MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 60137

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015572	CAC	2	6	116	121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981748
2	NC_015572	AGC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981748
3	NC_015572	CAA	2	6	374	379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981748
4	NC_015572	GCT	2	6	432	437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981748
5	NC_015572	ATA	2	6	454	459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981748
6	NC_015572	TAC	2	6	651	656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981748
7	NC_015572	CTG	2	6	672	677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981748
8	NC_015572	GAC	2	6	681	686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981748
9	NC_015572	CAA	2	6	740	745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981748
10	NC_015572	CGG	2	6	999	1004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981748
11	NC_015572	GTG	2	6	1005	1010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981748
12	NC_015572	ATA	2	6	1108	1113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981748
13	NC_015572	CAC	2	6	1280	1285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981748
14	NC_015572	ACG	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981748
15	NC_015572	TAT	2	6	1579	1584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981749
16	NC_015572	TTA	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981749
17	NC_015572	CAA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981749
18	NC_015572	GAA	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981749
19	NC_015572	GCC	2	6	1806	1811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981749
20	NC_015572	CCG	2	6	1905	1910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981749
21	NC_015572	ATC	2	6	1944	1949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981749
22	NC_015572	TTG	2	6	1955	1960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981749
23	NC_015572	TAC	2	6	2027	2032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981749
24	NC_015572	CTG	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981749
25	NC_015572	TGG	2	6	2076	2081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981749
26	NC_015572	ATT	2	6	2150	2155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981749
27	NC_015572	GAC	2	6	2195	2200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981749
28	NC_015572	CAA	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981749
29	NC_015572	TTA	2	6	2248	2253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981749
30	NC_015572	GTG	2	6	2261	2266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981749
31	NC_015572	TGG	2	6	2428	2433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981749
32	NC_015572	GAA	3	9	2480	2488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981749
33	NC_015572	CAG	2	6	2605	2610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981749
34	NC_015572	TTG	2	6	2690	2695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981750
35	NC_015572	TTG	2	6	2889	2894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981750
36	NC_015572	CAT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981750
37	NC_015572	CCG	2	6	3073	3078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981750
38	NC_015572	ACA	2	6	3154	3159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981750
39	NC_015572	TGG	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981750
40	NC_015572	GCT	2	6	3268	3273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981750
41	NC_015572	ATT	2	6	3477	3482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981750
42	NC_015572	CAA	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981750
43	NC_015572	TGC	2	6	3519	3524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981750
44	NC_015572	CTG	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981750
45	NC_015572	TGG	2	6	3576	3581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981750
46	NC_015572	TAA	2	6	3706	3711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981750
47	NC_015572	CGA	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
48	NC_015572	AGA	2	6	4121	4126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981751
49	NC_015572	TGC	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981751
50	NC_015572	CGG	2	6	4169	4174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981751
51	NC_015572	CGA	2	6	4181	4186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
52	NC_015572	CGG	2	6	4205	4210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981751
53	NC_015572	CGG	2	6	4318	4323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981751
54	NC_015572	AAG	2	6	4490	4495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981751
55	NC_015572	GGC	2	6	4524	4529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981751
56	NC_015572	AAG	2	6	4606	4611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981751
57	NC_015572	CAA	2	6	4676	4681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981751
58	NC_015572	CGG	2	6	4697	4702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981751
59	NC_015572	AGC	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
60	NC_015572	ACC	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981751
61	NC_015572	CGA	2	6	4802	4807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
62	NC_015572	TTC	2	6	4862	4867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981751
63	NC_015572	TCG	2	6	4890	4895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981751
64	NC_015572	TGG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981751
65	NC_015572	CCA	2	6	4918	4923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981751
66	NC_015572	AAC	2	6	4954	4959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981751
67	NC_015572	CAA	2	6	4982	4987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981751
68	NC_015572	GCC	2	6	4998	5003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981751
69	NC_015572	CCG	2	6	5177	5182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981751
70	NC_015572	GAA	2	6	5259	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981751
71	NC_015572	ACA	2	6	5314	5319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981751
72	NC_015572	CAT	4	12	5342	5353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981751
73	NC_015572	TCT	2	6	5404	5409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981751
