MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Spl

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015582	TCGC	2	8	395	402	0 %	25 %	25 %	50 %	334143045
2	NC_015582	GCCG	2	8	2188	2195	0 %	0 %	50 %	50 %	334143048
3	NC_015582	TGGA	2	8	2365	2372	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015582	CTTC	2	8	2677	2684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015582	CGGC	2	8	3226	3233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015582	CGAC	2	8	4136	4143	25 %	0 %	25 %	50 %	334143050
7	NC_015582	AGCC	2	8	4364	4371	25 %	0 %	25 %	50 %	334143050
8	NC_015582	TTGC	2	8	4714	4721	0 %	50 %	25 %	25 %	334143050
9	NC_015582	TGGC	2	8	5327	5334	0 %	25 %	50 %	25 %	334143051
10	NC_015582	GCGA	2	8	5570	5577	25 %	0 %	50 %	25 %	334143051
11	NC_015582	CAGC	2	8	5700	5707	25 %	0 %	25 %	50 %	334143051
12	NC_015582	CCCA	2	8	7355	7362	25 %	0 %	0 %	75 %	334143051
13	NC_015582	GACG	2	8	7734	7741	25 %	0 %	50 %	25 %	334143051
14	NC_015582	CGAA	2	8	8219	8226	50 %	0 %	25 %	25 %	334143051
15	NC_015582	CTTC	2	8	8259	8266	0 %	50 %	0 %	50 %	334143051
16	NC_015582	CGAG	2	8	8768	8775	25 %	0 %	50 %	25 %	334143051
17	NC_015582	CGAG	2	8	8901	8908	25 %	0 %	50 %	25 %	334143051
18	NC_015582	CCGA	2	8	9026	9033	25 %	0 %	25 %	50 %	334143051
19	NC_015582	TGAA	2	8	9869	9876	50 %	25 %	25 %	0 %	334143051
20	NC_015582	GATC	2	8	10119	10126	25 %	25 %	25 %	25 %	334143051
21	NC_015582	CTTC	2	8	10239	10246	0 %	50 %	0 %	50 %	334143051
22	NC_015582	CGTT	2	8	10439	10446	0 %	50 %	25 %	25 %	334143051
23	NC_015582	GCAT	2	8	10816	10823	25 %	25 %	25 %	25 %	334143051
24	NC_015582	GCGA	2	8	10850	10857	25 %	0 %	50 %	25 %	334143051
25	NC_015582	CCTT	2	8	10951	10958	0 %	50 %	0 %	50 %	334143052
26	NC_015582	CGGG	2	8	11330	11337	0 %	0 %	75 %	25 %	334143052
27	NC_015582	GATC	2	8	11711	11718	25 %	25 %	25 %	25 %	334143052
28	NC_015582	TATG	2	8	11934	11941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015582	CAAT	2	8	12266	12273	50 %	25 %	0 %	25 %	334143053
30	NC_015582	TGAT	2	8	12508	12515	25 %	50 %	25 %	0 %	334143053
31	NC_015582	GCAA	2	8	12530	12537	50 %	0 %	25 %	25 %	334143053
32	NC_015582	GCTC	2	8	12701	12708	0 %	25 %	25 %	50 %	334143053
33	NC_015582	TTCA	2	8	12773	12780	25 %	50 %	0 %	25 %	334143053
34	NC_015582	GAAG	2	8	13354	13361	50 %	0 %	50 %	0 %	334143055
35	NC_015582	AGGG	2	8	13573	13580	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015582	GAAG	2	8	13758	13765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015582	TCAT	2	8	13893	13900	25 %	50 %	0 %	25 %	334143056
38	NC_015582	GAAT	2	8	13937	13944	50 %	25 %	25 %	0 %	334143056
39	NC_015582	GTAG	2	8	13990	13997	25 %	25 %	50 %	0 %	334143056
40	NC_015582	AATC	2	8	14063	14070	50 %	25 %	0 %	25 %	334143056
41	NC_015582	CCTT	2	8	14815	14822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015582	GTGC	2	8	15360	15367	0 %	25 %	50 %	25 %	334143058
