MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Treponema azotonutricium ZAS-9 chromosome

Total Repeats: 1470

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015577	ACAAAA	2	12	1067	1078	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	333992988
2	NC_015577	AGATCG	2	12	1625	1636	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333992988
3	NC_015577	AGGAAG	2	12	4536	4547	50 %	0 %	50 %	0 %	333992991
4	NC_015577	GGCAGA	2	12	8783	8794	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333992994
5	NC_015577	AATAAA	2	12	10638	10649	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	333992996
6	NC_015577	AGGGGC	2	12	13569	13580	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	333992998
7	NC_015577	GCCGAG	2	12	16338	16349	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333993001
8	NC_015577	TTTCCC	2	12	16881	16892	0 %	50 %	0 %	50 %	333993001
9	NC_015577	CTGTTT	2	12	18665	18676	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333993003
10	NC_015577	ATTTTC	2	12	19323	19334	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	333993003
11	NC_015577	ATTTTT	2	12	19483	19494	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	333993003
12	NC_015577	TGAATT	2	12	22813	22824	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333993006
13	NC_015577	CCCAGG	2	12	22918	22929	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333993006
14	NC_015577	GTACCG	2	12	24023	24034	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333993007
15	NC_015577	AGGCCC	2	12	27521	27532	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333993010
16	NC_015577	GTTCCT	2	12	28403	28414	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	333993011
17	NC_015577	CAATGA	2	12	28710	28721	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333993012
18	NC_015577	GAATTT	2	12	28732	28743	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333993012
19	NC_015577	CAATAC	2	12	29029	29040	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333993013
20	NC_015577	TCGTCC	2	12	31345	31356	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	333993015
21	NC_015577	GAATAT	2	12	32307	32318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333993016
22	NC_015577	GTGATT	2	12	32895	32906	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333993017
23	NC_015577	GGTGCT	2	12	35766	35777	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	333993019
24	NC_015577	ACTATA	2	12	43526	43537	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333993026
25	NC_015577	GAAAGG	2	12	43685	43696	50 %	0 %	50 %	0 %	333993026
26	NC_015577	AGGGCG	2	12	45291	45302	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	333993028
27	NC_015577	GAAAAG	2	12	45728	45739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333993028
28	NC_015577	CAAAGG	2	12	47364	47375	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333993030
29	NC_015577	AGCTTG	2	12	50456	50467	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333993031
30	NC_015577	AAACGG	2	12	51278	51289	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333993033
31	NC_015577	TTTTCA	2	12	57354	57365	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	333993037
32	NC_015577	GTGGAG	2	12	59345	59356	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	333993038
33	NC_015577	GGCAGG	2	12	62886	62897	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	333993041
34	NC_015577	CGAAAA	2	12	63734	63745	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333993041
35	NC_015577	TTCGCT	2	12	64594	64605	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	333993042
36	NC_015577	ATTTTG	2	12	67435	67446	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333993044
37	NC_015577	GCTGCC	2	12	67655	67666	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333993045
38	NC_015577	ATGACG	2	12	68550	68561	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333993046
39	NC_015577	CGGTCA	2	12	71088	71099	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333993048
40	NC_015577	GATGTT	2	12	79776	79787	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333993059
41	NC_015577	CACAAA	2	12	80400	80411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333993059
42	NC_015577	GCCTGC	2	12	94514	94525	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333993075
43	NC_015577	GCCTCT	2	12	97872	97883	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	333993080
44	NC_015577	AGGGCG	2	12	98370	98381	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	333993080
45	NC_015577	GGCTTT	2	12	99178	99189	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333993080
46	NC_015577	CTTTTT	2	12	101586	101597	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	333993082
47	NC_015577	AGGGCA	2	12	102966	102977	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333993083
48	NC_015577	GGATCT	2	12	103722	103733	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333993084
49	NC_015577	AGGCCC	2	12	105279	105290	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333993086
50	NC_015577	TGTTTT	2	12	106768	106779	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	333993086
51	NC_015577	CCGCAG	2	12	107757	107768	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333993087
52	NC_015577	TCGGCG	2	12	108707	108718	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333993087
53	NC_015577	GTTGCC	2	12	109228	109239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333993087
54	NC_015577	TTATGA	2	12	122514	122525	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333993102
55	NC_015577	CCGTCA	2	12	128984	128995	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333993107
56	NC_015577	AAAGTA	2	12	131443	131454	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333993109
57	NC_015577	AGGCGC	2	12	133885	133896	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333993111
58	NC_015577	CGGCAG	2	12	135351	135362	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333993112
59	NC_015577	GGCCCT	2	12	139321	139332	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333993118
60	NC_015577	GAAGCT	2	12	148280	148291	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333993126
61	NC_015577	ATTTTT	2	12	151907	151918	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	333993129
62	NC_015577	TCCCCT	2	12	153442	153453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333993130
63	NC_015577	GCCCCA	2	12	159575	159586	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	333993135
64	NC_015577	ACCTAT	2	12	162479	162490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333993136
65	NC_015577	TTGATA	2	12	162609	162620	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333993136
66	NC_015577	CCTATG	2	12	163725	163736	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333993136
67	NC_015577	GACGGC	2	12	165488	165499	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333993136
