MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfotomaculum ruminis DSM 2154 chromosome

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015589	AAGCGA	2	12	13203	13214	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015589	CGCAGG	2	12	15197	15208	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015589	TTAAGG	2	12	31078	31089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015589	GAAAAG	2	12	43824	43835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015589	CACATA	2	12	51111	51122	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015589	TAGGAT	2	12	58264	58275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015589	GTAAAG	2	12	69339	69350	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015589	CTTTTT	2	12	84456	84467	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015589	TGAGGG	2	12	157472	157483	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015589	TTTTTA	2	12	170507	170518	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015589	AATCAG	2	12	173631	173642	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015589	TGTGGT	2	12	193151	193162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015589	ATAAAA	2	12	200314	200325	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015589	AAAGAG	2	12	200539	200550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015589	TAAAAA	2	12	240826	240837	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015589	AAGCGA	2	12	254789	254800	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015589	CGCAGG	2	12	256784	256795	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015589	AGAAAA	2	12	322525	322536	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015589	ATTTTC	2	12	390386	390397	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015589	GCATAA	2	12	392083	392094	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015589	ATTGTA	2	12	392185	392196	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015589	GGTAGC	2	12	439124	439135	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015589	AATAGA	2	12	441554	441565	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015589	CAATAT	2	12	460728	460739	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015589	ATGATT	2	12	461952	461963	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015589	AGAAAC	2	12	507436	507447	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015589	TATCCT	2	12	509701	509712	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015589	ATTTTA	2	12	527061	527072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015589	ATTTAT	2	12	551084	551095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015589	ATTTTA	2	12	553835	553846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015589	TTTATT	2	12	583749	583760	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015589	AGGTAG	2	12	609812	609823	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015589	AAGCGA	2	12	634480	634491	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015589	CGCAGG	2	12	636475	636486	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015589	ATTTTT	2	12	641466	641477	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015589	TAATTA	2	12	663229	663240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015589	TTTTGC	2	12	664775	664786	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015589	ATTTTT	2	12	678255	678266	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015589	AAAGGG	2	12	678439	678450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015589	AACCCG	2	12	707253	707264	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015589	TGAGAA	2	12	715620	715631	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015589	ACCAGG	2	12	715978	715989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015589	CCGGGA	2	12	716008	716019	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015589	TAGTAT	2	12	722018	722029	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015589	AAAATT	2	12	723185	723196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015589	GATTAT	2	12	731083	731094	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015589	ATAAGA	2	12	731906	731917	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015589	CTTTTT	2	12	734072	734083	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015589	AAGCAA	2	12	742043	742054	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015589	TAGGAT	2	12	785811	785822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015589	TTTCCA	2	12	788741	788752	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015589	TTGTTT	2	12	793171	793182	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015589	ATATTA	2	12	793259	793270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015589	CCGGAA	2	12	796773	796784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015589	TATCAT	2	12	814446	814457	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015589	CCCTGG	2	12	826712	826723	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015589	TCGGGT	2	12	866680	866691	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015589	ATTACC	2	12	875226	875237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015589	ATTATC	2	12	901527	901538	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015589	ATCATT	2	12	911105	911116	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015589	TTAAGA	2	12	940770	940781	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015589	GACAAA	2	12	965646	965657	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015589	ATAAAA	2	12	984694	984705	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015589	TTTAAT	2	12	995760	995771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015589	AGGGGG	2	12	1016181	1016192	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015589	AATAAA	2	12	1020584	1020595	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015589	CTTGTT	2	12	1023872	1023883	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015589	TAAAAA	2	12	1023905	1023916	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015589	GCTTTT	2	12	1036955	1036966	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015589	TAATAT	2	12	1047830	1047841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015589	AAAAGA	2	12	1068886	1068897	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015589	