MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 67643

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015564	CGA	2	6	35375	35380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917714
502	NC_015564	CGA	2	6	35420	35425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917714
503	NC_015564	CCG	2	6	35446	35451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917714
504	NC_015564	CGG	2	6	35480	35485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917714
505	NC_015564	AGG	2	6	35506	35511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917714
506	NC_015564	GAC	2	6	35535	35540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917714
507	NC_015564	AGG	2	6	35563	35568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917714
508	NC_015564	CGT	2	6	35615	35620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917714
509	NC_015564	GTC	2	6	35718	35723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917714
510	NC_015564	CCG	2	6	35926	35931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917714
511	NC_015564	ATC	2	6	35965	35970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917714
512	NC_015564	GTT	2	6	36057	36062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917714
513	NC_015564	GTC	2	6	36287	36292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917715
514	NC_015564	ATC	2	6	36311	36316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917715
515	NC_015564	TTG	2	6	36405	36410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917715
516	NC_015564	AGG	2	6	36417	36422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917715
517	NC_015564	GGC	2	6	36448	36453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917715
518	NC_015564	AGG	3	9	36531	36539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917715
519	NC_015564	GAT	2	6	36687	36692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917716
520	NC_015564	CAG	2	6	36792	36797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917716
521	NC_015564	GCG	2	6	36981	36986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917716
522	NC_015564	GCT	2	6	37003	37008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917716
523	NC_015564	CTC	2	6	37029	37034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917716
524	NC_015564	GTA	2	6	37080	37085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917716
525	NC_015564	CGG	2	6	37177	37182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917716
526	NC_015564	TGC	2	6	37205	37210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917716
527	NC_015564	GAT	2	6	37347	37352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917716
528	NC_015564	GCG	2	6	37414	37419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917716
529	NC_015564	TGA	2	6	37442	37447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917716
530	NC_015564	GAG	2	6	37551	37556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917716
531	NC_015564	CAG	2	6	37586	37591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917716
532	NC_015564	GAA	2	6	38461	38466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917717
533	NC_015564	TCG	3	9	38529	38537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917717
534	NC_015564	TCG	2	6	38565	38570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917717
535	NC_015564	GCT	2	6	38587	38592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917717
536	NC_015564	GTG	2	6	38634	38639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917717
537	NC_015564	GTC	2	6	38687	38692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917717
538	NC_015564	GGC	2	6	38758	38763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917717
539	NC_015564	CGC	2	6	38919	38924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917717
540	NC_015564	CGA	2	6	39165	39170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917717
541	NC_015564	TCA	2	6	39279	39284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917717
542	NC_015564	TGC	2	6	39381	39386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917717
543	NC_015564	ATG	2	6	39422	39427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917717
544	NC_015564	TCG	2	6	39618	39623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917717
545	NC_015564	CGA	3	9	39739	39747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917717
546	NC_015564	GCT	2	6	39802	39807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917717
547	NC_015564	TGC	2	6	39864	39869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917717
548	NC_015564	ACT	2	6	40011	40016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917717
549	NC_015564	CAG	2	6	40019	40024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917717
550	NC_015564	TGC	2	6	40152	40157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917717
551	NC_015564	ACG	2	6	40176	40181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917717
552	NC_015564	CTG	2	6	40400	40405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917717
553	NC_015564	CCA	3	9	40420	40428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917717
554	NC_015564	TCG	2	6	40467	40472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917717
555	NC_015564	CCA	2	6	40495	40500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917717
556	NC_015564	CTC	2	6	40511	40516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917717
557	NC_015564	GTT	2	6	40708	40713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917717
558	NC_015564	GCT	2	6	40738	40743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917717
559	NC_015564	CGA	2	6	40744	40749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917717
560	NC_015564	TTC	2	6	40751	40756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917717
561	NC_015564	GAC	2	6	40813	40818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917717
562	NC_015564	CCA	2	6	40822	40827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917717
563	NC_015564	GAA	2	6	40850	40855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917717
