MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Spl

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015582	AAAAG	2	10	1223	1232	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015582	CATGA	2	10	2326	2335	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015582	ACGGC	2	10	2460	2469	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015582	CCTGC	2	10	3727	3736	0 %	20 %	20 %	60 %	334143050
5	NC_015582	CCGGC	2	10	5002	5011	0 %	0 %	40 %	60 %	334143050
6	NC_015582	GCCCT	2	10	5227	5236	0 %	20 %	20 %	60 %	334143051
7	NC_015582	TGCCG	2	10	6266	6275	0 %	20 %	40 %	40 %	334143051
8	NC_015582	GCAAG	2	10	7148	7157	40 %	0 %	40 %	20 %	334143051
9	NC_015582	ATTTC	2	10	12197	12206	20 %	60 %	0 %	20 %	334143053
10	NC_015582	ATTTT	2	10	12432	12441	20 %	80 %	0 %	0 %	334143053
11	NC_015582	TGCAC	2	10	14099	14108	20 %	20 %	20 %	40 %	334143056
12	NC_015582	GAACA	2	10	14258	14267	60 %	0 %	20 %	20 %	334143057
13	NC_015582	CGGAG	2	10	14299	14308	20 %	0 %	60 %	20 %	334143057
14	NC_015582	CTTCG	2	10	14923	14932	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015582	TGATC	2	10	15381	15390	20 %	40 %	20 %	20 %	334143058
16	NC_015582	GGCGG	2	10	15734	15743	0 %	0 %	80 %	20 %	334143059
17	NC_015582	GGGGC	2	10	16652	16661	0 %	0 %	80 %	20 %	334143060
18	NC_015582	CGGAA	2	10	17144	17153	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015582	GGCCG	2	10	18243	18252	0 %	0 %	60 %	40 %	334143065
20	NC_015582	CAGGG	2	10	18309	18318	20 %	0 %	60 %	20 %	334143065
21	NC_015582	GCATG	2	10	24051	24060	20 %	20 %	40 %	20 %	334143070
22	NC_015582	GAAGA	2	10	24334	24343	60 %	0 %	40 %	0 %	334143070
23	NC_015582	CGGAA	2	10	28097	28106	40 %	0 %	40 %	20 %	334143074
24	NC_015582	CGCAG	2	10	28869	28878	20 %	0 %	40 %	40 %	334143074
25	NC_015582	AGGGC	2	10	28993	29002	20 %	0 %	60 %	20 %	334143074
26	NC_015582	AGGTC	2	10	29263	29272	20 %	20 %	40 %	20 %	334143074
27	NC_015582	GCGGG	2	10	32163	32172	0 %	0 %	80 %	20 %	334143077
28	NC_015582	TGCTC	2	10	35338	35347	0 %	40 %	20 %	40 %	334143080
29	NC_015582	GCTTG	2	10	35715	35724	0 %	40 %	40 %	20 %	334143081
30	NC_015582	GCCGC	2	10	39344	39353	0 %	0 %	40 %	60 %	334143085
31	NC_015582	GTCCT	2	10	39558	39567	0 %	40 %	20 %	40 %	334143085
32	NC_015582	GCCTT	2	10	41942	41951	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_015582	CGGCG	2	10	42084	42093	0 %	0 %	60 %	40 %	334143089
34	NC_015582	AAAGG	2	10	44009	44018	60 %	0 %	40 %	0 %	334143092
35	NC_015582	GTGCA	2	10	44400	44409	20 %	20 %	40 %	20 %	334143093
36	NC_015582	CAAGA	2	10	46297	46306	60 %	0 %	20 %	20 %	334143095
37	NC_015582	ACGGC	2	10	48060	48069	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.