Penta-nucleotide Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Spl
Total Repeats: 30
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_015582 | CCTGC | 2 | 10 | 3727 | 3736 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | 334143050 |
2 | NC_015582 | CCGGC | 2 | 10 | 5002 | 5011 | 0 % | 0 % | 40 % | 60 % | 334143050 |
3 | NC_015582 | GCCCT | 2 | 10 | 5227 | 5236 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | 334143051 |
4 | NC_015582 | TGCCG | 2 | 10 | 6266 | 6275 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 334143051 |
5 | NC_015582 | GCAAG | 2 | 10 | 7148 | 7157 | 40 % | 0 % | 40 % | 20 % | 334143051 |
6 | NC_015582 | ATTTC | 2 | 10 | 12197 | 12206 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 334143053 |
7 | NC_015582 | ATTTT | 2 | 10 | 12432 | 12441 | 20 % | 80 % | 0 % | 0 % | 334143053 |
8 | NC_015582 | TGCAC | 2 | 10 | 14099 | 14108 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 334143056 |
9 | NC_015582 | GAACA | 2 | 10 | 14258 | 14267 | 60 % | 0 % | 20 % | 20 % | 334143057 |
10 | NC_015582 | CGGAG | 2 | 10 | 14299 | 14308 | 20 % | 0 % | 60 % | 20 % | 334143057 |
11 | NC_015582 | TGATC | 2 | 10 | 15381 | 15390 | 20 % | 40 % | 20 % | 20 % | 334143058 |
12 | NC_015582 | GGCGG | 2 | 10 | 15734 | 15743 | 0 % | 0 % | 80 % | 20 % | 334143059 |
13 | NC_015582 | GGGGC | 2 | 10 | 16652 | 16661 | 0 % | 0 % | 80 % | 20 % | 334143060 |
14 | NC_015582 | GGCCG | 2 | 10 | 18243 | 18252 | 0 % | 0 % | 60 % | 40 % | 334143065 |
15 | NC_015582 | CAGGG | 2 | 10 | 18309 | 18318 | 20 % | 0 % | 60 % | 20 % | 334143065 |
16 | NC_015582 | GCATG | 2 | 10 | 24051 | 24060 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 334143070 |
17 | NC_015582 | GAAGA | 2 | 10 | 24334 | 24343 | 60 % | 0 % | 40 % | 0 % | 334143070 |
18 | NC_015582 | CGGAA | 2 | 10 | 28097 | 28106 | 40 % | 0 % | 40 % | 20 % | 334143074 |
19 | NC_015582 | CGCAG | 2 | 10 | 28869 | 28878 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 334143074 |
20 | NC_015582 | AGGGC | 2 | 10 | 28993 | 29002 | 20 % | 0 % | 60 % | 20 % | 334143074 |
21 | NC_015582 | AGGTC | 2 | 10 | 29263 | 29272 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 334143074 |
22 | NC_015582 | GCGGG | 2 | 10 | 32163 | 32172 | 0 % | 0 % | 80 % | 20 % | 334143077 |
23 | NC_015582 | TGCTC | 2 | 10 | 35338 | 35347 | 0 % | 40 % | 20 % | 40 % | 334143080 |
24 | NC_015582 | GCTTG | 2 | 10 | 35715 | 35724 | 0 % | 40 % | 40 % | 20 % | 334143081 |
25 | NC_015582 | GCCGC | 2 | 10 | 39344 | 39353 | 0 % | 0 % | 40 % | 60 % | 334143085 |
26 | NC_015582 | GTCCT | 2 | 10 | 39558 | 39567 | 0 % | 40 % | 20 % | 40 % | 334143085 |
27 | NC_015582 | CGGCG | 2 | 10 | 42084 | 42093 | 0 % | 0 % | 60 % | 40 % | 334143089 |
28 | NC_015582 | AAAGG | 2 | 10 | 44009 | 44018 | 60 % | 0 % | 40 % | 0 % | 334143092 |
29 | NC_015582 | GTGCA | 2 | 10 | 44400 | 44409 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 334143093 |
30 | NC_015582 | CAAGA | 2 | 10 | 46297 | 46306 | 60 % | 0 % | 20 % | 20 % | 334143095 |