MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfotomaculum ruminis DSM 2154 chromosome

Total Repeats: 702

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015589	TCGTG	2	10	11695	11704	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015589	GAAGC	2	10	11881	11890	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015589	TGAAG	2	10	11893	11902	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015589	GGGAG	2	10	13064	13073	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015589	CCGTA	2	10	14175	14184	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015589	GACAG	2	10	14624	14633	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015589	ATAAA	2	10	21353	21362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015589	TCCTT	2	10	23861	23870	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_015589	GTTAT	2	10	30219	30228	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015589	CTCGA	2	10	30996	31005	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_015589	GAAAA	2	10	34285	34294	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015589	GAAAA	2	10	36308	36317	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015589	TAAAG	2	10	44580	44589	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015589	AACCG	2	10	48993	49002	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015589	AGGGC	2	10	49344	49353	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015589	TTCAA	2	10	49592	49601	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015589	CGGGT	2	10	51551	51560	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015589	TGTAT	2	10	51628	51637	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015589	TCAAT	2	10	52044	52053	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015589	ATATA	2	10	63656	63665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015589	TTATC	2	10	80397	80406	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015589	ATGAA	2	10	87612	87621	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015589	TAATT	2	10	87979	87988	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015589	AGAAA	2	10	91692	91701	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015589	AAAAT	2	10	98402	98411	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015589	TTCAC	2	10	114270	114279	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_015589	CTTAG	2	10	114303	114312	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015589	AAAAT	2	10	120082	120091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015589	GTTCA	2	10	121945	121954	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015589	GTATA	2	10	127292	127301	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015589	CCAGT	2	10	127324	127333	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_015589	AGACC	2	10	133173	133182	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_015589	TGACC	2	10	133186	133195	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_015589	CTTTT	2	10	133265	133274	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015589	AAGGA	2	10	139758	139767	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015589	GAAGA	2	10	141457	141466	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015589	ACGCA	2	10	141622	141631	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_015589	TAAGG	2	10	146685	146694	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015589	AAGGG	2	10	155292	155301	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015589	AAATT	2	10	170661	170670	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015589	AAATG	2	10	187795	187804	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015589	TACGA	2	10	187954	187963	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015589	AATAA	2	10	197853	197862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015589	GCCAT	2	10	200026	200035	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_015589	CAAGA	2	10	219457	219466	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015589	GATAT	2	10	219602	219611	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015589	TTTTG	2	10	229818	229827	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015589	ACAAA	2	10	230054	230063	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015589	AATTT	2	10	232536	232545	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015589	GGTAT	2	10	241051	241060	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015589	TTTAT	2	10	245163	245172	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015589	ATACA	2	10	251673	251682	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015589	TCGTG	2	10	253020	253029	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015589	GAAGC	2	10	253206	253215	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015589	TGAAG	2	10	253218	253227	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015589	GGGAG	2	10	254650	254659	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015589	CCGTA	2	10	255761	255770	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_015589	GACAG	2	10	256210	256219	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015589	TAATT	2	10	257476	257485	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015589	TTAAA	2	10	257577	257586	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015589	GATGA	2	10	257603	257612	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015589	TATTT	2	10	257750	257759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015589	TTCTA	2	10	263765	263774	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015589	ATTTT	2	10	299848	299857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015589	ACCGG	2	10	303742	303751	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_015589	TTAAT	2	10	323468	323477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015589	TATAA	2	10	327018	327027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015589	GGATC	2	10	331868	331877	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015589	TATAA	2	10	337771	337780	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015589	AAGGT	2	10	340995	341004	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015589	ACCGG	2	10	358022	358031	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_015589	TCAAC	2	10	371988	371997	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_015589	AAAGT	2	10	372020	372029	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015589	CCAAC	2	10	379533	379542	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_015589	CTTTT	2	10	388667	388676	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015589	ACTCT	2	10	394092	394101	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_015589	TCTTG	2	10	395022	395031	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015589	GTTTT	2	10	399268	399277	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015589	TTTCT	2	10	400038	400047	