MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium sp. JDM601 chromosome

Total Repeats: 2806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015576	CCACCG	2	12	4127565	4127576	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	333992528
2502	NC_015576	TGTCGA	2	12	4128812	4128823	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333992530
2503	NC_015576	GCACCA	2	12	4129387	4129398	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333992531
2504	NC_015576	GTCGGG	2	12	4130149	4130160	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	333992532
2505	NC_015576	CCCGGG	2	12	4132194	4132205	0 %	0 %	50 %	50 %	333992533
2506	NC_015576	CAGTGC	2	12	4132662	4132673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333992534
2507	NC_015576	ACGTCG	2	12	4133295	4133306	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333992535
2508	NC_015576	ATGCCG	2	12	4134220	4134231	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333992537
2509	NC_015576	TGCGGC	3	18	4135603	4135620	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333992539
2510	NC_015576	CACCGC	2	12	4136364	4136375	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	333992539
2511	NC_015576	TGCCGG	2	12	4137119	4137130	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333992539
2512	NC_015576	GCCGAA	2	12	4137306	4137317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992539
2513	NC_015576	CGCCGA	2	12	4138419	4138430	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333992540
2514	NC_015576	CGACAC	2	12	4140358	4140369	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333992542
2515	NC_015576	CGAGGC	2	12	4143931	4143942	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333992545
2516	NC_015576	CATCCG	2	12	4147993	4148004	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333992548
2517	NC_015576	CGGCGC	2	12	4149222	4149233	0 %	0 %	50 %	50 %	333992549
2518	NC_015576	GAGGCC	2	12	4149881	4149892	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333992551
2519	NC_015576	CAGCAC	2	12	4151387	4151398	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333992554
2520	NC_015576	CAGCGC	2	12	4151708	4151719	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333992554
2521	NC_015576	GGTGGC	2	12	4152933	4152944	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	333992555
2522	NC_015576	CACGGC	2	12	4155085	4155096	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333992558
2523	NC_015576	GCCGAG	2	12	4156710	4156721	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333992559
2524	NC_015576	CTGATC	2	12	4160984	4160995	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333992561
2525	NC_015576	CCTGGA	2	12	4161598	4161609	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333992561
2526	NC_015576	CGCTGT	2	12	4162485	4162496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992561
2527	NC_015576	GTCCGG	2	12	4162511	4162522	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333992561
2528	NC_015576	GCCGCG	2	12	4163964	4163975	0 %	0 %	50 %	50 %	333992562
2529	NC_015576	GCTGGT	2	12	4164101	4164112	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	333992562
2530	NC_015576	TCGGCC	2	12	4175877	4175888	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333992569
2531	NC_015576	TGTTCG	2	12	4176883	4176894	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333992570
2532	NC_015576	ATCAGC	2	12	4177152	4177163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333992570
2533	NC_015576	CACCGC	2	12	4177238	4177249	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	333992570
2534	NC_015576	GTCGAT	2	12	4177547	4177558	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333992570
2535	NC_015576	GCGCCC	2	12	4178113	4178124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992570
2536	NC_015576	CGGCAA	2	12	4184820	4184831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992574
2537	NC_015576	CACCGA	2	12	4185546	4185557	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333992575
2538	NC_015576	CAGCAC	2	12	4186843	4186854	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333992577
2539	NC_015576	GGCCGC	2	12	4187607	4187618	0 %	0 %	50 %	50 %	333992579
2540	NC_015576	CGCCCG	2	12	4187742	4187753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992579
2541	NC_015576	GACCAC	2	12	4190067	4190078	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333992582
2542	NC_015576	CCGGCG	2	12	4192846	4192857	0 %	0 %	50 %	50 %	333992584
2543	NC_015576	AGACCG	2	12	4194831	4194842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992585
2544	NC_015576	GGCCAG	2	12	4200630	4200641	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333992592
2545	NC_015576	CGAGGC	2	12	4201517	4201528	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333992593
2546	NC_015576	ATGGGC	2	12	4208049	4208060	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333992601
2547	NC_015576	GCAACG	2	12	4208494	4208505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992601
2548	NC_015576	GCCACC	2	12	4218438	4218449	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	333992610
2549	NC_015576	GCCTGG	2	12	4218919	4218930	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333992610
2550	NC_015576	ACGGCG	2	12	4221603	4221614	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333992613
2551	NC_015576	GCGACC	2	12	4221668	4221679	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333992613
2552	NC_015576	GATCAT	2	12	4222724	4222735	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333992614
2553	NC_015576	CGGTTT	2	12	4223842	4223853	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333992615
2554	NC_015576	TGACGG	2	12	4225996	4226007	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333992617
2555	NC_015576	TCGGCG	2	12	4226229	4226240	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333992617
2556	NC_015576	TGTTCG	2	12	4226586	4226597	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333992617
2557	NC_015576	GTGACC	2	12	4227207	4227218	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333992618
2558	NC_015576	CGCTGC	2	12	4228069	4228080	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333992618
2559	NC_015576	TTCACC	2	12	4228203	4228214	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333992618
2560	NC_015576	TGCCGG	4	24	4228225	4228248	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333992618
