MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Lpl

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015579	GCCG	2	8	5722	5729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015579	CGAA	2	8	6733	6740	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015579	CGGT	2	8	7817	7824	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015579	CAGG	2	8	7897	7904	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015579	TCGT	2	8	7936	7943	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015579	TAAC	2	8	8033	8040	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015579	ACTT	2	8	8753	8760	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015579	CGGG	2	8	12063	12070	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015579	AGAC	2	8	12089	12096	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015579	GGCC	2	8	16769	16776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015579	TGGT	2	8	16794	16801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015579	CTGG	2	8	25783	25790	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015579	GCTT	2	8	39870	39877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015579	ACTG	2	8	45376	45383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015579	GGGC	2	8	45496	45503	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015579	GCTT	2	8	45618	45625	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015579	CCGT	2	8	45721	45728	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015579	ATCG	2	8	50428	50435	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015579	AGCC	2	8	50468	50475	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015579	GTCG	2	8	52064	52071	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015579	TGCC	2	8	52098	52105	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015579	CAGG	2	8	53451	53458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015579	AGCT	2	8	60316	60323	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015579	CCCT	2	8	64281	64288	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_015579	GAAG	2	8	64371	64378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015579	CGGG	2	8	80228	80235	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015579	CGCC	2	8	81590	81597	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_015579	TCGA	2	8	82206	82213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015579	TCCC	2	8	82554	82561	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_015579	TTCC	2	8	82736	82743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015579	ACTT	2	8	86300	86307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015579	CCCT	2	8	90246	90253	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_015579	GGCC	2	8	90348	90355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015579	ACCC	2	8	90433	90440	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_015579	GCCT	2	8	90584	90591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015579	AGGC	2	8	94758	94765	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015579	ATGT	2	8	96450	96457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015579	CGGA	2	8	96839	96846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015579	TCGC	2	8	98248	98255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015579	GGCG	2	8	99814	99821	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015579	CGGG	2	8	104975	104982	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015579	GCCC	2	8	105248	105255	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_015579	GTGC	2	8	105330	105337	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015579	CGGC	2	8	105352	105359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015579	GGGC	2	8	105449	105456	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015579	GCGG	2	8	105794	105801	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015579	GCTG	2	8	105815	105822	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015579	GGCG	2	8	105830	105837	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015579	GATC	2	8	105878	105885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015579	GGCC	2	8	106598	106605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015579	GCGT	2	8	110153	110160	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015579	CGAG	2	8	110306	110313	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015579	CCAG	2	8	110330	110337	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015579	CGAT	2	8	110772	110779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015579	CGGA	2	8	111260	111267	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015579	GCTC	2	8	111604	111611	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015579	CAGT	2	8	112231	112238	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015579	GACA	2	8	112326	112333	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015579	CACG	2	8	119001	119008	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015579	GAAG	2	8	119174	119181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015579	ACGG	2	8	121976	121983	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015579	ACCC	2	8	124818	124825	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_015579	GGCG	2	8	125760	125767	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015579	CCAG	2	8	126247	126254	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015579	CCCG	2	8	126919	126926	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_015579	CGTG	2	8	127083	127090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015579	AGAA	2	8	127209	127216	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015579	CTTT	2	8	128865	128872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015579	TTTG	2	8	134509	134516	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015579	AGTC	2	8	136489	136496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015579	GGCC	2	8	136529	136536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015579	CATG	2	8	136607	136614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015579	CGGG	2	8	137233	137240	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015579	TCCT	2	8	139263	139270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015579	CGGG	2	8	140274	140281	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015579	CGGA	2	8	142473	142480	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015579	GCCG	2	8	143763	143770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015579	CGAC	2	8	144255	144262	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015579	TTCC	2	8	144848	144855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015579	GCGT	2	8	148420	148427	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015579	CTCA	2	8	148797	148804	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015579	GACA	2	8	152858	152865	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015579	GCGA	2	8	152933	152940	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015579	TTCG	2	8	157558	157565	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015579	TACA	2	8	158348	158355	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015579	AGAT	2	8	161468	161475	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015579	CTGC	2	8	165079	165086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015579	CACG	2	8	165116	165123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015579	CGAT	2	8	165454	165461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015579	ACCG	2	8	166987	166994	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015579	GAAA	2	8	169693	169700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015579	AGCG	2	8	172049	172056	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015579	CCGG	2	8	172759	172766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015579	AAAG	2	8	176636	176643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015579	CTAA	2	8	178220	178227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015579	GTCG	2	8	178852	178859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015579	GCAA	2	8	178984	178991	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015579	CGAA	2	8	180069	180076	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015579	GCAA	2	8	184230	184237	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015579	GTTC	2	8	184253	184260	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015579	CGAC	2	8	186513	186520	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.