564	NC_015564	CGG	2	6	40879	40884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917717
565	NC_015564	GGC	2	6	40896	40901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917717
566	NC_015564	ACC	2	6	40914	40919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917717
567	NC_015564	GCA	2	6	40948	40953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917717
568	NC_015564	TCG	2	6	41001	41006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917717
569	NC_015564	CGA	2	6	41083	41088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917717
570	NC_015564	GAG	2	6	41102	41107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917717
571	NC_015564	TGG	2	6	41197	41202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917717
572	NC_015564	GCG	2	6	41223	41228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917717
573	NC_015564	GGC	2	6	41268	41273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917717
574	NC_015564	CGC	4	12	41463	41474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917717
575	NC_015564	GAA	2	6	41524	41529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917717
576	NC_015564	CGC	2	6	41590	41595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917717
577	NC_015564	TGT	2	6	41620	41625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917717
578	NC_015564	ACG	2	6	41640	41645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917717
579	NC_015564	GCA	2	6	41719	41724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917717
580	NC_015564	TGA	2	6	41733	41738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917717
581	NC_015564	AGA	2	6	41824	41829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917717
582	NC_015564	CAT	2	6	41869	41874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917717
583	NC_015564	CTT	2	6	41974	41979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917717
584	NC_015564	CTA	2	6	41980	41985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917717
585	NC_015564	AGA	2	6	41992	41997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917717
586	NC_015564	AAG	2	6	42326	42331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917717
587	NC_015564	GGC	2	6	42476	42481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917717
588	NC_015564	GCC	2	6	42496	42501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917717
589	NC_015564	CGA	2	6	42514	42519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917717
590	NC_015564	TCG	2	6	42522	42527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917717
591	NC_015564	GGA	2	6	42529	42534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917717
592	NC_015564	CAT	2	6	42538	42543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917717
593	NC_015564	CGG	2	6	42544	42549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917717
594	NC_015564	GGT	2	6	42686	42691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917717
595	NC_015564	ACA	2	6	42771	42776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917717
596	NC_015564	CGA	2	6	42829	42834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917717
597	NC_015564	TCG	2	6	42855	42860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917717
598	NC_015564	CAT	2	6	42901	42906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917717
599	NC_015564	AAG	2	6	42962	42967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917717
600	NC_015564	CTG	2	6	43107	43112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917718
601	NC_015564	GCT	2	6	43148	43153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917718
602	NC_015564	CAT	2	6	43223	43228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917718
603	NC_015564	CGA	2	6	43291	43296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917718
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605	NC_015564	GCA	2	6	43514	43519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917718
606	NC_015564	CTG	2	6	43578	43583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917718
607	NC_015564	TGT	2	6	43730	43735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917718
608	NC_015564	GCC	2	6	43859	43864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917718
609	NC_015564	GTC	2	6	43887	43892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917718
610	NC_015564	ATC	2	6	43893	43898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917718
611	NC_015564	GGT	3	9	43899	43907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917718
612	NC_015564	GGA	2	6	43991	43996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917718
613	NC_015564	GAA	2	6	44058	44063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917718
614	NC_015564	GGC	2	6	44064	44069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917718
615	NC_015564	TCG	2	6	44101	44106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917718
616	NC_015564	GAG	2	6	44109	44114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917718
617	NC_015564	TGG	2	6	44152	44157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917718
618	NC_015564	TCG	2	6	44230	44235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917718
619	NC_015564	CTG	2	6	44253	44258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917718
620	NC_015564	TCG	2	6	44338	44343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917718
621	NC_015564	ACC	2	6	44463	44468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917718
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993	NC_015564	GAC	2	6	69066	69071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917745
994	NC_015564	GTC	2	6	69084	69089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917745
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996	NC_015564	GCG	2	6	69377	69382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917746
997	NC_015564	GGC	2	6	69394	69399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917746
998	NC_015564	ACG	2	6	69441	69446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917746
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