MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 3252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015572	TTTTA	2	10	2812	2821	20 %	80 %	0 %	0 %	333981750
2	NC_015572	CAAAC	2	10	3185	3194	60 %	0 %	0 %	40 %	333981750
3	NC_015572	AAAAC	2	10	4558	4567	80 %	0 %	0 %	20 %	333981751
4	NC_015572	CCCTG	2	10	5108	5117	0 %	20 %	20 %	60 %	333981751
5	NC_015572	GCGAT	2	10	6711	6720	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015572	GTTGC	2	10	10792	10801	0 %	40 %	40 %	20 %	333981756
7	NC_015572	CAAAC	2	10	11979	11988	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015572	GAATT	2	10	13561	13570	40 %	40 %	20 %	0 %	333981758
9	NC_015572	TTGCG	2	10	13598	13607	0 %	40 %	40 %	20 %	333981758
10	NC_015572	GCCAT	2	10	14540	14549	20 %	20 %	20 %	40 %	333981759
11	NC_015572	TCAGC	2	10	17172	17181	20 %	20 %	20 %	40 %	333981761
12	NC_015572	AATTG	2	10	18974	18983	40 %	40 %	20 %	0 %	333981762
13	NC_015572	GACGG	2	10	19212	19221	20 %	0 %	60 %	20 %	333981762
14	NC_015572	CGAGC	2	10	19710	19719	20 %	0 %	40 %	40 %	333981762
15	NC_015572	TGGAA	2	10	22061	22070	40 %	20 %	40 %	0 %	333981764
16	NC_015572	GCCAT	2	10	22635	22644	20 %	20 %	20 %	40 %	333981764
17	NC_015572	AATCC	2	10	22969	22978	40 %	20 %	0 %	40 %	333981764
18	NC_015572	GCCGG	2	10	25481	25490	0 %	0 %	60 %	40 %	333981767
19	NC_015572	TGGCT	2	10	26852	26861	0 %	40 %	40 %	20 %	333981768
20	NC_015572	TTACC	2	10	27029	27038	20 %	40 %	0 %	40 %	333981768
21	NC_015572	AAAAT	2	10	27398	27407	80 %	20 %	0 %	0 %	333981768
22	NC_015572	GTGTT	2	10	27449	27458	0 %	60 %	40 %	0 %	333981768
23	NC_015572	GATTC	2	10	28349	28358	20 %	40 %	20 %	20 %	333981769
24	NC_015572	TTGTT	2	10	28916	28925	0 %	80 %	20 %	0 %	333981771
25	NC_015572	ATACT	2	10	31540	31549	40 %	40 %	0 %	20 %	333981774
26	NC_015572	TGATT	2	10	32570	32579	20 %	60 %	20 %	0 %	333981775
27	NC_015572	TACAT	2	10	36125	36134	40 %	40 %	0 %	20 %	333981777
28	NC_015572	AACTG	2	10	36146	36155	40 %	20 %	20 %	20 %	333981777
29	NC_015572	GACTC	2	10	36642	36651	20 %	20 %	20 %	40 %	333981777
30	NC_015572	GACAA	2	10	36964	36973	60 %	0 %	20 %	20 %	333981777
31	NC_015572	CCAAA	2	10	40776	40785	60 %	0 %	0 %	40 %	333981783
32	NC_015572	GTTTT	2	10	41531	41540	0 %	80 %	20 %	0 %	333981783
33	NC_015572	TTCGA	2	10	42487	42496	20 %	40 %	20 %	20 %	333981784
34	NC_015572	CAAGC	2	10	44017	44026	40 %	0 %	20 %	40 %	333981785
35	NC_015572	GTCTC	2	10	47292	47301	0 %	40 %	20 %	40 %	333981787
36	NC_015572	TAAGA	2	10	47483	47492	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015572	GCGTT	2	10	51794	51803	0 %	40 %	40 %	20 %	333981792
38	NC_015572	TGAAA	2	10	56163	56172	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015572	TCGTT	2	10	56562	56571	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015572	TTTCA	2	10	57357	57366	20 %	60 %	0 %	20 %	333981799
41	NC_015572	CGACA	2	10	58716	58725	40 %	0 %	20 %	40 %	333981800
42	NC_015572	GCGGA	2	10	61396	61405	20 %	0 %	60 %	20 %	333981801
43	NC_015572	CGGTT	2	10	63751	63760	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015572	CAAGC	2	10	64554	64563	40 %	0 %	20 %	40 %	333981803
45	NC_015572	TTTGG	2	10	64900	64909	0 %	60 %	40 %	0 %	333981803
46	NC_015572	GCTTG	2	10	67339	67348	0 %	40 %	40 %	20 %	333981804
47	NC_015572	TGAAC	2	10	68374	68383	40 %	20 %	20 %	20 %	333981804
48	NC_015572	CGCCA	2	10	69270	69279	20 %	0 %	20 %	60 %	333981804
49	NC_015572	TGAAG	2	10	71252	71261	40 %	20 %	40 %	0 %	333981806
50	NC_015572	TTTGA	2	10	75652	75661	20 %	60 %	20 %	0 %	333981812
51	NC_015572	ATCAC	2	10	76537	76546	40 %	20 %	0 %	40 %	333981814
52	NC_015572	AATTT	2	10	78872	78881	40 %	60 %	0 %	0 %	333981817
