MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 1334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015574	ATTAT	2	10	1381	1390	40 %	60 %	0 %	0 %	333986244
2	NC_015574	TCAAG	2	10	4006	4015	40 %	20 %	20 %	20 %	333986247
3	NC_015574	TCCCT	2	10	4900	4909	0 %	40 %	0 %	60 %	333986247
4	NC_015574	CATAG	2	10	7161	7170	40 %	20 %	20 %	20 %	333986249
5	NC_015574	AGGGC	2	10	7181	7190	20 %	0 %	60 %	20 %	333986249
6	NC_015574	ATGAA	2	10	8641	8650	60 %	20 %	20 %	0 %	333986250
7	NC_015574	AAGAT	2	10	14647	14656	60 %	20 %	20 %	0 %	333986254
8	NC_015574	GAGCG	2	10	17671	17680	20 %	0 %	60 %	20 %	333986259
9	NC_015574	ATTTA	2	10	23393	23402	40 %	60 %	0 %	0 %	333986263
10	NC_015574	AAGTT	2	10	25854	25863	40 %	40 %	20 %	0 %	333986265
11	NC_015574	CATGG	2	10	30099	30108	20 %	20 %	40 %	20 %	333986269
12	NC_015574	AGCAC	2	10	30229	30238	40 %	0 %	20 %	40 %	333986269
13	NC_015574	CCATA	2	10	30961	30970	40 %	20 %	0 %	40 %	333986269
14	NC_015574	CTTTT	2	10	32308	32317	0 %	80 %	0 %	20 %	333986271
15	NC_015574	TCAAG	2	10	34710	34719	40 %	20 %	20 %	20 %	333986274
16	NC_015574	AAGGT	2	10	35475	35484	40 %	20 %	40 %	0 %	333986274
17	NC_015574	TGGTC	3	15	36854	36868	0 %	40 %	40 %	20 %	333986275
18	NC_015574	TCTGT	2	10	38313	38322	0 %	60 %	20 %	20 %	333986277
19	NC_015574	ATTTT	2	10	41070	41079	20 %	80 %	0 %	0 %	333986280
20	NC_015574	GGACT	2	10	44364	44373	20 %	20 %	40 %	20 %	333986282
21	NC_015574	CAACA	2	10	49583	49592	60 %	0 %	0 %	40 %	333986287
22	NC_015574	CTGTT	2	10	49612	49621	0 %	60 %	20 %	20 %	333986287
23	NC_015574	TACGT	2	10	51299	51308	20 %	40 %	20 %	20 %	333986287
24	NC_015574	TACAA	2	10	51482	51491	60 %	20 %	0 %	20 %	333986287
25	NC_015574	CAGTG	2	10	53195	53204	20 %	20 %	40 %	20 %	333986287
26	NC_015574	GCAGT	2	10	53539	53548	20 %	20 %	40 %	20 %	333986287
27	NC_015574	CAGGA	2	10	56415	56424	40 %	0 %	40 %	20 %	333986290
28	NC_015574	GAATG	2	10	57045	57054	40 %	20 %	40 %	0 %	333986290
29	NC_015574	CGGCA	2	10	57875	57884	20 %	0 %	40 %	40 %	333986290
30	NC_015574	ACAGA	2	10	59253	59262	60 %	0 %	20 %	20 %	333986291
31	NC_015574	ACCCA	2	10	59263	59272	40 %	0 %	0 %	60 %	333986291
32	NC_015574	AAATC	2	10	60693	60702	60 %	20 %	0 %	20 %	333986291
33	NC_015574	TGTAT	2	10	60836	60845	20 %	60 %	20 %	0 %	333986291
34	NC_015574	CATGC	2	10	62642	62651	20 %	20 %	20 %	40 %	333986293
35	NC_015574	CAATT	2	10	66227	66236	40 %	40 %	0 %	20 %	333986295
36	NC_015574	CCTTG	2	10	67127	67136	0 %	40 %	20 %	40 %	333986295
37	NC_015574	AAGAT	2	10	69944	69953	60 %	20 %	20 %	0 %	333986296
38	NC_015574	TAAGA	2	10	70668	70677	60 %	20 %	20 %	0 %	333986297
39	NC_015574	GACAG	2	10	73536	73545	40 %	0 %	40 %	20 %	333986300
40	NC_015574	TGTAA	2	10	77630	77639	40 %	40 %	20 %	0 %	333986303
41	NC_015574	TTTCA	2	10	78711	78720	20 %	60 %	0 %	20 %	333986304
42	NC_015574	TATCG	2	10	80559	80568	20 %	40 %	20 %	20 %	333986306
43	NC_015574	TTCTG	2	10	81029	81038	0 %	60 %	20 %	20 %	333986306
44	NC_015574	ATAAG	2	10	89163	89172	60 %	20 %	20 %	0 %	333986312
45	NC_015574	GAAAG	2	10	91268	91277	60 %	0 %	40 %	0 %	333986314
