MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 4356

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015574	ATCA	2	8	2324779	2324786	50 %	25 %	0 %	25 %	333988439
4002	NC_015574	TAAT	2	8	2325757	2325764	50 %	50 %	0 %	0 %	333988440
4003	NC_015574	TCCT	2	8	2325938	2325945	0 %	50 %	0 %	50 %	333988440
4004	NC_015574	ATGA	2	8	2325963	2325970	50 %	25 %	25 %	0 %	333988440
4005	NC_015574	AATG	2	8	2326654	2326661	50 %	25 %	25 %	0 %	333988441
4006	NC_015574	AACG	2	8	2327401	2327408	50 %	0 %	25 %	25 %	333988442
4007	NC_015574	CAAA	2	8	2327750	2327757	75 %	0 %	0 %	25 %	333988443
4008	NC_015574	GACA	2	8	2330447	2330454	50 %	0 %	25 %	25 %	333988445
4009	NC_015574	AAGA	2	8	2333218	2333225	75 %	0 %	25 %	0 %	333988448
4010	NC_015574	ACCA	2	8	2333289	2333296	50 %	0 %	0 %	50 %	333988448
4011	NC_015574	TCCT	2	8	2333545	2333552	0 %	50 %	0 %	50 %	333988448
4012	NC_015574	CCTT	2	8	2333997	2334004	0 %	50 %	0 %	50 %	333988448
4013	NC_015574	GAAA	2	8	2334388	2334395	75 %	0 %	25 %	0 %	333988448
4014	NC_015574	ACCA	2	8	2334405	2334412	50 %	0 %	0 %	50 %	333988448
4015	NC_015574	CAAA	2	8	2334662	2334669	75 %	0 %	0 %	25 %	333988448
4016	NC_015574	GTTC	2	8	2337345	2337352	0 %	50 %	25 %	25 %	333988450
4017	NC_015574	CCTG	2	8	2337385	2337392	0 %	25 %	25 %	50 %	333988450
4018	NC_015574	ATGG	2	8	2337555	2337562	25 %	25 %	50 %	0 %	333988450
4019	NC_015574	TACA	2	8	2338637	2338644	50 %	25 %	0 %	25 %	333988451
4020	NC_015574	ATTT	2	8	2338742	2338749	25 %	75 %	0 %	0 %	333988451
4021	NC_015574	TCAA	2	8	2338861	2338868	50 %	25 %	0 %	25 %	333988451
4022	NC_015574	TGGC	2	8	2339175	2339182	0 %	25 %	50 %	25 %	333988451
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4035	NC_015574	CCAT	2	8	2350178	2350185	25 %	25 %	0 %	50 %	333988462
4036	NC_015574	TGCT	2	8	2351222	2351229	0 %	50 %	25 %	25 %	333988463
4037	NC_015574	CAGA	3	12	2351345	2351356	50 %	0 %	25 %	25 %	333988463
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4040	NC_015574	TCTT	2	8	2352832	2352839	0 %	75 %	0 %	25 %	333988465
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4042	NC_015574	TGGA	2	8	2354519	2354526	25 %	25 %	50 %	0 %	333988467
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4044	NC_015574	TTTC	2	8	2358285	2358292	0 %	75 %	0 %	25 %	333988471
4045	NC_015574	ACAT	2	8	2358766	2358773	50 %	25 %	0 %	25 %	333988472
4046	NC_015574	TTCC	2	8	2358980	2358987	0 %	50 %	0 %	50 %	333988473
4047	NC_015574	TCTT	2	8	2359322	2359329	0 %	75 %	0 %	25 %	333988473
4048	NC_015574	ACGT	2	8	2359425	2359432	25 %	25 %	25 %	25 %	333988473
4049	NC_015574	TAAT	2	8	2359767	2359774	50 %	50 %	0 %	0 %	333988474
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4056	NC_015574	GATG	2	8	2364544	2364551	25 %	25 %	50 %	0 %	333988481
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4059	NC_015574	CATC	2	8	2366114	2366121	25 %	25 %	0 %	50 %	333988484
4060	NC_015574	TCTT	2	8	2366310	2366317	0 %	75 %	0 %	25 %	333988484
4061	NC_015574	ATCA	2	8	2366322	2366329	50 %	25 %	0 %	25 %	333988484
4062	NC_015574	TTCT	2	8	2367047	2367054	0 %	75 %	0 %	25 %	333988484
4063	NC_015574	CTGA	2	8	2368804	2368811	25 %	25 %	25 %	25 %	333988486
4064	NC_015574	GGGC	2	8	2369649	2369656	0 %	0 %	75 %	25 %	333988486
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4088	NC_015574	GATA	2	8	2384246	2384253	50 %	25 %	25 %	0 %	333988503
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4097	NC_015574	TGCC	2	8	2394742	2394749	0 %	25 %	25 %	50 %	333988511
4098	NC_015574	TTTA	2	8	2395362	2395369	25 %	75 %	0 %	0 %	333988512
4099	NC_015574	CTTC	2	8	2395693	2395700	0 %	50 %	0 %	50 %	333988512
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4101	NC_015574	CCTT	2	8	2396467	2396474	0 %	50 %	0 %	50 %	333988513
4102	NC_015574	TAAT	2	8	2397669	2397676	50 %	50 %	0 %	0 %	333988514
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4110	NC_015574	ATTA	2	8	2403146	2403153	50 %	50 %	0 %	0 %	333988518
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4114	NC_015574	GAAT	2	8	2406078	2406085	50 %	25 %	25 %	0 %	333988520
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4122	NC_015574	TCAA	2	8	2411591	2411598	50 %	25 %	0 %	25 %	333988525
4123	NC_015574	GCAG	2	8	2411666	2411673	25 %	0 %	50 %	25 %	333988525
4124	NC_015574	TATT	2	8	2411970	2411977	25 %	75 %	0 %	0 %	333988525
4125	NC_015574	ATGG	2	8	2414094	2414101	25 %	25 %	50 %	0 %	333988528
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.