MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015562	TCAATA	2	12	1001588	1001599	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333910878
502	NC_015562	CCAAAA	2	12	1004804	1004815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910879
503	NC_015562	AGAAAT	2	12	1005288	1005299	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333910880
504	NC_015562	AAAAGA	2	12	1005606	1005617	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333910880
505	NC_015562	GATGTT	2	12	1005888	1005899	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333910881
506	NC_015562	TAAAAG	2	12	1009079	1009090	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333910885
507	NC_015562	TGGAGT	2	12	1009566	1009577	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	333910885
508	NC_015562	GGAGCA	2	12	1009828	1009839	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333910885
509	NC_015562	GTTGCA	2	12	1015181	1015192	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333910890
510	NC_015562	AAGGCA	2	12	1017209	1017220	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333910892
511	NC_015562	GAAAAA	2	12	1017436	1017447	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333910892
512	NC_015562	CAAAAA	2	12	1019558	1019569	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	333910895
513	NC_015562	ATTCAT	2	12	1020926	1020937	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333910896
514	NC_015562	GTTGTA	2	12	1021639	1021650	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333910898
515	NC_015562	TTGATA	2	12	1023108	1023119	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333910899
516	NC_015562	AGGAAA	2	12	1026419	1026430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910905
517	NC_015562	AGGAGA	2	12	1028268	1028279	50 %	0 %	50 %	0 %	333910907
518	NC_015562	AAGAGG	2	12	1029294	1029305	50 %	0 %	50 %	0 %	333910908
519	NC_015562	CACTGA	2	12	1030579	1030590	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333910909
520	NC_015562	CTGATG	2	12	1032106	1032117	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333910910
521	NC_015562	GTTATT	2	12	1033096	1033107	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333910911
522	NC_015562	ATAAAG	2	12	1033208	1033219	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333910911
523	NC_015562	AAATAA	2	12	1036023	1036034	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	333910914
524	NC_015562	CAAAAT	2	12	1036224	1036235	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	333910914
525	NC_015562	CCTATC	2	12	1039912	1039923	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333910916
526	NC_015562	TGCAGT	2	12	1042921	1042932	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333910920
527	NC_015562	AGTAAT	2	12	1053148	1053159	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333910927
528	NC_015562	CCTTAA	2	12	1059701	1059712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910932
529	NC_015562	AATTAA	2	12	1060905	1060916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910933
530	NC_015562	AATTTC	2	12	1062433	1062444	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333910935
531	NC_015562	TTTCTG	2	12	1063081	1063092	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333910936
532	NC_015562	TTTAGT	2	12	1063634	1063645	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333910938
533	NC_015562	TGCTGG	2	12	1063844	1063855	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	333910938
534	NC_015562	TAATAT	2	12	1064158	1064169	50 %	50 %	0 %	0 %	333910939
535	NC_015562	AACTTT	2	12	1066273	1066284	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333910942
536	NC_015562	ATGAAA	2	12	1066539	1066550	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333910942
537	NC_015562	AAAATA	2	12	1068820	1068831	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	333910945
538	NC_015562	GGAATT	2	12	1070960	1070971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910947
539	NC_015562	TGTGGA	2	12	1071585	1071596	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	333910948
540	NC_015562	TTTGGT	2	12	1073753	1073764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910950
541	NC_015562	TTGGAG	2	12	1074020	1074031	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	333910950
542	NC_015562	CTGCAT	2	12	1077878	1077889	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333910953
543	NC_015562	TTTGGA	2	12	1078406	1078417	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333910954
544	NC_015562	AAAAGA	2	12	1078841	1078852	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333910954
545	NC_015562	GAAAAA	2	12	1079448	1079459	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333910955
546	NC_015562	AGGAGC	2	12	1079822	1079833	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333910955
547	NC_015562	ATAGAG	2	12	1080548	1080559	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333910956
548	NC_015562	AAAATC	2	12	1080742	1080753	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	333910956
549	NC_015562	AGATTG	2	12	1081376	1081387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910956
550	NC_015562	ATCCTC	2	12	1083131	1083142	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333910957
551	NC_015562	CAAAAA	2	12	1085224	1085235	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	333910959
552	NC_015562	AAATAA	2	12	1086644	1086655	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	333910960
553	NC_015562	ATCCAT	2	12	1087405	1087416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910961
554	NC_015562	TTCCCA	2	12	1087719	1087730	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333910961
555	NC_015562	GAAAAA	2	12	1088147	1088158	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333910962
556	NC_015562	TTGAGT	2	12	1096005	1096016	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333910966
557	NC_015562	TTTAAA	2	12	1096222	1096233	50 %	50 %	0 %	0 %	333910966