AATAAG	2	12	1079813	1079824	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015589	CTTTTT	2	12	1143583	1143594	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015589	CAAAAT	2	12	1161494	1161505	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015589	AAAGTA	2	12	1189012	1189023	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015589	GTCCCT	2	12	1217851	1217862	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015589	GAAAAA	2	12	1266678	1266689	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015589	TAATGA	2	12	1337230	1337241	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015589	AAAAGG	2	12	1338524	1338535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015589	GAATAG	2	12	1386911	1386922	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015589	TAAAGG	2	12	1392145	1392156	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015589	TGTGTA	2	12	1400237	1400248	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015589	TTTTTC	2	12	1420668	1420679	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015589	ATTGAA	2	12	1423583	1423594	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015589	ATTGAA	2	12	1423651	1423662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015589	AATAAA	2	12	1440189	1440200	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015589	TAAACA	2	12	1443148	1443159	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_015589	AAAATG	2	12	1447778	1447789	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015589	CATTGA	2	12	1461053	1461064	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015589	TCCATT	2	12	1504038	1504049	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015589	TTCAGC	2	12	1504054	1504065	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015589	GGAAAT	2	12	1517762	1517773	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015589	TTTCCT	2	12	1517862	1517873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015589	AATAAG	2	12	1580294	1580305	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015589	TTAAGG	2	12	1613813	1613824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015589	TAGGTA	2	12	1616302	1616313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015589	TGTTAA	2	12	1626332	1626343	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015589	CTTTTT	2	12	1634800	1634811	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015589	AGTGAA	2	12	1643775	1643786	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015589	CAAAAA	2	12	1643978	1643989	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015589	GAAAAA	2	12	1671882	1671893	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015589	TTCCGC	2	12	1672205	1672216	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015589	TAAAGT	2	12	1678041	1678052	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015589	ATAAAA	2	12	1684507	1684518	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015589	ATTGGT	2	12	1718915	1718926	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015589	AAACAG	2	12	1736735	1736746	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_015589	AAAGGA	2	12	1745031	1745042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015589	TTGATT	2	12	1777394	1777405	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015589	GGGGTC	2	12	1803177	1803188	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015589	ATATTT	2	12	1840754	1840765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015589	TTAAAA	2	12	1848895	1848906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015589	AGGAAA	2	12	1859142	1859153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015589	GAATAG	2	12	1866462	1866473	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015589	ATACCA	2	12	1951415	1951426	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015589	TGACAG	2	12	1961704	1961715	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015589	TTTTAT	2	12	1963701	1963712	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015589	CTTTTT	2	12	1971994	1972005	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015589	GTTTCT	2	12	1974261	1974272	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015589	GGGTCC	2	12	1978735	1978746	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015589	CCTTTT	2	12	1993081	1993092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015589	TTTTTA	2	12	2015997	2016008	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015589	ATTCTT	2	12	2030260	2030271	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_015589	CTAACA	2	12	2054676	2054687	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015589	GAATAA	2	12	2058773	2058784	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015589	CCAAGA	2	12	2075006	2075017	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015589	AAAAAG	2	12	2081448	2081459	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015589	TTGTGA	2	12	2081906	2081917	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015589	TTATTG	2	12	2115306	2115317	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015589	ATTATA	2	12	2175219	2175230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015589	GGCTTT	2	12	2176000	2176011	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_015589	GACAAA	2	12	2217863	2217874	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_015589	TAATGA	2	12	2235585	2235596	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015589	TCAAGG	2	12	2238620	2238631	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_015589	TCCCTA	2	12	2275197	2275208	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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137	NC_015589	TTGACC	2	12	2290437	2290448	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_015589	TAAATT	2	12	2663986	2663997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015589	TTTTAT	2	12	2664010	2664021	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015589	TCCTTC	2	12	2705854	2705865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_015589	AAATTA	2	12	2756872	2756883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_015589	CCTGCG	2	12	2886599	2886610	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
170	NC_015589	TCGCTT	2	12	2888594	2888605	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.