MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 2904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015580	CTCGA	2	10	2870	2879	20 %	20 %	20 %	40 %	334139604
2	NC_015580	CTCGG	2	10	2883	2892	0 %	20 %	40 %	40 %	334139604
3	NC_015580	CGGCG	2	10	2983	2992	0 %	0 %	60 %	40 %	334139604
4	NC_015580	CGATG	2	10	3259	3268	20 %	20 %	40 %	20 %	334139604
5	NC_015580	TGGCG	2	10	4255	4264	0 %	20 %	60 %	20 %	334139606
6	NC_015580	TTCCA	2	10	7934	7943	20 %	40 %	0 %	40 %	334139610
7	NC_015580	CCCGG	2	10	8893	8902	0 %	0 %	40 %	60 %	334139610
8	NC_015580	CGAAT	2	10	11333	11342	40 %	20 %	20 %	20 %	334139612
9	NC_015580	GCCGC	2	10	12668	12677	0 %	0 %	40 %	60 %	334139614
10	NC_015580	GATCT	2	10	13377	13386	20 %	40 %	20 %	20 %	334139614
11	NC_015580	GCCAT	2	10	14053	14062	20 %	20 %	20 %	40 %	334139616
12	NC_015580	GTGCC	2	10	14114	14123	0 %	20 %	40 %	40 %	334139616
13	NC_015580	GAATG	2	10	14530	14539	40 %	20 %	40 %	0 %	334139617
14	NC_015580	ATGGC	2	10	15637	15646	20 %	20 %	40 %	20 %	334139618
15	NC_015580	TGCGA	2	10	16898	16907	20 %	20 %	40 %	20 %	334139619
16	NC_015580	CCTGC	2	10	17258	17267	0 %	20 %	20 %	60 %	334139620
17	NC_015580	TGCGC	2	10	17599	17608	0 %	20 %	40 %	40 %	334139620
18	NC_015580	CGGGG	2	10	20006	20015	0 %	0 %	80 %	20 %	334139624
19	NC_015580	CGGCG	2	10	20330	20339	0 %	0 %	60 %	40 %	334139625
20	NC_015580	CGGTG	2	10	23590	23599	0 %	20 %	60 %	20 %	334139626
21	NC_015580	CGGCG	2	10	24550	24559	0 %	0 %	60 %	40 %	334139626
22	NC_015580	AGGGC	2	10	24838	24847	20 %	0 %	60 %	20 %	334139627
23	NC_015580	GCGCC	2	10	29444	29453	0 %	0 %	40 %	60 %	334139631
24	NC_015580	CGGCG	2	10	38860	38869	0 %	0 %	60 %	40 %	334139639
25	NC_015580	CGGCG	2	10	38932	38941	0 %	0 %	60 %	40 %	334139639
26	NC_015580	GGCCC	2	10	41044	41053	0 %	0 %	40 %	60 %	334139640
27	NC_015580	CAGCG	2	10	43246	43255	20 %	0 %	40 %	40 %	334139644
28	NC_015580	GGGAA	2	10	43380	43389	40 %	0 %	60 %	0 %	334139644
29	NC_015580	GATCG	2	10	43584	43593	20 %	20 %	40 %	20 %	334139644
30	NC_015580	CGCTG	2	10	45847	45856	0 %	20 %	40 %	40 %	334139646
31	NC_015580	GCCCG	2	10	47689	47698	0 %	0 %	40 %	60 %	334139648
32	NC_015580	AATCG	2	10	48018	48027	40 %	20 %	20 %	20 %	334139649
33	NC_015580	CACGC	2	10	49274	49283	20 %	0 %	20 %	60 %	334139650
34	NC_015580	AGCTG	2	10	52031	52040	20 %	20 %	40 %	20 %	334139650
35	NC_015580	GTCAT	2	10	52048	52057	20 %	40 %	20 %	20 %	334139650
36	NC_015580	CTGGG	2	10	54282	54291	0 %	20 %	60 %	20 %	334139652
37	NC_015580	CGGCG	2	10	54980	54989	0 %	0 %	60 %	40 %	334139653
38	NC_015580	CGGCC	2	10	55262	55271	0 %	0 %	40 %	60 %	334139653
39	NC_015580	GCCGC	2	10	57238	57247	0 %	0 %	40 %	60 %	334139655
40	NC_015580	CCCCA	2	10	57886	57895	20 %	0 %	0 %	80 %	334139656
41	NC_015580	CCGGG	3	15	60460	60474	0 %	0 %	60 %	40 %	334139659
42	NC_015580	CTTTT	2	10	61214	61223	0 %	80 %	0 %	20 %	334139659
43	NC_015580	CCTGA	2	10	62157	62166	20 %	20 %	20 %	40 %	334139660
44	NC_015580	CAGCC	2	10	63027	63036	20 %	0 %	20 %	60 %	334139662
