MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Lpl

Total Repeats: 367

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015579	TG	3	6	322	327	0 %	50 %	50 %	0 %	334133218
2	NC_015579	GC	3	6	500	505	0 %	0 %	50 %	50 %	334133218
3	NC_015579	CG	3	6	549	554	0 %	0 %	50 %	50 %	334133218
4	NC_015579	CG	3	6	646	651	0 %	0 %	50 %	50 %	334133218
5	NC_015579	CG	3	6	713	718	0 %	0 %	50 %	50 %	334133218
6	NC_015579	GA	4	8	859	866	50 %	0 %	50 %	0 %	334133219
7	NC_015579	CG	3	6	1134	1139	0 %	0 %	50 %	50 %	334133219
8	NC_015579	GC	3	6	1199	1204	0 %	0 %	50 %	50 %	334133219
9	NC_015579	GC	3	6	1247	1252	0 %	0 %	50 %	50 %	334133219
10	NC_015579	GC	3	6	2425	2430	0 %	0 %	50 %	50 %	334133219
11	NC_015579	CG	3	6	2596	2601	0 %	0 %	50 %	50 %	334133219
12	NC_015579	GC	4	8	3125	3132	0 %	0 %	50 %	50 %	334133220
13	NC_015579	GC	3	6	3377	3382	0 %	0 %	50 %	50 %	334133220
14	NC_015579	GC	3	6	4728	4733	0 %	0 %	50 %	50 %	334133221
15	NC_015579	GC	4	8	5010	5017	0 %	0 %	50 %	50 %	334133221
16	NC_015579	GA	3	6	8647	8652	50 %	0 %	50 %	0 %	334133227
17	NC_015579	TC	3	6	9177	9182	0 %	50 %	0 %	50 %	334133228
18	NC_015579	AT	3	6	9289	9294	50 %	50 %	0 %	0 %	334133228
19	NC_015579	GA	3	6	9929	9934	50 %	0 %	50 %	0 %	334133229
20	NC_015579	TC	3	6	10384	10389	0 %	50 %	0 %	50 %	334133230
21	NC_015579	CA	3	6	10467	10472	50 %	0 %	0 %	50 %	334133230
22	NC_015579	CG	3	6	11857	11862	0 %	0 %	50 %	50 %	334133232
23	NC_015579	GC	3	6	13661	13666	0 %	0 %	50 %	50 %	334133235
24	NC_015579	AT	3	6	13723	13728	50 %	50 %	0 %	0 %	334133235
25	NC_015579	GC	3	6	14447	14452	0 %	0 %	50 %	50 %	334133236
26	NC_015579	CG	3	6	14541	14546	0 %	0 %	50 %	50 %	334133237
27	NC_015579	CG	4	8	14759	14766	0 %	0 %	50 %	50 %	334133237
28	NC_015579	GC	3	6	14855	14860	0 %	0 %	50 %	50 %	334133237
29	NC_015579	GC	3	6	14947	14952	0 %	0 %	50 %	50 %	334133237
30	NC_015579	GT	3	6	15729	15734	0 %	50 %	50 %	0 %	334133238
31	NC_015579	GC	3	6	15795	15800	0 %	0 %	50 %	50 %	334133238
32	NC_015579	GC	3	6	15852	15857	0 %	0 %	50 %	50 %	334133238
33	NC_015579	CG	3	6	15920	15925	0 %	0 %	50 %	50 %	334133238
34	NC_015579	CG	3	6	16197	16202	0 %	0 %	50 %	50 %	334133239
35	NC_015579	TC	3	6	16206	16211	0 %	50 %	0 %	50 %	334133239
36	NC_015579	GC	4	8	16301	16308	0 %	0 %	50 %	50 %	334133239
37	NC_015579	CG	4	8	17064	17071	0 %	0 %	50 %	50 %	334133240
38	NC_015579	GC	3	6	17080	17085	0 %	0 %	50 %	50 %	334133240
39	NC_015579	GC	3	6	17155	17160	0 %	0 %	50 %	50 %	334133240
40	NC_015579	CG	3	6	17371	17376	0 %	0 %	50 %	50 %	334133240
41	NC_015579	GC	3	6	17537	17542	0 %	0 %	50 %	50 %	334133240
42	NC_015579	CG	3	6	17884	17889	0 %	0 %	50 %	50 %	334133240
43	NC_015579	TC	3	6	17906	17911	0 %	50 %	0 %	50 %	334133240
44	NC_015579	GC	3	6	18279	18284	0 %	0 %	50 %	50 %	334133240
45	NC_015579	GC	5	10	18957	18966	0 %	0 %	50 %	50 %	334133241
46	NC_015579	CG	4	8	19237	19244	0 %	0 %	50 %	50 %	334133241
47	NC_015579	TC	3	6	20145	20150	0 %	50 %	0 %	50 %	334133241
