MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 1362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015580	TTGA	2	8	179	186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015580	GAAG	2	8	1377	1384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015580	GCCG	2	8	2040	2047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015580	CAAG	2	8	2073	2080	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015580	GTTA	2	8	14188	14195	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015580	GCCC	2	8	30627	30634	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_015580	AGGA	2	8	34509	34516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015580	GCCT	2	8	37886	37893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015580	CGCT	2	8	39481	39488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015580	ATCC	2	8	41811	41818	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015580	ACCT	2	8	47136	47143	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015580	TTTG	2	8	47188	47195	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015580	TCCG	2	8	53747	53754	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015580	CCGA	2	8	53845	53852	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015580	AAGC	2	8	59196	59203	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015580	CACC	2	8	66735	66742	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_015580	TCTG	2	8	67696	67703	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015580	GACC	2	8	67883	67890	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015580	CAAA	2	8	69250	69257	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015580	CTTA	2	8	74971	74978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015580	TCGC	2	8	77476	77483	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015580	TCGT	2	8	77974	77981	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015580	TGCG	2	8	83661	83668	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015580	CGAT	2	8	86652	86659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015580	ATCG	2	8	93982	93989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015580	ATCC	2	8	102955	102962	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015580	GGGC	2	8	106903	106910	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015580	TGCC	2	8	111811	111818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015580	GACT	2	8	119150	119157	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015580	CGCA	2	8	120987	120994	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015580	GATC	2	8	124646	124653	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015580	GAAT	2	8	149786	149793	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015580	CCCG	2	8	149966	149973	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_015580	GCTT	2	8	150031	150038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015580	AGCT	2	8	150099	150106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015580	TCAT	2	8	151153	151160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015580	GCGA	2	8	152351	152358	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015580	AAGC	2	8	152678	152685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015580	GAAC	2	8	152830	152837	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015580	GTGA	2	8	153175	153182	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015580	GGAG	2	8	153283	153290	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015580	GACT	2	8	153479	153486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015580	TTGG	2	8	153885	153892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015580	GAAA	2	8	154303	154310	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015580	TGAG	2	8	155217	155224	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015580	GCGA	2	8	155337	155344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015580	TGGA	2	8	155949	155956	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015580	CAGA	2	8	156019	156026	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015580	AAAG	2	8	156163	156170	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015580	ACCG	2	8	156309	156316	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015580	GCCT	2	8	157297	157304	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015580	CCTC	2	8	157726	157733	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_015580	ACCC	2	8	157986	157993	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_015580	TGGC	2	8	158476	158483	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015580	TCTA	2	8	161954	161961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015580	TCAA	2	8	162007	162014	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015580	AATT	2	8	163439	163446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015580	GCCC	3	12	164838	164849	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_015580	GGCC	2	8	171660	171667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015580	TTGT	2	8	174960	174967	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015580	GATG	2	8	175139	175146	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015580	GGCC	2	8	181124	181131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015580	CTTT	2	8	195453	195460	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015580	GCGA	2	8	196836	196843	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015580	CCTG	2	8	205006	205013	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015580	CAAT	2	8	211713	211720	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015580	CACC	2	8	215197	215204	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_015580	GCTG	2	8	224232	224239	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015580	GGCG	2	8	230571	230578	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015580	CCCT	2	8	230664	230671	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_015580	GCGG	2	8	232683	232690	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015580	TGGC	2	8	236871	236878	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015580	GCAG	3	12	244117	244128	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015580	GAGT	2	8	244409	244416	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015580	TGCG	2	8	244462	244469	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015580	CGGT	2	8	244584	244591	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015580	TTCC	2	8	245199	245206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015580	TCTG	2	8	245340	245347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015580	GGGC	2	8	250552	250559	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015580	GGCA	2	8	250936	250943	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015580	CCGC	2	8	254312	254319	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_015580	CCGG	2	8	255526	255533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015580	GAGT	2	8	255569	255576	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015580	GGCC	2	8	257513	257520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015580	CACG	2	8	257573	257580	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015580	GCCG	2	8	266020	266027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015580	CTCG	2	8	266142	266149	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015580	TCAA	2	8	266189	266196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015580	ATGG	2	8	269597	269604	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015580	TCGG	2	8	269727	269734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015580	GCGG	2	8	272642	272649	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015580	TGCG	2	8	272770	272777	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015580	GCGT	2	8	283087	283094	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015580	GGCG	2	8	284689	284696	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015580	GGTC	2	8	288023	288030	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015580	TCTT	2	8	293618	293625	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015580	GATC	2	8	293692	293699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015580	AGCG	2	8	303060	303067	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015580	TGGC	2	8	305707	305714	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015580	CGCC	2	8	305760	305767	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_015580	GCCC	2	8	315453	315460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_015580	