MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Treponema azotonutricium ZAS-9 chromosome

Total Repeats: 2291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015577	CCATA	2	10	1005	1014	40 %	20 %	0 %	40 %	333992988
2	NC_015577	CCATA	2	10	1497	1506	40 %	20 %	0 %	40 %	333992988
3	NC_015577	TCAAT	2	10	2190	2199	40 %	40 %	0 %	20 %	333992989
4	NC_015577	GCTGG	2	10	5382	5391	0 %	20 %	60 %	20 %	333992992
5	NC_015577	GCTGG	2	10	5508	5517	0 %	20 %	60 %	20 %	333992992
6	NC_015577	GACAA	2	10	6152	6161	60 %	0 %	20 %	20 %	333992993
7	NC_015577	CAGGT	2	10	6566	6575	20 %	20 %	40 %	20 %	333992993
8	NC_015577	CCGAT	2	10	6598	6607	20 %	20 %	20 %	40 %	333992993
9	NC_015577	AGGAG	2	10	8264	8273	40 %	0 %	60 %	0 %	333992994
10	NC_015577	GGGAG	2	10	8951	8960	20 %	0 %	80 %	0 %	333992995
11	NC_015577	AATCA	2	10	9557	9566	60 %	20 %	0 %	20 %	333992995
12	NC_015577	GGAAC	2	10	10586	10595	40 %	0 %	40 %	20 %	333992996
13	NC_015577	CAGGA	2	10	11533	11542	40 %	0 %	40 %	20 %	333992998
14	NC_015577	TGCAA	2	10	12165	12174	40 %	20 %	20 %	20 %	333992998
15	NC_015577	GGCAA	2	10	13793	13802	40 %	0 %	40 %	20 %	333992998
16	NC_015577	CAACT	2	10	15643	15652	40 %	20 %	0 %	40 %	333993000
17	NC_015577	TGCCC	2	10	16796	16805	0 %	20 %	20 %	60 %	333993001
18	NC_015577	TCAAG	2	10	18444	18453	40 %	20 %	20 %	20 %	333993002
19	NC_015577	GATTT	2	10	19136	19145	20 %	60 %	20 %	0 %	333993003
20	NC_015577	CTTTC	2	10	22232	22241	0 %	60 %	0 %	40 %	333993005
21	NC_015577	GCAGG	2	10	25377	25386	20 %	0 %	60 %	20 %	333993009
22	NC_015577	ATTTT	2	10	26749	26758	20 %	80 %	0 %	0 %	333993010
23	NC_015577	GGCCA	2	10	29126	29135	20 %	0 %	40 %	40 %	333993013
24	NC_015577	CATGG	2	10	31230	31239	20 %	20 %	40 %	20 %	333993015
25	NC_015577	GGGCG	2	10	33535	33544	0 %	0 %	80 %	20 %	333993018
26	NC_015577	CATAG	2	10	40178	40187	40 %	20 %	20 %	20 %	333993022
27	NC_015577	AAAGG	2	10	41427	41436	60 %	0 %	40 %	0 %	333993023
28	NC_015577	GTAAT	2	10	43391	43400	40 %	40 %	20 %	0 %	333993026
29	NC_015577	CTTCT	2	10	45990	45999	0 %	60 %	0 %	40 %	333993029
30	NC_015577	TTCCC	2	10	48624	48633	0 %	40 %	0 %	60 %	333993031
31	NC_015577	ATTTG	2	10	49097	49106	20 %	60 %	20 %	0 %	333993031
32	NC_015577	TACCG	2	10	51760	51769	20 %	20 %	20 %	40 %	333993033
33	NC_015577	GGAAG	2	10	54316	54325	40 %	0 %	60 %	0 %	333993035
34	NC_015577	CGGGC	2	10	54755	54764	0 %	0 %	60 %	40 %	333993035
35	NC_015577	CATAA	2	10	57227	57236	60 %	20 %	0 %	20 %	333993037
36	NC_015577	TCGGG	2	10	61870	61879	0 %	20 %	60 %	20 %	333993040
37	NC_015577	AAATC	2	10	64968	64977	60 %	20 %	0 %	20 %	333993043
38	NC_015577	CGGCG	2	10	67035	67044	0 %	0 %	60 %	40 %	333993044
39	NC_015577	TACGG	2	10	69428	69437	20 %	20 %	40 %	20 %	333993046
40	NC_015577	GGGTA	2	10	71788	71797	20 %	20 %	60 %	0 %	333993049
41	NC_015577	GCCCT	2	10	72393	72402	0 %	20 %	20 %	60 %	333993049
42	NC_015577	ATTTT	2	10	82704	82713	20 %	80 %	0 %	0 %	333993062
43	NC_015577	ATTTC	2	10	83607	83616	20 %	60 %	0 %	20 %	333993063
44	NC_015577	GGGAA	2	10	85601	85610	40 %	0 %	60 %	0 %	333993065
45	NC_015577	AAAAC	2	10	85793	85802	80 %	0 %	0 %	20 %	333993065