53	NC_015572	TCAAT	2	10	79452	79461	40 %	40 %	0 %	20 %	333981817
54	NC_015572	GAATC	2	10	80097	80106	40 %	20 %	20 %	20 %	333981817
55	NC_015572	TAGCG	2	10	81042	81051	20 %	20 %	40 %	20 %	333981818
56	NC_015572	CGGGC	2	10	81482	81491	0 %	0 %	60 %	40 %	333981819
57	NC_015572	TTTAA	2	10	82020	82029	40 %	60 %	0 %	0 %	333981819
58	NC_015572	CGCTG	2	10	82622	82631	0 %	20 %	40 %	40 %	333981820
59	NC_015572	TCGTA	2	10	84535	84544	20 %	40 %	20 %	20 %	333981822
60	NC_015572	GATGT	2	10	86981	86990	20 %	40 %	40 %	0 %	333981825
61	NC_015572	CTTGC	2	10	89419	89428	0 %	40 %	20 %	40 %	333981828
62	NC_015572	ACCGG	2	10	90229	90238	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_015572	CATTC	2	10	90504	90513	20 %	40 %	0 %	40 %	333981829
64	NC_015572	TTGCG	2	10	94171	94180	0 %	40 %	40 %	20 %	333981832
65	NC_015572	CCCAG	2	10	97294	97303	20 %	0 %	20 %	60 %	333981836
66	NC_015572	TTTTA	2	10	99802	99811	20 %	80 %	0 %	0 %	333981839
67	NC_015572	CAAAT	2	10	100587	100596	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015572	ATGCC	2	10	102396	102405	20 %	20 %	20 %	40 %	333981842
69	NC_015572	GCTTT	2	10	104877	104886	0 %	60 %	20 %	20 %	333981844
70	NC_015572	CGCAT	2	10	107985	107994	20 %	20 %	20 %	40 %	333981845
71	NC_015572	AATAG	2	10	108423	108432	60 %	20 %	20 %	0 %	333981845
72	NC_015572	ACGAA	2	10	110455	110464	60 %	0 %	20 %	20 %	333981847
73	NC_015572	ACGGT	2	10	114961	114970	20 %	20 %	40 %	20 %	333981851
74	NC_015572	GGCGT	2	10	115476	115485	0 %	20 %	60 %	20 %	333981851
75	NC_015572	TTGGC	2	10	117610	117619	0 %	40 %	40 %	20 %	333981851
76	NC_015572	GCGCG	2	10	119173	119182	0 %	0 %	60 %	40 %	333981852
77	NC_015572	GTTGG	2	10	119303	119312	0 %	40 %	60 %	0 %	333981853
78	NC_015572	CTTGG	2	10	119591	119600	0 %	40 %	40 %	20 %	333981853
79	NC_015572	ATCCA	2	10	121020	121029	40 %	20 %	0 %	40 %	333981855
80	NC_015572	CGATG	2	10	121954	121963	20 %	20 %	40 %	20 %	333981856
81	NC_015572	GGCGC	2	10	122492	122501	0 %	0 %	60 %	40 %	333981856
82	NC_015572	GCCGC	2	10	123587	123596	0 %	0 %	40 %	60 %	333981857
83	NC_015572	GAGGC	2	10	125007	125016	20 %	0 %	60 %	20 %	333981859
84	NC_015572	AAGGA	2	10	126469	126478	60 %	0 %	40 %	0 %	333981861
85	NC_015572	GGCGT	2	10	127041	127050	0 %	20 %	60 %	20 %	333981862
86	NC_015572	AGGAA	2	10	130179	130188	60 %	0 %	40 %	0 %	333981864
87	NC_015572	ACCAA	2	10	130365	130374	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_015572	ATTTT	2	10	131905	131914	20 %	80 %	0 %	0 %	333981867
89	NC_015572	GCTTT	2	10	132182	132191	0 %	60 %	20 %	20 %	333981867
90	NC_015572	ATGTA	2	10	133298	133307	40 %	40 %	20 %	0 %	333981868
91	NC_015572	AAATT	2	10	133811	133820	60 %	40 %	0 %	0 %	333981870
92	NC_015572	AATGA	2	10	137492	137501	60 %	20 %	20 %	0 %	333981873
93	NC_015572	GCCGC	2	10	138386	138395	0 %	0 %	40 %	60 %	333981873
94	NC_015572	CCCGG	2	10	146250	146259	0 %	0 %	40 %	60 %	333981879
95	NC_015572	TTGAG	2	10	147476	147485	20 %	40 %	40 %	0 %	333981881
96	NC_015572	TAAAA	2	10	148994	149003	80 %	20 %	0 %	0 %	333981882
97	NC_015572	GGTTG	2	10	149628	149637	0 %	40 %	60 %	0 %	333981882
98	NC_015572	CACCG	2	10	150399	150408	20 %	0 %	20 %	60 %	333981882
99	NC_015572	GGCCG	2	10	153126	153135	0 %	0 %	60 %	40 %	333981884
100	NC_015572	GCATA	2	10	154800	154809	40 %	20 %	20 %	20 %	333981885
101	NC_015572	GGTCC	2	10	155506	155515	0 %	20 %	40 %	40 %	333981885
102	NC_015572	CGCTT	2	10	155599	155608	0 %	40 %	20 %	40 %	333981885
103	NC_015572	GCTTG	2	10	157248	157257	0 %	40 %	40 %	20 %	333981887
104	NC_015572	CAAGG	2	10	159618	159627	40 %	0 %	40 %	20 %	333981888
105	NC_015572	AGCGA	2	10	159903	159912	40 %	0 %	40 %	20 %	333981888
