MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Delftia sp. Cs1-4 chromosome

Total Repeats: 2442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015563	CATC	2	8	5519	5526	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015563	CCTG	2	8	11471	11478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015563	CCAG	2	8	12711	12718	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015563	GATG	2	8	15254	15261	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015563	TGCG	2	8	23928	23935	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015563	CAAT	2	8	24275	24282	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015563	GCAA	2	8	29159	29166	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015563	CGGG	2	8	29932	29939	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015563	TGGA	2	8	29985	29992	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015563	GTCC	2	8	30039	30046	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015563	GTGC	2	8	41352	41359	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015563	CTGG	2	8	41674	41681	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015563	CGGC	2	8	41715	41722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015563	TGAC	2	8	41866	41873	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015563	GCGG	2	8	44859	44866	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015563	CTGG	2	8	46517	46524	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015563	AAGA	2	8	49833	49840	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015563	CTTG	2	8	55031	55038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015563	TGCG	2	8	64263	64270	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015563	TGGG	2	8	66858	66865	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015563	GGCC	2	8	74075	74082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015563	CCAG	2	8	80435	80442	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015563	GCAC	2	8	81517	81524	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015563	CGGC	2	8	95069	95076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015563	GCCC	2	8	97006	97013	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_015563	GGCG	2	8	101732	101739	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015563	TTTC	2	8	101912	101919	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015563	GGAA	2	8	104692	104699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015563	CTCC	2	8	106659	106666	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_015563	CGCC	2	8	121950	121957	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_015563	CTTC	2	8	124583	124590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015563	GAAG	2	8	124674	124681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015563	CAAA	2	8	124848	124855	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015563	AGGC	2	8	125089	125096	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015563	CGAA	2	8	127614	127621	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015563	CGGC	2	8	141269	141276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015563	GCCG	2	8	151860	151867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015563	ATTC	2	8	157979	157986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015563	TTGG	2	8	158975	158982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015563	GCTC	2	8	159032	159039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015563	CTGC	2	8	159115	159122	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015563	CATC	2	8	162698	162705	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015563	TTCA	2	8	173482	173489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015563	GGCA	2	8	181997	182004	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015563	GATG	2	8	188436	188443	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015563	CGGC	2	8	191569	191576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015563	TCCG	2	8	192910	192917	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015563	AATG	2	8	194355	194362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015563	TGCC	2	8	197253	197260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015563	GGGC	2	8	197536	197543	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015563	TTCT	2	8	201884	201891	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015563	CACC	2	8	203858	203865	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_015563	GCCC	2	8	205124	205131	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_015563	ATGC	2	8	211858	211865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015563	TGAA	2	8	214737	214744	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015563	GCAA	2	8	214792	214799	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015563	CTTG	2	8	222649	222656	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015563	GCCG	2	8	222729	222736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015563	ATTG	2	8	223733	223740	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015563	GCTT	2	8	224962	224969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015563	GATT	2	8	232017	232024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015563	GCCG	2	8	234428	234435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015563	GGGA	2	8	237162	237169	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015563	CAGG	2	8	240777	240784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015563	GGTG	2	8	241678	241685	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015563	CAGG	2	8	251281	251288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015563	GCAC	2	8	254342	254349	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015563	CCTG	2	8	256775	256782	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015563	CCGG	2	8	260947	260954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015563	CGGT	2	8	265906	265913	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015563	TGCA	2	8	268016	268023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015563	GCGG	2	8	268129	268136	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015563	GCGG	2	8	268200	268207	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015563	TGCC	2	8	269632	269639	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015563	AAGG	2	8	272130	272137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015563	CCCG	2	8	278345	278352	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_015563	TTGT	2	8	278355	278362	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015563	ACGG	2	8	278880	278887	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015563	TTCG	2	8	278920	278927	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015563	CTGT	2	8	278949	278956	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015563	GGAA	2	8	280983	280990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015563	CTTG	2	8	289881	289888	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015563	CGGC	2	8	293818	293825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015563	GAGG	2	8	297242	297249	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015563	GCAG	2	8	301940	301947	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015563	GCTG	2	8	302152	302159	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015563	AAAT	2	8	303122	303129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015563	GCCG	2	8	306354	306361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015563	TATT	2	8	307365	307372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015563	CGGG	2	8	307392	307399	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015563	CTTG	2	8	309835	309842	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015563	GATG	2	8	314566	314573	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015563	GAAG	2	8	317179	317186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015563	ATCA	2	8	317388	317395	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015563	TTTG	2	8	317555	317562	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015563	TCTT	2	8	317826	317833	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015563	CGAT	2	8	322251	322258	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015563	TTAA	2	8	324078	324085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015563	TCCG	2	8	324684	324691	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015563	TGAG	2	8	324939	324946	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015563	AGGC	2	8	339443	339450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015563	GCCT	2	8	339457	339464	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015563	GCTC	2	8	340632	340639	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015563	TTGC	2	8	340787	340794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015563	ATTT	2	8	340880	340887	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015563	TTTA	2	8	340919	340926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015563	ATTT	2	8	341007	341014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015563	TATT	2	8	341037	341044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015563	TCCA	2	8	341479	341486	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015563	TGAT	2	8	341508	341515	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015563	GGTC	2	8	341689	341696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015563	AGCA	2	8	349555	349562	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015563	