MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 6555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015574	AGAA	2	8	902	909	75 %	0 %	25 %	0 %	333986244
2	NC_015574	CAAA	2	8	1034	1041	75 %	0 %	0 %	25 %	333986244
3	NC_015574	CAAA	2	8	1049	1056	75 %	0 %	0 %	25 %	333986244
4	NC_015574	TAAG	2	8	1293	1300	50 %	25 %	25 %	0 %	333986244
5	NC_015574	ACTA	2	8	1732	1739	50 %	25 %	0 %	25 %	333986245
6	NC_015574	AGAT	2	8	2472	2479	50 %	25 %	25 %	0 %	333986245
7	NC_015574	TGTT	2	8	2519	2526	0 %	75 %	25 %	0 %	333986245
8	NC_015574	CAGA	2	8	3313	3320	50 %	0 %	25 %	25 %	333986246
9	NC_015574	TCAT	2	8	3520	3527	25 %	50 %	0 %	25 %	333986247
10	NC_015574	GTTC	2	8	4293	4300	0 %	50 %	25 %	25 %	333986247
11	NC_015574	AAAT	2	8	4521	4528	75 %	25 %	0 %	0 %	333986247
12	NC_015574	GATG	2	8	4635	4642	25 %	25 %	50 %	0 %	333986247
13	NC_015574	GAAA	2	8	4813	4820	75 %	0 %	25 %	0 %	333986247
14	NC_015574	CATT	2	8	4868	4875	25 %	50 %	0 %	25 %	333986247
15	NC_015574	GGTA	2	8	5571	5578	25 %	25 %	50 %	0 %	333986248
16	NC_015574	AGGT	2	8	5642	5649	25 %	25 %	50 %	0 %	333986248
17	NC_015574	GAAG	2	8	6235	6242	50 %	0 %	50 %	0 %	333986248
18	NC_015574	TGCA	2	8	6836	6843	25 %	25 %	25 %	25 %	333986248
19	NC_015574	ATTT	2	8	6949	6956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015574	ATTA	2	8	6974	6981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015574	TGGC	2	8	7959	7966	0 %	25 %	50 %	25 %	333986249
22	NC_015574	ATTT	2	8	8182	8189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015574	ATAC	2	8	8666	8673	50 %	25 %	0 %	25 %	333986250
24	NC_015574	ATTT	2	8	9227	9234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015574	ATTA	2	8	9324	9331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015574	TTAA	2	8	9369	9376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015574	ATTT	2	8	9404	9411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015574	CCGG	2	8	9600	9607	0 %	0 %	50 %	50 %	333986251
29	NC_015574	TAAA	2	8	9899	9906	75 %	25 %	0 %	0 %	333986251
30	NC_015574	CAAC	2	8	9995	10002	50 %	0 %	0 %	50 %	333986251
31	NC_015574	CTAT	2	8	10251	10258	25 %	50 %	0 %	25 %	333986251
32	NC_015574	TTTC	2	8	10838	10845	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015574	ATCT	2	8	11352	11359	25 %	50 %	0 %	25 %	333986252
34	NC_015574	AGAA	2	8	11601	11608	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015574	CCTT	2	8	11640	11647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015574	TAGT	2	8	11701	11708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015574	GAAA	2	8	11875	11882	75 %	0 %	25 %	0 %	333986253
38	NC_015574	TGCA	2	8	12042	12049	25 %	25 %	25 %	25 %	333986253
39	NC_015574	TTCC	2	8	12412	12419	0 %	50 %	0 %	50 %	333986253
40	NC_015574	TTTA	2	8	12937	12944	25 %	75 %	0 %	0 %	333986253
41	NC_015574	TTCA	2	8	13044	13051	25 %	50 %	0 %	25 %	333986253
42	NC_015574	CTTA	2	8	13852	13859	25 %	50 %	0 %	25 %	333986253
43	NC_015574	TTCA	2	8	13975	13982	25 %	50 %	0 %	25 %	333986254
44	NC_015574	TTTC	2	8	14047	14054	0 %	75 %	0 %	25 %	333986254
45	NC_015574	CCTG	2	8	14202	14209	0 %	25 %	25 %	50 %	333986254
46	NC_015574	CTTT	2	8	14568	14575	0 %	75 %	0 %	25 %	333986254
47	NC_015574	TCAT	2	8	14782	14789	25 %	50 %	0 %	25 %	333986254
48	NC_015574	CTTA	2	8	14846	14853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015574	ATTT	2	8	16431	16438	25 %	75 %	0 %	0 %	333986257
