MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Isoptericola variabilis 225 chromosome

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015588	CGCCGT	2	12	3360	3371	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015588	CGCACC	2	12	31909	31920	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015588	CGCGGG	2	12	52227	52238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015588	ACGAGG	2	12	61735	61746	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015588	GGTCGC	2	12	67296	67307	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015588	GCCCGA	2	12	67446	67457	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015588	GGTGCG	2	12	67710	67721	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015588	TGCCGC	2	12	98454	98465	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015588	GCGACG	2	12	120691	120702	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015588	CCCGCG	2	12	122732	122743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_015588	CGAGCT	2	12	123428	123439	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015588	CGTCGC	2	12	123440	123451	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015588	CGCACG	2	12	124480	124491	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015588	TGCCGC	2	12	125289	125300	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015588	CACGCC	2	12	125307	125318	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015588	CGCGGC	2	12	176606	176617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015588	CCGCGC	2	12	202782	202793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015588	GCGACG	2	12	222806	222817	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015588	TCGATC	2	12	228261	228272	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015588	CCCCGT	2	12	262099	262110	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015588	GGCCGC	2	12	297912	297923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015588	GCCCCC	2	12	304836	304847	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
23	NC_015588	GCGACC	3	18	325629	325646	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015588	CTGGCG	2	12	339441	339452	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015588	GTCGCC	2	12	339874	339885	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015588	GCCCGA	2	12	340098	340109	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015588	CGAGCG	2	12	340335	340346	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015588	AGCGCC	2	12	342438	342449	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015588	CGCCCG	2	12	383242	383253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015588	CCGCGC	2	12	473295	473306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015588	GTCGAT	2	12	500226	500237	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015588	GCCGAC	2	12	554018	554029	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015588	CCGCGC	2	12	554125	554136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015588	GGCGTC	2	12	633777	633788	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015588	GTAGCC	2	12	633813	633824	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015588	CGAGCC	2	12	700064	700075	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015588	TGCGCC	2	12	700079	700090	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015588	CCGTGC	2	12	709317	709328	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015588	GGCCCG	2	12	714027	714038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015588	GGGGCC	2	12	728143	728154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015588	GAGGGC	2	12	760727	760738	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015588	TGCACG	2	12	799113	799124	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015588	CGGCCG	2	12	850086	850097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015588	AGCTCG	2	12	894381	894392	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015588	GACGGC	2	12	901309	901320	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015588	CGATGG	2	12	957233	957244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015588	CCGGCC	2	12	981155	981166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015588	TGGGCG	2	12	1014416	1014427	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015588	GCGCCC	2	12	1020035	1020046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015588	GCCGTG	2	12	1070139	1070150	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015588	TCGCCG	2	12	1070152	1070163	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015588	CGCGGC	2	12	1070168	1070179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015588	CGGGCG	2	12	1108818	1108829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015588	CTCGGC	2	12	1139210	1139221	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015588	GTCGAG	2	12	1164526	1164537	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015588	CGACCA	2	12	1165038	1165049	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015588	CGGGGA	3	18	1165351	1165368	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015588	CCACCG	2	12	1173024	1173035	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015588	GAGCCT	2	12	1173454	1173465	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015588	CGGACC	2	12	1176103	1176114	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015588	GCACGT	2	12	1178969	1178980	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015588	CGGCCG	2	12	1266633	1266644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015588	CGTGGC	2	12	1267092	1267103	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015588	CGACGG	2	12	1267623	1267634	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015588	ACGCTC	2	12	1290717	1290728	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015588	CGCAAG	2	12	1291215	1291226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015588	AGGCCG	2	12	1291327	1291338	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015588	CCGAGC	2	12	1291654	1291665	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015588	GCGGGC	2	12	1291706	1291717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015588	CTCGCC	2	12	1292409	1292420	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015588	CGCTCG	2	12	1293698	1293709	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015588	TCGAGG	2	12	1293950	1293961	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015588	TTGACA	2	12	1319106	1319117	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015588	CCCGCG	2	12	1338409	1338420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_015588	AGGCCA	2	12	1356262	1356273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015588	GCAACG	2	12	1418909	1418920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015588	AGTGCA	2	12	1476918	1476929	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015588	CGCGCT	2	12	1491481	1491492	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015588	GGCCTG	2	12	1491586	1491597	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015588	