MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Isoptericola variabilis 225 chromosome

Total Repeats: 1286

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015588	CTCG	2	8	38	45	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015588	CCCT	2	8	165	172	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_015588	GTCC	2	8	1747	1754	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015588	CCAC	2	8	1868	1875	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_015588	GTCC	2	8	1909	1916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015588	CGAC	2	8	2125	2132	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015588	CGGT	2	8	5710	5717	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015588	GTCG	2	8	7476	7483	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015588	GGAA	2	8	9742	9749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015588	CCGT	2	8	13255	13262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015588	CTCC	2	8	13625	13632	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_015588	CACG	2	8	13726	13733	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015588	CCCG	2	8	15393	15400	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_015588	CGGC	2	8	19607	19614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015588	GCGT	2	8	28883	28890	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015588	CGAC	2	8	29273	29280	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015588	CCCT	2	8	38284	38291	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_015588	CTGT	2	8	41668	41675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015588	CCGG	2	8	52145	52152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015588	GTCC	2	8	52174	52181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015588	CGGG	2	8	52822	52829	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015588	CCGG	2	8	53252	53259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015588	CCAG	2	8	53316	53323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015588	CGTC	3	12	54248	54259	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015588	TCGA	2	8	54334	54341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015588	CGTC	2	8	56505	56512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015588	GGGA	2	8	56638	56645	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015588	GACG	2	8	61338	61345	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015588	GTGG	2	8	62489	62496	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015588	CCGG	2	8	67425	67432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015588	ACGT	2	8	67654	67661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015588	GGCA	2	8	68011	68018	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015588	CGTC	2	8	72299	72306	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015588	CACG	2	8	74618	74625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015588	CAGG	2	8	78915	78922	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015588	CGTC	2	8	81062	81069	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015588	GACG	2	8	81077	81084	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015588	GCCC	2	8	82352	82359	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_015588	AGGA	2	8	89727	89734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015588	CGGG	2	8	93783	93790	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015588	CGAG	2	8	93926	93933	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015588	ACGC	2	8	94332	94339	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015588	GCCG	2	8	95581	95588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015588	CTGA	2	8	98504	98511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015588	GCCC	2	8	99190	99197	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_015588	CGTG	2	8	100110	100117	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015588	CGAT	2	8	100357	100364	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015588	AACC	2	8	110594	110601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015588	GTGC	2	8	121875	121882	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015588	CCTG	2	8	122383	122390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015588	CGGG	2	8	122825	122832	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015588	ACGC	2	8	122858	122865	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015588	CTCG	2	8	122967	122974	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015588	GTCG	2	8	123342	123349	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015588	CCGG	2	8	123500	123507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015588	CGGC	2	8	123693	123700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015588	GGGC	2	8	123746	123753	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015588	GCGG	2	8	123922	123929	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015588	GGCC	2	8	124019	124026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015588	TCCG	2	8	124187	124194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015588	GGGC	2	8	125338	125345	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015588	TCGC	2	8	129574	129581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015588	GCCT	2	8	129611	129618	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015588	TCCC	2	8	129638	129645	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_015588	AGGT	2	8	131064	131071	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015588	TCGT	2	8	138939	138946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015588	ACGT	2	8	138966	138973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015588	ACCG	2	8	141836	141843	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015588	GGCG	2	8	143585	143592	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015588	GGAC	2	8	143617	143624	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015588	CGGC	2	8	148302	148309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015588	CACC	2	8	148378	148385	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_015588	GACC	2	8	148425	148432	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015588	GAGC	2	8	148448	148455	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015588	CAAG	2	8	148737	148744	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015588	CGAG	2	8	148814	148821	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015588	GACG	2	8	149905	149912	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015588	CGGT	2	8	151334	151341	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015588	CCGG	2	8	151351	151358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015588	CGGG	2	8	157024	157031	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015588	GTGC	2	8	157048	157055	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015588	GCCG	2	8	163211	163218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015588	GCGG	2	8	169116	169123	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015588	GCCC	2	8	172113	172120	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_015588	CCCG	2	8	172208	172215	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_015588	TCCG	2	8	181800	181807	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015588	CGGT	2	8	181810	181817	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015588	GGGC	2	8	181913	181920	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015588	AATG	2	8	184816	184823	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015588	GGCC	2	8	185105	185112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015588	GTCG	2	8	185273	185280	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015588	CGGG	2	8	185437	185444	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015588	CAAG	2	8	185472	185479	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015588	TCGG	2	8	188160	188167	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015588	GTCC	2	8	188264	188271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015588	GGTG	2	8	189620	189627	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015588	GCCG	2	8	189971	189978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015588	CCGG	2	8	191650	191657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015588	CCGC	2	8	191774	191781	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_015588	TCCG	2	8	191854	191861	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015588	GGCG	2	8	193470	193477	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015588	GCGG	2	8	195234	195241	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015588	CGGT	2	8	197237	197244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015588	CTCG	2	8	198038	198045	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015588	CCGA	2	8	198059	198066	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015588	CGAG	2	8	198079	198086	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015588	CCGG	2	8	201544	201551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015588	GCCG	2	8	201597	201604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015588	GACG	2	8	204303	204310	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015588	TGGG	2	8	204326	204333	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015588	GCCG	2	8	205229	205236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015588	CGGG	2	8	205406	205413	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015588	GCCG	2	8	205486	205493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015588	GCCG	2	8	209349	209356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015588	CGAG	2	8	211388	211395	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015588	CGAG	2	8	211409	211416	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015588	GCCG	2	8	211806	211813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015588	TCCC	2	8	213992	213999	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_015588	CCGC	2	8	214001	214008	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_015588	GTGC	2	8	217303	217310	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015588	CGTC	2	8	218889	218896	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015588	TCCG	2	8	220866	220873	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015588	CCAG	2	8	221921	221928	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015588	GGCC	2	8	225081	225088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015588	CGGC	2	8	225150	225157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015588	CCGG	2	8	225351	225358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015588	GCCG	2	8	225612	225619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015588	CGAC	2	8	225620	225627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015588	GCAC	2	8	231747	231754	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015588	TGCA	2	8	231774	231781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015588	CCCG	2	8	236019	236026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_015588	CCGC	2	8	236085	236092	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_015588	GGGC	2	8	238977	238984	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015588	GACC	2	8	245847	245854	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015588	GTGG	3	12	252439	252450	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015588	CGGG	2	8	253257	253264	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015588	GGGC	2	8	255924	255931	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015588	CGGG	2	8	256439	256446	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015588	CGGG	2	8	256646	256653	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015588	GACC	2	8	256882	256889	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015588	GGCG	2	8	256951	256958	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015588	CGGC	2	8	257353	257360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015588	CGCT	2	8	259014	259021	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015588	GCGG	2	8	259725	259732	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015588	TCCC	2	8	264032	264039	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_015588	CGTC	2	8	276646	276653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015588	TTCG	2	8	281978	281985	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015588	GGCC	2	8	283563	283570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015588	CTGG	2	8	283571	283578	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015588	CCGG	2	8	285509	285516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015588	GCCG	2	8	285562	285569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_015588	GCCG	2	8	289146	289153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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155	NC_015588	GCCG	2	8	296279	296286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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161	NC_015588	CCGG	2	8	300995	301002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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485	NC_015588	CGGG	2	8	1181912	1181919	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
486	NC_015588	GCGT	2	8	1191605	1191612	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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498	NC_015588	CGAC	2	8	1229150	1229157	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_015588	CGGC	2	8	1250849	1250856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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