106	NC_015572	GGTTT	2	10	160566	160575	0 %	60 %	40 %	0 %	333981889
107	NC_015572	CACGC	2	10	161490	161499	20 %	0 %	20 %	60 %	333981890
108	NC_015572	AAGCC	2	10	162572	162581	40 %	0 %	20 %	40 %	333981891
109	NC_015572	CGCCC	2	10	164792	164801	0 %	0 %	20 %	80 %	333981894
110	NC_015572	ATGCG	2	10	166468	166477	20 %	20 %	40 %	20 %	333981896
111	NC_015572	AACGC	2	10	170263	170272	40 %	0 %	20 %	40 %	333981898
112	NC_015572	CAAAG	2	10	172380	172389	60 %	0 %	20 %	20 %	333981899
113	NC_015572	TGGAA	2	10	172491	172500	40 %	20 %	40 %	0 %	333981899
114	NC_015572	TGATT	2	10	172697	172706	20 %	60 %	20 %	0 %	333981900
115	NC_015572	GCGCT	2	10	173027	173036	0 %	20 %	40 %	40 %	333981900
116	NC_015572	GCGCT	2	10	183204	183213	0 %	20 %	40 %	40 %	333981906
117	NC_015572	TGCGG	2	10	183229	183238	0 %	20 %	60 %	20 %	333981906
118	NC_015572	TTGGT	2	10	183852	183861	0 %	60 %	40 %	0 %	333981906
119	NC_015572	TAGCT	2	10	184923	184932	20 %	40 %	20 %	20 %	333981907
120	NC_015572	TTAAT	2	10	185254	185263	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015572	ATTGC	2	10	185429	185438	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015572	TCTAA	2	10	185441	185450	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015572	CTAAG	2	10	185807	185816	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015572	ATGCC	2	10	187153	187162	20 %	20 %	20 %	40 %	333981908
125	NC_015572	CCGCA	2	10	187422	187431	20 %	0 %	20 %	60 %	333981909
126	NC_015572	TTACC	2	10	187434	187443	20 %	40 %	0 %	40 %	333981909
127	NC_015572	ACAAA	2	10	187620	187629	80 %	0 %	0 %	20 %	333981909
128	NC_015572	AATTA	2	10	187816	187825	60 %	40 %	0 %	0 %	333981909
129	NC_015572	AAATG	2	10	190363	190372	60 %	20 %	20 %	0 %	333981913
130	NC_015572	GCTGT	2	10	195478	195487	0 %	40 %	40 %	20 %	333981917
131	NC_015572	ACCGT	2	10	198404	198413	20 %	20 %	20 %	40 %	333981922
132	NC_015572	ATGAC	2	10	198749	198758	40 %	20 %	20 %	20 %	333981922
133	NC_015572	TCGAT	2	10	201691	201700	20 %	40 %	20 %	20 %	333981924
134	NC_015572	AATCG	2	10	203066	203075	40 %	20 %	20 %	20 %	333981926
135	NC_015572	ACCAG	2	10	205129	205138	40 %	0 %	20 %	40 %	333981928
136	NC_015572	CCGAT	2	10	207146	207155	20 %	20 %	20 %	40 %	333981929
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242	NC_015572	TGGTA	2	10	387580	387589	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
243	NC_015572	GCGTG	2	10	387875	387884	0 %	20 %	60 %	20 %	333982103
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249	NC_015572	TCGTG	2	10	393658	393667	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
250	NC_015572	ATCCC	2	10	397992	398001	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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263	NC_015572	CTTTG	2	10	416969	416978	0 %	60 %	20 %	20 %	333982126
264	NC_015572	CTTTT	2	10	417963	417972	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
265	NC_015572	TGGAG	2	10	420635	420644	20 %	20 %	60 %	0 %	333982129
266	NC_015572	GGTGT	2	10	421264	421273	0 %	40 %	60 %	0 %	333982129
267	NC_015572	TTTTC	2	10	422636	422645	0 %	80 %	0 %	20 %	333982131
268	NC_015572	AAGGC	2	10	424089	424098	40 %	0 %	40 %	20 %	333982133
269	NC_015572	AAACC	2	10	425876	425885	60 %	0 %	0 %	40 %	333982136
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271	NC_015572	TTACT	2	10	430957	430966	20 %	60 %	0 %	20 %	333982141
272	NC_015572	GGGTT	2	10	431433	431442	0 %	40 %	60 %	0 %	333982142
273	NC_015572	ACAGG	2	10	431909	431918	40 %	0 %	40 %	20 %	333982142
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275	NC_015572	GATTC	2	10	437965	437974	20 %	40 %	20 %	20 %	333982148