45	NC_015580	GCGTT	2	10	63492	63501	0 %	40 %	40 %	20 %	334139662
46	NC_015580	TGCGC	2	10	68768	68777	0 %	20 %	40 %	40 %	334139667
47	NC_015580	GCGTC	2	10	69327	69336	0 %	20 %	40 %	40 %	334139668
48	NC_015580	ATCAA	2	10	69720	69729	60 %	20 %	0 %	20 %	334139669
49	NC_015580	GCGCC	2	10	76417	76426	0 %	0 %	40 %	60 %	334139674
50	NC_015580	GTGCG	2	10	76500	76509	0 %	20 %	60 %	20 %	334139674
51	NC_015580	ATCGA	2	10	78656	78665	40 %	20 %	20 %	20 %	334139676
52	NC_015580	CGACC	2	10	79327	79336	20 %	0 %	20 %	60 %	334139676
53	NC_015580	TCCGG	2	10	79960	79969	0 %	20 %	40 %	40 %	334139676
54	NC_015580	CGGTC	2	10	82106	82115	0 %	20 %	40 %	40 %	334139678
55	NC_015580	CAGAG	2	10	85911	85920	40 %	0 %	40 %	20 %	334139682
56	NC_015580	TCCGT	2	10	86433	86442	0 %	40 %	20 %	40 %	334139682
57	NC_015580	GCCCG	2	10	86900	86909	0 %	0 %	40 %	60 %	334139683
58	NC_015580	CGGTG	2	10	87337	87346	0 %	20 %	60 %	20 %	334139683
59	NC_015580	CGCGG	2	10	87352	87361	0 %	0 %	60 %	40 %	334139683
60	NC_015580	GCTCC	2	10	92826	92835	0 %	20 %	20 %	60 %	334139688
61	NC_015580	CGTGG	2	10	93009	93018	0 %	20 %	60 %	20 %	334139688
62	NC_015580	GCGCG	3	15	97449	97463	0 %	0 %	60 %	40 %	334139693
63	NC_015580	GATCG	2	10	101441	101450	20 %	20 %	40 %	20 %	334139694
64	NC_015580	TCGAT	2	10	102520	102529	20 %	40 %	20 %	20 %	334139694
65	NC_015580	CCGCG	2	10	102793	102802	0 %	0 %	40 %	60 %	334139694
66	NC_015580	TTGCG	2	10	104267	104276	0 %	40 %	40 %	20 %	334139695
67	NC_015580	CGCTG	2	10	104423	104432	0 %	20 %	40 %	40 %	334139695
68	NC_015580	TCCTG	2	10	107494	107503	0 %	40 %	20 %	40 %	334139697
69	NC_015580	TTCCA	2	10	107991	108000	20 %	40 %	0 %	40 %	334139697
70	NC_015580	CGCGC	2	10	110724	110733	0 %	0 %	40 %	60 %	334139700
71	NC_015580	GCCTT	2	10	114608	114617	0 %	40 %	20 %	40 %	334139703
72	NC_015580	CCGCG	2	10	115403	115412	0 %	0 %	40 %	60 %	334139704
73	NC_015580	TCCGC	2	10	115937	115946	0 %	20 %	20 %	60 %	334139704
74	NC_015580	CGAAG	2	10	116368	116377	40 %	0 %	40 %	20 %	334139704
75	NC_015580	GCGGG	2	10	118387	118396	0 %	0 %	80 %	20 %	334139707
76	NC_015580	CCGCG	2	10	120312	120321	0 %	0 %	40 %	60 %	334139710
77	NC_015580	AGCGC	2	10	121946	121955	20 %	0 %	40 %	40 %	334139712
78	NC_015580	CCGTC	2	10	122021	122030	0 %	20 %	20 %	60 %	334139712
79	NC_015580	CGATC	2	10	122169	122178	20 %	20 %	20 %	40 %	334139712
80	NC_015580	CAAGG	2	10	122571	122580	40 %	0 %	40 %	20 %	334139712
81	NC_015580	GGCCG	2	10	124129	124138	0 %	0 %	60 %	40 %	334139713
82	NC_015580	CCGGC	2	10	124781	124790	0 %	0 %	40 %	60 %	334139714
83	NC_015580	TGCCA	2	10	126553	126562	20 %	20 %	20 %	40 %	334139716
84	NC_015580	GCTGG	2	10	126567	126576	0 %	20 %	60 %	20 %	334139716
85	NC_015580	GCCGC	2	10	127718	127727	0 %	0 %	40 %	60 %	334139717
86	NC_015580	CGTGG	2	10	129158	129167	0 %	20 %	60 %	20 %	334139718
87	NC_015580	AATCG	2	10	129894	129903	40 %	20 %	20 %	20 %	334139720
88	NC_015580	GGGCG	2	10	131938	131947	0 %	0 %	80 %	20 %	334139721
