MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Lpl

Total Repeats: 391

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015579	ACCA	2	8	659	666	50 %	0 %	0 %	50 %	334133218
2	NC_015579	TCGT	2	8	835	842	0 %	50 %	25 %	25 %	334133219
3	NC_015579	CCGG	2	8	1113	1120	0 %	0 %	50 %	50 %	334133219
4	NC_015579	CGAC	2	8	1865	1872	25 %	0 %	25 %	50 %	334133219
5	NC_015579	ACGC	2	8	1918	1925	25 %	0 %	25 %	50 %	334133219
6	NC_015579	GCAG	2	8	2714	2721	25 %	0 %	50 %	25 %	334133219
7	NC_015579	GGCT	2	8	2817	2824	0 %	25 %	50 %	25 %	334133219
8	NC_015579	GCCG	2	8	2870	2877	0 %	0 %	50 %	50 %	334133219
9	NC_015579	CCGA	2	8	4513	4520	25 %	0 %	25 %	50 %	334133221
10	NC_015579	CAAC	2	8	6919	6926	50 %	0 %	0 %	50 %	334133225
11	NC_015579	AGGC	2	8	7019	7026	25 %	0 %	50 %	25 %	334133225
12	NC_015579	TCGA	2	8	7469	7476	25 %	25 %	25 %	25 %	334133225
13	NC_015579	CTGG	2	8	7513	7520	0 %	25 %	50 %	25 %	334133225
14	NC_015579	CTCG	2	8	8470	8477	0 %	25 %	25 %	50 %	334133227
15	NC_015579	GCTC	2	8	8520	8527	0 %	25 %	25 %	50 %	334133227
16	NC_015579	GACC	2	8	8660	8667	25 %	0 %	25 %	50 %	334133227
17	NC_015579	CAAC	2	8	8849	8856	50 %	0 %	0 %	50 %	334133228
18	NC_015579	TCGG	2	8	8971	8978	0 %	25 %	50 %	25 %	334133228
19	NC_015579	GCAT	2	8	9362	9369	25 %	25 %	25 %	25 %	334133228
20	NC_015579	CGAT	2	8	9427	9434	25 %	25 %	25 %	25 %	334133228
21	NC_015579	TCCA	2	8	9891	9898	25 %	25 %	0 %	50 %	334133229
22	NC_015579	GCTG	2	8	10735	10742	0 %	25 %	50 %	25 %	334133231
23	NC_015579	CGGA	2	8	11107	11114	25 %	0 %	50 %	25 %	334133231
24	NC_015579	CGAA	2	8	11891	11898	50 %	0 %	25 %	25 %	334133232
25	NC_015579	GAGC	2	8	12218	12225	25 %	0 %	50 %	25 %	334133233
26	NC_015579	CAAC	2	8	13404	13411	50 %	0 %	0 %	50 %	334133235
27	NC_015579	GGCA	2	8	13433	13440	25 %	0 %	50 %	25 %	334133235
28	NC_015579	TCCG	2	8	13452	13459	0 %	25 %	25 %	50 %	334133235
29	NC_015579	CGAC	2	8	13676	13683	25 %	0 %	25 %	50 %	334133235
30	NC_015579	TCGA	2	8	13961	13968	25 %	25 %	25 %	25 %	334133235
31	NC_015579	TCGA	2	8	14171	14178	25 %	25 %	25 %	25 %	334133235
32	NC_015579	CCTG	2	8	14261	14268	0 %	25 %	25 %	50 %	334133235
33	NC_015579	TTCT	2	8	14431	14438	0 %	75 %	0 %	25 %	334133236
34	NC_015579	CCGG	2	8	14672	14679	0 %	0 %	50 %	50 %	334133237
35	NC_015579	GCCT	2	8	15912	15919	0 %	25 %	25 %	50 %	334133238
36	NC_015579	GATC	2	8	17687	17694	25 %	25 %	25 %	25 %	334133240
37	NC_015579	AGTG	2	8	18233	18240	25 %	25 %	50 %	0 %	334133240
38	NC_015579	TGCG	2	8	18262	18269	0 %	25 %	50 %	25 %	334133240
39	NC_015579	GGCC	2	8	18787	18794	0 %	0 %	50 %	50 %	334133241
40	NC_015579	CTGG	2	8	19474	19481	0 %	25 %	50 %	25 %	334133241
41	NC_015579	TTTC	2	8	19492	19499	0 %	75 %	0 %	25 %	334133241
42	NC_015579	AACG	2	8	19621	19628	50 %	0 %	25 %	25 %	334133241
43	NC_015579	CGGC	2	8	19902	19909	0 %	0 %	50 %	50 %	334133241
44	NC_015579	ATCC	2	8	20423	20430	25 %	25 %	0 %	50 %	334133241
45	NC_015579	CAGC	2	8	20512	20519	25 %	0 %	25 %	50 %	334133241
46	NC_015579	ACGA	2	8	20988	20995	50 %	0 %	25 %	25 %	334133242
