Tetra-nucleotide Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Spl
Total Repeats: 112
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_015582 | TCGC | 2 | 8 | 395 | 402 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 334143045 |
2 | NC_015582 | GCCG | 2 | 8 | 2188 | 2195 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 334143048 |
3 | NC_015582 | CGAC | 2 | 8 | 4136 | 4143 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 334143050 |
4 | NC_015582 | AGCC | 2 | 8 | 4364 | 4371 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 334143050 |
5 | NC_015582 | TTGC | 2 | 8 | 4714 | 4721 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 334143050 |
6 | NC_015582 | TGGC | 2 | 8 | 5327 | 5334 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 334143051 |
7 | NC_015582 | GCGA | 2 | 8 | 5570 | 5577 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 334143051 |
8 | NC_015582 | CAGC | 2 | 8 | 5700 | 5707 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 334143051 |
9 | NC_015582 | CCCA | 2 | 8 | 7355 | 7362 | 25 % | 0 % | 0 % | 75 % | 334143051 |
10 | NC_015582 | GACG | 2 | 8 | 7734 | 7741 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 334143051 |
11 | NC_015582 | CGAA | 2 | 8 | 8219 | 8226 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 334143051 |
12 | NC_015582 | CTTC | 2 | 8 | 8259 | 8266 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 334143051 |
13 | NC_015582 | CGAG | 2 | 8 | 8768 | 8775 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 334143051 |
14 | NC_015582 | CGAG | 2 | 8 | 8901 | 8908 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 334143051 |
15 | NC_015582 | CCGA | 2 | 8 | 9026 | 9033 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 334143051 |
16 | NC_015582 | TGAA | 2 | 8 | 9869 | 9876 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 334143051 |
17 | NC_015582 | GATC | 2 | 8 | 10119 | 10126 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 334143051 |
18 | NC_015582 | CTTC | 2 | 8 | 10239 | 10246 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 334143051 |
19 | NC_015582 | CGTT | 2 | 8 | 10439 | 10446 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 334143051 |
20 | NC_015582 | GCAT | 2 | 8 | 10816 | 10823 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 334143051 |
21 | NC_015582 | GCGA | 2 | 8 | 10850 | 10857 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 334143051 |
22 | NC_015582 | CCTT | 2 | 8 | 10951 | 10958 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 334143052 |
23 | NC_015582 | CGGG | 2 | 8 | 11330 | 11337 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | 334143052 |
24 | NC_015582 | GATC | 2 | 8 | 11711 | 11718 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 334143052 |
25 | NC_015582 | CAAT | 2 | 8 | 12266 | 12273 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 334143053 |
26 | NC_015582 | TGAT | 2 | 8 | 12508 | 12515 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 334143053 |
27 | NC_015582 | GCAA | 2 | 8 | 12530 | 12537 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 334143053 |
28 | NC_015582 | GCTC | 2 | 8 | 12701 | 12708 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 334143053 |
29 | NC_015582 | TTCA | 2 | 8 | 12773 | 12780 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 334143053 |
30 | NC_015582 | GAAG | 2 | 8 | 13354 | 13361 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 334143055 |
31 | NC_015582 | TCAT | 2 | 8 | 13893 | 13900 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 334143056 |
32 | NC_015582 | GAAT | 2 | 8 | 13937 | 13944 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 334143056 |
33 | NC_015582 | GTAG | 2 | 8 | 13990 | 13997 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 334143056 |
34 | NC_015582 | AATC | 2 | 8 | 14063 | 14070 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 334143056 |
35 | NC_015582 | GTGC | 2 | 8 | 15360 | 15367 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 334143058 |
36 | NC_015582 | AACG | 2 | 8 | 17248 | 17255 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 334143062 |