558	NC_015562	TTTTCG	2	12	1096579	1096590	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333910966
559	NC_015562	CAAAAT	2	12	1101080	1101091	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	333910971
560	NC_015562	AAGTGG	2	12	1105553	1105564	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333910976
561	NC_015562	AATTAA	2	12	1108310	1108321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910979
562	NC_015562	TGAAGA	2	12	1108852	1108863	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333910980
563	NC_015562	TAATGT	2	12	1109876	1109887	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333910981
564	NC_015562	ACTTGA	2	12	1111576	1111587	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333910982
565	NC_015562	GATGTT	2	12	1112510	1112521	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333910983
566	NC_015562	CTTTAC	2	12	1116796	1116807	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	333910988
567	NC_015562	TCCTAC	2	12	1118676	1118687	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333910989
568	NC_015562	CTTTAA	2	12	1121160	1121171	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333910993
569	NC_015562	ATTATA	2	12	1122715	1122726	50 %	50 %	0 %	0 %	333910995
570	NC_015562	TGGAAT	2	12	1122763	1122774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910995
571	NC_015562	CCAAAA	2	12	1124017	1124028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910996
572	NC_015562	AAAGTT	2	12	1124615	1124626	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333910997
573	NC_015562	AAATGA	2	12	1124707	1124718	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333910997
574	NC_015562	ACACCT	2	12	1124912	1124923	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333910997
575	NC_015562	AGCGAT	2	12	1125065	1125076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333910997
576	NC_015562	ACATCA	2	12	1126311	1126322	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333910998
577	NC_015562	ATTGCT	2	12	1128403	1128414	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333911000
578	NC_015562	ATCTGC	2	12	1129676	1129687	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333911001
579	NC_015562	CTTTTG	2	12	1129777	1129788	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333911001
580	NC_015562	AATTGC	2	12	1130303	1130314	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333911002
581	NC_015562	AAATTA	2	12	1136529	1136540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333911006
582	NC_015562	ACTGGA	2	12	1137829	1137840	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333911007
583	NC_015562	ATGTGT	2	12	1138952	1138963	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333911009
584	NC_015562	ATCATT	2	12	1141459	1141470	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333911012
585	NC_015562	TGCTGA	2	12	1142635	1142646	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333911012
586	NC_015562	TATCAA	2	12	1145644	1145655	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333911015
587	NC_015562	CTTTGC	2	12	1145753	1145764	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	333911015
588	NC_015562	ATTTCA	2	12	1146681	1146692	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333911015
589	NC_015562	TTAATT	2	12	1149147	1149158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333911017
590	NC_015562	AACATG	2	12	1150768	1150779	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333911018
591	NC_015562	TTTCTT	2	12	1155210	1155221	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	333911022
592	NC_015562	TCTTTA	2	12	1156027	1156038	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	333911023
593	NC_015562	AAGAGG	2	12	1157791	1157802	50 %	0 %	50 %	0 %	333911024
594	NC_015562	CCTTAT	2	12	1157849	1157860	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	333911024
595	NC_015562	TACATT	2	12	1159202	1159213	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333911026
596	NC_015562	CCTTTA	2	12	1160978	1160989	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	333911027
597	NC_015562	CATTCA	2	12	1162727	1162738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333911028
598	NC_015562	TCCAAT	2	12	1165980	1165991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333911032
599	NC_015562	AAACAA	2	12	1172482	1172493	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	333911038
600	NC_015562	TCACAA	2	12	1172546	1172557	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333911038
601	NC_015562	TCAACA	2	12	1173607	1173618	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333911040
602	NC_015562	CTTTTT	2	12	1173817	1173828	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	333911040
603	NC_015562	TCAATA	2	12	1175658	1175669	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333911041
604	NC_015562	TCTTTT	2	12	1178716	1178727	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	333911044
605	NC_015562	ATTTTT	2	12	1183876	1183887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	333911049
606	NC_015562	ACCAAA	2	12	1186371	1186382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333911052
607	NC_015562	TGGAAT	2	12	1186940	1186951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333911052
608	NC_015562	TGTTAT	2	12	1187274	1187285	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333911053
609	NC_015562	TGGGAA	2	12	1187844	1187855	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333911053
610	NC_015562	AAATTT	2	12	1187922	1187933	50 %	50 %	0 %	0 %	333911054
611	NC_015562	AAAAAG	2	12	1190260	1190271	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333911055
612	NC_015562	TCCATA	2	12	1199879	1199890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333911065
613	NC_015562	CAACCT	2	12	1199947	1199958	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333911065
614	NC_015562	CAATGC	2	12	1201012	1201023	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333911066
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