MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Mpl

Total Repeats: 14562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015583	GGC	3	9	164	172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144766
2	NC_015583	GGA	2	6	185	190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144766
3	NC_015583	GCG	2	6	216	221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144766
4	NC_015583	CCG	2	6	248	253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144766
5	NC_015583	TGC	2	6	346	351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144766
6	NC_015583	CCG	2	6	428	433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144766
7	NC_015583	GGA	2	6	440	445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144766
8	NC_015583	ATC	2	6	447	452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144766
9	NC_015583	ATC	2	6	498	503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144766
10	NC_015583	CAG	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144767
11	NC_015583	CGT	2	6	1126	1131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144767
12	NC_015583	CTG	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144767
13	NC_015583	CAT	2	6	1180	1185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144767
14	NC_015583	TTC	2	6	1867	1872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144768
15	NC_015583	GGC	2	6	1972	1977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144768
16	NC_015583	CTC	2	6	1983	1988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144768
17	NC_015583	AGT	2	6	1998	2003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144768
18	NC_015583	GCC	2	6	2017	2022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144768
19	NC_015583	GTC	2	6	2067	2072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144768
20	NC_015583	TGT	2	6	2172	2177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144768
21	NC_015583	GTG	2	6	2366	2371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144768
22	NC_015583	CCT	2	6	2441	2446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144768
23	NC_015583	AGC	2	6	2712	2717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144768
24	NC_015583	CGA	2	6	2884	2889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144768
25	NC_015583	TTA	2	6	3143	3148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144769
26	NC_015583	CTT	2	6	3222	3227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144769
27	NC_015583	CAT	2	6	3246	3251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144769
28	NC_015583	CGC	2	6	3708	3713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144769
29	NC_015583	AGT	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144769
30	NC_015583	CAA	2	6	3834	3839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144769
31	NC_015583	GTT	2	6	3849	3854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144769
32	NC_015583	GCC	2	6	3945	3950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144769
33	NC_015583	CAG	2	6	3975	3980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144769
34	NC_015583	CGG	2	6	4037	4042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144769
35	NC_015583	GGC	2	6	4110	4115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144769
36	NC_015583	CAG	2	6	4122	4127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144769
37	NC_015583	TGC	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144769
38	NC_015583	GCC	2	6	4215	4220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144769
39	NC_015583	CGG	2	6	4222	4227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144769
40	NC_015583	CGT	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144769
41	NC_015583	CGC	2	6	4308	4313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144769
42	NC_015583	AGC	2	6	4328	4333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144769
43	NC_015583	CCA	2	6	4382	4387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144769
44	NC_015583	CAC	3	9	4473	4481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144769
45	NC_015583	CGG	2	6	4544	4549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144769
46	NC_015583	CTG	2	6	4551	4556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144769
47	NC_015583	GGC	2	6	4773	4778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144769
48	NC_015583	CGC	2	6	5179	5184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144770
49	NC_015583	GCG	2	6	5217	5222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144770
50	NC_015583	GGC	2	6	5231	5236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144770
51	NC_015583	GAT	2	6	5295	5300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144770
52	NC_015583	TCG	2	6	5330	5335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144770
53	NC_015583	GTC	2	6	5336	5341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144770
54	NC_015583	CGC	2	6	5374	5379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144770
55	NC_015583	CGA	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144770
56	NC_015583	GCC	2	6	5689	5694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144770
57	NC_015583	TGA	2	6	5727	5732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144770
58	NC_015583	TGC	2	6	5745	5750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144770
59	NC_015583	GCC	2	6	5764	5769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144770
60	NC_015583	GCG	2	6	5889	5894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144770
61	NC_015583	CGG	2	6	5955	5960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144770
62	NC_015583	GTC	2	6	5980	5985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144770
63	NC_015583	CAT	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144770
64	NC_015583	GGT	2	6	6037	6042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144770
65	NC_015583	GTG	2	6	6053	6058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144770
