MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium sp. JDM601 chromosome

Total Repeats: 98641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015576	CGC	2	6	185194	185199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988820
4002	NC_015576	GCC	2	6	185225	185230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988820
4003	NC_015576	CGC	2	6	185272	185277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988820
4004	NC_015576	CTG	2	6	185327	185332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988820
4005	NC_015576	GCC	2	6	185432	185437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988820
4006	NC_015576	CGG	2	6	185449	185454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988820
4007	NC_015576	GGC	2	6	185462	185467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988820
4008	NC_015576	CGC	2	6	185500	185505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988820
4009	NC_015576	GTC	2	6	185507	185512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988820
4010	NC_015576	CCA	2	6	185545	185550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988820
4011	NC_015576	AGG	2	6	185576	185581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_015576	CGC	2	6	185615	185620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_015576	GCC	2	6	185631	185636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_015576	CGC	2	6	185637	185642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_015576	CGC	2	6	185679	185684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_015576	GGC	2	6	185711	185716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_015576	CCA	2	6	186035	186040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988821
4018	NC_015576	GCG	2	6	186046	186051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988821
4019	NC_015576	ATC	2	6	186091	186096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988821
4020	NC_015576	GCG	2	6	186098	186103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988821
4021	NC_015576	CGT	2	6	186125	186130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988821
4022	NC_015576	GCC	2	6	186150	186155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988821
4023	NC_015576	GCG	2	6	186262	186267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988821
4024	NC_015576	TGG	2	6	186299	186304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988821
4025	NC_015576	GTT	2	6	186368	186373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988821
4026	NC_015576	TCC	2	6	186391	186396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333988821
4027	NC_015576	CGC	2	6	186426	186431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988821
4028	NC_015576	CAT	2	6	186462	186467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988821
4029	NC_015576	GCC	2	6	186492	186497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988821
4030	NC_015576	CCG	2	6	186503	186508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988821
4031	NC_015576	GTC	2	6	186525	186530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988821
4032	NC_015576	CCA	2	6	186614	186619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988821
4033	NC_015576	ACA	2	6	186620	186625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988821
4034	NC_015576	CAG	2	6	186672	186677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988821
4035	NC_015576	GGT	2	6	186765	186770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988821
4036	NC_015576	CCG	2	6	186796	186801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988821
4037	NC_015576	TGG	2	6	186818	186823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988821
4038	NC_015576	GCT	3	9	186863	186871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988821
4039	NC_015576	CAG	2	6	186891	186896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988821
4040	NC_015576	CGA	2	6	186902	186907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988821
4041	NC_015576	GCC	2	6	186999	187004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988821
4042	NC_015576	CTC	2	6	187008	187013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333988821
4043	NC_015576	CGA	2	6	187121	187126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988821
4044	NC_015576	TCG	2	6	187159	187164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988821
4045	NC_015576	ATC	2	6	187201	187206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_015576	TGA	2	6	187207	187212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988822
4047	NC_015576	CGA	2	6	187229	187234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988822
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4049	NC_015576	CCG	2	6	187439	187444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988822
4050	NC_015576	TGG	2	6	187579	187584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988822
4051	NC_015576	ACC	2	6	187596	187601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988822
4052	NC_015576	TGC	2	6	187648	187653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988822
4053	NC_015576	GCC	2	6	187668	187673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988822
4054	NC_015576	CGA	2	6	187688	187693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988822
4055	NC_015576	CGA	2	6	187754	187759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988822
4056	NC_015576	CGA	2	6	187790	187795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988822
4057	NC_015576	TCC	2	6	187848	187853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333988822
4058	NC_015576	GCT	2	6	187887	187892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988822
4059	NC_015576	CGG	2	6	187934	187939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988822
4060	NC_015576	GCC	2	6	187972	187977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988822
4061	NC_015576	GTG	2	6	187998	188003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988822
4062	NC_015576	GCC	2	6	188079	188084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988822
4063	NC_015576	ACA	2	6	188086	188091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988822
4064	NC_015576	GAT	2	6	188268	188273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988823
4065	NC_015576	GCC	3	9	188295	188303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988823
4066	NC_015576	CGA	2	6	188390	188395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988823
4067	NC_015576	CAG	2	6	188457	188462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988823
4068	NC_015576	GGC	2	6	188466	188471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988823
4069	NC_015576	GTT	2	6	188505	188510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988823
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4071	NC_015576	GCC	2	6	188607	188612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988823
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4073	NC_015576	TGG	2	6	188788	188793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988823
4074	NC_015576	GCA	2	6	188828	188833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988823
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4080	NC_015576	CAG	2	6	189149	189154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988823
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4082	NC_015576	CGG	3	9	189251	189259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988823
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4086	NC_015576	CGC	2	6	189420	189425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988824
4087	NC_015576	CCG	2	6	189430	189435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988824
4088	NC_015576	TGG	2	6	189495	189500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988824
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4103	NC_015576	CGC	2	6	190318	190323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988824
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4109	NC_015576	ACG	2	6	190693	190698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988825
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4239	NC_015576	GAT	2	6	196343	196348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988829
4240	NC_015576	ACC	2	6	196455	196460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988829
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4242	NC_015576	GCA	2	6	196531	196536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988829
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4244	NC_015576	CGG	2	6	196768	196773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988830