46	NC_015577	AGAGG	2	10	86486	86495	40 %	0 %	60 %	0 %	333993065
47	NC_015577	CCCAG	2	10	91282	91291	20 %	0 %	20 %	60 %	333993069
48	NC_015577	AAAGC	2	10	92725	92734	60 %	0 %	20 %	20 %	333993071
49	NC_015577	GTCAG	2	10	93055	93064	20 %	20 %	40 %	20 %	333993073
50	NC_015577	GTTTA	2	10	93354	93363	20 %	60 %	20 %	0 %	333993073
51	NC_015577	GCAAC	2	10	95439	95448	40 %	0 %	20 %	40 %	333993075
52	NC_015577	GCAAG	2	10	98706	98715	40 %	0 %	40 %	20 %	333993080
53	NC_015577	CCCTT	2	10	98856	98865	0 %	40 %	0 %	60 %	333993080
54	NC_015577	TTCCT	2	10	99381	99390	0 %	60 %	0 %	40 %	333993080
55	NC_015577	AAACT	2	10	102381	102390	60 %	20 %	0 %	20 %	333993083
56	NC_015577	CTTCT	2	10	103421	103430	0 %	60 %	0 %	40 %	333993084
57	NC_015577	AAAAT	2	10	105195	105204	80 %	20 %	0 %	0 %	333993086
58	NC_015577	GTAAC	2	10	109589	109598	40 %	20 %	20 %	20 %	333993088
59	NC_015577	ATTTG	2	10	110005	110014	20 %	60 %	20 %	0 %	333993088
60	NC_015577	GGACC	2	10	111419	111428	20 %	0 %	40 %	40 %	333993090
61	NC_015577	AAGCG	2	10	113484	113493	40 %	0 %	40 %	20 %	333993091
62	NC_015577	CTGGA	2	10	116022	116031	20 %	20 %	40 %	20 %	333993094
63	NC_015577	ATTGC	2	10	116208	116217	20 %	40 %	20 %	20 %	333993094
64	NC_015577	TTCTT	2	10	116949	116958	0 %	80 %	0 %	20 %	333993095
65	NC_015577	GTATG	2	10	117082	117091	20 %	40 %	40 %	0 %	333993095
66	NC_015577	AAAAG	2	10	118684	118693	80 %	0 %	20 %	0 %	333993097
67	NC_015577	CAGCG	2	10	120092	120101	20 %	0 %	40 %	40 %	333993099
68	NC_015577	GCTCT	2	10	121316	121325	0 %	40 %	20 %	40 %	333993100
69	NC_015577	GAATA	2	10	124724	124733	60 %	20 %	20 %	0 %	333993103
70	NC_015577	CTTCG	2	10	125190	125199	0 %	40 %	20 %	40 %	333993104
71	NC_015577	CCGTT	2	10	126281	126290	0 %	40 %	20 %	40 %	333993105
72	NC_015577	TCAAC	2	10	129213	129222	40 %	20 %	0 %	40 %	333993107
73	NC_015577	CTGCT	2	10	130111	130120	0 %	40 %	20 %	40 %	333993108
74	NC_015577	GACCT	2	10	130561	130570	20 %	20 %	20 %	40 %	333993108
75	NC_015577	GCCCT	2	10	134125	134134	0 %	20 %	20 %	60 %	333993111
76	NC_015577	CCATC	2	10	134226	134235	20 %	20 %	0 %	60 %	333993111
77	NC_015577	GGGAA	2	10	136738	136747	40 %	0 %	60 %	0 %	333993114
78	NC_015577	GCGCC	2	10	137084	137093	0 %	0 %	40 %	60 %	333993114
79	NC_015577	GGCGG	2	10	137299	137308	0 %	0 %	80 %	20 %	333993114
80	NC_015577	GCATC	2	10	139425	139434	20 %	20 %	20 %	40 %	333993118
81	NC_015577	GGGCA	2	10	140135	140144	20 %	0 %	60 %	20 %	333993119
82	NC_015577	TGGAA	2	10	142902	142911	40 %	20 %	40 %	0 %	333993121
83	NC_015577	TATAA	2	10	144843	144852	60 %	40 %	0 %	0 %	333993123
84	NC_015577	ATTTT	2	10	145073	145082	20 %	80 %	0 %	0 %	333993123
85	NC_015577	CTTCC	2	10	146917	146926	0 %	40 %	0 %	60 %	333993125
86	NC_015577	GCAGG	2	10	149185	149194	20 %	0 %	60 %	20 %	333993126
87	NC_015577	AAATG	2	10	149661	149670	60 %	20 %	20 %	0 %	333993126
88	NC_015577	GAAAG	2	10	151080	151089	60 %	0 %	40 %	0 %	333993128
89	NC_015577	AATAC	2	10	152752	152761	60 %	20 %	0 %	20 %	333993130
90	NC_015577	CGGAG	2	10	156486	156495	20 %	0 %	60 %	20 %	333993133
