MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 6233

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015572	TAT	2	6	27	32	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015572	CAA	2	6	1468	1473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015572	TAA	2	6	1484	1489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015572	GTA	3	9	1540	1548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015572	GCG	2	6	3828	3833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015572	ACA	2	6	3862	3867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015572	CTA	2	6	6361	6366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015572	AAC	2	6	6458	6463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015572	TTG	2	6	6574	6579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015572	CAA	2	6	6643	6648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015572	AAG	2	6	6844	6849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015572	GTT	2	6	6939	6944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015572	GTT	2	6	9831	9836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015572	GAA	2	6	10008	10013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015572	CTC	2	6	10019	10024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015572	ATG	2	6	10268	10273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015572	TGT	2	6	11598	11603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015572	TTA	2	6	11688	11693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015572	ATT	2	6	11825	11830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015572	ATT	2	6	11922	11927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015572	CAA	2	6	12037	12042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015572	GTT	2	6	12082	12087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015572	ATT	2	6	12150	12155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015572	ACC	2	6	12794	12799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015572	GTT	2	6	12810	12815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015572	AGC	2	6	12825	12830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015572	TGT	2	6	12874	12879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015572	AGT	2	6	12896	12901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015572	ATT	2	6	17959	17964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015572	TGT	2	6	19843	19848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015572	TTA	2	6	19989	19994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015572	GTT	2	6	20061	20066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015572	GGC	2	6	20115	20120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015572	AGC	2	6	20175	20180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015572	AGC	2	6	20431	20436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015572	ACA	2	6	20466	20471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015572	GCA	2	6	21105	21110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015572	AAC	2	6	21153	21158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015572	CGG	2	6	29560	29565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015572	AGC	2	6	29580	29585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015572	TAA	2	6	29696	29701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015572	TAA	2	6	29759	29764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015572	GAT	2	6	30151	30156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015572	GCC	2	6	30331	30336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015572	AAG	2	6	30891	30896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015572	CAA	2	6	30918	30923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015572	GAG	2	6	30937	30942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015572	GAA	2	6	30953	30958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015572	GGC	2	6	31108	31113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015572	TGT	2	6	32026	32031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015572	GAT	2	6	37481	37486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015572	TTA	2	6	38944	38949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015572	GAT	2	6	38962	38967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015572	CAT	2	6	39065	39070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015572	TAT	2	6	39098	39103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015572	ACC	2	6	39105	39110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_015572	TGG	2	6	39121	39126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015572	TTG	2	6	40163	40168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015572	GCA	2	6	41823	41828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015572	GAT	2	6	41868	41873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015572	CCG	2	6	41877	41882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_015572	CAC	2	6	41942	41947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015572	TTA	2	6	41960	41965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015572	TGT	2	6	47504	47509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015572	ATT	2	6	47565	47570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015572	CAA	2	6	47591	47596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015572	CCA	2	6	47597	47602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_015572	TGG	2	6	47612	47617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015572	CGG	2	6	47627	47632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015572	CCG	2	6	47639	47644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015572	CGG	2	6	47669	47674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015572	GCC	2	6	47713	47718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015572	ATA	2	6	47980	47985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015572	GCC	2	6	48015	48020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_015572	GCT	2	6	48053	48058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015572	TAA	2	6	48260	48265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015572	CAA	2	6	48522	48527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015572	AAC	2	6	50384	50389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015572	GAA	2	6	53209	53214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015572	AAT	2	6	53225	53230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015572	ATT	2	6	53383	53388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015572	GAA	2	6	53453	53458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015572	CGT	2	6	53464	53469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015572	GAA	2	6	54929	54934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015572	CGC	2	6	54966	54971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015572	TAA	2	6	55018	55023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015572	CTG	2	6	55277	55282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015572	TAT	2	6	55366	55371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015572	CTA	2	6	55438	55443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015572	GGC	2	6	55844	55849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015572	CCG	2	6	55930	55935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_015572	CCA	2	6	55945	55950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015572	GTT	2	6	55964	55969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015572	TAA	2	6	56102	56107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015572	TCA	2	6	56119	56124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015572	GGT	2	6	56200	56205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015572	CTC	2	6	56404	56409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_015572	TCC	2	6	56552	56557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_015572	AAG	2	6	56714	56719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015572	TTA	2	6	58550	58555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015572	TGC	2	6	58584	58589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015572	AGC	2	6	58612	58617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015572	GCT	2	6	63413	63418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015572	GCT	2	6	63450	63455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015572	ATC	2	6	63688	63693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015572	ATC	2	6	63697	63702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015572	GTT	2	6	63725	63730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015572	TGC	2	6	63739	63744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015572	GAA	2	6	63764	63769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015572	TGG	2	6	63827	63832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015572	ATT	2	6	63865	63870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015572	AGG	2	6	63923	63928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015572	TTG	2	6	64138	64143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015572	ATT	2	6	64364	64369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015572	TTG	2	6	64399	64404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015572	CGA	2	6	65520	65525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015572	AAT	2	6	65573	65578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015572	CAA	2	6	69803	69808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015572	TTG	2	6	70012	70017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015572	TTG	2	6	70665	70670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015572	CAA	2	6	71414	71419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015572	GCT	2	6	71634	71639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015572	CGG	2	6	72178	72183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015572	CGA	2	6	73957	73962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015572	ATG	2	6	74074	74079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015572	GCC	2	6	74085	74090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_015572	ATG	2	6	74255	74260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015572	TTA	2	6	74267	74272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015572	ATT	2	6	76201	76206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015572	AAT	2	6	76362	76367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015572	ATT	2	6	80329	80334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015572	ACC	2	6	80364	80369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_015572	ATG	2	6	80401	80406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015572	AGC	3	9	80537	80545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015572	ACT	2	6	80596	80601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015572	GAC	2	6	80635	80640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015572	TAA	2	6	80643	80648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015572	TTG	2	6	80688	80693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015572	TGA	2	6	82053	82058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015572	CCG	2	6	82109	82114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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