47	NC_015579	GACT	2	8	21960	21967	25 %	25 %	25 %	25 %	334133244
48	NC_015579	GCCA	2	8	22100	22107	25 %	0 %	25 %	50 %	334133244
49	NC_015579	GACC	2	8	22518	22525	25 %	0 %	25 %	50 %	334133245
50	NC_015579	TTGG	2	8	22753	22760	0 %	50 %	50 %	0 %	334133245
51	NC_015579	TGGA	2	8	22843	22850	25 %	25 %	50 %	0 %	334133245
52	NC_015579	ATCC	2	8	23212	23219	25 %	25 %	0 %	50 %	334133246
53	NC_015579	GGGC	2	8	23261	23268	0 %	0 %	75 %	25 %	334133246
54	NC_015579	TGGC	2	8	23520	23527	0 %	25 %	50 %	25 %	334133246
55	NC_015579	CCCA	2	8	23683	23690	25 %	0 %	0 %	75 %	334133246
56	NC_015579	GCCA	2	8	23694	23701	25 %	0 %	25 %	50 %	334133246
57	NC_015579	CTTG	2	8	24017	24024	0 %	50 %	25 %	25 %	334133247
58	NC_015579	CTGA	2	8	24899	24906	25 %	25 %	25 %	25 %	334133248
59	NC_015579	GCAG	2	8	25339	25346	25 %	0 %	50 %	25 %	334133248
60	NC_015579	GCTC	2	8	26047	26054	0 %	25 %	25 %	50 %	334133249
61	NC_015579	ATCG	2	8	26100	26107	25 %	25 %	25 %	25 %	334133249
62	NC_015579	GTGC	2	8	26132	26139	0 %	25 %	50 %	25 %	334133249
63	NC_015579	GCGG	2	8	26378	26385	0 %	0 %	75 %	25 %	334133249
64	NC_015579	GTGG	2	8	26461	26468	0 %	25 %	75 %	0 %	334133250
65	NC_015579	GGCA	2	8	26712	26719	25 %	0 %	50 %	25 %	334133250
66	NC_015579	CGGG	2	8	28939	28946	0 %	0 %	75 %	25 %	334133251
67	NC_015579	CCTG	2	8	30211	30218	0 %	25 %	25 %	50 %	334133252
68	NC_015579	ATCG	2	8	30334	30341	25 %	25 %	25 %	25 %	334133252
69	NC_015579	ACGA	2	8	30398	30405	50 %	0 %	25 %	25 %	334133252
70	NC_015579	AGGC	2	8	30510	30517	25 %	0 %	50 %	25 %	334133252
71	NC_015579	GGAC	2	8	30694	30701	25 %	0 %	50 %	25 %	334133252
72	NC_015579	GCAA	2	8	30806	30813	50 %	0 %	25 %	25 %	334133252
73	NC_015579	TCTG	2	8	31260	31267	0 %	50 %	25 %	25 %	334133252
74	NC_015579	CAAG	2	8	31450	31457	50 %	0 %	25 %	25 %	334133252
75	NC_015579	CGAT	2	8	32166	32173	25 %	25 %	25 %	25 %	334133252
76	NC_015579	CAAT	2	8	32312	32319	50 %	25 %	0 %	25 %	334133253
77	NC_015579	TCGA	2	8	32429	32436	25 %	25 %	25 %	25 %	334133253
78	NC_015579	CGAT	2	8	32594	32601	25 %	25 %	25 %	25 %	334133253
79	NC_015579	AGGC	2	8	32640	32647	25 %	0 %	50 %	25 %	334133253
80	NC_015579	GGTC	2	8	33159	33166	0 %	25 %	50 %	25 %	334133253
81	NC_015579	GAGG	2	8	34236	34243	25 %	0 %	75 %	0 %	334133254
82	NC_015579	TGTT	2	8	35629	35636	0 %	75 %	25 %	0 %	334133257
83	NC_015579	CTGC	2	8	35988	35995	0 %	25 %	25 %	50 %	334133257
84	NC_015579	CGGG	2	8	36016	36023	0 %	0 %	75 %	25 %	334133257
85	NC_015579	CGAT	2	8	36489	36496	25 %	25 %	25 %	25 %	334133257
86	NC_015579	GCCT	2	8	37390	37397	0 %	25 %	25 %	50 %	334133258
87	NC_015579	CGAA	2	8	38145	38152	50 %	0 %	25 %	25 %	334133259
88	NC_015579	CTGG	2	8	38403	38410	0 %	25 %	50 %	25 %	334133259
89	NC_015579	CGGC	2	8	38779	38786	0 %	0 %	50 %	50 %	334133260
90	NC_015579	ATCG	2	8	39642	39649	25 %	25 %	25 %	25 %	334133260
91	NC_015579	AGCG	2	8	40573	40580	25 %	0 %	50 %	25 %	334133261
92	NC_015579	TGAT	2	8	40739	40746	25 %	50 %	25 %	0 %	334133261
93	NC_015579	GGAA	2	8	41062	41069	50 %	0 %	50 %	0 %	334133262
