MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Lpl

Total Repeats: 2182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015579	CCG	2	6	30	35	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133218
2	NC_015579	CGA	2	6	190	195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133218
3	NC_015579	CTG	2	6	262	267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133218
4	NC_015579	GGC	2	6	415	420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133218
5	NC_015579	TCA	2	6	462	467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133218
6	NC_015579	GGC	2	6	478	483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133218
7	NC_015579	AAG	2	6	698	703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133218
8	NC_015579	GCT	2	6	875	880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
9	NC_015579	CTG	2	6	907	912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
10	NC_015579	AGA	2	6	916	921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133219
11	NC_015579	CAA	2	6	953	958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334133219
12	NC_015579	CGA	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133219
13	NC_015579	CTG	2	6	1146	1151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
14	NC_015579	CGC	2	6	1325	1330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133219
15	NC_015579	TTC	2	6	1335	1340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133219
16	NC_015579	GTC	2	6	1353	1358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
17	NC_015579	CGC	2	6	1387	1392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133219
18	NC_015579	CTG	2	6	1536	1541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
19	NC_015579	CGG	2	6	1610	1615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133219
20	NC_015579	TCG	2	6	1675	1680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
21	NC_015579	TGC	2	6	1724	1729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
22	NC_015579	AGA	2	6	1826	1831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133219
23	NC_015579	GAT	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133219
24	NC_015579	CGA	2	6	1985	1990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133219
25	NC_015579	GCG	2	6	2029	2034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133219
26	NC_015579	TGC	2	6	2035	2040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
27	NC_015579	CGA	2	6	2063	2068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133219
28	NC_015579	CGC	2	6	2173	2178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133219
29	NC_015579	GGA	3	9	2189	2197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334133219
30	NC_015579	CGC	2	6	2303	2308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133219
31	NC_015579	TCT	2	6	2332	2337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133219
32	NC_015579	GTC	2	6	2547	2552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
33	NC_015579	GGC	2	6	2662	2667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133219
34	NC_015579	GCC	2	6	2745	2750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133219
35	NC_015579	GAA	2	6	2796	2801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133219
36	NC_015579	GCG	2	6	2848	2853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133219
37	NC_015579	GAA	2	6	2904	2909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133219
38	NC_015579	CGG	2	6	2921	2926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133219
39	NC_015579	ATG	2	6	2965	2970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133219
40	NC_015579	CCG	3	9	2986	2994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133219
41	NC_015579	CAT	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133220
42	NC_015579	ATT	2	6	3195	3200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334133220
43	NC_015579	CAT	2	6	3325	3330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133220
44	NC_015579	TTC	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133220
45	NC_015579	CCG	2	6	3424	3429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133220
46	NC_015579	CAT	2	6	3447	3452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133220
47	NC_015579	CGC	2	6	3473	3478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133220
48	NC_015579	TAC	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133220
49	NC_015579	TGA	2	6	3601	3606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133220
50	NC_015579	GCG	2	6	3641	3646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133220
51	NC_015579	GCT	2	6	3812	3817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133220
52	NC_015579	CCG	2	6	3888	3893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133220
53	NC_015579	GCC	2	6	4030	4035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133220
54	NC_015579	GAC	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133220
55	NC_015579	ACG	2	6	4053	4058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133220
56	NC_015579	GCT	2	6	4112	4117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133220
57	NC_015579	GCG	2	6	4124	4129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133220
58	NC_015579	CGC	2	6	4719	4724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133221
59	NC_015579	CGA	2	6	4746	4751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133221
60	NC_015579	TGG	2	6	4847	4852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133221
61	NC_015579	GGC	2	6	4887	4892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133221
62	NC_015579	GAT	2	6	4974	4979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133221
63	NC_015579	GAA	2	6	5352	5357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133221
64	NC_015579	CGC	2	6	5575	5580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133222
65	NC_015579	GTC	2	6	5611	5616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133222
66	NC_015579	TTC	2	6	5660	5665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133222
67	NC_015579	GCC	2	6	5890	5895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133223
68	NC_015579	AGC	2	6	5896	5901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133223
69	NC_015579	CCA	2	6	5933	5938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133223
70	NC_015579	CGT	2	6	5979	5984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133223
71	NC_015579	GTC	2	6	6332	6337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133224
72	NC_015579	CCG	2	6	6346	6351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133224
73	NC_015579	CAG	2	6	6376	6381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133224
74	NC_015579	CTG	2	6	6805	6810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133225
75	NC_015579	GCT	2	6	6829	6834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133225
76	NC_015579	CGC	2	6	6848	6853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133225
77	NC_015579	GCA	2	6	6901	6906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133225