68	NC_015577	GATGGC	2	12	169217	169228	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333993136
69	NC_015577	GCTTTT	2	12	172717	172728	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333993137
70	NC_015577	GCGTCG	2	12	174672	174683	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333993139
71	NC_015577	CTCGTG	2	12	177231	177242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333993142
72	NC_015577	GGCAGT	2	12	179768	179779	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333993144
73	NC_015577	CGAAGG	2	12	181101	181112	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333993145
74	NC_015577	AGGGCC	2	12	182850	182861	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333993147
75	NC_015577	CTGGCC	2	12	183912	183923	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333993148
76	NC_015577	CCGGGT	2	12	185640	185651	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333993148
77	NC_015577	GGCCAT	2	12	187601	187612	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333993151
78	NC_015577	ACCCTG	2	12	190943	190954	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333993153
79	NC_015577	GAACAA	2	12	193641	193652	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333993154
80	NC_015577	GAAAAG	2	12	194431	194442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333993154
81	NC_015577	CTGCTC	2	12	208093	208104	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	333993168
82	NC_015577	CAAGGC	2	12	213507	213518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333993170
83	NC_015577	CAAAAT	2	12	213864	213875	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	333993170
84	NC_015577	CTCGTT	2	12	219119	219130	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	333993173
85	NC_015577	CTGTTG	2	12	219838	219849	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333993174
86	NC_015577	GCCTAC	2	12	224282	224293	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333993180
87	NC_015577	TACCCA	2	12	232105	232116	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333993187
88	NC_015577	CTTGCC	2	12	236755	236766	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	333993189
89	NC_015577	GGCGGA	2	12	237091	237102	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	333993189
90	NC_015577	GCCGAT	2	12	237136	237147	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333993189
91	NC_015577	GCTTTT	2	12	239716	239727	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333993192
92	NC_015577	GGCAGC	2	12	242805	242816	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333993195
93	NC_015577	CTGCCC	2	12	244527	244538	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	333993197
94	NC_015577	GCCGCT	2	12	246135	246146	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333993198
95	NC_015577	GCTTCG	2	12	247562	247573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333993200
96	NC_015577	ATATGG	2	12	250028	250039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333993203
97	NC_015577	AATGGG	2	12	250559	250570	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333993203
98	NC_015577	GAGCTT	2	12	250873	250884	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333993204
99	NC_015577	TTTTCG	2	12	250901	250912	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333993204
100	NC_015577	TTGACA	2	12	262010	262021	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333993216
101	NC_015577	CCTTGC	2	12	263801	263812	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	333993218
102	NC_015577	AGGCAT	2	12	264815	264826	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333993218
103	NC_015577	GCACCT	2	12	265420	265431	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333993219
104	NC_015577	CCATCG	2	12	265728	265739	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333993219
105	NC_015577	GGCGGG	2	12	265800	265811	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	333993219
106	NC_015577	CATGAG	2	12	270616	270627	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333993223
107	NC_015577	TTATCG	2	12	273691	273702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333993227
108	NC_015577	TTTTAC	2	12	275444	275455	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	333993228
109	NC_015577	TTTAAT	2	12	275592	275603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333993228
110	NC_015577	TGAGGG	2	12	276894	276905	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	333993229
111	NC_015577	GTTCAG	2	12	277982	277993	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333993230
112	NC_015577	CATGGG	2	12	284948	284959	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333993236
113	NC_015577	CCTGTG	2	12	285599	285610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333993237
114	NC_015577	ATAAGG	2	12	286262	286273	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333993237
115	NC_015577	GGGTAA	2	12	287441	287452	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333993239
116	NC_015577	AGCCGC	2	12	288468	288479	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333993239
117	NC_015577	GGCCCT	2	12	290855	290866	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333993242
118	NC_015577	CGGTTC	2	12	290914	290925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333993242
119	NC_015577	ACGGCC	2	12	291716	291727	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333993243
120	NC_015577	GCGTCC	2	12	292382	292393	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333993244
121	NC_015577	ATCTTG	2	12	292635	292646	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333993244
122	NC_015577	TATCAA	2	12	293471	293482	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333993245
123	NC_015577	TTTCCT	2	12	296142	296153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333993247
124	NC_015577	GGGGCA	2	12	304881	304892	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	333993253
125	NC_015577	GCTGTG	2	12	306823	306834	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	333993255
126	NC_015577	GGATAT	2	12	308967	308978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333993258
127	NC_015577	AAAACC	2	12	315766	315777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333993266
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129	NC_015577	GGCCAT	2	12	316994	317005	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333993267
130	NC_015577	CAAGGG	2	12	319596	319607	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333993269
131	NC_015577	TCCAGA	2	12	319724	319735	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333993269
132	NC_015577	CGAATT	2	12	319960	319971	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333993270
133	NC_015577	TCCGCC	2	12	323847	323858	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	333993275
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140	NC_015577	TTTGAA	2	12	340105	340116	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333993288