46	NC_015574	TTTAT	2	10	93553	93562	20 %	80 %	0 %	0 %	333986316
47	NC_015574	AAAGG	2	10	95064	95073	60 %	0 %	40 %	0 %	333986318
48	NC_015574	TCCTC	2	10	95215	95224	0 %	40 %	0 %	60 %	333986318
49	NC_015574	TTTTA	2	10	96067	96076	20 %	80 %	0 %	0 %	333986320
50	NC_015574	ATGGC	2	10	98487	98496	20 %	20 %	40 %	20 %	333986323
51	NC_015574	GATAT	2	10	102709	102718	40 %	40 %	20 %	0 %	333986325
52	NC_015574	TTCCA	2	10	108486	108495	20 %	40 %	0 %	40 %	333986329
53	NC_015574	TTTGT	2	10	111071	111080	0 %	80 %	20 %	0 %	333986333
54	NC_015574	ATTAA	2	10	113443	113452	60 %	40 %	0 %	0 %	333986337
55	NC_015574	AAGGA	2	10	119188	119197	60 %	0 %	40 %	0 %	333986341
56	NC_015574	ACTGG	2	10	122897	122906	20 %	20 %	40 %	20 %	333986342
57	NC_015574	CAGGA	2	10	122928	122937	40 %	0 %	40 %	20 %	333986342
58	NC_015574	AAATA	2	10	123576	123585	80 %	20 %	0 %	0 %	333986342
59	NC_015574	AAAAG	2	10	124061	124070	80 %	0 %	20 %	0 %	333986343
60	NC_015574	GGCAC	2	10	125455	125464	20 %	0 %	40 %	40 %	333986344
61	NC_015574	TAAAA	2	10	131782	131791	80 %	20 %	0 %	0 %	333986349
62	NC_015574	GGTCT	2	10	133128	133137	0 %	40 %	40 %	20 %	333986350
63	NC_015574	CGGAT	2	10	135574	135583	20 %	20 %	40 %	20 %	333986353
64	NC_015574	ACTAT	2	10	136908	136917	40 %	40 %	0 %	20 %	333986354
65	NC_015574	ATTCC	2	10	137445	137454	20 %	40 %	0 %	40 %	333986355
66	NC_015574	CTCTC	2	10	139703	139712	0 %	40 %	0 %	60 %	333986357
67	NC_015574	ATTTT	2	10	142181	142190	20 %	80 %	0 %	0 %	333986358
68	NC_015574	TAATT	2	10	142907	142916	40 %	60 %	0 %	0 %	333986358
69	NC_015574	GTTTT	2	10	146340	146349	0 %	80 %	20 %	0 %	333986361
70	NC_015574	AAGGG	2	10	146925	146934	40 %	0 %	60 %	0 %	333986362
71	NC_015574	GTGAA	2	10	149614	149623	40 %	20 %	40 %	0 %	333986366
72	NC_015574	GTATA	2	10	150546	150555	40 %	40 %	20 %	0 %	333986367
73	NC_015574	AAATG	2	10	151180	151189	60 %	20 %	20 %	0 %	333986367
74	NC_015574	GATCA	2	10	154772	154781	40 %	20 %	20 %	20 %	333986371
75	NC_015574	AATAA	2	10	154938	154947	80 %	20 %	0 %	0 %	333986371
76	NC_015574	AAATG	2	10	156484	156493	60 %	20 %	20 %	0 %	333986373
77	NC_015574	TTGAA	2	10	157134	157143	40 %	40 %	20 %	0 %	333986373
78	NC_015574	TGTTT	2	10	157492	157501	0 %	80 %	20 %	0 %	333986374
79	NC_015574	GTAAG	2	10	157792	157801	40 %	20 %	40 %	0 %	333986374
80	NC_015574	AGGGT	2	10	158562	158571	20 %	20 %	60 %	0 %	333986375
81	NC_015574	TAAAT	2	10	160269	160278	60 %	40 %	0 %	0 %	333986377
82	NC_015574	TTTGG	2	10	161356	161365	0 %	60 %	40 %	0 %	333986378
83	NC_015574	TGATA	2	10	161972	161981	40 %	40 %	20 %	0 %	333986379
84	NC_015574	CTTTT	2	10	162028	162037	0 %	80 %	0 %	20 %	333986379
85	NC_015574	CATAT	2	10	162627	162636	40 %	40 %	0 %	20 %	333986379
86	NC_015574	TTTAA	2	10	164295	164304	40 %	60 %	0 %	0 %	333986380
87	NC_015574	ACTGT	2	10	166183	166192	20 %	40 %	20 %	20 %	333986382
88	NC_015574	ATTTT	2	10	166339	166348	20 %	80 %	0 %	0 %	333986382
89	NC_015574	TTAAA	2	10	166520	166529	60 %	40 %	0 %	0 %	333986382
90	NC_015574	GTTTT	2	10	166886	166895	0 %	80 %	20 %	0 %	333986383