GGGC	2	8	357671	357678	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015563	CGGG	2	8	358349	358356	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015563	TGGC	2	8	360849	360856	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015563	CTGA	2	8	360877	360884	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015563	CCTG	2	8	363348	363355	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015563	AAGC	2	8	366551	366558	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015563	GCAC	2	8	372706	372713	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015563	GGCT	2	8	372754	372761	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015563	GCCC	2	8	372763	372770	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_015563	GCCA	2	8	372899	372906	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015563	GGGC	2	8	384696	384703	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015563	AGCC	2	8	386655	386662	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015563	GCCG	2	8	395664	395671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015563	GGTT	2	8	397658	397665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015563	GCTC	2	8	397967	397974	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015563	CTGA	2	8	397981	397988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015563	CCTT	2	8	407622	407629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015563	TGCG	2	8	411383	411390	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015563	GTGG	2	8	414966	414973	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015563	GGGC	2	8	416940	416947	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015563	CTGC	2	8	417210	417217	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015563	CCAT	2	8	421052	421059	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015563	GCAA	2	8	421127	421134	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015563	CAGC	2	8	421965	421972	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015563	GCAC	2	8	421983	421990	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015563	GAGG	2	8	422687	422694	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015563	CTTG	2	8	422723	422730	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015563	CAGC	2	8	423428	423435	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015563	CCAC	2	8	429799	429806	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_015563	CGGG	2	8	437586	437593	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015563	GCAA	2	8	438940	438947	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015563	GCAT	2	8	440011	440018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015563	CTCC	2	8	440104	440111	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_015563	CTTG	2	8	443992	443999	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015563	TCAA	2	8	451096	451103	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015563	TTGC	2	8	452189	452196	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015563	GATT	2	8	455709	455716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015563	GCCA	2	8	455846	455853	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015563	ACAA	2	8	458195	458202	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_015563	CTGC	2	8	458204	458211	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015563	TAGA	2	8	460055	460062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015563	GCCT	3	12	466058	466069	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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158	NC_015563	GCCC	2	8	479307	479314	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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160	NC_015563	TGGT	2	8	482958	482965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_015563	ATGG	2	8	512589	512596	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_015563	CCTC	2	8	515685	515692	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
169	NC_015563	GGAG	2	8	515930	515937	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015563	TTGA	2	8	516027	516034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_015563	TGTT	2	8	549040	549047	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
177	NC_015563	CGGG	2	8	551869	551876	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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179	NC_015563	GCCT	2	8	552376	552383	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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186	NC_015563	TGCT	2	8	580624	580631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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442	NC_015563	GATG	2	8	1331867	1331874	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
443	NC_015563	AGGA	2	8	1333041	1333048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
444	NC_015563	GCAG	2	8	1333125	1333132	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
445	NC_015563	TAAA	2	8	1337451	1337458	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_015563	GGCC	2	8	1337491	1337498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
447	NC_015563	CGGC	2	8	1340711	1340718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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449	NC_015563	CCAT	2	8	1349496	1349503	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
450	NC_015563	CACG	2	8	1354742	1354749	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
451	NC_015563	AAGA	2	8	1356136	1356143	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
452	NC_015563	GAAT	2	8	1363851	1363858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
453	NC_015563	TGCC	2	8	1373311	1373318	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
454	NC_015563	TGCC	2	8	1373455	1373462	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
455	NC_015563	CGGC	2	8	1375809	1375816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
456	NC_015563	ATGG	2	8	1377718	1377725	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_015563	GCCA	2	8	1415775	1415782	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
465	NC_015563	GGCA	2	8	1423125	1423132	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
466	NC_015563	ATGC	2	8	1423284	1423291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
467	NC_015563	CTGC	2	8	1423510	1423517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
468	NC_015563	AGCC	2	8	1426824	1426831	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
469	NC_015563	CGTT	2	8	1427424	1427431	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
470	NC_015563	AAAG	2	8	1433529	1433536	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
471	NC_015563	TCTT	2	8	1433551	1433558	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
472	NC_015563	CATT	2	8	1434732	1434739	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
473	NC_015563	CCTG	2	8	1438912	1438919	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
474	NC_015563	GCCC	2	8	1438935	1438942	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
475	NC_015563	CGGT	2	8	1442398	1442405	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
476	NC_015563	ATGG	2	8	1442432	1442439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
477	NC_015563	TGCA	2	8	1444652	1444659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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479	NC_015563	CGGG	2	8	1450395	1450402	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
480	NC_015563	TGAT	2	8	1450467	1450474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
481	NC_015563	TGCG	2	8	1453789	1453796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
482	NC_015563	GGCG	2	8	1453847	1453854	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
483	NC_015563	CTTC	2	8	1462688	1462695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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485	NC_015563	CGGC	2	8	1468422	1468429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
486	NC_015563	CGGG	2	8	1470433	1470440	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
487	NC_015563	GGAC	2	8	1475931	1475938	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
488	NC_015563	TGTA	2	8	1475979	1475986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
489	NC_015563	CTGC	2	8	1476229	1476236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
490	NC_015563	GCCC	2	8	1483475	1483482	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
491	NC_015563	ACAG	2	8	1493856	1493863	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
492	NC_015563	GATT	2	8	1497602	1497609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
493	NC_015563	GACT	2	8	1497615	1497622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
494	NC_015563	GCGG	2	8	1500312	1500319	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
495	NC_015563	CGGC	2	8	1505206	1505213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
496	NC_015563	TGTC	2	8	1505413	1505420	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
497	NC_015563	GCTG	2	8	1508730	1508737	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
498	NC_015563	GCCG	2	8	1512935	1512942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
499	NC_015563	GCCG	2	8	1513807	1513814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
500	NC_015563	GGGT	2	8	1513925	1513932	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

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