141	NC_015577	GCTTCG	2	12	345753	345764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333993292
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147	NC_015577	CACCAA	2	12	354400	354411	50 %	0 %	0 %	50 %	333993299
148	NC_015577	CCGTAA	2	12	355429	355440	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333993301
149	NC_015577	CAATGC	2	12	358393	358404	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333993303
150	NC_015577	ATCGTC	2	12	359575	359586	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333993304
151	NC_015577	AACCTG	2	12	362640	362651	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333993306
152	NC_015577	GTAGAG	2	12	366356	366367	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333993308
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154	NC_015577	ATTTAA	2	12	371732	371743	50 %	50 %	0 %	0 %	333993312
155	NC_015577	TTCAAT	2	12	380424	380435	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333993322
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186	NC_015577	CGAAGA	2	12	486084	486095	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333993439
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199	NC_015577	GGAACC	2	12	529543	529554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333993471
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203	NC_015577	TTCCAG	2	12	538794	538805	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333993480
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208	NC_015577	CGGCCT	2	12	550094	550105	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333993487
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215	NC_015577	TTCTGG	2	12	568645	568656	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333993504
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219	NC_015577	GTGGGC	2	12	575044	575055	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	333993512
220	NC_015577	GTGGGT	2	12	579027	579038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333993519
221	NC_015577	TGCTTC	2	12	582838	582849	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	333993522
222	NC_015577	GTGTTG	2	12	583419	583430	0 %	50 %	50 %	0 %	333993524
223	NC_015577	GCCAGG	2	12	584886	584897	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333993524
224	NC_015577	CCATGG	2	12	589337	589348	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333993530
225	NC_015577	GAGGTT	2	12	589737	589748	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	333993530
226	NC_015577	GCCCAG	2	12	590319	590330	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333993530
227	NC_015577	ATGCCC	2	12	590596	590607	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333993530
228	NC_015577	TTTTCG	2	12	593991	594002	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333993533
229	NC_015577	CCTTCC	2	12	600831	600842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333993538
230	NC_015577	TGCCGG	2	12	600867	600878	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333993538
231	NC_015577	GGCGAT	2	12	603708	603719	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333993539
232	NC_015577	TCAAGA	2	12	605721	605732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333993540
233	NC_015577	CGCTGC	2	12	613718	613729	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333993543
234	NC_015577	ATGCTG	2	12	619726	619737	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333993547
235	NC_015577	TGGGGC	2	12	620348	620359	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	333993547
236	NC_015577	ATTGCC	2	12	620526	620537	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333993547
237	NC_015577	GGCCAG	2	12	625209	625220	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333993554
238	NC_015577	TGGCTA	2	12	631068	631079	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333993558
239	NC_015577	CCTGGC	2	12	634688	634699	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333993563
240	NC_015577	TACCCT	2	12	637511	637522	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333993567
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244	NC_015577	CCGGCG	2	12	648090	648101	0 %	0 %	50 %	50 %	333993577
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250	NC_015577	GAAAAA	2	12	656781	656792	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333993589
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330	NC_015577	GCGAAA	2	12	847916	847927	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333993754
331	NC_015577	CCTTAC	2	12	848948	848959	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333993755
332	NC_015577	TGACCT	2	12	850302	850313	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333993756
333	NC_015577	AAAGCC	2	12	853534	853545	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	333993760
334	NC_015577	TGCCTT	2	12	855407	855418	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	333993761
335	NC_015577	GCTATA	2	12	860883	860894	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333993767
336	NC_015577	TAAAGG	2	12	863075	863086	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333993770
337	NC_015577	CCATCA	2	12	864533	864544	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333993770
338	NC_015577	AGTTTT	2	12	864699	864710	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333993770
339	NC_015577	CGCCGA	2	12	865410	865421	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333993770
340	NC_015577	TGCGGC	2	12	866716	866727	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333993770
341	NC_015577	CTTTTT	2	12	869773	869784	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	333993775
342	NC_015577	GTAAAT	2	12	871221	871232	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333993776
343	NC_015577	CTTTTT	2	12	872226	872237	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	333993776
344	NC_015577	GATGCC	2	12	875709	875720	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333993778
345	NC_015577	CATCGC	2	12	876385	876396	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333993779
346	NC_015577	TTGCCC	2	12	879556	879567	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	333993781
347	NC_015577	TTTGTC	2	12	881200	881211	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333993782
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452	NC_015577	CGCTGT	2	12	1131748	1131759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333993999
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455	NC_015577	TGAAGA	2	12	1134967	1134978	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333994003
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458	NC_015577	GCTTTT	2	12	1148805	1148816	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333994016
459	NC_015577	GTATTG	2	12	1151650	1151661	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333994019
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