89	NC_015580	GGGCG	2	10	132283	132292	0 %	0 %	80 %	20 %	334139722
90	NC_015580	CGATC	2	10	133090	133099	20 %	20 %	20 %	40 %	334139722
91	NC_015580	GTGCC	2	10	134369	134378	0 %	20 %	40 %	40 %	334139723
92	NC_015580	GCCTT	2	10	135011	135020	0 %	40 %	20 %	40 %	334139723
93	NC_015580	GGCGC	2	10	135615	135624	0 %	0 %	60 %	40 %	334139723
94	NC_015580	GTGCG	2	10	137580	137589	0 %	20 %	60 %	20 %	334139725
95	NC_015580	GGGCA	2	10	137993	138002	20 %	0 %	60 %	20 %	334139725
96	NC_015580	CGCGG	2	10	138234	138243	0 %	0 %	60 %	40 %	334139725
97	NC_015580	CGATG	2	10	139529	139538	20 %	20 %	40 %	20 %	334139727
98	NC_015580	GGCGA	2	10	141649	141658	20 %	0 %	60 %	20 %	334139729
99	NC_015580	CGATC	2	10	143865	143874	20 %	20 %	20 %	40 %	334139729
100	NC_015580	GCTCG	2	10	144166	144175	0 %	20 %	40 %	40 %	334139730
101	NC_015580	GGGCT	2	10	144812	144821	0 %	20 %	60 %	20 %	334139730
102	NC_015580	CCGTT	2	10	146355	146364	0 %	40 %	20 %	40 %	334139732
103	NC_015580	CTGGT	2	10	146621	146630	0 %	40 %	40 %	20 %	334139732
104	NC_015580	CCTGG	2	10	147005	147014	0 %	20 %	40 %	40 %	334139733
105	NC_015580	TGAAG	2	10	147248	147257	40 %	20 %	40 %	0 %	334139733
106	NC_015580	TCCCG	2	10	148136	148145	0 %	20 %	20 %	60 %	334139734
107	NC_015580	AACGA	2	10	159088	159097	60 %	0 %	20 %	20 %	334139738
108	NC_015580	CCATT	2	10	161318	161327	20 %	40 %	0 %	40 %	334139739
109	NC_015580	GTCCA	2	10	161422	161431	20 %	20 %	20 %	40 %	334139739
110	NC_015580	GATGC	2	10	162561	162570	20 %	20 %	40 %	20 %	334139740
111	NC_015580	AGGTC	2	10	162890	162899	20 %	20 %	40 %	20 %	334139740
112	NC_015580	GGATC	2	10	167189	167198	20 %	20 %	40 %	20 %	334139744
113	NC_015580	TGCGC	2	10	170448	170457	0 %	20 %	40 %	40 %	334139746
114	NC_015580	TGCCT	2	10	170611	170620	0 %	40 %	20 %	40 %	334139746
115	NC_015580	CGGGG	2	10	171600	171609	0 %	0 %	80 %	20 %	334139746
116	NC_015580	GACGA	2	10	172506	172515	40 %	0 %	40 %	20 %	334139747
117	NC_015580	CGTTG	2	10	174098	174107	0 %	40 %	40 %	20 %	334139748
118	NC_015580	CGACG	2	10	176105	176114	20 %	0 %	40 %	40 %	334139749
119	NC_015580	CGGAT	2	10	178834	178843	20 %	20 %	40 %	20 %	334139752
120	NC_015580	CGGCG	2	10	179664	179673	0 %	0 %	60 %	40 %	334139753
121	NC_015580	TCTCA	2	10	184261	184270	20 %	40 %	0 %	40 %	334139758
122	NC_015580	TCGCT	2	10	184509	184518	0 %	40 %	20 %	40 %	334139758
123	NC_015580	CAACG	2	10	184546	184555	40 %	0 %	20 %	40 %	334139758
124	NC_015580	GGGCC	2	10	184899	184908	0 %	0 %	60 %	40 %	334139759
125	NC_015580	GCTCG	2	10	186307	186316	0 %	20 %	40 %	40 %	334139760
126	NC_015580	CCGGC	2	10	188092	188101	0 %	0 %	40 %	60 %	334139762
127	NC_015580	GCTGG	2	10	188372	188381	0 %	20 %	60 %	20 %	334139763
128	NC_015580	GCTGG	2	10	190792	190801	0 %	20 %	60 %	20 %	334139765
129	NC_015580	TGCGC	2	10	191129	191138	0 %	20 %	40 %	40 %	334139766
130	NC_015580	GCGCG	2	10	191742	191751	0 %	0 %	60 %	40 %	334139766
131	NC_015580	TCCGG	2	10	191970	191979	0 %	20 %	40 %	40 %	334139766