2561	NC_015576	CAGCCG	2	12	4229981	4229992	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333992619
2562	NC_015576	AAGTCG	2	12	4232098	4232109	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333992621
2563	NC_015576	TGCACC	2	12	4232392	4232403	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333992621
2564	NC_015576	CGTCGA	2	12	4232453	4232464	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333992621
2565	NC_015576	CCAGGC	2	12	4236776	4236787	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333992625
2566	NC_015576	ATCGTC	2	12	4237479	4237490	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333992627
2567	NC_015576	ACCGGC	2	12	4239933	4239944	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333992629
2568	NC_015576	CCTCGA	2	12	4241817	4241828	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333992630
2569	NC_015576	AGGTGA	2	12	4242321	4242332	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333992631
2570	NC_015576	GTCGGC	2	12	4242391	4242402	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333992631
2571	NC_015576	CGCCGG	2	12	4245065	4245076	0 %	0 %	50 %	50 %	333992633
2572	NC_015576	TCGACG	2	12	4246247	4246258	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333992634
2573	NC_015576	CGGCGC	2	12	4246461	4246472	0 %	0 %	50 %	50 %	333992635
2574	NC_015576	CTGCAG	2	12	4247581	4247592	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333992635
2575	NC_015576	CGAACG	2	12	4248879	4248890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992637
2576	NC_015576	ACGCCG	2	12	4255276	4255287	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333992645
2577	NC_015576	GTTGCG	2	12	4257389	4257400	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	333992647
2578	NC_015576	CGGCTG	2	12	4260079	4260090	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333992649
2579	NC_015576	CGCCGG	2	12	4263915	4263926	0 %	0 %	50 %	50 %	333992652
2580	NC_015576	GCTGAC	2	12	4265345	4265356	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333992653
2581	NC_015576	CTGCGC	2	12	4267705	4267716	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333992655
2582	NC_015576	CGTCGG	2	12	4268527	4268538	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333992657
2583	NC_015576	CATCAC	2	12	4268915	4268926	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333992657
2584	NC_015576	TTGGCC	2	12	4270938	4270949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992657
2585	NC_015576	TGCTGT	2	12	4271499	4271510	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333992658
2586	NC_015576	ACCTGC	2	12	4272297	4272308	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333992659
2587	NC_015576	GCCGGC	2	12	4272377	4272388	0 %	0 %	50 %	50 %	333992659
2588	NC_015576	TTGACC	2	12	4275625	4275636	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333992663
2589	NC_015576	CCGGTG	2	12	4278195	4278206	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333992667
2590	NC_015576	GCCGGT	2	12	4281259	4281270	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333992669
2591	NC_015576	AACGCG	2	12	4283566	4283577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992671
2592	NC_015576	ACGGTG	2	12	4287255	4287266	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333992676
2593	NC_015576	AGCCCG	2	12	4289454	4289465	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333992681
2594	NC_015576	CGGCCG	2	12	4290617	4290628	0 %	0 %	50 %	50 %	333992681
2595	NC_015576	CGCAAC	2	12	4291198	4291209	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333992682
2596	NC_015576	CGCGGT	2	12	4291446	4291457	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333992682
2597	NC_015576	GGCCCG	2	12	4293256	4293267	0 %	0 %	50 %	50 %	333992685
2598	NC_015576	CCCGGG	2	12	4295213	4295224	0 %	0 %	50 %	50 %	333992687
2599	NC_015576	CCGATC	2	12	4295741	4295752	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333992688
2600	NC_015576	GCTGGG	2	12	4296524	4296535	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	333992689
2601	NC_015576	CTACTT	2	12	4299218	4299229	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	333992692
2602	NC_015576	CGACGC	2	12	4299641	4299652	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333992694
2603	NC_015576	GGCGAT	2	12	4299879	4299890	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333992694
2604	NC_015576	CCGAAC	2	12	4300324	4300335	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333992694
2605	NC_015576	CCGGAT	2	12	4303235	4303246	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333992699
2606	NC_015576	TCGCCA	2	12	4304990	4305001	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333992700
2607	NC_015576	GCCTCG	2	12	4307026	4307037	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333992703
2608	NC_015576	TCCGCC	2	12	4310305	4310316	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	333992708
2609	NC_015576	CGGGGC	2	12	4313216	4313227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992712
2610	NC_015576	TCGCCG	2	12	4314387	4314398	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333992712
2611	NC_015576	CCGGCC	2	12	4314642	4314653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992712
2612	NC_015576	TGCCGT	2	12	4316158	4316169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992712
2613	NC_015576	ACCGAT	2	12	4316228	4316239	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333992712
2614	NC_015576	CCGTCG	2	12	4319514	4319525	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333992712
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2622	NC_015576	CCGATC	2	12	4326413	4326424	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333992715
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2721	NC_015576	CGTAGA	2	12	4474969	4474980	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333992829
2722	NC_015576	CACCGC	2	12	4477549	4477560	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	333992830
2723	NC_015576	TCGCCG	2	12	4481323	4481334	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333992835
2724	NC_015576	GGCGTA	2	12	4483408	4483419	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333992836
2725	NC_015576	GGCCGC	2	12	4483738	4483749	0 %	0 %	50 %	50 %	333992836
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