74	NC_015572	GCC	2	6	5459	5464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981751
75	NC_015572	GCC	2	6	5702	5707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981751
76	NC_015572	CGA	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
77	NC_015572	CAC	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981751
78	NC_015572	AGG	2	6	6019	6024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333981751
79	NC_015572	GAT	2	6	6035	6040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981751
80	NC_015572	AGC	2	6	6103	6108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
81	NC_015572	ACC	2	6	6117	6122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981751
82	NC_015572	GCC	2	6	6136	6141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981751
83	NC_015572	TGC	2	6	6145	6150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981751
84	NC_015572	CGA	2	6	6179	6184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
85	NC_015572	TAC	2	6	6191	6196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981751
86	NC_015572	GTT	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981751
87	NC_015572	CTG	2	6	7209	7214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981752
88	NC_015572	TGG	2	6	7320	7325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981752
89	NC_015572	ATG	2	6	7562	7567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981752
90	NC_015572	TGC	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981752
91	NC_015572	GAT	2	6	7643	7648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981752
92	NC_015572	AGC	2	6	7649	7654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981752
93	NC_015572	CGA	2	6	7755	7760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981752
94	NC_015572	ATT	2	6	7911	7916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981752
95	NC_015572	GAT	2	6	7944	7949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981752
96	NC_015572	CTT	2	6	7999	8004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981753
97	NC_015572	GAA	2	6	8140	8145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981753
98	NC_015572	GTT	2	6	8164	8169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981753
99	NC_015572	GAC	2	6	8184	8189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981753
100	NC_015572	AAT	2	6	8196	8201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981753
101	NC_015572	AAG	2	6	8378	8383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981753
102	NC_015572	AAG	2	6	8402	8407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981753
103	NC_015572	TAT	2	6	8454	8459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981753
104	NC_015572	ATT	2	6	8515	8520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981753
105	NC_015572	AGA	2	6	8541	8546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981753
106	NC_015572	GAT	2	6	8659	8664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981753
107	NC_015572	GAT	2	6	8671	8676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981753
108	NC_015572	CTT	2	6	8733	8738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981753
109	NC_015572	TTC	2	6	8768	8773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981753
110	NC_015572	TTC	2	6	8809	8814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981753
111	NC_015572	GTT	2	6	9013	9018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981753
112	NC_015572	ATG	2	6	9122	9127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981754
113	NC_015572	AGA	2	6	9263	9268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981754
114	NC_015572	AAG	2	6	9299	9304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981754
115	NC_015572	AGC	2	6	9306	9311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981754
116	NC_015572	GAG	2	6	9463	9468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333981754
117	NC_015572	TTA	2	6	9608	9613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981754
118	NC_015572	GGC	2	6	9625	9630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981754
119	NC_015572	ATG	2	6	9656	9661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981754
120	NC_015572	TGA	2	6	10424	10429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981756
121	NC_015572	ATT	2	6	10509	10514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981756
122	NC_015572	AAT	2	6	10521	10526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981756
123	NC_015572	TGC	2	6	10557	10562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981756
124	NC_015572	ATG	2	6	10564	10569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981756
125	NC_015572	TCG	2	6	10671	10676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981756
126	NC_015572	ACA	2	6	10678	10683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981756
127	NC_015572	GCT	2	6	10855	10860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981756
128	NC_015572	AAC	2	6	11072	11077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981756
129	NC_015572	GAT	2	6	11223	11228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981756
130	NC_015572	AAT	2	6	11233	11238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981756
131	NC_015572	ATT	2	6	11249	11254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981756
132	NC_015572	CTT	2	6	11307	11312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981756
133	NC_015572	CGC	2	6	11330	11335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981756
134	NC_015572	CGC	2	6	11340	11345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981756
135	NC_015572	AAG	2	6	11439	11444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981756
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248	NC_015572	GCC	2	6	23172	23177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981764
249	NC_015572	GCA	2	6	23279	23284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981764
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252	NC_015572	TGT	2	6	23425	23430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981764
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255	NC_015572	GCA	2	6	23630	23635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981764
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258	NC_015572	TGA	2	6	24177	24182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981765
259	NC_015572	TGA	2	6	24213	24218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981765
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