132	NC_015580	GCAGC	2	10	192405	192414	20 %	0 %	40 %	40 %	334139766
133	NC_015580	TCCGC	2	10	192654	192663	0 %	20 %	20 %	60 %	334139766
134	NC_015580	CGGAT	2	10	194285	194294	20 %	20 %	40 %	20 %	334139768
135	NC_015580	ATGAC	2	10	196193	196202	40 %	20 %	20 %	20 %	334139769
136	NC_015580	AGCCC	2	10	198362	198371	20 %	0 %	20 %	60 %	334139771
137	NC_015580	CCGGC	2	10	199088	199097	0 %	0 %	40 %	60 %	334139771
138	NC_015580	ACCGC	2	10	200186	200195	20 %	0 %	20 %	60 %	334139772
139	NC_015580	AGGCG	2	10	200550	200559	20 %	0 %	60 %	20 %	334139773
140	NC_015580	TTCGA	2	10	201008	201017	20 %	40 %	20 %	20 %	334139773
141	NC_015580	AGGCG	2	10	201342	201351	20 %	0 %	60 %	20 %	334139773
142	NC_015580	GCGAC	2	10	202141	202150	20 %	0 %	40 %	40 %	334139774
143	NC_015580	CGTGG	2	10	205347	205356	0 %	20 %	60 %	20 %	334139779
144	NC_015580	CGCGG	2	10	208072	208081	0 %	0 %	60 %	40 %	334139782
145	NC_015580	CGGGC	2	10	208398	208407	0 %	0 %	60 %	40 %	334139782
146	NC_015580	GCTGC	2	10	208654	208663	0 %	20 %	40 %	40 %	334139782
147	NC_015580	GCCGG	2	10	211173	211182	0 %	0 %	60 %	40 %	334139784
148	NC_015580	GGGCA	2	10	211884	211893	20 %	0 %	60 %	20 %	334139785
149	NC_015580	GCGCG	2	10	212718	212727	0 %	0 %	60 %	40 %	334139786
150	NC_015580	GGCGC	2	10	214071	214080	0 %	0 %	60 %	40 %	334139787
151	NC_015580	CGTGC	2	10	216159	216168	0 %	20 %	40 %	40 %	334139789
152	NC_015580	GGACG	2	10	221070	221079	20 %	0 %	60 %	20 %	334139793
153	NC_015580	TCGGC	2	10	222604	222613	0 %	20 %	40 %	40 %	334139794
154	NC_015580	CCGGG	2	10	222640	222649	0 %	0 %	60 %	40 %	334139794
155	NC_015580	CGGCG	2	10	222660	222669	0 %	0 %	60 %	40 %	334139794
156	NC_015580	CGAAG	2	10	222923	222932	40 %	0 %	40 %	20 %	334139795
157	NC_015580	CGGCG	2	10	223292	223301	0 %	0 %	60 %	40 %	334139795
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160	NC_015580	GACTG	2	10	224435	224444	20 %	20 %	40 %	20 %	334139797
161	NC_015580	GGCGA	2	10	227536	227545	20 %	0 %	60 %	20 %	334139799
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164	NC_015580	GGGCG	2	10	229768	229777	0 %	0 %	80 %	20 %	334139801
165	NC_015580	GCGAG	2	10	229833	229842	20 %	0 %	60 %	20 %	334139801
166	NC_015580	CGCGG	2	10	231985	231994	0 %	0 %	60 %	40 %	334139802
167	NC_015580	CGTGT	2	10	233222	233231	0 %	40 %	40 %	20 %	334139803
168	NC_015580	AGCCG	2	10	234066	234075	20 %	0 %	40 %	40 %	334139805
169	NC_015580	CGGCG	2	10	236309	236318	0 %	0 %	60 %	40 %	334139806
170	NC_015580	GCGCA	2	10	237919	237928	20 %	0 %	40 %	40 %	334139807
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173	NC_015580	TTCCT	2	10	239974	239983	0 %	60 %	0 %	40 %	334139809
174	NC_015580	CGGCT	2	10	242855	242864	0 %	20 %	40 %	40 %	334139812
175	NC_015580	ATCGT	2	10	243741	243750	20 %	40 %	20 %	20 %	334139812
176	NC_015580	GGCTG	2	10	245986	245995	0 %	20 %	60 %	20 %	334139815
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187	NC_015580	CGGCT	2	10	262047	262056	0 %	20 %	40 %	40 %	334139830