66	NC_015583	CAC	2	6	6091	6096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144770
67	NC_015583	GCG	2	6	6124	6129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144770
68	NC_015583	GAT	2	6	6133	6138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144770
69	NC_015583	GTA	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144770
70	NC_015583	GCG	2	6	6190	6195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144770
71	NC_015583	CCG	2	6	6204	6209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144770
72	NC_015583	GCC	5	15	6483	6497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144771
73	NC_015583	TTG	2	6	6673	6678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144771
74	NC_015583	CGG	2	6	6707	6712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144771
75	NC_015583	TGT	2	6	6773	6778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144771
76	NC_015583	GAA	2	6	6828	6833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144771
77	NC_015583	GTG	2	6	6922	6927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144771
78	NC_015583	CGA	2	6	6950	6955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144771
79	NC_015583	ACC	2	6	6958	6963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144771
80	NC_015583	GTG	2	6	6982	6987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144771
81	NC_015583	CCG	2	6	6988	6993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144771
82	NC_015583	GCG	2	6	7042	7047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144771
83	NC_015583	GAT	2	6	7056	7061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144771
84	NC_015583	GCA	2	6	7085	7090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144771
85	NC_015583	AGT	2	6	7142	7147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144771
86	NC_015583	GCC	2	6	7239	7244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144771
87	NC_015583	GTA	2	6	7299	7304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144771
88	NC_015583	GCC	2	6	7677	7682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144771
89	NC_015583	CCG	2	6	7709	7714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144771
90	NC_015583	TGC	2	6	7733	7738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144771
91	NC_015583	CGA	2	6	7770	7775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144771
92	NC_015583	CCG	2	6	7781	7786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144771
93	NC_015583	GCT	2	6	7833	7838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144771
94	NC_015583	GCC	2	6	7875	7880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144771
95	NC_015583	CGG	2	6	8057	8062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144771
96	NC_015583	TAG	2	6	8119	8124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144771
97	NC_015583	TCG	3	9	8147	8155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144771
98	NC_015583	GCG	2	6	8159	8164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144771
99	NC_015583	GTT	2	6	8256	8261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144771
100	NC_015583	CTG	2	6	8265	8270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144771
101	NC_015583	GCC	2	6	8343	8348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144771
102	NC_015583	CGG	2	6	8441	8446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144771
103	NC_015583	CCG	2	6	8542	8547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144771
104	NC_015583	TCG	2	6	8566	8571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144771
105	NC_015583	TGG	2	6	8717	8722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144771
106	NC_015583	GGT	2	6	8742	8747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144771
107	NC_015583	CGC	2	6	8804	8809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144771
108	NC_015583	CCG	2	6	8918	8923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144771
109	NC_015583	GCT	2	6	8948	8953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144771
110	NC_015583	CGC	2	6	8993	8998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144771
111	NC_015583	CAC	2	6	9161	9166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144771
112	NC_015583	GCC	2	6	9639	9644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144772
113	NC_015583	GCG	2	6	9771	9776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144772
114	NC_015583	GCA	2	6	9833	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144772
115	NC_015583	CCG	2	6	9852	9857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144772
116	NC_015583	GTC	2	6	9902	9907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144772
117	NC_015583	CGT	2	6	10034	10039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144773
118	NC_015583	ATC	2	6	10048	10053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144773
119	NC_015583	GCG	2	6	10143	10148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144773
120	NC_015583	GGT	2	6	10160	10165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144773
121	NC_015583	GAA	2	6	10338	10343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144773
122	NC_015583	TCG	2	6	10550	10555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144773
123	NC_015583	CGC	2	6	10571	10576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144773
124	NC_015583	AAC	2	6	10678	10683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144773
125	NC_015583	ATC	2	6	11005	11010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144774
126	NC_015583	CTT	2	6	11082	11087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144774
127	NC_015583	ATG	2	6	11152	11157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144774
128	NC_015583	CGG	2	6	11168	11173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144774
129	NC_015583	CAG	2	6	11174	11179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144774
130	NC_015583	CCG	2	6	11269	11274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144774
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