MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema azotonutricium ZAS-9 chromosome

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015577	GGATAA	2	12	32640	32651	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015577	TAAATA	2	12	141157	141168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015577	ATAATT	2	12	180011	180022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015577	ATTTTC	2	12	246528	246539	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015577	CTTTTC	2	12	331220	331231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015577	GCGATA	2	12	363205	363216	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015577	GCAAGG	2	12	363987	363998	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015577	TCAATA	2	12	367906	367917	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015577	TTCTGA	2	12	384500	384511	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015577	TGAGCA	2	12	385431	385442	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015577	CATATT	2	12	444436	444447	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015577	GAGAAA	2	12	494152	494163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015577	TCCACC	2	12	495213	495224	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015577	AACCCC	2	12	536750	536761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015577	CTGGCT	2	12	536882	536893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015577	GGCGGG	2	12	659116	659127	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015577	ATGCTG	2	12	684037	684048	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015577	CGCAAG	2	12	684152	684163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015577	ACCTTT	2	12	735899	735910	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015577	TATAAA	2	12	792151	792162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015577	ATGTTC	2	12	842349	842360	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015577	TCAAAA	2	12	894932	894943	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015577	GGCGAA	2	12	940340	940351	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015577	TCCAAT	2	12	941496	941507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015577	GCGGAA	2	12	941806	941817	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015577	GGGACA	2	12	943898	943909	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015577	TGATCC	2	12	952901	952912	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015577	GATTTT	2	12	1048524	1048535	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015577	CAGAAG	2	12	1140698	1140709	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015577	GGCCCG	2	12	1141063	1141074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015577	AGTATG	2	12	1141111	1141122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015577	TTTAAA	2	12	1148164	1148175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015577	CTCCTT	2	12	1212448	1212459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015577	CCCCTG	2	12	1239592	1239603	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_015577	CAAGAC	2	12	1245356	1245367	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015577	TGGGAC	2	12	1302550	1302561	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015577	CTTAAC	2	12	1346587	1346598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015577	ATTTCT	2	12	1383507	1383518	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015577	TTCCGG	2	12	1397641	1397652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015577	GGGCAA	2	12	1399546	1399557	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015577	GGGCGC	2	12	1424847	1424858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015577	CTTTTC	2	12	1439861	1439872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015577	TTGGCC	2	12	1440633	1440644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015577	TTTTAA	2	12	1491846	1491857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015577	CAGGTT	2	12	1501724	1501735	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015577	TTGTCG	2	12	1508554	1508565	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015577	GTTAAT	2	12	1588773	1588784	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015577	TTGGAA	2	12	1589824	1589835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015577	GGCGAA	2	12	1629456	1629467	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015577	TCCAAT	2	12	1630611	1630622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015577	GCGGAA	2	12	1630921	1630932	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015577	GGGACA	2	12	1633013	1633024	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015577	CTTCAT	2	12	1668813	1668824	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015577	TTCCGG	2	12	1682298	1682309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015577	ATTTTG	2	12	1695755	1695766	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015577	GCTTTT	2	12	1874290	1874301	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015577	TTTATT	2	12	1882496	1882507	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015577	AATTTG	2	12	1895281	1895292	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015577	CAAGAT	2	12	1899013	1899024	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015577	TGCCTT	2	12	1910519	1910530	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015577	ATTTTG	2	12	1919255	1919266	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015577	GGGCAG	2	12	1966399	1966410	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015577	TTTAAA	2	12	1968256	1968267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015577	ACCTTA	2	12	2053339	2053350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015577	GAAGGG	2	12	2077165	2077176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015577	TCTTGG	2	12	2087020	2087031	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015577	AAGGGA	2	12	2147194	2147205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015577	TTTAAA	2	12	2149085	2149096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015577	AAAATA	2	12	2149355	2149366	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015577	TAAAAA	2	12	2220378	2220389	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015577	TTTCAG	2	12	2264145	2264156	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015577	AAAGGC	2	12	2292842	2292853	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015577	ACGGCT	2	12	2292922	2292933	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015577	CACGGT	2	12	2347769	2347780	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015577	TATACT	2	12	2356345	2356356	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015577	CATTTA	2	12	2437797	2437808	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015577	TTCTTT	2	12	2443998	2444009	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015577	GAAAGG	2	12	2447831	2447842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015577	CTGCTC	2	12	2473168	2473179	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015577	CCGCTG	2	12	2474033	2474044	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015577	TGGCCC	2	12	2500986	2500997	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015577	TAAATA	2	12	2514611	2514622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015577	TGCAAA	2	12	2704562	2704573	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015577	AAAATG	2	12	2712426	2712437	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015577	GTTCAC	2	12	2717461	2717472	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015577	CATGGA	2	12	2733009	2733020	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015577	GTTAAG	2	12	2812668	2812679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015577	TACAAT	2	12	2839584	2839595	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015577	TCGGTG	2	12	2863997	2864008	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015577	ATGGTG	2	12	2865203	2865214	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015577	GTGGCG	2	12	2878566	2878577	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015577	GGTCAC	2	12	2879264	2879275	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015577	GGTAAG	2	12	2885419	2885430	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015577	AGTAAA	2	12	2886082	2886093	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015577	GGTAAG	2	12	2887730	2887741	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015577	AGTAAA	2	12	2888393	2888404	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015577	AATATA	2	12	2939269	2939280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015577	AAATCA	2	12	3123711	3123722	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015577	TTTATT	2	12	3133606	3133617	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015577	TTTGTC	2	12	3136156	3136167	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015577	CTTTTT	2	12	3146970	3146981	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_015577	TTCCCC	2	12	3277153	3277164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_015577	GCTTCC	2	12	3307622	3307633	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015577	TATTCT	2	12	3449828	3449839	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_015577	TAAACA	2	12	3524070	3524081	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015577	CGACAC	2	12	3526874	3526885	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015577	CAGGGG	2	12	3528404	3528415	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015577	CTGCTT	2	12	3534335	3534346	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015577	CTTTTA	2	12	3565788	3565799	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015577	GGTTCA	2	12	3640304	3640315	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015577	CAATAG	2	12	3679780	3679791	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_015577	AGAGGG	2	12	3711030	3711041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015577	CATGCG	2	12	3836728	3836739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.