MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Spl

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015582	CG	3	6	428	433	0 %	0 %	50 %	50 %	334143045
2	NC_015582	GC	3	6	485	490	0 %	0 %	50 %	50 %	334143045
3	NC_015582	CT	3	6	891	896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015582	TA	3	6	1313	1318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015582	CG	3	6	1514	1519	0 %	0 %	50 %	50 %	334143047
6	NC_015582	TC	3	6	1541	1546	0 %	50 %	0 %	50 %	334143047
7	NC_015582	AT	3	6	1645	1650	50 %	50 %	0 %	0 %	334143047
8	NC_015582	CG	3	6	2628	2633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015582	GC	3	6	2640	2645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015582	GC	3	6	2877	2882	0 %	0 %	50 %	50 %	334143049
11	NC_015582	CG	3	6	3469	3474	0 %	0 %	50 %	50 %	334143050
12	NC_015582	CG	3	6	4127	4132	0 %	0 %	50 %	50 %	334143050
13	NC_015582	CG	3	6	4684	4689	0 %	0 %	50 %	50 %	334143050
14	NC_015582	TA	3	6	5509	5514	50 %	50 %	0 %	0 %	334143051
15	NC_015582	CG	3	6	5802	5807	0 %	0 %	50 %	50 %	334143051
16	NC_015582	CG	3	6	5966	5971	0 %	0 %	50 %	50 %	334143051
17	NC_015582	CG	3	6	6049	6054	0 %	0 %	50 %	50 %	334143051
18	NC_015582	GC	3	6	6124	6129	0 %	0 %	50 %	50 %	334143051
19	NC_015582	GC	3	6	7832	7837	0 %	0 %	50 %	50 %	334143051
20	NC_015582	CG	3	6	7881	7886	0 %	0 %	50 %	50 %	334143051
21	NC_015582	GT	3	6	7887	7892	0 %	50 %	50 %	0 %	334143051
22	NC_015582	GC	3	6	7920	7925	0 %	0 %	50 %	50 %	334143051
23	NC_015582	GC	3	6	8527	8532	0 %	0 %	50 %	50 %	334143051
24	NC_015582	GC	3	6	9620	9625	0 %	0 %	50 %	50 %	334143051
25	NC_015582	GC	3	6	9758	9763	0 %	0 %	50 %	50 %	334143051
26	NC_015582	CG	3	6	10581	10586	0 %	0 %	50 %	50 %	334143051
27	NC_015582	CG	3	6	10715	10720	0 %	0 %	50 %	50 %	334143051
28	NC_015582	CT	4	8	12082	12089	0 %	50 %	0 %	50 %	334143053
29	NC_015582	GA	3	6	12299	12304	50 %	0 %	50 %	0 %	334143053
30	NC_015582	AT	3	6	12344	12349	50 %	50 %	0 %	0 %	334143053
31	NC_015582	AC	3	6	12961	12966	50 %	0 %	0 %	50 %	334143054
32	NC_015582	GC	3	6	13009	13014	0 %	0 %	50 %	50 %	334143054
33	NC_015582	TG	3	6	13468	13473	0 %	50 %	50 %	0 %	334143055
34	NC_015582	AT	3	6	13899	13904	50 %	50 %	0 %	0 %	334143056
35	NC_015582	GA	3	6	16340	16345	50 %	0 %	50 %	0 %	334143059
36	NC_015582	TC	3	6	17542	17547	0 %	50 %	0 %	50 %	334143063
37	NC_015582	GC	3	6	17583	17588	0 %	0 %	50 %	50 %	334143063
38	NC_015582	CA	3	6	17765	17770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015582	GC	3	6	17821	17826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015582	GC	3	6	18114	18119	0 %	0 %	50 %	50 %	334143065
41	NC_015582	GC	3	6	18787	18792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015582	CT	3	6	18985	18990	0 %	50 %	0 %	50 %	334143066
43	NC_015582	GC	3	6	19170	19175	0 %	0 %	50 %	50 %	334143066
44	NC_015582	CG	3	6	20201	20206	0 %	0 %	50 %	50 %	334143067
45	NC_015582	GC	4	8	20347	20354	0 %	0 %	50 %	50 %	334143067
46	NC_015582	CG	3	6	20502	20507	0 %	0 %	50 %	50 %	334143067
47	NC_015582	GC	3	6	20519	20524	0 %	0 %	50 %	50 %	334143067
48	NC_015582	GC	4	8	20545	20552	0 %	0 %	50 %	50 %	334143067
49	NC_015582	GC	3	6	20620	20625	0 %	0 %	50 %	50 %	334143067
50	NC_015582	GC	4	8	21766	21773	0 %	0 %	50 %	50 %	334143069
51	NC_015582	CG	3	6	21850	21855	0 %	0 %	50 %	50 %	334143069
52	NC_015582	CG	3	6	21959	21964	0 %	0 %	50 %	50 %	334143069
53	NC_015582	GC	3	6	22647	22652	0 %	0 %	50 %	50 %	334143069
54	NC_015582	AT	3	6	23097	23102	50 %	50 %	0 %	0 %	334143069
55	NC_015582	CG	4	8	23385	23392	0 %	0 %	50 %	50 %	334143069
56	NC_015582	CG	3	6	23787	23792	0 %	0 %	50 %	50 %	334143069
57	NC_015582	CG	4	8	24450	24457	0 %	0 %	50 %	50 %	334143070
58	NC_015582	CG	3	6	24612	24617	0 %	0 %	50 %	50 %	334143070
59	NC_015582	CG	4	8	24856	24863	0 %	0 %	50 %	50 %	334143071
60	NC_015582	GC	3	6	25009	25014	0 %	0 %	50 %	50 %	334143071
61	NC_015582	TA	3	6	25455	25460	50 %	50 %	0 %	0 %	334143071
62	NC_015582	CA	3	6	25895	25900	50 %	0 %	0 %	50 %	334143071
63	NC_015582	GC	3	6	27238	27243	0 %	0 %	50 %	50 %	334143073
64	NC_015582	CG	3	6	27352	27357	0 %	0 %	50 %	50 %	334143073