91	NC_015574	CATTT	2	10	167334	167343	20 %	60 %	0 %	20 %	333986383
92	NC_015574	GGAAC	2	10	168736	168745	40 %	0 %	40 %	20 %	333986385
93	NC_015574	TTCTT	2	10	171124	171133	0 %	80 %	0 %	20 %	333986389
94	NC_015574	ATTTT	2	10	171182	171191	20 %	80 %	0 %	0 %	333986389
95	NC_015574	TTTGG	2	10	174908	174917	0 %	60 %	40 %	0 %	333986394
96	NC_015574	TCAAA	2	10	177847	177856	60 %	20 %	0 %	20 %	333986396
97	NC_015574	CCATG	2	10	179662	179671	20 %	20 %	20 %	40 %	333986399
98	NC_015574	TGTAT	2	10	180963	180972	20 %	60 %	20 %	0 %	333986399
99	NC_015574	TATTG	2	10	182882	182891	20 %	60 %	20 %	0 %	333986400
100	NC_015574	CCATA	2	10	183132	183141	40 %	20 %	0 %	40 %	333986401
101	NC_015574	TCACC	2	10	184401	184410	20 %	20 %	0 %	60 %	333986402
102	NC_015574	TTGTG	2	10	184491	184500	0 %	60 %	40 %	0 %	333986402
103	NC_015574	TTCCA	2	10	186286	186295	20 %	40 %	0 %	40 %	333986404
104	NC_015574	TTTGA	2	10	186698	186707	20 %	60 %	20 %	0 %	333986404
105	NC_015574	GTGGA	2	10	189291	189300	20 %	20 %	60 %	0 %	333986406
106	NC_015574	GCATT	2	10	189731	189740	20 %	40 %	20 %	20 %	333986406
107	NC_015574	CTTTT	2	10	192340	192349	0 %	80 %	0 %	20 %	333986408
108	NC_015574	CTCTT	2	10	194035	194044	0 %	60 %	0 %	40 %	333986409
109	NC_015574	TATTT	2	10	194223	194232	20 %	80 %	0 %	0 %	333986409
110	NC_015574	ATGAA	2	10	195223	195232	60 %	20 %	20 %	0 %	333986410
111	NC_015574	GTTAC	2	10	196156	196165	20 %	40 %	20 %	20 %	333986410
112	NC_015574	ATGGG	2	10	202509	202518	20 %	20 %	60 %	0 %	333986415
113	NC_015574	TTAAA	2	10	203047	203056	60 %	40 %	0 %	0 %	333986415
114	NC_015574	ATTGG	2	10	203981	203990	20 %	40 %	40 %	0 %	333986416
115	NC_015574	ACAGC	2	10	204180	204189	40 %	0 %	20 %	40 %	333986416
116	NC_015574	CAGTT	2	10	206720	206729	20 %	40 %	20 %	20 %	333986419
117	NC_015574	ATTAT	2	10	207579	207588	40 %	60 %	0 %	0 %	333986419
118	NC_015574	TAAAG	2	10	208255	208264	60 %	20 %	20 %	0 %	333986420
119	NC_015574	ATTAA	2	10	209050	209059	60 %	40 %	0 %	0 %	333986422
120	NC_015574	TTTTC	2	10	211326	211335	0 %	80 %	0 %	20 %	333986424
121	NC_015574	ACCCC	2	10	215012	215021	20 %	0 %	0 %	80 %	333986426
122	NC_015574	TAAAA	2	10	215186	215195	80 %	20 %	0 %	0 %	333986426
123	NC_015574	AACGA	2	10	217257	217266	60 %	0 %	20 %	20 %	333986429
124	NC_015574	AGTGG	2	10	221969	221978	20 %	20 %	60 %	0 %	333986432
125	NC_015574	TGAAT	2	10	223217	223226	40 %	40 %	20 %	0 %	333986433
126	NC_015574	TGATA	2	10	224788	224797	40 %	40 %	20 %	0 %	333986434
127	NC_015574	CCAGC	2	10	225984	225993	20 %	0 %	20 %	60 %	333986435
128	NC_015574	GAACT	2	10	226004	226013	40 %	20 %	20 %	20 %	333986435
129	NC_015574	CTTTT	2	10	230691	230700	0 %	80 %	0 %	20 %	333986439
130	NC_015574	TCCCC	2	10	234301	234310	0 %	20 %	0 %	80 %	333986442
131	NC_015574	TTTCC	2	10	236590	236599	0 %	60 %	0 %	40 %	333986444
132	NC_015574	TTTAA	2	10	239947	239956	40 %	60 %	0 %	0 %	333986448
133	NC_015574	TGGAA	2	10	241495	241504	40 %	20 %	40 %	0 %	333986450
134	NC_015574	ATTTT	2	10	244696	244705	20 %	80 %	0 %	0 %	333986453
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