MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Spl

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015582	GGC	2	6	677	682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015582	GCC	2	6	689	694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015582	ATT	2	6	778	783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015582	GCA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015582	ATG	2	6	1192	1197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015582	CGG	2	6	1243	1248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015582	CGA	2	6	2307	2312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015582	GCG	2	6	2359	2364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015582	CGA	2	6	2526	2531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015582	GCG	3	9	2547	2555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015582	GCC	2	6	2558	2563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_015582	CGG	2	6	2661	2666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015582	CCG	2	6	2719	2724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015582	GCG	2	6	3241	3246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015582	CTT	2	6	5109	5114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015582	CAT	2	6	11954	11959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015582	ATA	2	6	11982	11987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015582	ACC	2	6	13170	13175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015582	ATG	2	6	13533	13538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015582	GGC	2	6	13545	13550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015582	AGC	2	6	13609	13614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015582	TCA	2	6	13686	13691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015582	TAT	2	6	13802	13807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015582	GCG	2	6	14907	14912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015582	GAA	2	6	15619	15624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015582	GAC	2	6	16680	16685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015582	GAG	2	6	17400	17405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015582	TGA	2	6	18008	18013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015582	AAG	2	6	18660	18665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015582	GCG	3	9	18679	18687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015582	GGC	2	6	18711	18716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015582	TTC	2	6	18737	18742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015582	TCC	2	6	18750	18755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015582	GCA	2	6	18814	18819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015582	GAG	2	6	24641	24646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015582	GCC	2	6	26430	26435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015582	GTT	2	6	26465	26470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015582	TGG	2	6	27760	27765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015582	CAA	2	6	27808	27813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015582	TGC	2	6	33864	33869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015582	GGC	3	9	33885	33893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015582	GCG	2	6	33895	33900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015582	CGC	2	6	33965	33970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015582	GGC	2	6	34060	34065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015582	ATG	2	6	36218	36223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015582	TGG	2	6	39129	39134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015582	GGC	2	6	39142	39147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015582	GCG	2	6	39202	39207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015582	AGG	2	6	39215	39220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015582	GAC	2	6	39231	39236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015582	GTC	2	6	41174	41179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015582	AAG	2	6	41295	41300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015582	GAA	2	6	41301	41306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015582	GCG	2	6	41900	41905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015582	GGC	2	6	43216	43221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015582	CGT	2	6	44157	44162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015582	TGC	2	6	44937	44942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015582	GCG	2	6	45003	45008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015582	CGA	3	9	45013	45021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015582	ACG	2	6	45055	45060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015582	TTC	2	6	45075	45080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015582	CGC	2	6	46036	46041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015582	ATT	2	6	46115	46120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015582	TCG	2	6	47024	47029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015582	TGG	2	6	47041	47046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015582	TCA	2	6	47156	47161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015582	AAT	2	6	47641	47646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015582	GTT	2	6	47647	47652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015582	GCG	2	6	47670	47675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015582	CGC	2	6	48149	48154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015582	CGC	2	6	48457	48462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015582	GCC	2	6	48685	48690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.