50	NC_015574	ATTT	2	8	17516	17523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015574	TAAA	2	8	18865	18872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015574	ATAG	2	8	19021	19028	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015574	TAAA	2	8	19051	19058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015574	CATC	2	8	19298	19305	25 %	25 %	0 %	50 %	333986260
55	NC_015574	CAGC	2	8	19778	19785	25 %	0 %	25 %	50 %	333986260
56	NC_015574	TCTT	2	8	20187	20194	0 %	75 %	0 %	25 %	333986260
57	NC_015574	CTGT	2	8	20264	20271	0 %	50 %	25 %	25 %	333986260
58	NC_015574	AGGT	2	8	20292	20299	25 %	25 %	50 %	0 %	333986260
59	NC_015574	TGCC	2	8	21960	21967	0 %	25 %	25 %	50 %	333986262
60	NC_015574	ATTG	2	8	22442	22449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015574	TTAA	2	8	22513	22520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015574	ATTT	2	8	22569	22576	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015574	ATTT	2	8	22579	22586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015574	TTGT	2	8	22677	22684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015574	TATC	2	8	23114	23121	25 %	50 %	0 %	25 %	333986263
66	NC_015574	AAAT	2	8	23366	23373	75 %	25 %	0 %	0 %	333986263
67	NC_015574	ATTT	2	8	23624	23631	25 %	75 %	0 %	0 %	333986263
68	NC_015574	ATTT	2	8	23708	23715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015574	TAAG	2	8	24147	24154	50 %	25 %	25 %	0 %	333986264
70	NC_015574	CAGG	2	8	25203	25210	25 %	0 %	50 %	25 %	333986264
71	NC_015574	TGGT	2	8	25891	25898	0 %	50 %	50 %	0 %	333986265
72	NC_015574	CAGA	2	8	26826	26833	50 %	0 %	25 %	25 %	333986266
73	NC_015574	AAGA	2	8	26889	26896	75 %	0 %	25 %	0 %	333986266
74	NC_015574	TTCA	2	8	27647	27654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015574	AAAC	2	8	27863	27870	75 %	0 %	0 %	25 %	333986267
76	NC_015574	TTTC	2	8	28556	28563	0 %	75 %	0 %	25 %	333986268
77	NC_015574	CCGT	2	8	29430	29437	0 %	25 %	25 %	50 %	333986268
78	NC_015574	GCTG	2	8	29705	29712	0 %	25 %	50 %	25 %	333986268
79	NC_015574	TAAT	2	8	30313	30320	50 %	50 %	0 %	0 %	333986269
80	NC_015574	CTTT	2	8	31103	31110	0 %	75 %	0 %	25 %	333986270
81	NC_015574	TGTA	2	8	31155	31162	25 %	50 %	25 %	0 %	333986270
82	NC_015574	CTTA	2	8	31227	31234	25 %	50 %	0 %	25 %	333986270
83	NC_015574	CTTC	2	8	31463	31470	0 %	50 %	0 %	50 %	333986270
84	NC_015574	TGGT	2	8	31676	31683	0 %	50 %	50 %	0 %	333986270
85	NC_015574	CTTG	2	8	31769	31776	0 %	50 %	25 %	25 %	333986270
86	NC_015574	TTTA	2	8	33166	33173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015574	TGAA	2	8	33271	33278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015574	CATC	2	8	33351	33358	25 %	25 %	0 %	50 %	333986272
89	NC_015574	CCAT	2	8	33492	33499	25 %	25 %	0 %	50 %	333986272
90	NC_015574	AATG	2	8	33532	33539	50 %	25 %	25 %	0 %	333986272
91	NC_015574	TGAA	2	8	33655	33662	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015574	GCAC	2	8	34033	34040	25 %	0 %	25 %	50 %	333986273
93	NC_015574	GATT	2	8	34164	34171	25 %	50 %	25 %	0 %	333986273
94	NC_015574	AATA	2	8	34289	34296	75 %	25 %	0 %	0 %	333986273
95	NC_015574	GATA	2	8	34516	34523	50 %	25 %	25 %	0 %	333986273
96	NC_015574	ATAA	2	8	34621	34628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015574	ATTA	2	8	35248	35255	50 %	50 %	0 %	0 %	333986274