43	NC_015582	AACG	2	8	17248	17255	50 %	0 %	25 %	25 %	334143062
44	NC_015582	CGGA	2	8	17291	17298	25 %	0 %	50 %	25 %	334143062
45	NC_015582	GATC	2	8	18051	18058	25 %	25 %	25 %	25 %	334143065
46	NC_015582	CCTC	2	8	19204	19211	0 %	25 %	0 %	75 %	334143066
47	NC_015582	GATC	2	8	19382	19389	25 %	25 %	25 %	25 %	334143066
48	NC_015582	GGGC	2	8	19787	19794	0 %	0 %	75 %	25 %	334143066
49	NC_015582	GCGA	2	8	19803	19810	25 %	0 %	50 %	25 %	334143066
50	NC_015582	CGAG	2	8	19900	19907	25 %	0 %	50 %	25 %	334143066
51	NC_015582	GAGC	2	8	20008	20015	25 %	0 %	50 %	25 %	334143066
52	NC_015582	TCCC	2	8	20443	20450	0 %	25 %	0 %	75 %	334143067
53	NC_015582	CAAC	2	8	21048	21055	50 %	0 %	0 %	50 %	334143069
54	NC_015582	TCGT	2	8	21392	21399	0 %	50 %	25 %	25 %	334143069
55	NC_015582	GGCC	2	8	21439	21446	0 %	0 %	50 %	50 %	334143069
56	NC_015582	CAGC	2	8	21949	21956	25 %	0 %	25 %	50 %	334143069
57	NC_015582	GGCA	2	8	22613	22620	25 %	0 %	50 %	25 %	334143069
58	NC_015582	CCGA	2	8	22839	22846	25 %	0 %	25 %	50 %	334143069
59	NC_015582	CCCT	2	8	23133	23140	0 %	25 %	0 %	75 %	334143069
60	NC_015582	GCCA	2	8	23174	23181	25 %	0 %	25 %	50 %	334143069
61	NC_015582	TTGC	2	8	23372	23379	0 %	50 %	25 %	25 %	334143069
62	NC_015582	GTCG	2	8	23492	23499	0 %	25 %	50 %	25 %	334143069
63	NC_015582	CGGT	2	8	23847	23854	0 %	25 %	50 %	25 %	334143069
64	NC_015582	CGCT	2	8	23877	23884	0 %	25 %	25 %	50 %	334143069
65	NC_015582	CCGA	2	8	24541	24548	25 %	0 %	25 %	50 %	334143070
66	NC_015582	CCGG	2	8	25330	25337	0 %	0 %	50 %	50 %	334143071
67	NC_015582	GCAG	2	8	25365	25372	25 %	0 %	50 %	25 %	334143071
68	NC_015582	AAGG	2	8	25656	25663	50 %	0 %	50 %	0 %	334143071
69	NC_015582	GTCA	2	8	26170	26177	25 %	25 %	25 %	25 %	334143071
70	NC_015582	GCCC	2	8	27436	27443	0 %	0 %	25 %	75 %	334143073
71	NC_015582	TCAT	2	8	27463	27470	25 %	50 %	0 %	25 %	334143073
72	NC_015582	CGGG	2	8	28201	28208	0 %	0 %	75 %	25 %	334143074
73	NC_015582	CGAA	2	8	28327	28334	50 %	0 %	25 %	25 %	334143074
74	NC_015582	TCCT	2	8	29194	29201	0 %	50 %	0 %	50 %	334143074
75	NC_015582	GCCG	2	8	29819	29826	0 %	0 %	50 %	50 %	334143075
76	NC_015582	CGCC	2	8	30154	30161	0 %	0 %	25 %	75 %	334143075
77	NC_015582	CTCG	2	8	30253	30260	0 %	25 %	25 %	50 %	334143075
78	NC_015582	TTCG	2	8	30989	30996	0 %	50 %	25 %	25 %	334143076
79	NC_015582	CCCG	2	8	31085	31092	0 %	0 %	25 %	75 %	334143076
80	NC_015582	GTCG	2	8	31442	31449	0 %	25 %	50 %	25 %	334143076
81	NC_015582	GGGC	2	8	31490	31497	0 %	0 %	75 %	25 %	334143076
82	NC_015582	GCCT	2	8	31539	31546	0 %	25 %	25 %	50 %	334143076
83	NC_015582	GGTG	2	8	31835	31842	0 %	25 %	75 %	0 %	334143076
84	NC_015582	CTGG	2	8	31868	31875	0 %	25 %	50 %	25 %	334143076
85	NC_015582	AGCC	2	8	33458	33465	25 %	0 %	25 %	50 %	334143078
86	NC_015582	GAAG	2	8	34300	34307	50 %	0 %	50 %	0 %	334143079