GCGAGC	2	12	1502478	1502489	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015588	TCGGGC	2	12	1549420	1549431	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015588	TGCTCG	2	12	1552451	1552462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015588	CGGCCG	2	12	1584421	1584432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015588	CACGTC	2	12	1641879	1641890	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015588	CCGAGG	2	12	1651674	1651685	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015588	CGACAA	2	12	1653774	1653785	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015588	CGGCGC	2	12	1656305	1656316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015588	AGCGCG	2	12	1673376	1673387	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015588	TCGCGG	2	12	1673983	1673994	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015588	ACGTCG	2	12	1696023	1696034	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015588	GGCGCC	2	12	1696218	1696229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015588	CCGGCC	2	12	1702341	1702352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015588	GCGCCC	2	12	1744246	1744257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015588	TCGACG	2	12	1777357	1777368	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015588	CGCTCG	2	12	1818636	1818647	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015588	GGCCGG	2	12	1829155	1829166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015588	CACCGA	2	12	1870737	1870748	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015588	CGGGCG	2	12	1880195	1880206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015588	CCGCGA	2	12	1880440	1880451	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015588	GGCCGG	2	12	1920927	1920938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015588	TGTCGG	2	12	1927899	1927910	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_015588	GAGGCG	2	12	1933696	1933707	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015588	GCCGGC	2	12	1964612	1964623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015588	CGGCGC	2	12	2022603	2022614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015588	AGGACG	2	12	2056848	2056859	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015588	GCCCCG	2	12	2098766	2098777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_015588	GAAGGA	2	12	2125089	2125100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015588	CGCTCG	2	12	2152468	2152479	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015588	ACGGGC	2	12	2152587	2152598	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015588	CGAGGC	2	12	2153819	2153830	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015588	ACGGCG	2	12	2195035	2195046	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015588	GGCGCC	2	12	2197963	2197974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015588	GCCGGG	2	12	2227638	2227649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015588	GTCTCG	2	12	2237635	2237646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015588	GGCGAG	2	12	2247888	2247899	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015588	GCACCG	2	12	2248045	2248056	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015588	GCGACG	2	12	2248129	2248140	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015588	GCGCCG	2	12	2267847	2267858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015588	GCATCC	2	12	2268061	2268072	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015588	GCGTCG	2	12	2294212	2294223	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015588	TCTCCC	2	12	2300237	2300248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015588	CGCCTC	2	12	2305566	2305577	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_015588	GCCCGG	2	12	2338168	2338179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015588	CGGCAG	2	12	2338206	2338217	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015588	CGCGGC	2	12	2338356	2338367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015588	GGGGTG	2	12	2343795	2343806	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015588	TGCACT	2	12	2358009	2358020	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015588	GTCGGG	2	12	2460855	2460866	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_015588	TCCTGG	2	12	2499614	2499625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015588	GGGACG	2	12	2505611	2505622	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_015588	GAGACG	2	12	2570013	2570024	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_015588	GTCGAG	2	12	2573033	2573044	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_015588	CGACGC	2	12	2573335	2573346	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015588	CTCGAC	2	12	2573622	2573633	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015588	GTCGCT	2	12	2574167	2574178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015588	CAGGCC	2	12	2580075	2580086	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015588	GGGCCT	2	12	2580098	2580109	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015588	CTCGGC	2	12	2604611	2604622	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015588	TCGCGG	2	12	2604679	2604690	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015588	CCGAGC	2	12	2604873	2604884	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015588	AGCGCG	2	12	2606050	2606061	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015588	CGAGCA	2	12	2606375	2606386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015588	CGGCGA	2	12	2606858	2606869	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015588	CGTCGA	2	12	2607086	2607097	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015588	GTCACG	2	12	2607193	2607204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015588	TCATGA	2	12	2608906	2608917	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_015588	CAGGCC	2	12	2657748	2657759	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015588	TCAGGC	2	12	2657808	2657819	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015588	GACGGC	2	12	2680037	2680048	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015588	GGCCTG	2	12	2681736	2681747	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_015588	GCGCTG	2	12	2681768	2681779	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_015588	CGGGGC	2	12	2754918	2754929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_015588	GCGGCC	3	18	2798199	2798216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
157	NC_015588	TCGGGT	2	12	2822501	2822512	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_015588	TCGGGT	2	12	2823685	2823696	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_015588	CGCGGT	3	18	2826826	2826843	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_015588	GCGGCC	2	12	2861278	2861289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_015588	GGGCGA	2	12	2887522	2887533	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.