MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 1066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015564	ATCG	2	8	13015	13022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015564	TTGA	2	8	19991	19998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015564	AGAA	2	8	21400	21407	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015564	GAGG	2	8	21564	21571	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015564	CAGT	2	8	24270	24277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015564	ACTG	2	8	24294	24301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015564	GTGC	2	8	25195	25202	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015564	GTTT	2	8	26895	26902	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015564	CTCG	2	8	44538	44545	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015564	CTCG	2	8	47348	47355	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015564	CGGT	2	8	50557	50564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015564	TCCT	2	8	59757	59764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015564	AGCG	2	8	62471	62478	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015564	GCGG	2	8	69498	69505	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015564	CTAA	2	8	73787	73794	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015564	TGCC	2	8	79024	79031	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015564	CCCG	2	8	94864	94871	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_015564	CGAC	2	8	96201	96208	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015564	GGGA	2	8	101870	101877	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015564	GTGA	2	8	102948	102955	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015564	AGTC	2	8	103115	103122	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015564	GGGT	2	8	103144	103151	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015564	GGGC	2	8	105301	105308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015564	GCCC	2	8	105339	105346	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_015564	GTAA	2	8	107054	107061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015564	TCCA	2	8	115733	115740	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015564	GCGG	2	8	166394	166401	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015564	CTAG	2	8	172125	172132	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015564	CGTT	2	8	172678	172685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015564	AGCG	2	8	172736	172743	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015564	GGGC	2	8	174112	174119	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015564	GACG	2	8	183655	183662	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015564	TGCG	2	8	183667	183674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015564	ACCG	2	8	183856	183863	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015564	CCGA	2	8	186775	186782	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015564	ACCG	2	8	189697	189704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015564	GGAA	2	8	191555	191562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015564	CACG	2	8	193557	193564	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015564	GGAC	2	8	200797	200804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015564	GCGT	2	8	201634	201641	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015564	TGGT	2	8	205657	205664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015564	GGCA	2	8	211079	211086	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015564	TTTC	2	8	211602	211609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015564	AAGA	2	8	214565	214572	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015564	CGGG	2	8	235379	235386	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015564	GGAT	2	8	253321	253328	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015564	GGGC	2	8	258967	258974	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015564	CGAA	2	8	264773	264780	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015564	GCTG	2	8	268533	268540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015564	CAGT	2	8	268693	268700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015564	GCAG	2	8	269299	269306	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015564	TGAG	2	8	277889	277896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015564	TTGT	2	8	288987	288994	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015564	CCGC	2	8	289908	289915	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_015564	TGCG	2	8	289940	289947	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015564	GTCA	2	8	299542	299549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015564	TAGG	2	8	300348	300355	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015564	AGGC	2	8	300453	300460	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015564	CCGT	2	8	303320	303327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015564	GATG	2	8	312265	312272	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015564	GCAT	2	8	312383	312390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015564	AATC	2	8	313569	313576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015564	GGGA	2	8	336837	336844	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015564	CCGT	2	8	336857	336864	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015564	CCTC	2	8	336892	336899	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_015564	CGGG	2	8	347302	347309	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015564	GGAG	2	8	347570	347577	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015564	GACC	2	8	347610	347617	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015564	TCCG	2	8	357453	357460	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015564	GAAT	2	8	359490	359497	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015564	ACGA	2	8	359498	359505	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015564	TCCC	2	8	374151	374158	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_015564	CGCC	2	8	387671	387678	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_015564	GCGG	2	8	394300	394307	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015564	GGCA	2	8	396312	396319	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015564	CTTA	2	8	398298	398305	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015564	GCAG	2	8	399690	399697	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015564	AAGA	2	8	401724	401731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015564	TCGA	2	8	404116	404123	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015564	TGAG	2	8	409992	409999	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015564	AAGG	2	8	410637	410644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015564	TGCT	2	8	417650	417657	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015564	CCAT	2	8	421870	421877	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015564	TCTG	2	8	431982	431989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015564	GGCG	2	8	433658	433665	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015564	GCTG	2	8	433741	433748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015564	GTTC	2	8	433809	433816	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015564	TTCG	2	8	434035	434042	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015564	GCCC	2	8	441492	441499	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_015564	GGGC	2	8	441510	441517	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015564	TCCG	2	8	444794	444801	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015564	CCTG	2	8	447910	447917	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015564	TTCC	2	8	447974	447981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015564	