015589	ATTTTA	2	12	249027	249038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334338856
90	NC_015589	GAAAGA	2	12	249478	249489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338857
91	NC_015589	GCATCG	2	12	251408	251419	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334338858
92	NC_015589	AAGCGA	2	12	254789	254800	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015589	CGCAGG	2	12	256784	256795	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015589	GGGGCC	2	12	261881	261892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334338862
95	NC_015589	AAGGAA	2	12	267474	267485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334338866
96	NC_015589	GGCCAA	2	12	270656	270667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334338868
97	NC_015589	CAGACG	2	12	274545	274556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334338873
98	NC_015589	ACAACC	2	12	275046	275057	50 %	0 %	0 %	50 %	334338874
99	NC_015589	CTGGCC	2	12	280064	280075	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	334338878
100	NC_015589	ATATTT	2	12	281608	281619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334338879
101	NC_015589	ACCAAG	2	12	281787	281798	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	334338880
102	NC_015589	ACCGGA	2	12	281939	281950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334338880
103	NC_015589	ATGCGG	2	12	286849	286860	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334338885
104	NC_015589	TGAAAT	2	12	287047	287058	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	334338885
105	NC_015589	TCATAC	2	12	288043	288054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334338886
106	NC_015589	TAAAGT	2	12	289037	289048	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	334338888
107	NC_015589	CCTTTA	2	12	289341	289352	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	334338889
108	NC_015589	GGATGT	2	12	293083	293094	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	334338893
109	NC_015589	GAAATT	2	12	295196	295207	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	334338893
110	NC_015589	TCAGGC	2	12	297945	297956	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334338894
111	NC_015589	ATTTGA	2	12	298617	298628	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	334338894
112	NC_015589	ATTACC	2	12	300558	300569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334338898
113	NC_015589	GCTGTG	2	12	300681	300692	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	334338898
114	NC_015589	ATGCGG	2	12	303039	303050	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334338899
115	NC_015589	TGAAAT	2	12	303237	303248	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	334338899
116	NC_015589	GGCGAA	2	12	304557	304568	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	334338901
117	NC_015589	ATTGAA	2	12	311393	311404	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	334338916
118	NC_015589	AAGCAA	2	12	315868	315879	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	334338925
119	NC_015589	GTCTGG	2	12	317029	317040	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	334338928
120	NC_015589	TGCTGG	2	12	319375	319386	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	334338931
121	NC_015589	AACATC	2	12	319784	319795	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	334338932
122	NC_015589	TGACCA	2	12	321195	321206	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	334338933
123	NC_015589	AGAAAA	2	12	322525	322536	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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219	NC_015589	CAATGG	2	12	629317	629328	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	334339195
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223	NC_015589	CGCAGG	2	12	636475	636486	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
224	NC_015589	CAACTT	2	12	637009	637020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334339198
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226	NC_015589	AGTGGC	2	12	645151	645162	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334339206
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229	NC_015589	GAGTTA	2	12	651012	651023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334339212
230	NC_015589	CGGGCC	2	12	651420	651431	0 %	0 %	50 %	50 %	334339212
231	NC_015589	CTCAGG	2	12	651568	651579	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334339212
232	NC_015589	ATGTTC	2	12	651979	651990	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	334339212
233	NC_015589	TGTGCA	2	12	652371	652382	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334339213
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235	NC_015589	TATCCT	2	12	654981	654992	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	334339215
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335	NC_015589	TCCACT	2	12	909026	909037	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	334339463
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339	NC_015589	CTGGGC	2	12	912255	912266	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334339467
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346	NC_015589	TCAGTA	2	12	930723	930734	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	334339483
347	NC_015589	AGGGGC	2	12	930979	930990	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	334339484
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349	NC_015589	AAAAAG	2	12	939341	939352	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	334339493
350	NC_015589	CCATGG	2	12	939523	939534	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334339494
351	NC_015589	TTAAGA	2	12	940770	940781	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
352	NC_015589	TGGATT	2	12	941647	941658	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	334339495
353	NC_015589	TAAGCT	2	12	943381	943392	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	334339496
354	NC_015589	CACCGG	2	12	943918	943929	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	334339496
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427	NC_015589	AGATTG	2	12	1163468	1163479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334339712
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450	NC_015589	TTGGTA	2	12	1211275	1211286	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	334339756
451	NC_015589	GGGTTG	2	12	1213345	1213356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334339759
452	NC_015589	GGAGCA	2	12	1214085	1214096	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	334339761
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454	NC_015589	GGGCCG	2	12	1217178	1217189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334339763
455	NC_015589	GTCCCT	2	12	1217851	1217862	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
456	NC_015589	GCAGGT	2	12	1218362	1218373	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334339764
457	NC_015589	GGCGGA	2	12	1222242	1222253	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	334339768
458	NC_015589	TGGATG	2	12	1222461	1222472	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	334339768
459	NC_015589	GAGGTG	2	12	1224521	1224532	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	334339770
460	NC_015589	TGGCCG	2	12	1228414	1228425	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334339774
461	NC_015589	GCCCAA	2	12	1233731	1233742	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	334339779
462	NC_015589	GGAAAA	2	12	1238932	1238943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334339786
463	NC_015589	AGGAGA	2	12	1240131	1240142	50 %	0 %	50 %	0 %	334339787
464	NC_015589	GTGGAC	2	12	1240728	1240739	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334339788
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