37 | NC_015582 | CGGA | 2 | 8 | 17291 | 17298 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 334143062 |
38 | NC_015582 | GATC | 2 | 8 | 18051 | 18058 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 334143065 |
39 | NC_015582 | CCTC | 2 | 8 | 19204 | 19211 | 0 % | 25 % | 0 % | 75 % | 334143066 |
40 | NC_015582 | GATC | 2 | 8 | 19382 | 19389 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 334143066 |
41 | NC_015582 | GGGC | 2 | 8 | 19787 | 19794 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | 334143066 |
42 | NC_015582 | GCGA | 2 | 8 | 19803 | 19810 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 334143066 |
43 | NC_015582 | CGAG | 2 | 8 | 19900 | 19907 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 334143066 |
44 | NC_015582 | GAGC | 2 | 8 | 20008 | 20015 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 334143066 |
45 | NC_015582 | TCCC | 2 | 8 | 20443 | 20450 | 0 % | 25 % | 0 % | 75 % | 334143067 |
46 | NC_015582 | CAAC | 2 | 8 | 21048 | 21055 | 50 % | 0 % | 0 % | 50 % | 334143069 |
47 | NC_015582 | TCGT | 2 | 8 | 21392 | 21399 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 334143069 |
48 | NC_015582 | GGCC | 2 | 8 | 21439 | 21446 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 334143069 |
49 | NC_015582 | CAGC | 2 | 8 | 21949 | 21956 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 334143069 |
50 | NC_015582 | GGCA | 2 | 8 | 22613 | 22620 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 334143069 |
51 | NC_015582 | CCGA | 2 | 8 | 22839 | 22846 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 334143069 |
52 | NC_015582 | CCCT | 2 | 8 | 23133 | 23140 | 0 % | 25 % | 0 % | 75 % | 334143069 |
53 | NC_015582 | GCCA | 2 | 8 | 23174 | 23181 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 334143069 |
54 | NC_015582 | TTGC | 2 | 8 | 23372 | 23379 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 334143069 |
55 | NC_015582 | GTCG | 2 | 8 | 23492 | 23499 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 334143069 |
56 | NC_015582 | CGGT | 2 | 8 | 23847 | 23854 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 334143069 |
57 | NC_015582 | CGCT | 2 | 8 | 23877 | 23884 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 334143069 |
58 | NC_015582 | CCGA | 2 | 8 | 24541 | 24548 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 334143070 |
59 | NC_015582 | CCGG | 2 | 8 | 25330 | 25337 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 334143071 |
60 | NC_015582 | GCAG | 2 | 8 | 25365 | 25372 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 334143071 |
61 | NC_015582 | AAGG | 2 | 8 | 25656 | 25663 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 334143071 |
62 | NC_015582 | GTCA | 2 | 8 | 26170 | 26177 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 334143071 |
63 | NC_015582 | GCCC | 2 | 8 | 27436 | 27443 | 0 % | 0 % | 25 % | 75 % | 334143073 |
64 | NC_015582 | TCAT | 2 | 8 | 27463 | 27470 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 334143073 |
65 | NC_015582 | CGGG | 2 | 8 | 28201 | 28208 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | 334143074 |
66 | NC_015582 | CGAA | 2 | 8 | 28327 | 28334 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 334143074 |
67 | NC_015582 | TCCT | 2 | 8 | 29194 | 29201 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 334143074 |
68 | NC_015582 | GCCG | 2 | 8 | 29819 | 29826 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 334143075 |
69 | NC_015582 | CGCC | 2 | 8 | 30154 | 30161 | 0 % | 0 % | 25 % | 75 % | 334143075 |
70 | NC_015582 | CTCG | 2 | 8 | 30253 | 30260 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 334143075 |
71 | NC_015582 | TTCG | 2 | 8 | 30989 | 30996 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 334143076 |
72 | NC_015582 | CCCG | 2 | 8 | 31085 | 31092 | 0 % | 0 % | 25 % | 75 % | 334143076 |
73 | NC_015582 | GTCG | 2 | 8 | 31442 | 31449 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 334143076 |
74 | NC_015582 | GGGC | 2 | 8 | 31490 | 31497 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | 334143076 |