4245	NC_015576	TGG	2	6	196806	196811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988830
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4247	NC_015576	GGT	2	6	196867	196872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988830
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4249	NC_015576	CTG	2	6	196949	196954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988830
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4260	NC_015576	CGA	2	6	197371	197376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988830
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4262	NC_015576	CGA	2	6	197446	197451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988830
4263	NC_015576	CGC	2	6	197452	197457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988830
4264	NC_015576	GCT	2	6	197689	197694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988831
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4267	NC_015576	CGG	2	6	198018	198023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988831
4268	NC_015576	AGC	3	9	198081	198089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988831
4269	NC_015576	GGC	2	6	198097	198102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988831
4270	NC_015576	CCA	2	6	198129	198134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988831
4271	NC_015576	AGC	2	6	198195	198200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988831
4272	NC_015576	TCA	2	6	198237	198242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988831
4273	NC_015576	CAT	2	6	198274	198279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988831
4274	NC_015576	ACC	2	6	198443	198448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988831
4275	NC_015576	ATG	2	6	198554	198559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988831
4276	NC_015576	CAT	2	6	198682	198687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988831
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4279	NC_015576	TGA	2	6	198714	198719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988831
4280	NC_015576	CCA	2	6	198772	198777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988831
4281	NC_015576	CTG	3	9	198842	198850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988831
4282	NC_015576	CGG	2	6	198916	198921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988831
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4287	NC_015576	GCT	2	6	199135	199140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988831
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4309	NC_015576	CGA	2	6	200176	200181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988833
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4315	NC_015576	CGC	2	6	200381	200386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988833
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4318	NC_015576	CCA	2	6	200485	200490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988833
4319	NC_015576	CAG	2	6	200501	200506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988833
4320	NC_015576	GCG	2	6	200535	200540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988833
4321	NC_015576	GCA	2	6	200584	200589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988833
4322	NC_015576	CGC	2	6	200702	200707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988833
4323	NC_015576	GCG	2	6	200716	200721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988833
4324	NC_015576	ACG	2	6	200778	200783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4325	NC_015576	CTG	2	6	200866	200871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988834
4326	NC_015576	CCT	2	6	200889	200894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333988834
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4328	NC_015576	GCA	2	6	200941	200946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988834
4329	NC_015576	GTC	2	6	201026	201031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988834
4330	NC_015576	CCT	3	9	201081	201089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333988834
4331	NC_015576	GAT	2	6	201103	201108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988834
4332	NC_015576	TCC	2	6	201131	201136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333988834
4333	NC_015576	CGA	2	6	201183	201188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988834
4334	NC_015576	GCC	3	9	201217	201225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988834
4335	NC_015576	GGC	2	6	201316	201321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988834
4336	NC_015576	GCA	2	6	201498	201503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988834
4337	NC_015576	CGC	2	6	201508	201513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988834
4338	NC_015576	GCC	2	6	201520	201525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988834
4339	NC_015576	AGC	2	6	201548	201553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988834
4340	NC_015576	CAC	2	6	201664	201669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988834
4341	NC_015576	ACA	2	6	201672	201677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988834
4342	NC_015576	CGG	2	6	201741	201746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988834
4343	NC_015576	CAC	2	6	201757	201762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988834
4344	NC_015576	CAG	2	6	201775	201780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988834
4345	NC_015576	TTG	2	6	201794	201799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988834
4346	NC_015576	CGA	2	6	201828	201833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988834
4347	NC_015576	TCG	2	6	201914	201919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988834
4348	NC_015576	GAA	2	6	201934	201939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988834
4349	NC_015576	CGG	2	6	201988	201993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988834
4350	NC_015576	CGG	2	6	202005	202010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988834
4351	NC_015576	CTC	2	6	202039	202044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333988834
4352	NC_015576	CGG	2	6	202059	202064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988834
4353	NC_015576	GCC	2	6	202130	202135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988834
4354	NC_015576	CGT	2	6	202152	202157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988834
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4356	NC_015576	GCC	2	6	202249	202254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988834
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4476	NC_015576	CTT	2	6	207577	207582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333988840
4477	NC_015576	ACT	2	6	207765	207770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988840
4478	NC_015576	TCA	2	6	207813	207818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988840
4479	NC_015576	TTC	3	9	207842	207850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333988840
4480	NC_015576	ATC	2	6	207869	207874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988840
4481	NC_015576	CGG	2	6	207963	207968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988840
4482	NC_015576	TGC	2	6	207972	207977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988840
4483	NC_015576	GCT	2	6	207997	208002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988840
4484	NC_015576	TCG	2	6	208077	208082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988840
4485	NC_015576	TCG	2	6	208089	208094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988840
4486	NC_015576	TGC	2	6	208095	208100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988840
4487	NC_015576	GAC	2	6	208124	208129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988840
4488	NC_015576	CGT	2	6	208167	208172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4489	NC_015576	CGC	2	6	208187	208192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4490	NC_015576	AAC	2	6	208198	208203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4491	NC_015576	TCT	2	6	208241	208246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4492	NC_015576	GAT	2	6	208284	208289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988841
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4497	NC_015576	GCG	2	6	208484	208489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988841
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4499	NC_015576	CAT	2	6	208623	208628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988841
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