91	NC_015577	CCAGG	2	10	157649	157658	20 %	0 %	40 %	40 %	333993135
92	NC_015577	TCGGA	2	10	165231	165240	20 %	20 %	40 %	20 %	333993136
93	NC_015577	ACAGG	2	10	169898	169907	40 %	0 %	40 %	20 %	333993136
94	NC_015577	CGGCG	2	10	170756	170765	0 %	0 %	60 %	40 %	333993136
95	NC_015577	AAACC	2	10	171058	171067	60 %	0 %	0 %	40 %	333993136
96	NC_015577	GGGCC	2	10	173817	173826	0 %	0 %	60 %	40 %	333993138
97	NC_015577	CGCGT	2	10	177198	177207	0 %	20 %	40 %	40 %	333993142
98	NC_015577	TGGAG	2	10	178856	178865	20 %	20 %	60 %	0 %	333993143
99	NC_015577	AGAGC	2	10	181926	181935	40 %	0 %	40 %	20 %	333993145
100	NC_015577	TTTCC	2	10	183181	183190	0 %	60 %	0 %	40 %	333993147
101	NC_015577	CGAAG	2	10	185781	185790	40 %	0 %	40 %	20 %	333993148
102	NC_015577	TTTCT	2	10	186478	186487	0 %	80 %	0 %	20 %	333993150
103	NC_015577	GGCAG	2	10	186641	186650	20 %	0 %	60 %	20 %	333993150
104	NC_015577	GGAAA	2	10	190183	190192	60 %	0 %	40 %	0 %	333993153
105	NC_015577	AGAAA	2	10	193089	193098	80 %	0 %	20 %	0 %	333993154
106	NC_015577	GGTAT	2	10	195029	195038	20 %	40 %	40 %	0 %	333993155
107	NC_015577	GGGGA	2	10	197218	197227	20 %	0 %	80 %	0 %	333993160
108	NC_015577	GCGCT	2	10	199277	199286	0 %	20 %	40 %	40 %	333993162
109	NC_015577	TACGG	2	10	200670	200679	20 %	20 %	40 %	20 %	333993162
110	NC_015577	CTGCT	2	10	201105	201114	0 %	40 %	20 %	40 %	333993163
111	NC_015577	GAGCT	2	10	201282	201291	20 %	20 %	40 %	20 %	333993163
112	NC_015577	CGGCG	2	10	201545	201554	0 %	0 %	60 %	40 %	333993163
113	NC_015577	ACGGC	2	10	201958	201967	20 %	0 %	40 %	40 %	333993163
114	NC_015577	TACAG	2	10	203426	203435	40 %	20 %	20 %	20 %	333993163
115	NC_015577	TTATT	2	10	205697	205706	20 %	80 %	0 %	0 %	333993165
116	NC_015577	TACAG	2	10	205962	205971	40 %	20 %	20 %	20 %	333993165
117	NC_015577	ACTGG	2	10	206724	206733	20 %	20 %	40 %	20 %	333993166
118	NC_015577	GGCAT	2	10	207096	207105	20 %	20 %	40 %	20 %	333993166
119	NC_015577	GAGCT	2	10	208276	208285	20 %	20 %	40 %	20 %	333993168
120	NC_015577	CGACA	2	10	211965	211974	40 %	0 %	20 %	40 %	333993168
121	NC_015577	TCCCG	2	10	214743	214752	0 %	20 %	20 %	60 %	333993170
122	NC_015577	TTTTC	2	10	215082	215091	0 %	80 %	0 %	20 %	333993170
123	NC_015577	AAGGG	2	10	216924	216933	40 %	0 %	60 %	0 %	333993171
124	NC_015577	TTCTT	2	10	218076	218085	0 %	80 %	0 %	20 %	333993173
125	NC_015577	TTTTA	2	10	220381	220390	20 %	80 %	0 %	0 %	333993175
126	NC_015577	TGCTC	2	10	222091	222100	0 %	40 %	20 %	40 %	333993177
127	NC_015577	AGGGA	2	10	223849	223858	40 %	0 %	60 %	0 %	333993179
128	NC_015577	GGAAC	2	10	223988	223997	40 %	0 %	40 %	20 %	333993179
129	NC_015577	CTTCC	2	10	225926	225935	0 %	40 %	0 %	60 %	333993181
130	NC_015577	TTTTC	2	10	227966	227975	0 %	80 %	0 %	20 %	333993184
131	NC_015577	AGCTG	2	10	229437	229446	20 %	20 %	40 %	20 %	333993184
132	NC_015577	GGAAA	2	10	233152	233161	60 %	0 %	40 %	0 %	333993187
133	NC_015577	GGGCA	2	10	233251	233260	20 %	0 %	60 %	20 %	333993187
134	NC_015577	CGCTC	2	10	233822	233831	0 %	20 %	20 %	60 %	333993188
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