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280	NC_015572	ATTTT	2	10	439993	440002	20 %	80 %	0 %	0 %	333982150
281	NC_015572	TTAAT	2	10	442152	442161	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_015572	CAATA	2	10	442397	442406	60 %	20 %	0 %	20 %	333982152
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284	NC_015572	AATCG	2	10	442911	442920	40 %	20 %	20 %	20 %	333982152
285	NC_015572	ATTTG	2	10	443589	443598	20 %	60 %	20 %	0 %	333982153
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287	NC_015572	GCCTT	2	10	446170	446179	0 %	40 %	20 %	40 %	333982154
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290	NC_015572	GGCAA	2	10	453726	453735	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
291	NC_015572	AAAAC	2	10	454120	454129	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
292	NC_015572	TTTAA	2	10	458783	458792	40 %	60 %	0 %	0 %	333982166
293	NC_015572	GATCA	2	10	459257	459266	40 %	20 %	20 %	20 %	333982166
294	NC_015572	CCGAC	2	10	459390	459399	20 %	0 %	20 %	60 %	333982166
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296	NC_015572	GCGGG	2	10	461150	461159	0 %	0 %	80 %	20 %	333982168
297	NC_015572	CGGGT	2	10	461351	461360	0 %	20 %	60 %	20 %	333982168
298	NC_015572	GCCGG	2	10	462231	462240	0 %	0 %	60 %	40 %	333982169
299	NC_015572	ATTCG	2	10	462524	462533	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
300	NC_015572	TCGGC	2	10	467505	467514	0 %	20 %	40 %	40 %	333982173
301	NC_015572	CGAAG	2	10	467815	467824	40 %	0 %	40 %	20 %	333982173
302	NC_015572	GCTGC	2	10	468122	468131	0 %	20 %	40 %	40 %	333982174
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306	NC_015572	GGGCT	2	10	472114	472123	0 %	20 %	60 %	20 %	333982178
307	NC_015572	GCGAT	2	10	476208	476217	20 %	20 %	40 %	20 %	333982181
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321	NC_015572	TAGGG	2	10	508638	508647	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
322	NC_015572	TGATT	2	10	508693	508702	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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340	NC_015572	GGCTG	2	10	539256	539265	0 %	20 %	60 %	20 %	333982238
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350	NC_015572	CCGGC	2	10	555680	555689	0 %	0 %	40 %	60 %	333982253
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352	NC_015572	CCCAG	2	10	557424	557433	20 %	0 %	20 %	60 %	333982254
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372	NC_015572	CGGTG	2	10	592139	592148	0 %	20 %	60 %	20 %	333982282
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376	NC_015572	GCAAA	2	10	600044	600053	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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386	NC_015572	GGTTA	2	10	615531	615540	20 %	40 %	40 %	0 %	333982299
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390	NC_015572	GGTCG	2	10	620553	620562	0 %	20 %	60 %	20 %	333982304
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392	NC_015572	ATTTC	2	10	623195	623204	20 %	60 %	0 %	20 %	333982305
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394	NC_015572	CTTCT	2	10	625785	625794	0 %	60 %	0 %	40 %	333982308
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432	NC_015572	TTGAT	2	10	699460	699469	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_015572	GGGTT	2	10	813587	813596	0 %	40 %	60 %	0 %	333982493
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499	NC_015572	GATTT	2	10	817311	817320	20 %	60 %	20 %	0 %	333982496
500	NC_015572	GGTGA	2	10	820963	820972	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

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