94	NC_015579	CCAG	2	8	41225	41232	25 %	0 %	25 %	50 %	334133262
95	NC_015579	GATC	2	8	41549	41556	25 %	25 %	25 %	25 %	334133262
96	NC_015579	GCCA	2	8	41568	41575	25 %	0 %	25 %	50 %	334133262
97	NC_015579	GATC	2	8	41727	41734	25 %	25 %	25 %	25 %	334133262
98	NC_015579	CGCA	2	8	42577	42584	25 %	0 %	25 %	50 %	334133262
99	NC_015579	AACC	2	8	42678	42685	50 %	0 %	0 %	50 %	334133262
100	NC_015579	CGGT	2	8	42694	42701	0 %	25 %	50 %	25 %	334133262
101	NC_015579	CTTG	2	8	42735	42742	0 %	50 %	25 %	25 %	334133262
102	NC_015579	AGCG	2	8	43347	43354	25 %	0 %	50 %	25 %	334133263
103	NC_015579	GCCG	2	8	43868	43875	0 %	0 %	50 %	50 %	334133265
104	NC_015579	GTCG	2	8	44501	44508	0 %	25 %	50 %	25 %	334133265
105	NC_015579	ATCG	2	8	47383	47390	25 %	25 %	25 %	25 %	334133269
106	NC_015579	GAGC	2	8	49685	49692	25 %	0 %	50 %	25 %	334133270
107	NC_015579	ACCA	2	8	49996	50003	50 %	0 %	0 %	50 %	334133270
108	NC_015579	CTGT	2	8	50267	50274	0 %	50 %	25 %	25 %	334133271
109	NC_015579	GCCA	2	8	50780	50787	25 %	0 %	25 %	50 %	334133272
110	NC_015579	CGAT	2	8	52521	52528	25 %	25 %	25 %	25 %	334133274
111	NC_015579	GACC	2	8	53401	53408	25 %	0 %	25 %	50 %	334133275
112	NC_015579	CGGA	2	8	54126	54133	25 %	0 %	50 %	25 %	334133277
113	NC_015579	GCCG	2	8	54136	54143	0 %	0 %	50 %	50 %	334133277
114	NC_015579	ACCG	2	8	55599	55606	25 %	0 %	25 %	50 %	334133279
115	NC_015579	ATCT	2	8	55648	55655	25 %	50 %	0 %	25 %	334133279
116	NC_015579	TCCA	2	8	56002	56009	25 %	25 %	0 %	50 %	334133279
117	NC_015579	TTGT	2	8	56131	56138	0 %	75 %	25 %	0 %	334133279
118	NC_015579	TCGA	2	8	56628	56635	25 %	25 %	25 %	25 %	334133279
119	NC_015579	TGGC	2	8	56844	56851	0 %	25 %	50 %	25 %	334133279
120	NC_015579	GCCA	2	8	57586	57593	25 %	0 %	25 %	50 %	334133279
121	NC_015579	TGGC	2	8	58186	58193	0 %	25 %	50 %	25 %	334133279
122	NC_015579	CTGC	2	8	58357	58364	0 %	25 %	25 %	50 %	334133279
123	NC_015579	CTTC	2	8	58403	58410	0 %	50 %	0 %	50 %	334133279
124	NC_015579	GTCG	2	8	58413	58420	0 %	25 %	50 %	25 %	334133279
125	NC_015579	GGCG	2	8	58749	58756	0 %	0 %	75 %	25 %	334133279
126	NC_015579	AACT	2	8	59103	59110	50 %	25 %	0 %	25 %	334133280
127	NC_015579	AGCG	2	8	59761	59768	25 %	0 %	50 %	25 %	334133280
128	NC_015579	AAAC	2	8	59782	59789	75 %	0 %	0 %	25 %	334133280
129	NC_015579	TGCG	2	8	59810	59817	0 %	25 %	50 %	25 %	334133280
130	NC_015579	GAGG	2	8	60490	60497	25 %	0 %	75 %	0 %	334133281
131	NC_015579	CAAG	2	8	61623	61630	50 %	0 %	25 %	25 %	334133282
132	NC_015579	TACG	2	8	62044	62051	25 %	25 %	25 %	25 %	334133282
133	NC_015579	CCTT	2	8	62174	62181	0 %	50 %	0 %	50 %	334133282
134	NC_015579	AAGT	2	8	62765	62772	50 %	25 %	25 %	0 %	334133283
135	NC_015579	ATTT	2	8	63063	63070	25 %	75 %	0 %	0 %	334133283
136	NC_015579	CAGG	2	8	63359	63366	25 %	0 %	50 %	25 %	334133283
137	NC_015579	AGGT	2	8	63811	63818	25 %	25 %	50 %	0 %	334133283
138	NC_015579	AGCT	2	8	64539	64546	25 %	25 %	25 %	25 %	334133285
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.