MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Mpl

Total Repeats: 319

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015583	AG	3	6	1225	1230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015583	CG	3	6	1303	1308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015583	CG	3	6	4869	4874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015583	CG	3	6	9213	9218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015583	TG	3	6	10826	10831	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015583	GC	3	6	14760	14765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015583	AG	3	6	17693	17698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015583	CT	3	6	18861	18866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015583	CG	3	6	30797	30802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015583	GC	3	6	30945	30950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015583	GC	4	8	30981	30988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015583	CT	3	6	35973	35978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015583	GC	3	6	39052	39057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015583	TC	3	6	53322	53327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015583	AT	3	6	54750	54755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015583	CG	3	6	56793	56798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015583	GA	3	6	70931	70936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015583	TC	3	6	73605	73610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015583	CT	3	6	75872	75877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015583	AG	3	6	92789	92794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015583	GA	3	6	93025	93030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015583	TC	3	6	96927	96932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015583	TA	3	6	97026	97031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015583	CT	4	8	105128	105135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015583	GC	3	6	115229	115234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015583	CG	3	6	119765	119770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015583	GC	3	6	121218	121223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015583	GC	4	8	123656	123663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015583	GC	4	8	123674	123681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015583	GA	3	6	123692	123697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015583	TC	3	6	128747	128752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015583	TG	3	6	128913	128918	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015583	AC	3	6	129062	129067	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015583	GC	3	6	146155	146160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015583	CG	3	6	148280	148285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015583	GC	3	6	148412	148417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015583	GT	3	6	155396	155401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015583	CG	3	6	162135	162140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015583	GC	3	6	162252	162257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015583	AG	4	8	162302	162309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015583	GC	3	6	162483	162488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015583	GC	3	6	162670	162675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015583	GC	3	6	163082	163087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015583	GC	3	6	164128	164133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015583	CG	3	6	170599	170604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015583	CG	3	6	179814	179819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015583	AG	3	6	181163	181168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015583	GC	3	6	185297	185302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015583	AG	3	6	188534	188539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015583	GC	3	6	190079	190084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015583	AG	3	6	190258	190263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015583	GC	3	6	192206	192211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015583	CG	3	6	199337	199342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015583	GC	3	6	199478	199483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015583	CG	3	6	199775	199780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015583	GT	3	6	204431	204436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015583	GC	4	8	208752	208759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015583	GC	4	8	212078	212085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015583	TC	4	8	239980	239987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015583	AT	3	6	243922	243927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015583	GC	3	6	244082	244087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015583	GC	4	8	244157	244164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015583	GC	4	8	244189	244196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015583	GC	3	6	245930	245935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015583	GC	3	6	250700	250705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015583	CG	3	6	259097	259102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015583	GC	3	6	263611	263616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015583	CG	3	6	263825	263830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015583	GC	3	6	267707	267712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015583	TC	3	6	270424	270429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015583	GC	4	8	270548	270555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015583	CT	3	6	271572	271577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015583	AT	4	8	277523	277530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015583	CT	3	6	277576	277581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015583	TC	3	6	279458	279463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015583	GC	3	6	285723	285728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015583	AT	4	8	285794	285801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015583	TC	3	6	306752	306757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015583	GA	3	6	306920	306925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015583	CG	3	6	316769	316774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015583	CT	3	6	336420	336425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015583	TC	3	6	336587	336592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015583	CG	3	6	336830	336835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015583	TC	3	6	339875	339880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015583	CG	3	6	339937	339942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015583	TC	4	8	340350	340357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015583	TA	3	6	340382	340387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015583	GA	4	8	340559	340566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015583	CG	3	6	344332	344337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015583	GA	3	6	350393	350398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015583	AT	4	8	362057	362064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015583	GA	3	6	362805	362810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015583	GA	3	6	366481	366486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015583	TC	3	6	369609	369614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015583	GA	3	6	374615	374620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015583	AT	3	6	374997	375002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015583	CG	3	6	379960	379965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015583	GC	3	6	383265	383270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015583	GC	4	8	384739	384746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015583	GT	3	6	391516	391521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015583	AC	3	6	391559	391564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015583	GC	3	6	405023	405028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015583	TA	3	6	420417	420422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015583	GC	3	6	428789	428794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015583	CA	3	6	430186	430191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015583	CG	3	6	434371	434376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015583	CG	3	6	434389	434394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015583	GA	3	6	434433	434438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015583	AC	3	6	438187	438192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015583	GC	3	6	439436	439441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015583	TC	3	6	445158	445163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015583	CG	4	8	447935	447942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015583	GC	3	6	448037	448042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015583	GC	3	6	448103	448108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015583	GC	3	6	448205	448210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015583	GC	3	6	452637	452642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015583	CG	3	6	452727	452732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015583	CG	3	6	452999	453004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015583	GC	3	6	453012	453017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015583	GC	3	6	461428	461433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015583	GC	3	6	463073	463078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015583	CG	3	6	466712	466717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015583	CG	3	6	466730	466735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015583	GA	3	6	466774	466779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015583	GC	3	6	484245	484250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015583	CG	3	6	484363	484368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015583	TC	3	6	484370	484375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015583	TC	3	6	484850	484855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015583	CA	3	6	487386	487391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015583	CG	3	6	487680	487685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015583	CG	3	6	491829	491834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015583	GC	3	6	491947	491952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015583	AC	3	6	498546	498551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015583	CG	3	6	498773	498778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015583	TG	3	6	498891	498896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015583	GC	3	6	506287	506292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015583	GC	3	6	517914	517919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015583	GA	3	6	520428	520433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015583	GA	3	6	521619	521624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015583	AC	3	6	524345	524350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015583	CT	3	6	529178	529183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015583	GA	3	6	530017	530022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015583	GA	3	6	532618	532623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015583	CG	4	8	536653	536660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015583	GC	3	6	537501	537506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015583	TC	3	6	541636	541641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015583	CG	3	6	549388	549393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015583	TC	3	6	549942	549947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015583	CG	3	6	564334	564339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_015583	CT	3	6	567088	567093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015583	CG	3	6	568482	568487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_015583	GC	3	6	568582	568587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015583	GC	3	6	573134	573139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_015583	GC	4	8	575074	575081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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308	NC_015583	AG	3	6	1117457	1117462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
309	NC_015583	GA	3	6	1124680	1124685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
310	NC_015583	TG	3	6	1124814	1124819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
311	NC_015583	GC	3	6	1127184	1127189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
312	NC_015583	GC	3	6	1129680	1129685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
313	NC_015583	TA	3	6	1129734	1129739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
314	NC_015583	CG	3	6	1136158	1136163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
315	NC_015583	GC	3	6	1140660	1140665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
316	NC_015583	GC	3	6	1140745	1140750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
317	NC_015583	GC	3	6	1150825	1150830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
318	NC_015583	GC	3	6	1153570	1153575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
319	NC_015583	GC	3	6	1153777	1153782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.