MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Serratia plymuthica AS9 chromosome

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015567	TCGCTA	2	12	75910	75921	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015567	CACCAT	2	12	84401	84412	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015567	AAACCT	2	12	95153	95164	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015567	AGGTTT	2	12	95203	95214	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015567	CTGTGC	2	12	103857	103868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015567	CGCTTG	2	12	139454	139465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015567	GAAATG	2	12	144638	144649	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015567	CCTTGT	15	90	160256	160345	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015567	CAGTGA	2	12	224693	224704	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015567	TAAGAC	2	12	257564	257575	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015567	GGAAGG	2	12	262705	262716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015567	TAAGAC	2	12	300247	300258	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015567	TTTGTT	2	12	322697	322708	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015567	AACAGC	2	12	360620	360631	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015567	GGTATC	2	12	360714	360725	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015567	AATTAA	2	12	374374	374385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015567	TGAAAA	2	12	391712	391723	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015567	ATTTTT	2	12	411507	411518	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015567	GGCAGT	2	12	455563	455574	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015567	TTAACC	2	12	708506	708517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015567	CCCACG	2	12	746458	746469	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015567	GTAACG	2	12	801170	801181	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015567	ATCGGC	2	12	812795	812806	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015567	CGGCAG	2	12	816077	816088	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015567	GTGCGG	2	12	816456	816467	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015567	TAAGAC	2	12	912623	912634	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015567	CTTTCT	2	12	971177	971188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015567	AAAAAG	2	12	971314	971325	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015567	TCATTT	2	12	998367	998378	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015567	TTTGAT	2	12	1012895	1012906	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015567	TCGTTA	2	12	1016324	1016335	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015567	GCCGTC	2	12	1059115	1059126	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015567	TTTTAC	2	12	1126004	1126015	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015567	CTATTA	2	12	1140840	1140851	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015567	GCGCTG	2	12	1212542	1212553	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015567	TTCAAT	2	12	1212716	1212727	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015567	GTCAAT	2	12	1215981	1215992	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015567	ATAAAA	2	12	1231356	1231367	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015567	TGTTGA	2	12	1260018	1260029	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015567	TTGTGC	2	12	1262061	1262072	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015567	GTTAAT	2	12	1277967	1277978	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015567	CTGTCA	2	12	1283598	1283609	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015567	AGTAAA	2	12	1295820	1295831	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015567	TGCTGT	2	12	1348167	1348178	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015567	CCCATC	2	12	1392164	1392175	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015567	CTGCGT	2	12	1449954	1449965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015567	ATAAAT	2	12	1459108	1459119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015567	AATAAG	2	12	1602894	1602905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015567	AAGGAG	2	12	1701318	1701329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015567	TTTTGT	2	12	1725735	1725746	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015567	CAAAGG	2	12	1774737	1774748	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015567	CGTTGC	2	12	1801862	1801873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015567	CAATAA	2	12	1801946	1801957	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015567	GTGCCG	2	12	1828345	1828356	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015567	CAAAAA	2	12	1845046	1845057	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015567	TCCTTT	2	12	1858137	1858148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015567	AAAGGG	2	12	1874355	1874366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015567	ACTAAC	2	12	1876395	1876406	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015567	CAAGTG	2	12	1884181	1884192	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015567	TTGGTG	2	12	1921676	1921687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015567	ATAAGG	2	12	1925747	1925758	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015567	CTTTTT	2	12	1940214	1940225	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015567	AGGCTA	2	12	1940428	1940439	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015567	ACGTTA	2	12	1965630	1965641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015567	GCGGCA	2	12	1990252	1990263	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015567	TGACAA	2	12	2050236	2050247	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015567	AATTAA	2	12	2052262	2052273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015567	AGCATG	2	12	2066532	2066543	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015567	GCTTTT	2	12	2097187	2097198	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015567	ATAAAA	2	12	2139345	2139356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015567	CAGAAA	2	12	2161707	2161718	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015567	CACCCG	2	12	2170537	2170548	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015567	GTTAAC	2	12	2179737	2179748	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015567	GTTAAC	2	12	2179801	2179812	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015567	TATTTT	2	12	2193814	2193825	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015567	TTTGTT	2	12	2193904	2193915	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015567	ATGAGA	2	12	2216528	2216539	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015567	AAATGA	2	12	2228152	2228163	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015567	TAGCGG	2	12	2237450	2237461	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015567	AGAGGA	2	12	2242682	2242693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015567	CTTTTT	2	12	2246418	2246429	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015567	GCAAAT	2	12	2290133	2290144	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015567	CAATAA	2	12	2304823	2304834	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015567	GGAGCG	2	12	2355610	2355621	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015567	GCAACG	2	12	2443961	2443972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015567	CGGCTT	2	12	2449952	2449963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015567	CATTTT	2	12	2456122	2456133	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_015567	CTTTTT	2	12	2462992	2463003	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015567	ATTATC	2	12	2467345	2467356	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015567	TGGCGC	2	12	2468527	2468538	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015567	GTTTCC	2	12	2533400	2533411	