48	NC_015579	CA	3	6	20279	20284	50 %	0 %	0 %	50 %	334133241
49	NC_015579	GC	3	6	20287	20292	0 %	0 %	50 %	50 %	334133241
50	NC_015579	CG	3	6	21157	21162	0 %	0 %	50 %	50 %	334133242
51	NC_015579	GC	3	6	21917	21922	0 %	0 %	50 %	50 %	334133244
52	NC_015579	CG	4	8	22321	22328	0 %	0 %	50 %	50 %	334133245
53	NC_015579	GC	3	6	22362	22367	0 %	0 %	50 %	50 %	334133245
54	NC_015579	GC	3	6	22647	22652	0 %	0 %	50 %	50 %	334133245
55	NC_015579	GC	3	6	23572	23577	0 %	0 %	50 %	50 %	334133246
56	NC_015579	GC	3	6	24049	24054	0 %	0 %	50 %	50 %	334133247
57	NC_015579	AG	3	6	25261	25266	50 %	0 %	50 %	0 %	334133248
58	NC_015579	GC	3	6	25555	25560	0 %	0 %	50 %	50 %	334133248
59	NC_015579	CG	3	6	26020	26025	0 %	0 %	50 %	50 %	334133249
60	NC_015579	GC	3	6	26085	26090	0 %	0 %	50 %	50 %	334133249
61	NC_015579	GC	4	8	26521	26528	0 %	0 %	50 %	50 %	334133250
62	NC_015579	CG	4	8	26965	26972	0 %	0 %	50 %	50 %	334133250
63	NC_015579	GC	3	6	27668	27673	0 %	0 %	50 %	50 %	334133251
64	NC_015579	CG	3	6	29612	29617	0 %	0 %	50 %	50 %	334133251
65	NC_015579	GC	3	6	30616	30621	0 %	0 %	50 %	50 %	334133252
66	NC_015579	CG	3	6	31494	31499	0 %	0 %	50 %	50 %	334133252
67	NC_015579	GC	3	6	31955	31960	0 %	0 %	50 %	50 %	334133252
68	NC_015579	AG	3	6	32736	32741	50 %	0 %	50 %	0 %	334133253
69	NC_015579	GC	3	6	33233	33238	0 %	0 %	50 %	50 %	334133253
70	NC_015579	TG	3	6	34310	34315	0 %	50 %	50 %	0 %	334133254
71	NC_015579	CG	3	6	35225	35230	0 %	0 %	50 %	50 %	334133256
72	NC_015579	GT	3	6	35483	35488	0 %	50 %	50 %	0 %	334133257
73	NC_015579	TG	3	6	35589	35594	0 %	50 %	50 %	0 %	334133257
74	NC_015579	CG	3	6	36346	36351	0 %	0 %	50 %	50 %	334133257
75	NC_015579	GC	3	6	36517	36522	0 %	0 %	50 %	50 %	334133257
76	NC_015579	GC	3	6	38072	38077	0 %	0 %	50 %	50 %	334133259
77	NC_015579	GC	3	6	38101	38106	0 %	0 %	50 %	50 %	334133259
78	NC_015579	CG	4	8	38372	38379	0 %	0 %	50 %	50 %	334133259
79	NC_015579	CG	3	6	38823	38828	0 %	0 %	50 %	50 %	334133260
80	NC_015579	GC	3	6	40187	40192	0 %	0 %	50 %	50 %	334133261
81	NC_015579	CG	3	6	40237	40242	0 %	0 %	50 %	50 %	334133261
82	NC_015579	GC	3	6	40314	40319	0 %	0 %	50 %	50 %	334133261
83	NC_015579	CG	3	6	41402	41407	0 %	0 %	50 %	50 %	334133262
84	NC_015579	GC	3	6	41498	41503	0 %	0 %	50 %	50 %	334133262
85	NC_015579	CG	3	6	42768	42773	0 %	0 %	50 %	50 %	334133262
86	NC_015579	GC	3	6	43357	43362	0 %	0 %	50 %	50 %	334133263
87	NC_015579	GC	4	8	43925	43932	0 %	0 %	50 %	50 %	334133265
88	NC_015579	CG	3	6	44195	44200	0 %	0 %	50 %	50 %	334133265
89	NC_015579	GC	3	6	44709	44714	0 %	0 %	50 %	50 %	334133265
90	NC_015579	CG	3	6	46319	46324	0 %	0 %	50 %	50 %	334133266
91	NC_015579	AG	3	6	46549	46554	50 %	0 %	50 %	0 %	334133267
92	NC_015579	GC	3	6	46891	46896	0 %	0 %	50 %	50 %	334133267
93	NC_015579	AG	3	6	47736	47741	50 %	0 %	50 %	0 %	334133269
94	NC_015579	GC	3	6	50199	50204	0 %	0 %	50 %	50 %	334133271
95	NC_015579	TC	3	6	50336	50341	0 %	50 %	0 %	50 %	334133271
96	NC_015579	CA	3	6	50692	50697	50 %	0 %	0 %	50 %	334133272
