MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 72578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
72501	NC_015564	TCC	2	6	4733279	4733284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333922230
72502	NC_015564	GCT	2	6	4733289	4733294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922230
72503	NC_015564	GCA	2	6	4733300	4733305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333922230
72504	NC_015564	CTT	2	6	4733307	4733312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333922230
72505	NC_015564	CAA	2	6	4733362	4733367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333922230
72506	NC_015564	TCA	2	6	4733372	4733377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333922230
72507	NC_015564	CAT	2	6	4733497	4733502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333922230
72508	NC_015564	TCA	2	6	4733543	4733548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333922230
72509	NC_015564	CGG	2	6	4733649	4733654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333922230
72510	NC_015564	CGC	2	6	4733703	4733708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333922230
72511	NC_015564	CGC	2	6	4733742	4733747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333922230
72512	NC_015564	CCG	3	9	4733760	4733768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333922230
72513	NC_015564	GCG	2	6	4733813	4733818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333922230
72514	NC_015564	CAC	2	6	4733939	4733944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333922231
72515	NC_015564	ACC	2	6	4734031	4734036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333922231
72516	NC_015564	TGC	2	6	4734046	4734051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922231
72517	NC_015564	GTA	2	6	4734195	4734200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333922231
72518	NC_015564	GAC	2	6	4734219	4734224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333922231
72519	NC_015564	ATG	2	6	4734286	4734291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333922231
72520	NC_015564	GCC	2	6	4734331	4734336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333922231
72521	NC_015564	GCT	2	6	4734353	4734358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922231
72522	NC_015564	GGT	2	6	4734506	4734511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333922231
72523	NC_015564	GCA	2	6	4734592	4734597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333922231
72524	NC_015564	GTC	3	9	4734610	4734618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922231
72525	NC_015564	GAA	2	6	4734698	4734703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333922231
72526	NC_015564	GTC	2	6	4734753	4734758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922231
72527	NC_015564	CAC	2	6	4734918	4734923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333922232
72528	NC_015564	TCG	2	6	4735060	4735065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922232
72529	NC_015564	GCA	2	6	4735097	4735102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333922232
72530	NC_015564	GCG	2	6	4735103	4735108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333922232
72531	NC_015564	ACT	2	6	4735153	4735158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333922232
72532	NC_015564	ACC	2	6	4735183	4735188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333922232
72533	NC_015564	CCG	2	6	4735312	4735317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333922232
72534	NC_015564	ACG	2	6	4735330	4735335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333922232
72535	NC_015564	CTG	2	6	4735336	4735341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922232
72536	NC_015564	TCG	2	6	4735466	4735471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922232
72537	NC_015564	GTG	2	6	4735553	4735558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72538	NC_015564	ACT	2	6	4735625	4735630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72539	NC_015564	AAC	2	6	4735803	4735808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72540	NC_015564	ACG	2	6	4735840	4735845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333922233
72541	NC_015564	TGT	2	6	4736077	4736082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333922233
72542	NC_015564	GTC	2	6	4736129	4736134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922233
72543	NC_015564	CCA	2	6	4736135	4736140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333922233
72544	NC_015564	CTA	2	6	4736273	4736278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333922233
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72546	NC_015564	CGT	2	6	4736595	4736600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922234
72547	NC_015564	CGG	2	6	4736613	4736618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333922234
72548	NC_015564	TCG	2	6	4736631	4736636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922234
72549	NC_015564	ACG	2	6	4736668	4736673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333922234
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72551	NC_015564	TCT	2	6	4736730	4736735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333922234
72552	NC_015564	GTT	2	6	4736755	4736760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333922234
72553	NC_015564	ATC	2	6	4736939	4736944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333922234
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72555	NC_015564	TCA	2	6	4737095	4737100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333922234
72556	NC_015564	GGC	2	6	4737153	4737158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333922234
72557	NC_015564	GCC	2	6	4737169	4737174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333922234
72558	NC_015564	CTT	2	6	4737325	4737330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333922234
72559	NC_015564	CGT	2	6	4737373	4737378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922234
72560	NC_015564	TAG	2	6	4737533	4737538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333922234
72561	NC_015564	CTC	2	6	4737564	4737569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333922235
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72563	NC_015564	TGC	3	9	4737717	4737725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72564	NC_015564	ACG	2	6	4737769	4737774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72565	NC_015564	AGA	2	6	4737822	4737827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72566	NC_015564	ATC	2	6	4737878	4737883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72567	NC_015564	AAG	2	6	4737960	4737965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72568	NC_015564	ACC	2	6	4737992	4737997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72569	NC_015564	TCC	2	6	4738120	4738125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72570	NC_015564	CGC	3	9	4738194	4738202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72571	NC_015564	GGC	2	6	4738247	4738252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72572	NC_015564	GCG	3	9	4738309	4738317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333922236
72573	NC_015564	AAT	2	6	4738324	4738329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333922236
72574	NC_015564	CTC	2	6	4738434	4738439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72575	NC_015564	CAC	2	6	4738556	4738561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72576	NC_015564	CGC	2	6	4738576	4738581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72577	NC_015564	TGT	2	6	4738645	4738650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72578	NC_015564	CAG	2	6	4738689	4738694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.