MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Porphyromonas gingivalis TDC60

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015571	CCTTGC	2	12	26352	26363	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015571	TGGCTC	2	12	45098	45109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015571	AAGGAT	2	12	55207	55218	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015571	AGAAAA	2	12	62452	62463	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015571	TTAATC	2	12	73546	73557	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015571	TTGCAT	2	12	91514	91525	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015571	ATCCTG	2	12	136599	136610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015571	GATCTC	2	12	140771	140782	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015571	AAACGA	2	12	149599	149610	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015571	AAGAAC	2	12	170365	170376	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015571	CAGGAT	2	12	198222	198233	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015571	AATTGA	2	12	294434	294445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015571	CCTATT	2	12	396196	396207	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015571	AAGCGA	2	12	407352	407363	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015571	CCAGGC	2	12	408463	408474	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015571	CAGGAT	2	12	410891	410902	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015571	TGGCTC	2	12	412550	412561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015571	CAAAGA	2	12	452775	452786	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015571	TCAAAT	2	12	498714	498725	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015571	GCCACA	2	12	499697	499708	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015571	TTTTGT	2	12	507550	507561	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015571	ATGAAA	2	12	531921	531932	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015571	AATATC	2	12	540731	540742	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015571	TGTTCT	2	12	583111	583122	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015571	TCAATT	2	12	604648	604659	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015571	ATTTCA	2	12	644988	644999	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015571	AAGCGA	2	12	660736	660747	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015571	CCAGGC	2	12	661847	661858	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015571	TTATAT	2	12	729901	729912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015571	CAGGAT	2	12	771546	771557	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015571	ACCGAC	2	12	796746	796757	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015571	AGTGCA	2	12	805326	805337	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015571	CTTGCA	2	12	805360	805371	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015571	CTGTAT	2	12	805382	805393	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015571	ATCCTG	2	12	840969	840980	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015571	CAGGAT	2	12	878665	878676	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015571	ATCCTG	2	12	904068	904079	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015571	TTTCTC	2	12	919544	919555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015571	CTCTTT	2	12	986262	986273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015571	TATGGA	2	12	988167	988178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015571	GTTTGA	2	12	1003742	1003753	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015571	TTTTTC	2	12	1073879	1073890	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015571	TCGTTT	2	12	1073942	1073953	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015571	AGATAA	2	12	1084420	1084431	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015571	CAAAGC	2	12	1112540	1112551	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015571	GCCATG	2	12	1112653	1112664	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015571	CAAATT	2	12	1141502	1141513	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015571	AAAATA	2	12	1218565	1218576	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015571	TCGTTT	2	12	1251712	1251723	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015571	GAAAAA	2	12	1253772	1253783	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015571	TCTCTT	2	12	1266900	1266911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015571	CAGGAT	2	12	1272754	1272765	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015571	GCCTGG	2	12	1274960	1274971	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015571	TCGCTT	2	12	1276071	1276082	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015571	CTTCCT	2	12	1303518	1303529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015571	TTTCAT	2	12	1330046	1330057	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015571	AAACCC	2	12	1347039	1347050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015571	GTTTTT	2	12	1352825	1352836	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015571	GTATGC	2	12	1392555	1392566	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015571	GCAGCC	2	12	1394730	1394741	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015571	GAAATT	2	12	1394752	1394763	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015571	GGTTTT	2	12	1399322	1399333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015571	TTCTAT	2	12	1472722	1472733	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015571	CAGGAT	2	12	1474622	1474633	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015571	ACGGCC	2	12	1504569	1504580	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015571	ATAGAC	2	12	1528343	1528354	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015571	TCGTTT	2	12	1542990	1543001	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015571	AACAAA	2	12	1556095	1556106	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015571	AAACGA	2	12	1577898	1577909	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015571	AAAAGA	2	12	1595415	1595426	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015571	GCCTCC	2	12	1641095	1641106	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015571	ATTACA	2	12	1653809	1653820	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015571	TCAGCG	2	12	1688176	1688187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015571	TTGTTA	2	12	1705978	1705989	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015571	TTTTCT	2	12	1722960	1722971	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015571	CTTTCT	2	12	1729125	1729136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015571	GCAATC	2	12	1806951	1806962	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015571	AATAGA	2	12	1820451	1820462	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015571	TCTCTT	2	12	1823423	1823434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015571	TAAAAA	2	12	1846388	1846399	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015571	ATAGAA	2	12	1965531	1965542	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015571	ATTCTA	2	12	1969272	1969283	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015571	TTTCAA	2	12	2066237	2066248	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015571	AGGTTA	2	12	2071256	2071267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015571	AACCTT	2	12	2073859	2073870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015571	CCTAAT	2	12	2109148	2109159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015571	ATCTTA	2	12	2122181	2122192	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_015571	TCATGT	2	12	2130243	2130254	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015571	GGCGTG	2	12	2130272	2130283	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015571	TGTTTT	2	12	2130331	2130342	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015571	TACAGA	2	12	2143531	2143542	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015571	GCTCTT	2	12	2180349	2180360	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015571	TATAAT	2	12	2208073	2208084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015571	TCCGAA	2	12	2232856	2232867	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015571	AAGCGA	2	12	2283228	2283239	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015571	CCAGGC	2	12	2284339	2284350	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015571	GATTCC	2	12	2299977	2299988	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015571	ATTATA	2	12	2317395	2317406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015571	CGCGAT	2	12	2320753	2320764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.