87	NC_015582	AGCC	2	8	34590	34597	25 %	0 %	25 %	50 %	334143079
88	NC_015582	CAGC	2	8	34604	34611	25 %	0 %	25 %	50 %	334143079
89	NC_015582	GCAG	2	8	34627	34634	25 %	0 %	50 %	25 %	334143079
90	NC_015582	TCGG	2	8	35433	35440	0 %	25 %	50 %	25 %	334143080
91	NC_015582	GTTG	2	8	35586	35593	0 %	50 %	50 %	0 %	334143081
92	NC_015582	GAGC	2	8	35899	35906	25 %	0 %	50 %	25 %	334143081
93	NC_015582	AGGT	2	8	36119	36126	25 %	25 %	50 %	0 %	334143081
94	NC_015582	CTTG	2	8	36400	36407	0 %	50 %	25 %	25 %	334143082
95	NC_015582	AGGT	2	8	37146	37153	25 %	25 %	50 %	0 %	334143082
96	NC_015582	CGAC	2	8	37753	37760	25 %	0 %	25 %	50 %	334143082
97	NC_015582	CTGG	2	8	38147	38154	0 %	25 %	50 %	25 %	334143082
98	NC_015582	ACGG	2	8	38446	38453	25 %	0 %	50 %	25 %	334143082
99	NC_015582	GAGC	2	8	38477	38484	25 %	0 %	50 %	25 %	334143082
100	NC_015582	CTGC	2	8	38604	38611	0 %	25 %	25 %	50 %	334143083
101	NC_015582	TGGT	2	8	39282	39289	0 %	50 %	50 %	0 %	334143085
102	NC_015582	TAGC	2	8	39469	39476	25 %	25 %	25 %	25 %	334143085
103	NC_015582	GCCG	2	8	39599	39606	0 %	0 %	50 %	50 %	334143085
104	NC_015582	CGTT	2	8	39921	39928	0 %	50 %	25 %	25 %	334143085
105	NC_015582	GGAA	2	8	40880	40887	50 %	0 %	50 %	0 %	334143087
106	NC_015582	TCGC	2	8	41813	41820	0 %	25 %	25 %	50 %	334143088
107	NC_015582	CGGC	2	8	41880	41887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015582	AAGC	2	8	42163	42170	50 %	0 %	25 %	25 %	334143089
109	NC_015582	TGGC	2	8	42227	42234	0 %	25 %	50 %	25 %	334143089
110	NC_015582	ACCG	2	8	43327	43334	25 %	0 %	25 %	50 %	334143091
111	NC_015582	TGGT	2	8	43784	43791	0 %	50 %	50 %	0 %	334143091
112	NC_015582	CGTG	2	8	43857	43864	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015582	GCTG	2	8	43911	43918	0 %	25 %	50 %	25 %	334143092
114	NC_015582	CTAT	2	8	44208	44215	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015582	CATC	2	8	44220	44227	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015582	GTCT	2	8	44321	44328	0 %	50 %	25 %	25 %	334143093
117	NC_015582	CTGC	2	8	44353	44360	0 %	25 %	25 %	50 %	334143093
118	NC_015582	CCTC	2	8	44846	44853	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_015582	ACGA	2	8	44929	44936	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015582	CGAT	2	8	45273	45280	25 %	25 %	25 %	25 %	334143094
121	NC_015582	CTGG	2	8	45655	45662	0 %	25 %	50 %	25 %	334143094
122	NC_015582	GCAA	2	8	46401	46408	50 %	0 %	25 %	25 %	334143096
123	NC_015582	ATTC	2	8	46810	46817	25 %	50 %	0 %	25 %	334143096
124	NC_015582	AGCG	2	8	46995	47002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015582	CGAT	2	8	47198	47205	25 %	25 %	25 %	25 %	334143097
126	NC_015582	TTCT	2	8	47985	47992	0 %	75 %	0 %	25 %	334143098
127	NC_015582	CCGA	2	8	48087	48094	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015582	CTCG	2	8	48134	48141	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.