97	NC_015579	AT	3	6	51010	51015	50 %	50 %	0 %	0 %	334133273
98	NC_015579	AC	3	6	53013	53018	50 %	0 %	0 %	50 %	334133274
99	NC_015579	CG	3	6	54009	54014	0 %	0 %	50 %	50 %	334133276
100	NC_015579	GC	3	6	54929	54934	0 %	0 %	50 %	50 %	334133278
101	NC_015579	CT	3	6	55114	55119	0 %	50 %	0 %	50 %	334133278
102	NC_015579	CG	3	6	55975	55980	0 %	0 %	50 %	50 %	334133279
103	NC_015579	GC	3	6	56551	56556	0 %	0 %	50 %	50 %	334133279
104	NC_015579	TG	3	6	56577	56582	0 %	50 %	50 %	0 %	334133279
105	NC_015579	CG	3	6	56822	56827	0 %	0 %	50 %	50 %	334133279
106	NC_015579	CT	3	6	57365	57370	0 %	50 %	0 %	50 %	334133279
107	NC_015579	CG	3	6	57371	57376	0 %	0 %	50 %	50 %	334133279
108	NC_015579	TG	3	6	57471	57476	0 %	50 %	50 %	0 %	334133279
109	NC_015579	CG	3	6	58229	58234	0 %	0 %	50 %	50 %	334133279
110	NC_015579	GC	3	6	58720	58725	0 %	0 %	50 %	50 %	334133279
111	NC_015579	GA	3	6	59112	59117	50 %	0 %	50 %	0 %	334133280
112	NC_015579	GA	3	6	59123	59128	50 %	0 %	50 %	0 %	334133280
113	NC_015579	GC	3	6	61154	61159	0 %	0 %	50 %	50 %	334133281
114	NC_015579	TC	3	6	61334	61339	0 %	50 %	0 %	50 %	334133281
115	NC_015579	GC	3	6	63396	63401	0 %	0 %	50 %	50 %	334133283
116	NC_015579	GC	3	6	63443	63448	0 %	0 %	50 %	50 %	334133283
117	NC_015579	GC	3	6	64753	64758	0 %	0 %	50 %	50 %	334133285
118	NC_015579	TC	3	6	65042	65047	0 %	50 %	0 %	50 %	334133285
119	NC_015579	GC	3	6	66202	66207	0 %	0 %	50 %	50 %	334133287
120	NC_015579	CG	3	6	66800	66805	0 %	0 %	50 %	50 %	334133287
121	NC_015579	GC	3	6	67948	67953	0 %	0 %	50 %	50 %	334133288
122	NC_015579	GC	3	6	68795	68800	0 %	0 %	50 %	50 %	334133289
123	NC_015579	GC	3	6	69017	69022	0 %	0 %	50 %	50 %	334133289
124	NC_015579	GC	3	6	69642	69647	0 %	0 %	50 %	50 %	334133289
125	NC_015579	CG	3	6	69765	69770	0 %	0 %	50 %	50 %	334133289
126	NC_015579	GC	3	6	70123	70128	0 %	0 %	50 %	50 %	334133290
127	NC_015579	GC	3	6	70548	70553	0 %	0 %	50 %	50 %	334133290
128	NC_015579	CA	3	6	71276	71281	50 %	0 %	0 %	50 %	334133290
129	NC_015579	CG	4	8	71322	71329	0 %	0 %	50 %	50 %	334133290
130	NC_015579	GC	3	6	71386	71391	0 %	0 %	50 %	50 %	334133290
131	NC_015579	CG	3	6	71543	71548	0 %	0 %	50 %	50 %	334133291
132	NC_015579	CA	3	6	71688	71693	50 %	0 %	0 %	50 %	334133291
133	NC_015579	GC	4	8	72085	72092	0 %	0 %	50 %	50 %	334133291
134	NC_015579	AG	3	6	73126	73131	50 %	0 %	50 %	0 %	334133294
135	NC_015579	GC	3	6	73473	73478	0 %	0 %	50 %	50 %	334133295
136	NC_015579	CG	3	6	74319	74324	0 %	0 %	50 %	50 %	334133295
137	NC_015579	GA	3	6	74407	74412	50 %	0 %	50 %	0 %	334133295
138	NC_015579	CG	3	6	74428	74433	0 %	0 %	50 %	50 %	334133295
139	NC_015579	CG	3	6	74822	74827	0 %	0 %	50 %	50 %	334133296
140	NC_015579	TC	3	6	75930	75935	0 %	50 %	0 %	50 %	334133296
141	NC_015579	GC	3	6	76481	76486	0 %	0 %	50 %	50 %	334133297
142	NC_015579	CG	3	6	76589	76594	0 %	0 %	50 %	50 %	334133297
143	NC_015579	GC	3	6	77786	77791	0 %	0 %	50 %	50 %	334133299
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.