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015589	GGATA	2	10	412634	412643	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015589	ATTAT	2	10	412768	412777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015589	TAAAG	2	10	416911	416920	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015589	CAAAA	2	10	418990	418999	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015589	GTTTT	2	10	419019	419028	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015589	TTTTA	2	10	419869	419878	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015589	GTTTT	2	10	438233	438242	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015589	CGGTG	2	10	438746	438755	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015589	ACTAA	2	10	439503	439512	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015589	TTAAA	2	10	441612	441621	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015589	AATTT	2	10	443261	443270	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015589	TTCTA	2	10	446192	446201	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015589	CCGGT	2	10	448313	448322	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_015589	AGAGG	2	10	448385	448394	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015589	AAATG	2	10	459140	459149	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015589	TTTTC	2	10	459594	459603	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015589	AGGGA	2	10	460758	460767	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015589	ACAAA	2	10	481446	481455	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015589	GATTA	2	10	481496	481505	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015589	GCAAC	2	10	486583	486592	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_015589	TTTAA	2	10	487906	487915	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015589	GAACA	2	10	496254	496263	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015589	TTATT	2	10	524846	524855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015589	AAAAG	2	10	526711	526720	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015589	TTTAC	2	10	549004	549013	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015589	AAAAT	2	10	550023	550032	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015589	TTATT	2	10	551241	551250	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015589	AATAA	2	10	557697	557706	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015589	TATAA	2	10	572839	572848	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015589	AACGG	2	10	574112	574121	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015589	AAAAT	2	10	574204	574213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015589	CATGC	2	10	577245	577254	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_015589	TAGTC	2	10	582933	582942	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015589	TAAGG	2	10	599646	599655	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015589	CCCTA	2	10	600459	600468	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
115	NC_015589	AACGG	2	10	615678	615687	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015589	TTTTA	2	10	626257	626266	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015589	AATAA	2	10	631509	631518	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015589	ATTAA	2	10	631554	631563	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015589	TCGTG	2	10	633083	633092	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015589	GAAGC	2	10	633269	633278	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015589	TGAAG	2	10	633281	633290	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015589	GGGAG	2	10	634341	634350	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015589	CCGTA	2	10	635452	635461	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_015589	GACAG	2	10	635901	635910	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015589	CTTTT	2	10	640637	640646	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015589	TTTTC	2	10	643877	643886	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_015589	CTTTT	2	10	647062	647071	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015589	TATAA	2	10	657136	657145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015589	ACATA	2	10	658257	658266	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015589	CTTTT	2	10	660213	660222	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015589	AAATA	2	10	660372	660381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015589	ATGAG	2	10	663709	663718	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015589	TATTT	2	10	667812	667821	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015589	TGTAT	2	10	668303	668312	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015589	TTTAA	2	10	668566	668575	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015589	ATTTT	2	10	669344	669353	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015589	TTGCT	2	10	673216	673225	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_015589	TAAAA	2	10	675407	675416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015589	AGGGG	2	10	698049	698058	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015589	TATTT	2	10	706968	706977	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015589	GGCCC	2	10	715746	715755	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
142	NC_015589	CCCGG	2	10	715893	715902	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_015589	GAGAG	2	10	724007	724016	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015589	AAATG	2	10	724584	724593	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015589	AAATG	2	10	724605	724614	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015589	TAGAT	2	10	726556	726565	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015589	TGACT	2	10	734331	734340	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_015589	GAAAA	2	10	741965	741974	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015589	GAAAA	2	10	752325	752334	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015589	GGCTG	2	10	753147	753156	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_015589	TATAT	2	10	768942	768951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_015589	TTTAT	2	10	1565990	1565999	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_015589	TAAAA	3	15	1566060	1566074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_015589	TAAAA	2	10	2678236	2678245	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_015589	CTTAC	2	10	2712373	2712382	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
483	NC_015589	TGCAT	2	10	2717499	2717508	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_015589	AGATA	2	10	2845361	2845370	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

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