65	NC_015582	GA	3	6	28893	28898	50 %	0 %	50 %	0 %	334143074
66	NC_015582	GC	4	8	29060	29067	0 %	0 %	50 %	50 %	334143074
67	NC_015582	GC	3	6	29480	29485	0 %	0 %	50 %	50 %	334143074
68	NC_015582	GC	3	6	29620	29625	0 %	0 %	50 %	50 %	334143074
69	NC_015582	GC	4	8	29665	29672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015582	GC	3	6	29926	29931	0 %	0 %	50 %	50 %	334143075
71	NC_015582	GC	3	6	29998	30003	0 %	0 %	50 %	50 %	334143075
72	NC_015582	GC	3	6	30341	30346	0 %	0 %	50 %	50 %	334143075
73	NC_015582	GC	3	6	30558	30563	0 %	0 %	50 %	50 %	334143075
74	NC_015582	GC	3	6	31061	31066	0 %	0 %	50 %	50 %	334143076
75	NC_015582	CG	3	6	31150	31155	0 %	0 %	50 %	50 %	334143076
76	NC_015582	GC	3	6	31187	31192	0 %	0 %	50 %	50 %	334143076
77	NC_015582	CG	3	6	32833	32838	0 %	0 %	50 %	50 %	334143077
78	NC_015582	CG	3	6	33304	33309	0 %	0 %	50 %	50 %	334143078
79	NC_015582	CG	4	8	33441	33448	0 %	0 %	50 %	50 %	334143078
80	NC_015582	CG	3	6	33706	33711	0 %	0 %	50 %	50 %	334143078
81	NC_015582	CG	3	6	33836	33841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015582	GA	3	6	33844	33849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015582	AG	4	8	35483	35490	50 %	0 %	50 %	0 %	334143080
84	NC_015582	AG	3	6	35535	35540	50 %	0 %	50 %	0 %	334143081
85	NC_015582	GC	3	6	35668	35673	0 %	0 %	50 %	50 %	334143081
86	NC_015582	GA	3	6	36336	36341	50 %	0 %	50 %	0 %	334143082
87	NC_015582	GC	3	6	36865	36870	0 %	0 %	50 %	50 %	334143082
88	NC_015582	GC	3	6	36940	36945	0 %	0 %	50 %	50 %	334143082
89	NC_015582	GC	3	6	37164	37169	0 %	0 %	50 %	50 %	334143082
90	NC_015582	CG	4	8	37340	37347	0 %	0 %	50 %	50 %	334143082
91	NC_015582	CG	3	6	37522	37527	0 %	0 %	50 %	50 %	334143082
92	NC_015582	GC	3	6	38128	38133	0 %	0 %	50 %	50 %	334143082
93	NC_015582	CG	4	8	38287	38294	0 %	0 %	50 %	50 %	334143082
94	NC_015582	GC	3	6	38745	38750	0 %	0 %	50 %	50 %	334143083
95	NC_015582	AG	3	6	38759	38764	50 %	0 %	50 %	0 %	334143083
96	NC_015582	CG	3	6	39004	39009	0 %	0 %	50 %	50 %	334143084
97	NC_015582	CG	3	6	39224	39229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015582	GA	3	6	39237	39242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015582	CG	3	6	40428	40433	0 %	0 %	50 %	50 %	334143086
100	NC_015582	GC	3	6	40489	40494	0 %	0 %	50 %	50 %	334143086
101	NC_015582	CG	3	6	40599	40604	0 %	0 %	50 %	50 %	334143086
102	NC_015582	AT	3	6	41158	41163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015582	TG	3	6	41289	41294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015582	TG	3	6	41386	41391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015582	GC	3	6	42490	42495	0 %	0 %	50 %	50 %	334143089
106	NC_015582	GC	3	6	43101	43106	0 %	0 %	50 %	50 %	334143090
107	NC_015582	TC	3	6	43247	43252	0 %	50 %	0 %	50 %	334143091
108	NC_015582	AT	3	6	43508	43513	50 %	50 %	0 %	0 %	334143091
109	NC_015582	CG	3	6	44075	44080	0 %	0 %	50 %	50 %	334143092
110	NC_015582	GC	3	6	44874	44879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015582	GC	3	6	44995	45000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015582	CG	3	6	45508	45513	0 %	0 %	50 %	50 %	334143094
113	NC_015582	CG	3	6	45515	45520	0 %	0 %	50 %	50 %	334143094
114	NC_015582	GC	4	8	45606	45613	0 %	0 %	50 %	50 %	334143094
115	NC_015582	GC	3	6	45802	45807	0 %	0 %	50 %	50 %	334143094
116	NC_015582	CG	3	6	45830	45835	0 %	0 %	50 %	50 %	334143094
117	NC_015582	GC	3	6	46379	46384	0 %	0 %	50 %	50 %	334143096
118	NC_015582	CG	3	6	46482	46487	0 %	0 %	50 %	50 %	334143096
119	NC_015582	GC	4	8	46582	46589	0 %	0 %	50 %	50 %	334143096
120	NC_015582	CG	3	6	47431	47436	0 %	0 %	50 %	50 %	334143097
121	NC_015582	GT	3	6	48099	48104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015582	CG	3	6	48230	48235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015582	GC	3	6	48242	48247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015582	GC	3	6	48474	48479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015582	CT	3	6	48570	48575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015582	CG	3	6	48644	48649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.