98	NC_015574	CAAA	2	8	36210	36217	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015574	CCTG	2	8	36533	36540	0 %	25 %	25 %	50 %	333986275
100	NC_015574	GTCT	2	8	36894	36901	0 %	50 %	25 %	25 %	333986275
101	NC_015574	TTGT	2	8	37337	37344	0 %	75 %	25 %	0 %	333986276
102	NC_015574	TCAA	2	8	37883	37890	50 %	25 %	0 %	25 %	333986276
103	NC_015574	ATTA	2	8	37901	37908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015574	TTAT	2	8	37915	37922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015574	TTTA	2	8	38013	38020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015574	AAAT	2	8	38034	38041	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015574	TGGC	2	8	38626	38633	0 %	25 %	50 %	25 %	333986278
108	NC_015574	TGTT	2	8	39053	39060	0 %	75 %	25 %	0 %	333986278
109	NC_015574	TCCA	2	8	39069	39076	25 %	25 %	0 %	50 %	333986278
110	NC_015574	TATT	2	8	39241	39248	25 %	75 %	0 %	0 %	333986278
111	NC_015574	ATTA	2	8	39405	39412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015574	TTCA	2	8	39450	39457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015574	ATTT	2	8	39891	39898	25 %	75 %	0 %	0 %	333986279
114	NC_015574	ACCT	2	8	41880	41887	25 %	25 %	0 %	50 %	333986281
115	NC_015574	TACC	2	8	42236	42243	25 %	25 %	0 %	50 %	333986281
116	NC_015574	CAAG	2	8	42415	42422	50 %	0 %	25 %	25 %	333986281
117	NC_015574	ATTT	2	8	42748	42755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015574	TTTC	2	8	43302	43309	0 %	75 %	0 %	25 %	333986282
119	NC_015574	ACAG	2	8	43325	43332	50 %	0 %	25 %	25 %	333986282
120	NC_015574	TATT	2	8	44686	44693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015574	ACAA	2	8	45603	45610	75 %	0 %	0 %	25 %	333986283
122	NC_015574	AGTT	2	8	45817	45824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015574	CCAT	2	8	46642	46649	25 %	25 %	0 %	50 %	333986285
124	NC_015574	AAAG	2	8	46675	46682	75 %	0 %	25 %	0 %	333986285
125	NC_015574	AGAT	2	8	47199	47206	50 %	25 %	25 %	0 %	333986285
126	NC_015574	GCTG	2	8	47293	47300	0 %	25 %	50 %	25 %	333986285
127	NC_015574	GGTG	2	8	47482	47489	0 %	25 %	75 %	0 %	333986285
128	NC_015574	TGGT	2	8	48547	48554	0 %	50 %	50 %	0 %	333986286
129	NC_015574	AGCA	2	8	48608	48615	50 %	0 %	25 %	25 %	333986286
130	NC_015574	TGAA	2	8	49107	49114	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015574	AGTT	2	8	50900	50907	25 %	50 %	25 %	0 %	333986287
132	NC_015574	ACAT	2	8	51117	51124	50 %	25 %	0 %	25 %	333986287
133	NC_015574	TAAC	2	8	51784	51791	50 %	25 %	0 %	25 %	333986287
134	NC_015574	CACT	2	8	52354	52361	25 %	25 %	0 %	50 %	333986287
135	NC_015574	TCAA	2	8	52950	52957	50 %	25 %	0 %	25 %	333986287
136	NC_015574	TCAT	2	8	53731	53738	25 %	50 %	0 %	25 %	333986287
137	NC_015574	ACAA	2	8	53844	53851	75 %	0 %	0 %	25 %	333986287
138	NC_015574	CTGG	2	8	54369	54376	0 %	25 %	50 %	25 %	333986287
139	NC_015574	TAAA	2	8	54481	54488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015574	ATTC	2	8	54500	54507	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015574	AAAC	2	8	55511	55518	75 %	0 %	0 %	25 %	333986289
142	NC_015574	TGCC	2	8	55803	55810	0 %	25 %	25 %	50 %	333986289
143	NC_015574	TGGA	2	8	56440	56447	25 %	25 %	50 %	0 %	333986290
144	NC_015574	GCAT	2	8	57150	57157	25 %	25 %	25 %	25 %	333986290
145	NC_015574	GCTG	2	8	57332	57339	0 %	25 %	50 %	25 %	333986290
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