75 | NC_015582 | GCCT | 2 | 8 | 31539 | 31546 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 334143076 |
76 | NC_015582 | GGTG | 2 | 8 | 31835 | 31842 | 0 % | 25 % | 75 % | 0 % | 334143076 |
77 | NC_015582 | CTGG | 2 | 8 | 31868 | 31875 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 334143076 |
78 | NC_015582 | AGCC | 2 | 8 | 33458 | 33465 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 334143078 |
79 | NC_015582 | GAAG | 2 | 8 | 34300 | 34307 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 334143079 |
80 | NC_015582 | AGCC | 2 | 8 | 34590 | 34597 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 334143079 |
81 | NC_015582 | CAGC | 2 | 8 | 34604 | 34611 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 334143079 |
82 | NC_015582 | GCAG | 2 | 8 | 34627 | 34634 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 334143079 |
83 | NC_015582 | TCGG | 2 | 8 | 35433 | 35440 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 334143080 |
84 | NC_015582 | GTTG | 2 | 8 | 35586 | 35593 | 0 % | 50 % | 50 % | 0 % | 334143081 |
85 | NC_015582 | GAGC | 2 | 8 | 35899 | 35906 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 334143081 |
86 | NC_015582 | AGGT | 2 | 8 | 36119 | 36126 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 334143081 |
87 | NC_015582 | CTTG | 2 | 8 | 36400 | 36407 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 334143082 |
88 | NC_015582 | AGGT | 2 | 8 | 37146 | 37153 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 334143082 |
89 | NC_015582 | CGAC | 2 | 8 | 37753 | 37760 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 334143082 |
90 | NC_015582 | CTGG | 2 | 8 | 38147 | 38154 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 334143082 |
91 | NC_015582 | ACGG | 2 | 8 | 38446 | 38453 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 334143082 |
92 | NC_015582 | GAGC | 2 | 8 | 38477 | 38484 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 334143082 |
93 | NC_015582 | CTGC | 2 | 8 | 38604 | 38611 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 334143083 |
94 | NC_015582 | TGGT | 2 | 8 | 39282 | 39289 | 0 % | 50 % | 50 % | 0 % | 334143085 |
95 | NC_015582 | TAGC | 2 | 8 | 39469 | 39476 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 334143085 |
96 | NC_015582 | GCCG | 2 | 8 | 39599 | 39606 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 334143085 |
97 | NC_015582 | CGTT | 2 | 8 | 39921 | 39928 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 334143085 |
98 | NC_015582 | GGAA | 2 | 8 | 40880 | 40887 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 334143087 |
99 | NC_015582 | TCGC | 2 | 8 | 41813 | 41820 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 334143088 |
100 | NC_015582 | AAGC | 2 | 8 | 42163 | 42170 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 334143089 |
101 | NC_015582 | TGGC | 2 | 8 | 42227 | 42234 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 334143089 |
102 | NC_015582 | ACCG | 2 | 8 | 43327 | 43334 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 334143091 |
103 | NC_015582 | TGGT | 2 | 8 | 43784 | 43791 | 0 % | 50 % | 50 % | 0 % | 334143091 |
104 | NC_015582 | GCTG | 2 | 8 | 43911 | 43918 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 334143092 |
105 | NC_015582 | GTCT | 2 | 8 | 44321 | 44328 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 334143093 |
106 | NC_015582 | CTGC | 2 | 8 | 44353 | 44360 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 334143093 |
107 | NC_015582 | CGAT | 2 | 8 | 45273 | 45280 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 334143094 |
108 | NC_015582 | CTGG | 2 | 8 | 45655 | 45662 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 334143094 |
109 | NC_015582 | GCAA | 2 | 8 | 46401 | 46408 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 334143096 |
110 | NC_015582 | ATTC | 2 | 8 | 46810 | 46817 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 334143096 |
111 | NC_015582 | CGAT | 2 | 8 | 47198 | 47205 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 334143097 |
112 | NC_015582 | TTCT | 2 | 8 | 47985 | 47992 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 334143098 |