78	NC_015579	ACC	2	6	6987	6992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133225
79	NC_015579	GTC	2	6	6995	7000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133225
80	NC_015579	ATG	2	6	7058	7063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133225
81	NC_015579	CAG	2	6	7088	7093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133225
82	NC_015579	CAC	2	6	7220	7225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133225
83	NC_015579	CGA	2	6	7273	7278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133225
84	NC_015579	CGA	2	6	7313	7318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133225
85	NC_015579	CAG	2	6	7454	7459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133225
86	NC_015579	CGG	2	6	7549	7554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133225
87	NC_015579	GTA	2	6	7589	7594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133225
88	NC_015579	TCG	2	6	7629	7634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133225
89	NC_015579	CCG	2	6	8080	8085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133226
90	NC_015579	GTC	2	6	8088	8093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133226
91	NC_015579	GGC	3	9	8448	8456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133227
92	NC_015579	CAA	2	6	8499	8504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334133227
93	NC_015579	GCC	2	6	8783	8788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133228
94	NC_015579	GAA	2	6	8841	8846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133228
95	NC_015579	CGA	2	6	8873	8878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133228
96	NC_015579	CGG	2	6	8924	8929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133228
97	NC_015579	ATC	2	6	8932	8937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133228
98	NC_015579	AAG	2	6	9045	9050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133228
99	NC_015579	CCA	2	6	9068	9073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133228
100	NC_015579	ACG	2	6	9115	9120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133228
101	NC_015579	ACC	2	6	9349	9354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133228
102	NC_015579	GAG	2	6	9408	9413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334133228
103	NC_015579	GCA	2	6	9882	9887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133229
104	NC_015579	ACG	2	6	9962	9967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133229
105	NC_015579	TAC	2	6	10012	10017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133229
106	NC_015579	CTG	2	6	10539	10544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133230
107	NC_015579	CAT	2	6	10682	10687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133231
108	NC_015579	ATC	2	6	10689	10694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133231
109	NC_015579	TCA	2	6	10720	10725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133231
110	NC_015579	TCT	2	6	10886	10891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133231
111	NC_015579	GCA	2	6	10988	10993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133231
112	NC_015579	CCG	2	6	11004	11009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133231
113	NC_015579	TGG	2	6	11036	11041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133231
114	NC_015579	AAG	2	6	11728	11733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133232
115	NC_015579	ATC	2	6	11761	11766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133232
116	NC_015579	CAT	2	6	11796	11801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133232
117	NC_015579	TCG	2	6	11849	11854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133232
118	NC_015579	GCC	2	6	11872	11877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133232
119	NC_015579	GAT	2	6	11926	11931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133232
120	NC_015579	CGA	2	6	11967	11972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133232
121	NC_015579	GCC	2	6	12014	12019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133232
122	NC_015579	CGC	2	6	12298	12303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133233
123	NC_015579	GGA	2	6	12375	12380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334133233
124	NC_015579	TGT	2	6	12564	12569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334133234
125	NC_015579	TGA	2	6	12670	12675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133234
126	NC_015579	AGC	2	6	12714	12719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133234
127	NC_015579	CGC	3	9	12926	12934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133234
128	NC_015579	GCC	2	6	13143	13148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133235
129	NC_015579	TGC	2	6	13181	13186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133235
130	NC_015579	GCT	2	6	13190	13195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133235
131	NC_015579	CGC	2	6	13204	13209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133235
132	NC_015579	GGC	2	6	13263	13268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133235
133	NC_015579	GGT	2	6	13271	13276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133235
134	NC_015579	CGA	2	6	13286	13291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133235
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240	NC_015579	TGG	2	6	24166	24171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133247
241	NC_015579	GCC	2	6	24213	24218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133247
242	NC_015579	TGC	2	6	24301	24306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133247
243	NC_015579	ACC	2	6	24313	24318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133247
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245	NC_015579	ACC	2	6	24669	24674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133248
246	NC_015579	AGC	2	6	24687	24692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133248
247	NC_015579	GTG	2	6	24707	24712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133248
248	NC_015579	GAG	2	6	24725	24730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334133248
249	NC_015579	CGA	2	6	24733	24738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133248
250	NC_015579	GAA	3	9	24766	24774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133248
251	NC_015579	GTC	2	6	24791	24796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133248
252	NC_015579	CGG	2	6	24817	24822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133248
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498	NC_015579	GGA	2	6	43635	43640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334133264
499	NC_015579	TGA	2	6	43669	43674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133264
500	NC_015579	GGT	2	6	43720	43725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133264

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