AAGC	2	8	448014	448021	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015564	AAGG	2	8	458099	458106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015564	TGGG	2	8	459347	459354	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015564	GGGT	2	8	464205	464212	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015564	CCTG	2	8	484879	484886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015564	GTGC	2	8	502273	502280	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015564	AGTG	2	8	502687	502694	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015564	GTTG	2	8	503018	503025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015564	TCAG	2	8	503143	503150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015564	AGCG	2	8	503155	503162	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015564	CCAG	2	8	503515	503522	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015564	TCCG	2	8	503813	503820	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015564	GTCG	2	8	507217	507224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015564	AGGT	2	8	507237	507244	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015564	CTTC	2	8	519661	519668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015564	GGAA	2	8	522737	522744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015564	CTGG	2	8	527414	527421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015564	GGAC	2	8	527480	527487	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015564	GGAC	2	8	527741	527748	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015564	AGGA	2	8	531058	531065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015564	AGCG	2	8	531771	531778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015564	CGTG	2	8	554039	554046	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015564	GCAG	2	8	554385	554392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015564	GGTG	2	8	557447	557454	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015564	GCAC	2	8	561950	561957	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015564	GCCC	2	8	561986	561993	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_015564	CTCA	2	8	581613	581620	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015564	AGTT	2	8	581752	581759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015564	TCCC	2	8	585048	585055	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_015564	AGCG	2	8	587152	587159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015564	TCCG	2	8	596461	596468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015564	CTCA	2	8	601305	601312	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015564	CCGT	2	8	607926	607933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015564	TTTC	2	8	612491	612498	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015564	AGGC	2	8	618965	618972	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015564	ACTC	2	8	619085	619092	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015564	TTTG	2	8	619226	619233	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015564	GTGG	2	8	619594	619601	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015564	TTCC	2	8	620214	620221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015564	GGGA	2	8	620835	620842	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015564	GCTG	2	8	621144	621151	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015564	TGAT	2	8	621253	621260	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015564	GCGA	2	8	621521	621528	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015564	GGGT	2	8	622581	622588	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015564	CAGT	2	8	622946	622953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015564	GACG	2	8	624169	624176	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015564	ACAA	2	8	624466	624473	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015564	TTCG	2	8	625619	625626	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015564	ACGT	2	8	625775	625782	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015564	TAAT	2	8	625842	625849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015564	GTCG	2	8	632505	632512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015564	GGCG	2	8	637616	637623	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015564	ATGG	2	8	637693	637700	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015564	GGGC	2	8	637773	637780	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015564	GCCC	2	8	637880	637887	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
149	NC_015564	GCGG	2	8	640428	640435	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015564	AGCC	2	8	642961	642968	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015564	CCTG	2	8	645453	645460	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_015564	CACG	2	8	646840	646847	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015564	AGTG	2	8	667862	667869	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_015564	GGAC	2	8	723136	723143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
161	NC_015564	GTGA	2	8	729632	729639	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015564	CGGG	2	8	736438	736445	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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166	NC_015564	AGCG	2	8	753243	753250	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
167	NC_015564	CCGG	2	8	765237	765244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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173	NC_015564	CGGG	2	8	791280	791287	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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175	NC_015564	CTGG	2	8	791906	791913	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
176	NC_015564	CCGC	2	8	791933	791940	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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189	NC_015564	GCCC	2	8	811086	811093	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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261	NC_015564	ACTG	2	8	1143052	1143059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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292	NC_015564	GCGA	2	8	1283806	1283813	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
293	NC_015564	CGGT	2	8	1283933	1283940	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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464	NC_015564	CTCG	2	8	2135242	2135249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
465	NC_015564	GCGT	2	8	2135427	2135434	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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471	NC_015564	GCTC	2	8	2192721	2192728	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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481	NC_015564	GGTG	2	8	2241473	2241480	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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486	NC_015564	CGGT	2	8	2261562	2261569	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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492	NC_015564	CGTG	2	8	2276762	2276769	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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496	NC_015564	TCGG	2	8	2288851	2288858	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
497	NC_015564	AACG	2	8	2289855	2289862	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_015564	AACT	2	8	2289924	2289931	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
499	NC_015564	GCCC	2	8	2292360	2292367	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
500	NC_015564	CGAA	2	8	2292560	2292567	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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