MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Spl

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015582	CCCGTC	2	12	3517	3528	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	334143050
2	NC_015582	TGCCCT	2	12	4473	4484	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	334143050
3	NC_015582	GGTGAC	2	12	6853	6864	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334143051
4	NC_015582	TGCGCT	2	12	8142	8153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143051
5	NC_015582	TGGCGA	2	12	10194	10205	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334143051
6	NC_015582	TCATCG	2	12	13410	13421	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	334143055
7	NC_015582	AGGACG	2	12	18581	18592	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	334143065
8	NC_015582	CTCGAT	2	12	19097	19108	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	334143066
9	NC_015582	GCCTGA	2	12	19640	19651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334143066
10	NC_015582	ACTGGC	2	12	20026	20037	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334143067
11	NC_015582	CGGTGT	2	12	21655	21666	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	334143069
12	NC_015582	GATGCG	2	12	22184	22195	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334143069
13	NC_015582	ATCAGC	2	12	22920	22931	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	334143069
14	NC_015582	CGCCAA	2	12	25571	25582	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	334143071
15	NC_015582	GGCGCA	2	12	33655	33666	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334143078
16	NC_015582	GAGGCC	2	12	36470	36481	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334143082
17	NC_015582	TCGGCA	2	12	36909	36920	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334143082
18	NC_015582	AGAGCG	2	12	38053	38064	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	334143082
19	NC_015582	GGCGTT	2	12	39721	39732	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	334143085
20	NC_015582	GGGATG	2	12	47807	47818	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	334143098

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.