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196	NC_015580	ACTGG	2	10	273939	273948	20 %	20 %	40 %	20 %	334139845
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199	NC_015580	CGCGT	2	10	276578	276587	0 %	20 %	40 %	40 %	334139846
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203	NC_015580	CTGCG	2	10	279159	279168	0 %	20 %	40 %	40 %	334139851
204	NC_015580	CTGGC	2	10	280765	280774	0 %	20 %	40 %	40 %	334139853
205	NC_015580	CCATG	2	10	281621	281630	20 %	20 %	20 %	40 %	334139854
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211	NC_015580	AGCTG	2	10	291019	291028	20 %	20 %	40 %	20 %	334139862
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225	NC_015580	GACTG	2	10	305415	305424	20 %	20 %	40 %	20 %	334139874
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230	NC_015580	CTCGT	2	10	311705	311714	0 %	40 %	20 %	40 %	334139877
231	NC_015580	GCGCC	2	10	320171	320180	0 %	0 %	40 %	60 %	334139883
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242	NC_015580	CTCTT	2	10	328452	328461	0 %	60 %	0 %	40 %	334139892
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247	NC_015580	GCTGA	2	10	342073	342082	20 %	20 %	40 %	20 %	334139904
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249	NC_015580	AACCG	2	10	343838	343847	40 %	0 %	20 %	40 %	334139906
250	NC_015580	AGCTG	2	10	343981	343990	20 %	20 %	40 %	20 %	334139906
251	NC_015580	GCAAG	2	10	344708	344717	40 %	0 %	40 %	20 %	334139906
252	NC_015580	CTGCG	2	10	345929	345938	0 %	20 %	40 %	40 %	334139907
253	NC_015580	GACGC	2	10	346076	346085	20 %	0 %	40 %	40 %	334139907
254	NC_015580	CGCGC	2	10	346529	346538	0 %	0 %	40 %	60 %	334139907
255	NC_015580	AATAG	2	10	346619	346628	60 %	20 %	20 %	0 %	334139907
256	NC_015580	CGCGA	2	10	348076	348085	20 %	0 %	40 %	40 %	334139909
257	NC_015580	GGGGA	2	10	350180	350189	20 %	0 %	80 %	0 %	334139911
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261	NC_015580	TCCGA	2	10	359088	359097	20 %	20 %	20 %	40 %	334139923
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263	NC_015580	TCGAT	2	10	360764	360773	20 %	40 %	20 %	20 %	334139924
264	NC_015580	GCGCT	2	10	360921	360930	0 %	20 %	40 %	40 %	334139925
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381	NC_015580	ACCGC	2	10	521844	521853	20 %	0 %	20 %	60 %	334140078
382	NC_015580	GGCGC	2	10	522401	522410	0 %	0 %	60 %	40 %	334140079
383	NC_015580	CGGCG	2	10	523103	523112	0 %	0 %	60 %	40 %	334140080
384	NC_015580	GCGCC	2	10	523577	523586	0 %	0 %	40 %	60 %	334140080
385	NC_015580	GGCCT	2	10	523805	523814	0 %	20 %	40 %	40 %	334140080
386	NC_015580	CGCGG	2	10	524765	524774	0 %	0 %	60 %	40 %	334140081
387	NC_015580	CGGTT	2	10	524960	524969	0 %	40 %	40 %	20 %	334140081
388	NC_015580	AGCGC	2	10	525700	525709	20 %	0 %	40 %	40 %	334140081
389	NC_015580	ATCGC	2	10	526374	526383	20 %	20 %	20 %	40 %	334140082
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