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015567	AATAAA	2	12	2586093	2586104	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015567	AATATC	2	12	2586886	2586897	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015567	TAATTT	2	12	2598231	2598242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015567	CAATTG	2	12	2606432	2606443	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015567	ACCTTC	2	12	2630541	2630552	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015567	CCGCGC	2	12	2669426	2669437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_015567	AACGTT	2	12	2678568	2678579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015567	CTATTA	2	12	2686723	2686734	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015567	GCTTGC	2	12	2728408	2728419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015567	GTTTGA	2	12	2829284	2829295	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015567	TTTACC	2	12	2856209	2856220	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015567	ACAAAA	2	12	2877569	2877580	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_015567	TAATTT	2	12	2931341	2931352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015567	TGAAGA	2	12	2943484	2943495	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015567	AGTAAT	2	12	3028175	3028186	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015567	AAAAGG	2	12	3039689	3039700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015567	TAAAAA	2	12	3044844	3044855	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015567	CTAAAA	2	12	3082465	3082476	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015567	AACAAA	2	12	3166744	3166755	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015567	ATAAAA	2	12	3187911	3187922	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015567	CTACTC	2	12	3198598	3198609	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015567	ATTTTT	2	12	3198632	3198643	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015567	TAAATA	2	12	3200234	3200245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015567	TGCCAA	2	12	3228111	3228122	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015567	AAAGGT	2	12	3252834	3252845	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015567	CAGCAC	2	12	3268562	3268573	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015567	TTTTAA	2	12	3271984	3271995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015567	GAAAGA	2	12	3361341	3361352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015567	AAAATA	2	12	3373783	3373794	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015567	GAGCCT	2	12	3385697	3385708	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015567	AATGGC	2	12	3434377	3434388	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_015567	CATTTC	2	12	3474220	3474231	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015567	TTATCC	2	12	3474924	3474935	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015567	GGAAAT	2	12	3476203	3476214	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015567	GATCAC	2	12	3523783	3523794	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015567	ATCAGG	2	12	3531056	3531067	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_015567	TTCATT	2	12	3544028	3544039	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_015567	CAGCCG	2	12	3621222	3621233	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015567	AGCGCC	2	12	3744164	3744175	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015567	AGAAAA	2	12	3763514	3763525	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015567	AAAACC	2	12	3826192	3826203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015567	CACAAA	2	12	3847998	3848009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015567	CTCAAC	2	12	3873421	3873432	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015567	AGCCTG	2	12	3876897	3876908	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015567	TTTTAA	2	12	3913242	3913253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015567	ATAAAA	2	12	3916355	3916366	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015567	GCGCGG	2	12	3934664	3934675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015567	TGATAT	2	12	3934919	3934930	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015567	CATTGC	2	12	3977890	3977901	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015567	ATCTAC	2	12	3986082	3986093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015567	CAACGC	2	12	4026662	4026673	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015567	CGATCC	2	12	4037655	4037666	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015567	CCTGAG	2	12	4054838	4054849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015567	CTAATA	2	12	4059802	4059813	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_015567	CAAAAA	2	12	4060074	4060085	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_015567	TGAGGA	2	12	4117346	4117357	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015567	GTCTTA	2	12	4212891	4212902	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_015567	AGTATT	2	12	4249528	4249539	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015567	ATCAAA	2	12	4318502	4318513	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_015567	GTTGAA	2	12	4329736	4329747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015567	GCTCAG	2	12	4472529	4472540	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_015567	AAATAA	2	12	4551889	4551900	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015567	TGCCGG	2	12	4552466	4552477	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015567	CATCGT	2	12	4650973	4650984	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_015567	AATAGG	2	12	4657836	4657847	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015567	GTTTTT	2	12	4777896	4777907	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015567	TTTTAC	2	12	4822558	4822569	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_015567	CTTTTT	2	12	4886531	4886542	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_015567	AGGAAA	2	12	4893199	4893210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015567	ATCGCT	2	12	4914429	4914440	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_015567	GCATTT	2	12	4923570	4923581	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_015567	AAAAAG	2	12	4925167	4925178	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015567	CAAAAA	2	12	4933584	4933595	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
165	NC_015567	GAAAAA	2	12	4953526	4953537	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015567	TAAAAA	2	12	4982352	4982363	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015567	GTCTTA	2	12	4984466	4984477	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
168	NC_015567	GCAAAT	2	12	5040999	5041010	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_015567	TGCGAT	2	12	5043748	5043759	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
170	NC_015567	ACGCTA	2	12	5074862	5074873	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_015567	TTATCC	2	12	5074874	5074885	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_015567	TTGAAA	2	12	5131632	5131643	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015567	AATATA	2	12	5166071	5166082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_015567	TTTTCC	2	12	5167622	5167633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_015567	AAAAAT	2	12	5192375	5192386	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_015567	TAAAAA	2	12	5222672	5222683	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_015567	TAGTTG	2	12	5257536	5257547	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_015567	GTCTTA	2	12	5258339	5258350	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
179	NC_015567	CATCCT	2	12	5349758	5349769	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
180	NC_015567	CCCGGC	2	12	5351278	5351289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_015567	GTCTTA	2	12	5389305	5389316	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.