ATTA	2	8	331855	331862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015580	TTGG	2	8	336247	336254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015580	GGCC	2	8	342360	342367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015580	GAGC	2	8	349152	349159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015580	CCTG	2	8	349322	349329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015580	GCAG	2	8	349442	349449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015580	CGAC	2	8	349940	349947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015580	GCTG	2	8	350376	350383	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015580	GTGG	2	8	350854	350861	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015580	GGGC	2	8	351440	351447	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015580	GACC	2	8	352669	352676	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015580	TTGT	2	8	353524	353531	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015580	CCTG	2	8	353537	353544	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015580	GGCG	2	8	365793	365800	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015580	GCTG	2	8	370781	370788	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015580	CCAT	2	8	374828	374835	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015580	GCTG	2	8	375462	375469	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015580	TCGC	2	8	385542	385549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015580	TTGC	2	8	386548	386555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015580	GTCC	2	8	388418	388425	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015580	CGGG	2	8	391769	391776	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015580	GGCG	2	8	392569	392576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015580	GCTG	2	8	393806	393813	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015580	CGGA	2	8	400446	400453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015580	CATG	2	8	402031	402038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015580	GCTC	2	8	403882	403889	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015580	CCGC	2	8	404068	404075	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_015580	CCCG	2	8	409868	409875	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_015580	CTTC	2	8	414238	414245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015580	CGAG	2	8	414288	414295	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015580	GCGA	2	8	414385	414392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015580	CGAT	2	8	415202	415209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015580	GGCA	2	8	415272	415279	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015580	CTCG	2	8	415334	415341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015580	GAAC	2	8	416009	416016	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015580	TCCG	2	8	416147	416154	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015580	GCCG	2	8	417346	417353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015580	CTCG	2	8	421234	421241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015580	CCAT	2	8	423361	423368	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015580	CGAA	2	8	425062	425069	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015580	CGGG	2	8	425158	425165	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015580	TGGC	2	8	425266	425273	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015580	CCTG	2	8	427022	427029	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015580	CCGC	2	8	429907	429914	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_015580	GCGA	2	8	431156	431163	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015580	ACCG	2	8	433804	433811	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015580	AGCC	2	8	443001	443008	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015580	CGGT	2	8	446021	446028	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015580	GGCG	3	12	450217	450228	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015580	TCGG	2	8	450361	450368	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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169	NC_015580	GAGG	2	8	511743	511750	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_015580	GGCT	2	8	518284	518291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
176	NC_015580	GCTG	2	8	518325	518332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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444	NC_015580	GCCA	2	8	1315089	1315096	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
445	NC_015580	ACGA	2	8	1316095	1316102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
446	NC_015580	GCTC	2	8	1316688	1316695	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
447	NC_015580	CGAA	2	8	1317718	1317725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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451	NC_015580	GGTC	2	8	1328298	1328305	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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457	NC_015580	AAGC	2	8	1343212	1343219	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
458	NC_015580	GAGC	2	8	1343937	1343944	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
459	NC_015580	ACAA	2	8	1343974	1343981	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
460	NC_015580	TGGT	2	8	1350202	1350209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
461	NC_015580	CGGT	2	8	1351006	1351013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
462	NC_015580	ATTA	2	8	1351016	1351023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_015580	CGGT	2	8	1351033	1351040	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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465	NC_015580	AATC	2	8	1362083	1362090	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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471	NC_015580	GCCG	2	8	1369311	1369318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
472	NC_015580	ACCG	2	8	1378355	1378362	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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475	NC_015580	GGCC	2	8	1378968	1378975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
476	NC_015580	TGCA	2	8	1379716	1379723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
477	NC_015580	TCGA	2	8	1379768	1379775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
478	NC_015580	GCAC	2	8	1379778	1379785	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
479	NC_015580	GAGG	2	8	1379809	1379816	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
480	NC_015580	CTGG	2	8	1383666	1383673	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
481	NC_015580	GATA	2	8	1383702	1383709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
482	NC_015580	GATC	2	8	1383938	1383945	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
483	NC_015580	GCCT	2	8	1384030	1384037	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
484	NC_015580	GGCG	3	12	1384148	1384159	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
485	NC_015580	TCGT	2	8	1386392	1386399	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
486	NC_015580	GAAG	2	8	1386580	1386587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
487	NC_015580	ATGG	2	8	1386895	1386902	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
488	NC_015580	CTGG	2	8	1386940	1386947	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
489	NC_015580	CGGC	2	8	1398432	1398439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
490	NC_015580	CTCG	2	8	1411438	1411445	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
491	NC_015580	GCAA	2	8	1411453	1411460	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
492	NC_015580	CTGG	2	8	1413055	1413062	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
493	NC_015580	GCGT	2	8	1415130	1415137	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
494	NC_015580	CCAG	2	8	1416901	1416908	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
495	NC_015580	CCTT	2	8	1417003	1417010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
496	NC_015580	CCGG	2	8	1417018	1417025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
497	NC_015580	GTAT	2	8	1419546	1419553	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_015580	GGCC	2	8	1464347	1464354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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